BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-337E14
Chromosome13 (Build37)
Map Location 4,576,937 - 4,704,803
singlet/doubletdoublet
Overlap geneAkr1c21, Akr1e1, EG432721
Upstream geneAsb13, Calml3, Calm4, Calm5, LOC100039279, Net1, Tubal3, Ucn3, Akr1c14, Akr1c18, LOC100039262, Akr1c13, Akr1c19, Akr1c12, Akr1c6, Akr1c20
Downstream geneEG432723
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-337E14.bB6Ng01-337E14.g
ACCGA121960GA121961
length1,0751,083
definitionB6Ng01-337E14.b B6Ng01-337E14.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(4,703,735 - 4,704,803)(4,576,937 - 4,578,012)
sequence
gaattcctattgcatctaagacagtgatggtctaatatagttgattatct
ttgaagctgagaatatttgttgaaatttcttggtattaatgtgtcctgtt
gctgtgatgccaatatttataagtggtgttttatattgtttcatataaag
cctcttatattaaaattaaaccatgtctgtgtgacacattgagaggactc
aaacatgaataataatcattttgaaggataaaaaatccaccactcattaa
gtaatattccattcacccttgttgagaaaaaaacatcctaaatgtatttt
atgcaattcatattaactttgaggtttctgtttccacgaaaatgtcacat
aagccttcaaaggctcattattcactgtgttctatgaccatgatactaaa
aatgtaggtctcaggtttagatagtcagaaattagtgctcacaatctgct
ttccgcctaatcagtcttattgctgttaaaacactagaactgagtaaaat
gtagtcataattcatggattagtgtttttgtaataacaataaatttatgg
cccactcatatacacttcagtaagtgactatatatcctaagttctgaaca
ataaaagggaaccattgtcttattttacacacaaaaacaatctcttctat
gtctgactccatgaaatatagctgaattctctaaattcatccaccaacac
tacgtctgaagccccttatacagttgagtagactaacaaattcattattt
gattttcacagtttaagctcatatttataaattttagtacaatctgtcat
tccaagttctattttaatcacacacacacacacaaacgtgtatgtgtgta
tgcctctgcatattatataatctctaatacagattaaaggattctcacaa
tcattaaattagttgggttttctttcatttcttccccttttctcactttt
caatgtttttatctaatgtcttacagtattagcccttataggagaatgct
atgttccctgttctctctctctctctctttctctctctctctctctctct
ctctctctcatcagggatggcttaa
gaattcactctgtagagcaggctggcctcgaactcagaaatcctcctgcc
tctgcctcctgagtactgggattaaaggcgtgaaccaccacgcctgccta
gtggttccttttcttgatagactttagaaaagtaaggatgatcaaagtag
actgtggtcaataatcacactctaaatgggaaagtgaacttgtattcaat
gtattaagaaaggacaatgattaacagggggacaaaagtgtaagcaacaa
tacctagaaaagattgagaaagtgtgagattaccaggaatcaaggatact
gtgtcaagaacagatgatgggtttcattgggctcatatgctttcttgttt
atggaccacaacttaagcaatactaaaaattaagtaaagcagactacaat
tctcatccaggttagagggcagatgtttattttttgttgtggtattattt
tgggtatgtaaaattaaactcagaaactttgaacaagacttcaacggact
ctgtttctgagcatggttcaatacactctcctagttgatggaatcaaatg
agttgtgaaatagtttctttgtatctctggctccattctttcaggtatta
acaacagcattcattagacaagtaaaagtcagatatgagaaaggaggtta
tatagtaaaacttctcctagtaatgaggatacatattcttttacagttgt
attagcattatggaaatatacagagtttattacattccattctatatggt
ttttctcttacatatgtgcttatagtgtacatgcaatttgtgttgatgta
tatgtggaggcctaaggttgatatcataagtatttctttctggggcttgt
tccagccccagcaagcagcagaacttggcagcttttggccatgtggctct
ggctgttaaagtccagaacatgaaggattactgggaacatttgatgcttg
ttagctggagcttaaacatttagtggtgattaagaagagactggcatcac
tgagtgaaattttattgggaggtgtttctgatagtacaaagagctgtgtg
tttcagagggtaggcaggattgtacttcctgct
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr13_4703735_4704803
seq2: B6Ng01-337E14.b_51_1125 (reverse)

seq1  TTAA-CCAT-CCTGATGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAGA  48
      |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAGCCATCCCTGATGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAGA  50

seq1  GAGAGAGAGAGAGAACAGGGAACATAGCATTCT-CTATAA-GGCTAATAC  96
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||
seq2  GAGAGAGAGAGAGAACAGGGAACATAGCATTCTCCTATAAGGGCTAATAC  100

seq1  TGTAAGACATTAGAT-AAAACATTGAAAAGTGAGAAAAGGGGAAGAAATG  145
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAAGACATTAGATAAAAACATTGAAAAGTGAGAAAAGGGGAAGAAATG  150

