seq1: chr13_5274331_5274547
seq2: B6Ng01-342O07.b_52_269
seq1 TCATGTGGCAGCAGTTTGCTTATATAGTCAGGGCAAGGAGGTAGGGATAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TCATGTGGCAGCAGTTTGCTTATATAGTCAGGGCAAGGAGGTAGGGATAG 50
seq1 AATTATAGGGTGAAATGACTTATGGGGTGGTGTGAGATGATGAGGGGTGT 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AATTATAGGGTGAAATGACTTATGGGGTGGTGTGAGATGATGAGGGGTGT 100
seq1 GGGTGATCTCACGGGCCCTATAAGAAATTTATACATCGGGCTGGAGAGAT 150
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2 GGGTGATCTCACGGGCCCTATAACAAATTTATACATCGGGCTGGAGAGAT 150
seq1 GGCTCAGAGGCTA-AGAGCACTGACTGCTCTTCTGAAGATCCTGAGTTCA 199
|||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||
seq2 GGCTCATAGGCTATTTTTCTTTGACTGCTCTTCTGAAGAGCCTGAGTTCA 200
seq1 AATCCCAGCAACCACATG 217
||||||||| ||||||||
seq2 AATCCCAGCTACCACATG 218
| seq1: chr13_5372150_5373308
seq2: B6Ng01-342O07.g_72_1219 (reverse)
seq1 AACTGGACTATAAATGTTCAATGAGTTTTTAAATTACA-TGTGCCTTCAG 49
|||||||||||||| | | |||||||| ||||||| |||| || |||
seq2 AACTGGACTATAAACGGTTCATGAGTTT---AATTACATTGTG-CTCCAG 46
seq1 GACACAGAAACA-CAAATGGCTGGATGATAGCCATGTCGAATTTAAAACT 98
|||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||
seq2 GACACAGAAACACCAAATTGCTGGATGATAG-CATGTCGAATTT--AACT 93
seq1 ATACGGAGTAAAAAATAAGACAGCAAG-ATCAAAGGCAATGCTTAATTAA 147
||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||
seq2 ATACGGAGT-AAAAATAAGACAGCAAGAATCAAAGGCAATGCTTA--TAA 140
seq1 TTGTGTACTCAGATAAATTCCAGGTTATGTGCATTTAATTGT-GTCTGCA 196
|||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||
seq2 -TGTGTACTCAGATAAATT-CAGG-TATGTGCATTTAATTGTGGTCTGCA 187
seq1 TAAAGTGTGTGCACCTGTTTATATTGCTAGATAGCATTGGCCCAACCTCA 246
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2 TAAAGTGTGTGCACCTGTTTATATTGCTAGATAGCA-TGGCCCAACCTC- 235
seq1 AAACCCAAAGAAATTCTGAGTAAGCCCCCAAGAACTGTGTTCTGAGAACA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AAACCCAAAGAAATTCTGAGTAAGCCCCCAAGAACTGTGTTCTGAGAACA 285
seq1 AATACATCCAGTATTTATTTAATACCTTGAAGACTTGTTTTTGCCAGAAG 346
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AATACATCCAGTATTTATTTAATACCTTGAAGACTTGTTTTTGCCAGAAG 335
seq1 AATAAATTTACATGGATGCTTAAGTTAGAAAATAGTTTCTTGGCACTTTG 396
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AATAAATTTACATGGATGCTTAAGTTAGAAAATAGTTTCTTGGCACTTTG 385
seq1 TTGGTTTTCTGAACACCAGTCATGGTAAAAATATTTAGAGGTGGGCTGTT 446
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTGGTTTTCTGAACACCAGTCATGGTAAAAATATTTAGAGGTGGGCTGTT 435
seq1 TGTCAGCTACTGTGCACATTCTCAAGATTCATTGTTTGTATTCCCAAAGC 496
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TGTCAGCTACTGTGCACATTCTCAAGATTCATTGTTTGTATTCCCAAAGC 485
seq1 TAGAAGGCTAAACTGAAAGCAGTCAAATAACTGGGCTAGCAATTCACATA 546
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TAGAAGGCTAAACTGAAAGCAGTCAAATAACTGGGCTAGCAATTCACATA 535
seq1 TTTCTTGGACCACAGGGTTGAATCCAGACAGAAAATTAACCTATTTTCAC 596
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTTCTTGGACCACAGGGTTGAATCCAGACAGAAAATTAACCTATTTTCAC 585
seq1 CAAGAAAACCAGACTAGTAACTACAGACCTTCCTAGTTTCTGAGAAAAGC 646
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CAAGAAAACCAGACTAGTAACTACAGACCTTCCTAGTTTCTGAGAAAAGC 635
seq1 ATTCATTGAGCAGAAGGCAACTTGAGTAGTCTAAGGTTATTAATAACAAC 696
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ATTCATTGAGCAGAAGGCAACTTGAGTAGTCTAAGGTTATTAATAACAAC 685
seq1 TTTGATGAGCCATCTGAGATCATGGGAAGAAATTTAGGATAACTTTTACA 746
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTTGATGAGCCATCTGAGATCATGGGAAGAAATTTAGGATAACTTTTACA 735
seq1 TATTCATCTAGGTTCATTTCCTTTGGTCTACTGAGAAATGTATCAATGTT 796
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TATTCATCTAGGTTCATTTCCTTTGGTCTACTGAGAAATGTATCAATGTT 785
seq1 TTTGTTTGTGAATGATACTTATACTTTCTCCTTTCTTTTTCTTAAGGGTA 846
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTTGTTTGTGAATGATACTTATACTTTCTCCTTTCTTTTTCTTAAGGGTA 835
seq1 ATTGTAGAAAGATGATTGGCAAATATGTAGAACAGAGCAGACAGCAGTTT 896
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ATTGTAGAAAGATGATTGGCAAATATGTAGAACAGAGCAGACAGCAGTTT 885
seq1 CAAGTGCTATTTTGAAGTTGCCTGTGGTCTCTGTGAATACATTCTTACCA 946
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CAAGTGCTATTTTGAAGTTGCCTGTGGTCTCTGTGAATACATTCTTACCA 935
seq1 AGGAGGGCAATATTATCTGACCTTTCACCTATGTTCTGGTTCGGGTAAAA 996
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AGGAGGGCAATATTATCTGACCTTTCACCTATGTTCTGGTTCGGGTAAAA 985
seq1 GCCAAATATTTTAAGTGACCTCAAACAGTATTTCATAAATGTGGTCTTTG 1046
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GCCAAATATTTTAAGTGACCTCAAACAGTATTTCATAAATGTGGTCTTTG 1035
seq1 AAGAAGAGTGTCTGCAATCTTGCTCTTGTCTCTTAGAACAAAGCCTCACA 1096
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AAGAAGAGTGTCTGCAATCTTGCTCTTGTCTCTTAGAACAAAGCCTCACA 1085
seq1 TTTCTCCAGGGGAACTCTTGTGCTTATATGATTGCTGTAGTGGCGAGAAA 1146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTTCTCCAGGGGAACTCTTGTGCTTATATGATTGCTGTAGTGGCGAGAAA 1135
seq1 AGTTCAGGAATTC 1159
|||||||||||||
seq2 AGTTCAGGAATTC 1148
|
