BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-302L19
Chromosome13 (Build37)
Map Location 44,434,162 - 44,623,295
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEG667157
Upstream geneSirt5, Nol7, Ranbp9, LOC637627, Ccdc90a, Rnf182, LOC100039403, Cd83, LOC100039432, A730030A06, EG637868
Downstream geneJarid2, Dtnbp1, Hsp25-ps1, LOC100039502, LOC667204, LOC100039533, Mylip, Gmpr
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-302L19.bB6Ng01-302L19.g
ACCGA096710GA096711
length1,082868
definitionB6Ng01-302L19.b B6Ng01-302L19.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(44,622,207 - 44,623,295)(44,434,162 - 44,435,028)
sequence
gaattcttaacgataaaaggaagtacgtctttttcatcttctacatcctc
agtaccagcacatgcatgcatcattgagaatgtgaccacgttctagagga
gatacagttctagatttcaagaagcctgtggtctgaattaagagacactg
gagacaagaccagccacacaggataggaagctggacagctactgtagagg
aagtagtggatctgaccttacaccagctttgctcaggcaagtagttccat
tttcctgagtctcattttcacctctggtaaaaggactaacagtgggaagg
tggctctcagtcccagcagagtgaggttctgagcagatctgagggaatca
agaatgctttctcaacaatgtgatgggtttcaggataaagttggacatca
tagatggctctgagtgggagcctttgggtctgtctgggactggtacgacc
gtgcattcttctaccatctggttgagatagaatctgtggaagagcaggca
ctcagggaatgtccgtagaataaattaataaatttgcctggagcccagtg
accacagagattatgatgttcacatgtatgaaattctcaaagaagaaata
gaaagaaatttaaaaagaaatgatggcactcagaggcagcatattgttat
agtgtggacattggagccacaagggctatgttcatagtctagctttcttg
ggctgacaagacagtttagaaggtaaaggcgcttgccagcaagcctgata
atctgaatttgatcatctggtaggaggagagacccagcctctaagcatgt
ttatgccattgtgtttttggtgtatgtcactctgttttttttgttttgtt
ttgttttgtttttgtaaaatttttttttatttaaaaatttttattagatg
tttgcagcaatagtttgtttaagtctcagaaagactttgaattaggactg
ttgaacattgttagatttgtgagacttgggggacttcttgggttaatgca
tttcacatatgagatgacatgaaccttttgggggggtccaggatggagaa
gttatggggtaagccaatgtatctgggtatca
gaattcagagattctaatgatgctcagctctgtggtcttcaggcctgagg
agaggcaggaggcaggtaccgtgaacaggaagcattcatgtgtcaaactg
ctcccctcatgatgatcaggaagagaaagagaaggagctgagttcttggc
atccctgtgacctcacttcctgccattagtccccatctcttaaagcttct
acgtcctgctagcatgacagtctagcagccaagcttccaacacaaatctt
aggagatgcttagctgaaccatcatagatacgatgggggagatgtctatg
gtgatagtggagttctgtacatttaactgtctacacatgtaataacttgg
catagaactgcacgcatgctttgtaccaatgtcagctccctgatgttcat
gcagagctggaattgtgtaacatatggcctttgaggaaactgggtgatgg
gtacccagaagcactccacattccatttgctatgcttgcaacatttgtca
agtgtgcaattactcagaattaaaaagtggagaggggcggggggataccc
aagaaggacagagaagaaaagagaaggaaactatctgggatgggtgttga
caattccagagataaaaggtgacaggaacgatttggacaaaggaacagca
gagtaaatattagaggtcacagtcaggcaagctgacagccagagactgtt
tggattgtaaattgcaaatgaactcagtggacagagaaggggaaagatca
ttgaactgttacccctgagtgacaagggttgacatggagcggggtgaaca
gggaagacatagagtaaacgtggcagccccagcagcagaatcatcctgtc
ctgtgggggaaggggaga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr13_44622207_44623295
seq2: B6Ng01-302L19.b_49_1130 (reverse)

seq1  TGATACCCAGATACATTGGCTTACCCCATAACTTTCTTCCATTCTTGACC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| || ||||
seq2  TGATACCCAGATACATTGGCTTACCCCATAACTT--CTCCATCCTGGACC  48

seq1  CCCC--AAAGGTTCATGTCCATCTCATATTGTGAAATGCATTTAACCCAA  98
      ||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||
seq2  CCCCCAAAAGGTTCATGT-CATCTCATA-TGTGAAATGCA-TTAACCCAA  95