seq1  AAAGAAAA-CCAACTAATTTAATGATTGTGAGAATCCTTTAATCTGTATT  194
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGAAAACCCAACTAATTTAATGATTGTGAGAATCCTTTAATCTGTATT  200

seq1  AGAGATTATATAATATGCAGAGGCATACACACATACACGTTTGTGTGTGT  244
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGATTATATAATATGCAGAGGCATACACACATACACGTTTGTGTGTGT  250

seq1  GTGTGTGATTAAAATAGAACTTGGAATGACAGATTGTACTAAAATTTATA  294
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTGATTAAAATAGAACTTGGAATGACAGATTGTACTAAAATTTATA  300

seq1  AATATGAGCTTAAACTGTGAAAATCAAATAATGAATTTGTTAGTCTACTC  344
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATGAGCTTAAACTGTGAAAATCAAATAATGAATTTGTTAGTCTACTC  350

seq1  AACTGTATAAGGGGCTTCAGACGTAGTGTTGGTGGATGAATTTAGAGAAT  394
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTGTATAAGGGGCTTCAGACGTAGTGTTGGTGGATGAATTTAGAGAAT  400

seq1  TCAGCTATATTTCATGGAGTCAGACATAGAAGAGATTGTTTTTGTGTGTA  444
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGCTATATTTCATGGAGTCAGACATAGAAGAGATTGTTTTTGTGTGTA  450

seq1  AAATAAGACAATGGTTCCCTTTTATTGTTCAGAACTTAGGATATATAGTC  494
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATAAGACAATGGTTCCCTTTTATTGTTCAGAACTTAGGATATATAGTC  500

seq1  ACTTACTGAAGTGTATATGAGTGGGCCATAAATTTATTGTTATTACAAAA  544
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTACTGAAGTGTATATGAGTGGGCCATAAATTTATTGTTATTACAAAA  550

seq1  ACACTAATCCATGAATTATGACTACATTTTACTCAGTTCTAGTGTTTTAA  594
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACTAATCCATGAATTATGACTACATTTTACTCAGTTCTAGTGTTTTAA  600

seq1  CAGCAATAAGACTGATTAGGCGGAAAGCAGATTGTGAGCACTAATTTCTG  644
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCAATAAGACTGATTAGGCGGAAAGCAGATTGTGAGCACTAATTTCTG  650

seq1  ACTATCTAAACCTGAGACCTACATTTTTAGTATCATGGTCATAGAACACA  694
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTATCTAAACCTGAGACCTACATTTTTAGTATCATGGTCATAGAACACA  700

seq1  GTGAATAATGAGCCTTTGAAGGCTTATGTGACATTTTCGTGGAAACAGAA  744
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAATAATGAGCCTTTGAAGGCTTATGTGACATTTTCGTGGAAACAGAA  750

seq1  ACCTCAAAGTTAATATGAATTGCATAAAATACATTTAGGATGTTTTTTTC  794
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTCAAAGTTAATATGAATTGCATAAAATACATTTAGGATGTTTTTTTC  800

seq1  TCAACAAGGGTGAATGGAATATTACTTAATGAGTGGTGGATTTTTTATCC  844
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAACAAGGGTGAATGGAATATTACTTAATGAGTGGTGGATTTTTTATCC  850

seq1  TTCAAAATGATTATTATTCATGTTTGAGTCCTCTCAATGTGTCACACAGA  894
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAAAATGATTATTATTCATGTTTGAGTCCTCTCAATGTGTCACACAGA  900

seq1  CATGGTTTAATTTTAATATAAGAGGCTTTATATGAAACAATATAAAACAC  944
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGGTTTAATTTTAATATAAGAGGCTTTATATGAAACAATATAAAACAC  950

seq1  CACTTATAAATATTGGCATCACAGCAACAGGACACATTAATACCAAGAAA  994
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTATAAATATTGGCATCACAGCAACAGGACACATTAATACCAAGAAA  1000

seq1  TTTCAACAAATATTCTCAGCTTCAAAGATAATCAACTATATTAGACCATC  1044
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCAACAAATATTCTCAGCTTCAAAGATAATCAACTATATTAGACCATC  1050

seq1  ACTGTCTTAGATGCAATAGGAATTC  1069
      |||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGTCTTAGATGCAATAGGAATTC  1075

seq1: chr13_4576937_4578012
seq2: B6Ng01-337E14.g_64_1146

seq1  GAATTCACTCTGTAGAGCAGGCTGGCCTCGAACTCAGAAATCCTCCTGCC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACTCTGTAGAGCAGGCTGGCCTCGAACTCAGAAATCCTCCTGCC  50

seq1  TCTGCCTCCTGAGTACTGGGATTAAAGGCGTGAACCACCACGCCTGCCTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCCTCCTGAGTACTGGGATTAAAGGCGTGAACCACCACGCCTGCCTA  100

