BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-305E10
Chromosome13 (Build37)
Map Location 13,379,231 - 13,474,278
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC385049, LOC630663, LOC100040108, Gpr137b
Upstream geneActn2, EG432725, Heatr1, LOC546246, Lgals8, LOC100039900, Edaradd, Ero1lb, LOC664862, EG238507, LOC100039744, EG630757, Prl2c3, LOC100039999, LOC100039754, Prl2c2, LOC434483, LOC674723, Prl2c5, LOC630611, LOC100039786
Downstream geneLOC664960, Nid1, Lyst, LOC100039831, Gng4, EG665000, EG665008, LOC630894, LOC100040205, B3galnt2, Tbce, Ggps1, LOC100040243, Arid4b, LOC100039916, Hecw1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-305E10.bB6Ng01-305E10.g
ACCGA098607GA098608
length7851,028
definitionB6Ng01-305E10.b B6Ng01-305E10.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(13,473,494 - 13,474,278)(13,379,231 - 13,380,166)
sequence
gaattccatcatctgtcagctgctgcctcttaaggctgaaactcagatat
acagctatcagcatagagaagtgactgagtgctacctaagacttgtatga
aaccctgccctggtcctactagggcagactgtacctgggtgagactttat
tactgtccttaactcccttccctttcctcttgctggagacagaatctgag
tcactttgaatgtgaggtgagtgagccatcactgaactgtgtacgaagtc
cctttttattttttttattttgagacagtagctcacccatttgttcaggc
agacatcaaacttggatcctctctcctcagccttctttgttttgttttgt
ttttgtttttcaagacagggtttttctatgtagccctggctgttctggaa
cttactttgtagaccaggctggcctcgaactcagaaatctgcctgcctct
gcctcccaagtgctgggactaaaggtgtgtgccaccactgcccggcttct
cttcagccttctaagaggcttgcatcatcagtgctcagctcctggtagaa
tgtaaagcagatgaagtgggctgtggtggtgtgggcttgtaaactcagtc
cctgagagacagaggcaggtggatagatcttgatttttgaggccagcctg
tggtaactgagacccccttcccacaatggtaacaaaaggttgacggagct
aagctaaaactaaaaggcatttttaaaagccccttgaaactttcagaaag
cccctttgcaaactaggtggtagtggtggaacatg
gaattcacttataatgcaaacatttactgtcttacatgcttggaaaagca
gctaaagaaattgtaattatatctgttgtaaacttgaaagtaggtagtta
aaatagacaacactaaaacctatgagagttttgaaaacgtcttaggccag
cttgattagatattgcctcattctatacacttattttcattactgatgta
caccataaataaaatgtaagagcttatttagaatatatataattttcatt
ctacatgataaggagaattcatgctgggactaattataattttttatggt
actaatcagtgttatagttctacataccaatatattagtaaatggtttga
agcatcagggtaaacctgtttagccaaagataattcaatatgaagtcaag
caagatttaatcacaagtccaattgtggcacaaacctttctgtttaattg
gatattttctttatttacatttcaaatgttttccctttccagttatcccc
ttcggaagccccatatcccatcacccctcctcctgcctctatgggggtgc
tcactcactcagttacccactccagtcttcctgccctggcattcccctac
tctggggcatccaactccctcaggctcaaggacctctcctcccactgatg
tccaacaagtccctcctctgggaaatatgtgtccagagccatgggtctct
ccatgtttacactttggttggtggtacactccccagaaactgcaaggggt
ctggctggttgacactgttgctctctccatggggctgcaaaccccctcag
ctccttcagtcccttctccaactcctccactggggactccacactcagtc
aaatggttggctgtaggcatccacttctgtatttatcaggctctagtaga
gcctctcaggagacagccatgtcaaatttctgtcagcaagcacttctcag
catccaacaatggtatccaggttttttgactgtatatggactactaatat
ccacttatcagtgagtatatactgtgta
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr13_13473494_13474278
seq2: B6Ng01-305E10.b_49_833 (reverse)