seq1  G-AGTCCCCCAAAGTCTTCACAATTCTAACAATGTTCAACAGTCCTAATT  147
      | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGTCCCCC-AAGTC-TCACAAATCTAACAATGTTCAACAGTCCTAATT  143

seq1  CAAAGTCTTTCCTGAGACTTTAAACAAACTATTTGCTGCAAACATCTAAT  197
      |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  CAAAGTCTTT-CTGAGAC-TTAAACAAACTA-TTGCTGCAAACATCTAAT  190

seq1  AAAAATTTTTAAATAAAAAAAAATTTTACAAAAACAAAACAAAACAAAAC  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAATTTTTAAATAAAAAAAAATTTTACAAAAACAAAACAAAACAAAAC  240

seq1  AAAAAAAACAGAGTGACATACACCAAAAACACAATGGCATAAACATGCTT  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAAAACAGAGTGACATACACCAAAAACACAATGGCATAAACATGCTT  290

seq1  AGAGGCTGGGTCTCTCCTCCTACCAGATGATCAAATTCAGATTATCAGGC  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGCTGGGTCTCTCCTCCTACCAGATGATCAAATTCAGATTATCAGGC  340

seq1  TTGCTGGCAAGCGCCTTTACCTTCTAAACTGTCTTGTCAGCCCAAGAAAG  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCTGGCAAGCGCCTTTACCTTCTAAACTGTCTTGTCAGCCCAAGAAAG  390

seq1  CTAGACTATGAACATAGCCCTTGTGGCTCCAATGTCCACACTATAACAAT  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGACTATGAACATAGCCCTTGTGGCTCCAATGTCCACACTATAACAAT  440

seq1  ATGCTGCCTCTGAGTGCCATCATTTCTTTTTAAATTTCTTTCTATTTCTT  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCTGCCTCTGAGTGCCATCATTTCTTTTTAAATTTCTTTCTATTTCTT  490

seq1  CTTTGAGAATTTCATACATGTGAACATCATAATCTCTGTGGTCACTGGGC  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTGAGAATTTCATACATGTGAACATCATAATCTCTGTGGTCACTGGGC  540

seq1  TCCAGGCAAATTTATTAATTTATTCTACGGACATTCCCTGAGTGCCTGCT  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGGCAAATTTATTAATTTATTCTACGGACATTCCCTGAGTGCCTGCT  590

seq1  CTTCCACAGATTCTATCTCAACCAGATGGTAGAAGAATGCACGGTCGTAC  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCACAGATTCTATCTCAACCAGATGGTAGAAGAATGCACGGTCGTAC  640

seq1  CAGTCCCAGACAGACCCAAAGGCTCCCACTCAGAGCCATCTATGATGTCC  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTCCCAGACAGACCCAAAGGCTCCCACTCAGAGCCATCTATGATGTCC  690

seq1  AACTTTATCCTGAAACCCATCACATTGTTGAGAAAGCATTCTTGATTCCC  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTTTATCCTGAAACCCATCACATTGTTGAGAAAGCATTCTTGATTCCC  740

seq1  TCAGATCTGCTCAGAACCTCACTCTGCTGGGACTGAGAGCCACCTTCCCA  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGATCTGCTCAGAACCTCACTCTGCTGGGACTGAGAGCCACCTTCCCA  790

seq1  CTGTTAGTCCTTTTACCAGAGGTGAAAATGAGACTCAGGAAAATGGAACT  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTTAGTCCTTTTACCAGAGGTGAAAATGAGACTCAGGAAAATGGAACT  840

seq1  ACTTGCCTGAGCAAAGCTGGTGTAAGGTCAGATCCACTACTTCCTCTACA  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTGCCTGAGCAAAGCTGGTGTAAGGTCAGATCCACTACTTCCTCTACA  890

seq1  GTAGCTGTCCAGCTTCCTATCCTGTGTGGCTGGTCTTGTCTCCAGTGTCT  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGCTGTCCAGCTTCCTATCCTGTGTGGCTGGTCTTGTCTCCAGTGTCT  940

seq1  CTTAATTCAGACCACAGGCTTCTTGAAATCTAGAACTGTATCTCCTCTAG  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAATTCAGACCACAGGCTTCTTGAAATCTAGAACTGTATCTCCTCTAG  990

seq1  AACGTGGTCACATTCTCAATGATGCATGCATGTGCTGGTACTGAGGATGT  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACGTGGTCACATTCTCAATGATGCATGCATGTGCTGGTACTGAGGATGT  1040

