BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-322M14
Chromosome13 (Build37)
Map Location 80,267,545 - 80,394,488
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEG666933
Upstream geneLOC666925, LOC382780
Downstream geneArrdc3, LOC666964, LOC100043074, LOC218368, LOC666979, EG666984, Gpr98
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-322M14.bB6Ng01-322M14.g
ACCGA111540GA111541
length1,131930
definitionB6Ng01-322M14.b B6Ng01-322M14.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(80,267,545 - 80,268,674)(80,393,916 - 80,394,488)
sequence
gaattcatgatttgctcagctttgcagaagcaatggtgtcataacaggta
ccagtacctactcagtaaagaggtcatttagttaatagagaaacgtaact
ctgacttcatcttgatttttagatgcatccaggtaaaaatttccattaaa
catgtttatgcatttgcttttgagtctccaaagtagctaaagaaattgtt
atataatacattgtttgtttgttttttaagaacaagtctgcatgttagca
tctatattttttctaaatacactgccatactttctcaaatatgtatacac
acaaagaaacacattatataagttccatacacactataaatcagcatgtg
tttattattatttgtataccatcaacttagtaaatttgactaagctaagt
tcagagtctaaatatataccaagactatttgtagacttattaattagaca
tactctatatatttaatgaattcttatactgaataaattagaatacatta
ttgtaatatatgtatatgtgtacgtatatgtaatcaatacataaaattgt
atacattttatatataaagtatacatacatttatatgtacaaaatataca
tgtgtttacttgttaaatatatggaaatatatgtacacacacacatatat
ataaatgttaagacataaaaaattcagaccaagttcaagttgtactatat
tcatacatcttagcttttcttttcccaaaatcaatatctacaaataataa
atgagatcccagagggttgagataagctccaactttcactcagcaatact
gcaattgatcattggctcaataatacaggtgagtgtcacactacagaaca
ccctttgtgcactacagtacaaaatcaatagctttcaaataagcaccatg
gttaccttaaagactacatggtagcttgggttagaatgatctctcaactt
caaaaaaggtatgatatcgtaaaacctaaataatgaacaaagcttccaat
atcatattttatttttgttgtgtgcactatatttacctagccaaaaatac
ttttattgatttaaaatcatcatattacacagtgtggtaaaaagccacat
gcaatgaaatacaatggtctctggatcattt
gaattcaggaaaccagatctgagtttttacattccagaactggacaagtc
atttacttgaacaaccataggcttatgcaaaagtgatccattcctagttg
caaaaggatagttaaaagagcttgtggctaagaggtgaagaactaccccc
cttgacatgaagcaagaatagtcaaatatgcttgaagcaagaccctaacc
aattacagcaactcccagagatagaacatgaaatcaagatatggatcacc
cactcctccctaatattcccccctttgactttaaaactgaatctgtaaat
tcatttggggatccttccatcctgatggaattgggtccctgcctgcagga
atttgttcaataaatactcttgggcttttgtatattacttgagtctgggg
tcatgaatcttcagtgattcatggactgtaacttaggaatgctaatgtat
attctctcattgcatgttcgaaatatatttgcttttgcttttctattttg
ttttgcataaatttatagttaagaaattgccttgagtccaagaaaactcc
tgtagttggagatacacatactctcttgagattgaaggaatgtagggact
ttcaagttagactaaatgtataatctatggctataaacctatgaggccaa
tgagtggaatgtggtagtttgaagaagaatgactcccagaggccaatata
tttaaatgcttgatcccagttagtggaactgtttggaaattatcagtctg
ttctaattaaggtggaataggtgtggccttggaggaaatatctcactggg
gatgggctttgaggtttcaaaagcccacacaagactcagtcacactctct
gcatgctgcctgtggatcagaatgggaagctctaagctcctactccagta
ctctccctgtctccttcttgccatgatgat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr13_80267545_80268674
seq2: B6Ng01-322M14.b_46_1176