seq1  GTGGTTCCTTTTCTTGATAGACTTTAGAAAAGTAAGGATGATCAAAGTAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGTTCCTTTTCTTGATAGACTTTAGAAAAGTAAGGATGATCAAAGTAG  150

seq1  ACTGTGGTCAATAATCACACTCTAAATGGGAAAGTGAACTTGTATTCAAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGTGGTCAATAATCACACTCTAAATGGGAAAGTGAACTTGTATTCAAT  200

seq1  GTATTAAGAAAGGACAATGATTAACAGGGGGACAAAAGTGTAAGCAACAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATTAAGAAAGGACAATGATTAACAGGGGGACAAAAGTGTAAGCAACAA  250

seq1  TACCTAGAAAAGATTGAGAAAGTGTGAGATTACCAGGAATCAAGGATACT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCTAGAAAAGATTGAGAAAGTGTGAGATTACCAGGAATCAAGGATACT  300

seq1  GTGTCAAGAACAGATGATGGGTTTCATTGGGCTCATATGCTTTCTTGTTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTCAAGAACAGATGATGGGTTTCATTGGGCTCATATGCTTTCTTGTTT  350

seq1  ATGGACCACAACTTAAGCAATACTAAAAATTAAGTAAAGCAGACTACAAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGACCACAACTTAAGCAATACTAAAAATTAAGTAAAGCAGACTACAAT  400

seq1  TCTCATCCAGGTTAGAGGGCAGATGTTTATTTTTTGTTGTGGTATTATTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCATCCAGGTTAGAGGGCAGATGTTTATTTTTTGTTGTGGTATTATTT  450

seq1  TGGGTATGTAAAATTAAACTCAGAAACTTTGAACAAGACTTCAACGGACT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGTATGTAAAATTAAACTCAGAAACTTTGAACAAGACTTCAACGGACT  500

seq1  CTGTTTCTGAGCATGGTTCAATACACTCTCCTAGTTGATGGAATCAAATG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTTTCTGAGCATGGTTCAATACACTCTCCTAGTTGATGGAATCAAATG  550

seq1  AGTTGTGAAATAGTTTCTTTGTATCTCTGGCTCCATTCTTTCAGGTATTA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTGTGAAATAGTTTCTTTGTATCTCTGGCTCCATTCTTTCAGGTATTA  600

seq1  ACAACAGCATTCATTAGACAAGTAAAAGTCAGATATGAGAAAGGAGGTTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAACAGCATTCATTAGACAAGTAAAAGTCAGATATGAGAAAGGAGGTTA  650

seq1  TATAGTAAAACTTCTCCTAGTAATGAGGATACATATTCTTTTACAGTTGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAGTAAAACTTCTCCTAGTAATGAGGATACATATTCTTTTACAGTTGT  700

seq1  ATTAGCATTATGGAAATATACAGAGTTTATTACATTCCATTCTATATGGT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAGCATTATGGAAATATACAGAGTTTATTACATTCCATTCTATATGGT  750

seq1  TTTTCTCTTACATATGTGCTTATAGTGTACATGCAATTTGTGTTGATGTA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCTCTTACATATGTGCTTATAGTGTACATGCAATTTGTGTTGATGTA  800

seq1  TATGTGGAGGCCTAAGGTTGATATCATAAGTATT--CTTCTGGGGCTTGT  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||
seq2  TATGTGGAGGCCTAAGGTTGATATCATAAGTATTTCTTTCTGGGGCTTGT  850

seq1  TCCAGCCCCAGCAAGCAGCAGAACTTGGCAGC-TTTGGCCATGTGGCTCT  897
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  TCCAGCCCCAGCAAGCAGCAGAACTTGGCAGCTTTTGGCCATGTGGCTCT  900

seq1  GGCTG-TAAAGTCCAGAACAGAAAGGATTACTGGG-ACAATTGATGCTTG  945
      ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||
seq2  GGCTGTTAAAGTCCAGAACATGAAGGATTACTGGGAACATTTGATGCTTG  950

seq1  TTAGCTGGAGCTTAAACAATTAGTGGTGATTAAGAAGAGACTGGCATCAC  995
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGCTGGAGCTTAAACATTTAGTGGTGATTAAGAAGAGACTGGCATCAC  1000

seq1  TGAGGTGAAATTTTA-TGGGAGGTGTTTCTGATAGTACAAAGAAGC--TG  1042
      ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||
seq2  TGA-GTGAAATTTTATTGGGAGGTGTTTCTGATAGTACAAAG-AGCTGTG  1048

seq1  TGTTCCAGA-GGTAGCCAAGATTGTACTTCCTGCT  1076
      |||| |||| ||||| || ||||||||||||||||
seq2  TGTTTCAGAGGGTAGGCAGGATTGTACTTCCTGCT  1083