seq1  AGAAGATGAAAAAGACGTACTTCCTTTTATCGTTAAGAATTC  1089
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGATGAAAAAGACGTACTTCCTTTTATCGTTAAGAATTC  1082

seq1: chr13_44434162_44435028
seq2: B6Ng01-302L19.g_67_934

seq1  GAATTCAGAGATTCTAATGATGCTCAGCTCTGTGGTCTTCAGGCCTGAGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGAGATTCTAATGATGCTCAGCTCTGTGGTCTTCAGGCCTGAGG  50

seq1  AGAGGCAGGAGGCAGGTACCGTGAACAGGAAGCATTCATGTGTCAAACTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGCAGGAGGCAGGTACCGTGAACAGGAAGCATTCATGTGTCAAACTG  100

seq1  CTCCCCTCATGATGATCAGGAAGAGAAAGAGAAGGAGCTGAGTTCTTGGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCCCTCATGATGATCAGGAAGAGAAAGAGAAGGAGCTGAGTTCTTGGC  150

seq1  ATCCCTGTGACCTCACTTCCTGCCATTAGTCCCCATCTCTTAAAGCTTCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCCTGTGACCTCACTTCCTGCCATTAGTCCCCATCTCTTAAAGCTTCT  200

seq1  ACGTCCTGCTAGCATGACAGTCTAGCAGCCAAGCTTCCAACACAAATCTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGTCCTGCTAGCATGACAGTCTAGCAGCCAAGCTTCCAACACAAATCTT  250

seq1  AGGAGATGCTTAGCTGAACCATCATAGATACGATGGGGGAGATGTCTATG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAGATGCTTAGCTGAACCATCATAGATACGATGGGGGAGATGTCTATG  300

seq1  GTGATAGTGGAGTTCTGTACATTTAACTGTCTACACATGTAATAACTTGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGATAGTGGAGTTCTGTACATTTAACTGTCTACACATGTAATAACTTGG  350

seq1  CATAGAACTGCACGCATGCTTTGTACCAATGTCAGCTCCCTGATGTTCAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAGAACTGCACGCATGCTTTGTACCAATGTCAGCTCCCTGATGTTCAT  400

seq1  GCAGAGCTGGAATTGTGTAACATATGGCCTTTGAGGAAACTGGGTGATGG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGAGCTGGAATTGTGTAACATATGGCCTTTGAGGAAACTGGGTGATGG  450

seq1  GTACCCAGAAGCACTCCACATTCCATTTGCTATGCTTGCAACATTTGTCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACCCAGAAGCACTCCACATTCCATTTGCTATGCTTGCAACATTTGTCA  500

seq1  AGTGTGCAATTACTCAGAATTAAAAAGTGGAGAGGGGCGGGGGGATACCC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGTGCAATTACTCAGAATTAAAAAGTGGAGAGGGGCGGGGGGATACCC  550

seq1  AAGAAGGACAGAGAAGAAAAGAGAAGGAAACTATCTGGGATGGGTGTTGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAAGGACAGAGAAGAAAAGAGAAGGAAACTATCTGGGATGGGTGTTGA  600

seq1  CAATTCCAGAGATAAAAGGTGACAGGAACGATTTGGACAAAGGAACAGCA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATTCCAGAGATAAAAGGTGACAGGAACGATTTGGACAAAGGAACAGCA  650

seq1  GAGTAAATATTAGAGGTCACAGTCAGGCAAGCTGACAGCCAGAGACTGTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTAAATATTAGAGGTCACAGTCAGGCAAGCTGACAGCCAGAGACTGTT  700

seq1  TGGATTGTAAATTGCAAATGAACTCAGTGGACAGAGAAGGGGAAAGATCA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGATTGTAAATTGCAAATGAACTCAGTGGACAGAGAAGGGGAAAGATCA  750

seq1  TTGAACTGTTACCCCTGAGTGACAAGGGTTGACATGGAGCGGGGTGAACA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAACTGTTACCCCTGAGTGACAAGGGTTGACATGGAGCGGGGTGAACA  800

seq1  -GGAAGACATAGAGTAAACGTGGCAGCCCCAGCAGCAGAATCATCCTGTC  849
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAAGACATAGAGTAAACGTGGCAGCCCCAGCAGCAGAATCATCCTGTC  850

seq1  CTGTGGGGGAAGGGGAGA  867
      ||||||||||||||||||
seq2  CTGTGGGGGAAGGGGAGA  868