seq1  GAATTCATGATTTGCTCAGCTTTGCAGAAGCAATGGTGTCATAACAGGTA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATGATTTGCTCAGCTTTGCAGAAGCAATGGTGTCATAACAGGTA  50

seq1  CCAGTACCTACTCAGTAAAGAGGTCATTTAGTTAATAGAGAAACGTAACT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGTACCTACTCAGTAAAGAGGTCATTTAGTTAATAGAGAAACGTAACT  100

seq1  CTGACTTCATCTTGATTTTTAGATGCATCCAGGTAAAAATTTCCATTAAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGACTTCATCTTGATTTTTAGATGCATCCAGGTAAAAATTTCCATTAAA  150

seq1  CATGTTTATGCATTTGCTTTTGAGTCTCCAAAGTAGCTAAAGAAATTGTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGTTTATGCATTTGCTTTTGAGTCTCCAAAGTAGCTAAAGAAATTGTT  200

seq1  ATATAATACATTGTTTGTTTGTTTTTTAAGAACAAGTCTGCATGTTAGCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATAATACATTGTTTGTTTGTTTTTTAAGAACAAGTCTGCATGTTAGCA  250

seq1  TCTATATTTTTTCTAAATACACTGCCATACTTTCTCAAATATGTATACAC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTATATTTTTTCTAAATACACTGCCATACTTTCTCAAATATGTATACAC  300

seq1  ACAAAGAAACACATTATATAAGTTCCATACACACTATAAATCAGCATGTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAAGAAACACATTATATAAGTTCCATACACACTATAAATCAGCATGTG  350

seq1  TTTATTATTATTTGTATACCATCAACTTAGTAAATTTGACTAAGCTAAGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATTATTATTTGTATACCATCAACTTAGTAAATTTGACTAAGCTAAGT  400

seq1  TCAGAGTCTAAATATATACCAAGACTATTTGTAGACTTATTAATTAGACA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGAGTCTAAATATATACCAAGACTATTTGTAGACTTATTAATTAGACA  450

seq1  TACTCTATATATTTAATGAATTCTTATACTGAATAAATTAGAATACATTA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTCTATATATTTAATGAATTCTTATACTGAATAAATTAGAATACATTA  500

seq1  TTGTAATATATGTATATGTGTACGTATATGTAATCAATACATAAAATTGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTAATATATGTATATGTGTACGTATATGTAATCAATACATAAAATTGT  550

seq1  ATACATTTTATATATAAAGTATACATACATTTATATGTACAAAATATACA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACATTTTATATATAAAGTATACATACATTTATATGTACAAAATATACA  600

seq1  TGTGTTTACTTGTTAAATATATGGAAATATATGTACACACACACATATAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTTTACTTGTTAAATATATGGAAATATATGTACACACACACATATAT  650

seq1  ATAAATGTTAAGACATAAAAAATTCAGACCAAGTTCAAGTTGTACTATAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAATGTTAAGACATAAAAAATTCAGACCAAGTTCAAGTTGTACTATAT  700

seq1  TCATACATCTTAGCTTTTCTTTTCCCAAAATCAATATCTACAAATAATAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATACATCTTAGCTTTTCTTTTCCCAAAATCAATATCTACAAATAATAA  750

seq1  ATGAGATCCCAGAGGGTTGAGATAAGCTCCAACTTTCACTCAGCAATACT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAGATCCCAGAGGGTTGAGATAAGCTCCAACTTTCACTCAGCAATACT  800

seq1  GCAATTGATCATTGGCTCAATAATACAGGTGAGTGTCACACTACAGAACA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAATTGATCATTGGCTCAATAATACAGGTGAGTGTCACACTACAGAACA  850

seq1  CCCTTTGTGCACTACAGTACAAAATCAATAGCTTTCAAATAAGCACCATG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTTTGTGCACTACAGTACAAAATCAATAGCTTTCAAATAAGCACCATG  900