seq1  CATGTTCCACCACTACCACCTAGTTTGCAAAGGGGCTTTCTGAAAGTTTC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGTTCCACCACTACCACCTAGTTTGCAAAGGGGCTTTCTGAAAGTTTC  50

seq1  AAGGGGCTTTTAAAAATGCCTTTTAGTTTTAGCTTAGCTCCGTCAACCTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGGGCTTTTAAAAATGCCTTTTAGTTTTAGCTTAGCTCCGTCAACCTT  100

seq1  TTGTTACCATTGTGGGAAGGGGGTCTCAGTTACCACAGGCTGGCCTCAAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTACCATTGTGGGAAGGGGGTCTCAGTTACCACAGGCTGGCCTCAAA  150

seq1  AATCAAGATCTATCCACCTGCCTCTGTCTCTCAGGGACTGAGTTTACAAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCAAGATCTATCCACCTGCCTCTGTCTCTCAGGGACTGAGTTTACAAG  200

seq1  CCCACACCACCACAGCCCACTTCATCTGCTTTACATTCTACCAGGAGCTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCACACCACCACAGCCCACTTCATCTGCTTTACATTCTACCAGGAGCTG  250

seq1  AGCACTGATGATGCAAGCCTCTTAGAAGGCTGAAGAGAAGCCGGGCAGTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCACTGATGATGCAAGCCTCTTAGAAGGCTGAAGAGAAGCCGGGCAGTG  300

seq1  GTGGCACACACCTTTAGTCCCAGCACTTGGGAGGCAGAGGCAGGCAGATT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGCACACACCTTTAGTCCCAGCACTTGGGAGGCAGAGGCAGGCAGATT  350

seq1  TCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTCTACAAAGTAAGTTCCAGAACAGCCAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTCTACAAAGTAAGTTCCAGAACAGCCAG  400

seq1  GGCTACATAGAAAAACCCTGTCTTGAAAAACAAAAACAAAACAAAACAAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTACATAGAAAAACCCTGTCTTGAAAAACAAAAACAAAACAAAACAAA  450

seq1  GAAGGCTGAGGAGAGAGGATCCAAGTTTGATGTCTGCCTGAACAAATGGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGGCTGAGGAGAGAGGATCCAAGTTTGATGTCTGCCTGAACAAATGGG  500

seq1  TGAGCTACTGTCTCAAAATAAAAAAAATAAAAAGGGACTTCGTACACAGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGCTACTGTCTCAAAATAAAAAAAATAAAAAGGGACTTCGTACACAGT  550

seq1  TCAGTGATGGCTCACTCACCTCACATTCAAAGTGACTCAGATTCTGTCTC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGTGATGGCTCACTCACCTCACATTCAAAGTGACTCAGATTCTGTCTC  600

seq1  CAGCAAGAGGAAAGGGAAGGGAGTTAAGGACAGTAATAAAGTCTCACCCA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCAAGAGGAAAGGGAAGGGAGTTAAGGACAGTAATAAAGTCTCACCCA  650

seq1  GGTACAGTCTGCCCTAGTAGGACCAGGGCAGGGTTTCATACAAGTCTTAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTACAGTCTGCCCTAGTAGGACCAGGGCAGGGTTTCATACAAGTCTTAG  700

seq1  GTAGCACTCAGTCACTTCTCTATGCTGATAGCTGTATATCTGAGTTTCAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGCACTCAGTCACTTCTCTATGCTGATAGCTGTATATCTGAGTTTCAG  750

seq1  CCTTAAGAGGCAGCAGCTGACAGATGATGGAATTC  785
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTAAGAGGCAGCAGCTGACAGATGATGGAATTC  785

seq1: chr13_13379231_13380166
seq2: B6Ng01-305E10.g_67_1002

seq1  GAATTCACTTATAATGCAAACATTTACTGTCTTACATGCTTGGAAAAGCA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACTTATAATGCAAACATTTACTGTCTTACATGCTTGGAAAAGCA  50

seq1  GCTAAAGAAATTGTAATTATATCTGTTGTAAACTTGAAAGTAGGTAGTTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAAAGAAATTGTAATTATATCTGTTGTAAACTTGAAAGTAGGTAGTTA  100

seq1  AAATAGACAACACTAAAACCTATGAGAGTTTTGAAAACGTCTTAGGCCAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATAGACAACACTAAAACCTATGAGAGTTTTGAAAACGTCTTAGGCCAG  150

seq1  CTTGATTAGATATTGCCTCATTCTATACACTTATTTTCATTACTGATGTA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGATTAGATATTGCCTCATTCTATACACTTATTTTCATTACTGATGTA  200

seq1  CACCATAAATAAAATGTAAGAGCTTATTTAGAATATATATAATTTTCATT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCATAAATAAAATGTAAGAGCTTATTTAGAATATATATAATTTTCATT  250

seq1  CTACATGATAAGGAGAATTCATGCTGGGACTAATTATAATTTTTTATGGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACATGATAAGGAGAATTCATGCTGGGACTAATTATAATTTTTTATGGT  300

seq1  ACTAATCAGTGTTATAGTTCTACATACCAATATATTAGTAAATGGTTTGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTAATCAGTGTTATAGTTCTACATACCAATATATTAGTAAATGGTTTGA  350

seq1  AGCATCAGGGTAAACCTGTTTAGCCAAAGATAATTCAATATGAAGTCAAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCATCAGGGTAAACCTGTTTAGCCAAAGATAATTCAATATGAAGTCAAG  400

seq1  CAAGATTTAATCACAAGTCCAATTGTGGCACAAACCTTTCTGTTTAATTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGATTTAATCACAAGTCCAATTGTGGCACAAACCTTTCTGTTTAATTG  450

seq1  GATATTTTCTTTATTTACATTTCAAATGTTTTCCCTTTCCAGTTATCCCC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATATTTTCTTTATTTACATTTCAAATGTTTTCCCTTTCCAGTTATCCCC  500

seq1  TTCGGAAGCCCCATATCCCATCACCCCTCCTCCTGCCTCTATGGGGGTGC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCGGAAGCCCCATATCCCATCACCCCTCCTCCTGCCTCTATGGGGGTGC  550

seq1  TCACTCACTCAGTTACCCACTCCAGTCTTCCTGCCCTGGCATTCCCCTAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACTCACTCAGTTACCCACTCCAGTCTTCCTGCCCTGGCATTCCCCTAC  600

seq1  TCTGGGGCATCCAACTCCCTCAGGCTCAAGGACCTCTCCTCCCACTGATG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGGGGCATCCAACTCCCTCAGGCTCAAGGACCTCTCCTCCCACTGATG  650

seq1  TCCAACAAGTCCCTCCTCTGGGAAATATGTGTCCAGAGCCATGGGTCTCT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAACAAGTCCCTCCTCTGGGAAATATGTGTCCAGAGCCATGGGTCTCT  700

seq1  CCATGTTTACACTTTGGTTGGTGGTACACTCCCCAGAAACTGCAAGGGGT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATGTTTACACTTTGGTTGGTGGTACACTCCCCAGAAACTGCAAGGGGT  750

seq1  CTGGCTGGTTGACACTGTTGCTCTCTCCATGGGGCTGCAAACCCCCTCAG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGCTGGTTGACACTGTTGCTCTCTCCATGGGGCTGCAAACCCCCTCAG  800

seq1  CTCCTTCAGTCCCTTCTCCAACTCCTCCACTGGGGACTCCACACTCAGTC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTTCAGTCCCTTCTCCAACTCCTCCACTGGGGACTCCACACTCAGTC  850

seq1  AAATGGTTGGCTGTAGGCATCCACTTCTGTATTTATCAGGCTCTAGTAGA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGGTTGGCTGTAGGCATCCACTTCTGTATTTATCAGGCTCTAGTAGA  900

seq1  GCCTCTCAGGAGACAGCCATGTCAAATTTCTGTCAG  936
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTCTCAGGAGACAGCCATGTCAAATTTCTGTCAG  936