seq1  GTTACCTTAAAGACTACATGGTAGCTTGGGTTAGAATGATCTCTCAACTT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTACCTTAAAGACTACATGGTAGCTTGGGTTAGAATGATCTCTCAACTT  950

seq1  CAAAAAAGGTATGATATCGTAAAACCTAAATAATGAACAAAGCTTCCAAT  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAAAAGGTATGATATCGTAAAACCTAAATAATGAACAAAGCTTCCAAT  1000

seq1  ATCATA-TTTATTTTTGTTGTGTGCACTATATTTTACCTAGCCAAAAATA  1049
      |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  ATCATATTTTATTTTTGTTGTGTGCACTATA-TTTACCTAGCCAAAAATA  1049

seq1  ACTTTA-TGA-TTAAAATCATCATATTAACACAGTGTGTTAAAAAGCCAC  1097
        |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||
seq2  CTTTTATTGATTTAAAATCATCATATT-ACACAGTGTGGTAAAAAGCCAC  1098

seq1  AATGCAGTGACATAC-ATGGTCTCTGGATCATTT  1130
       ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||
seq2  -ATGCAATGAAATACAATGGTCTCTGGATCATTT  1131

seq1: chr13_80393916_80394488
seq2: B6Ng01-322M14.g_69_641 (reverse)

seq1  GAGTATGTGTATCTCCAACTACAGGAGTTTTCTTGGACTCAAGGCAATTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTATGTGTATCTCCAACTACAGGAGTTTTCTTGGACTCAAGGCAATTT  50

seq1  CTTAACTATAAATTTATGCAAAACAAAATAGAAAAGCAAAAGCAAATATA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAACTATAAATTTATGCAAAACAAAATAGAAAAGCAAAAGCAAATATA  100

seq1  TTTCGAACATGCAATGAGAGAATATACATTAGCATTCCTAAGTTACAGTC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCGAACATGCAATGAGAGAATATACATTAGCATTCCTAAGTTACAGTC  150

seq1  CATGAATCACTGAAGATTCATGACCCCAGACTCAAGTAATATACAAAAGC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGAATCACTGAAGATTCATGACCCCAGACTCAAGTAATATACAAAAGC  200

seq1  CCAAGAGTATTTATTGAACAAATTCCTGCAGGCAGGGACCCAATTCCATC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAGAGTATTTATTGAACAAATTCCTGCAGGCAGGGACCCAATTCCATC  250

seq1  AGGATGGAAGGATCCCCAAATGAATTTACAGATTCAGTTTTAAAGTCAAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGATGGAAGGATCCCCAAATGAATTTACAGATTCAGTTTTAAAGTCAAA  300

seq1  GGGGGGAATATTAGGGAGGAGTGGGTGATCCATATCTTGATTTCATGTTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGGGAATATTAGGGAGGAGTGGGTGATCCATATCTTGATTTCATGTTC  350

seq1  TATCTCTGGGAGTTGCTGTAATTGGTTAGGGTCTTGCTTCAAGCATATTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCTCTGGGAGTTGCTGTAATTGGTTAGGGTCTTGCTTCAAGCATATTT  400

seq1  GACTATTCTTGCTTCATGTCAAGGGGGGTAGTTCTTCACCTCTTAGCCAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTATTCTTGCTTCATGTCAAGGGGGGTAGTTCTTCACCTCTTAGCCAC  450

seq1  AAGCTCTTTTAACTATCCTTTTGCAACTAGGAATGGATCACTTTTGCATA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTCTTTTAACTATCCTTTTGCAACTAGGAATGGATCACTTTTGCATA  500

seq1  AGCCTATGGTTGTTCAAGTAAATGACTTGTCCAGTTCTGGAATGTAAAAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCTATGGTTGTTCAAGTAAATGACTTGTCCAGTTCTGGAATGTAAAAA  550

seq1  CTCAGATCTGGTTTCCTGAATTC  573
      |||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGATCTGGTTTCCTGAATTC  573