BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-350H16
Chromosome13 (Build37)
Map Location 57,413,209 - 57,414,390
singlet/doubletsinglet
Overlap genenone
Upstream geneLOC100040926, AU042651, Il9, Fbxl21, Lect2, Tgfbi, Smad5, EG627415, Trpc7, LOC100040995
Downstream geneSpock1, Klhl3, Hnrpa0, 5133401N09Rik, Ubqln1, LOC671252, Gkap1, Kif27
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-350H16.bB6Ng01-350H16.g
ACCGA131134GA131135
length1,176271
definitionB6Ng01-350H16.b B6Ng01-350H16.g
singlet/doubletsinglet---
BLAST hituniqueno hit data
sequence
gaattctgtcccacggtggagctggttctaggaagtgcgcactcagcgaa
ggcttcaggagggcttgtggctgagtgagacttcctttataatcctcagc
gatttcttccttggcatattccttcccccaatgtagttgtacacaagtcc
ctctatgacaaagactgtatgtctcagcttgctttatagcttttctgtcc
atgtcactagggtgaaccagtggagcttagagcagatgagtaagatgccg
aacttgaactcacagacatccacctgcctctccgttcctagtacagataa
gaccgaggaaaaattttccctagcctctttacgaacacagtcacacatgc
atgcacacacatacatacatacattcacacatacagagactcaaaaacac
atttacacagagagaaatgcatgaatacacacagactcacaaacacacat
acacacacaaaaagagaaagacacgtatacacacatacagacacatactc
ccacatacctgcataaacacacaggcatacacacacatgcacactcacat
atactcatacatacacattgacacacacatgcacagagagtgagagatac
atgcacacacagagactcacaaatacatatacccagataggcatatactc
ttatataggcagataaacatgcacagttacatacatacacacacacacac
acatacacacacatgcacatacatagatgcacaaacatacacataaacaa
acacacaaatgcatacacacacataagtacaaacagagatatataaacaa
aagcatacatatgcatgcactcacacacagacacatatacagataaatgc
acatgtacgcccacacatgcacacacatagacacatacatacagatacac
acatgttagtgtctgcatgtacacacacatgcatagatgtacacatgcat
gcactgctcacagaattaggtcctaattatattcgaagctccttccctac
tgtatgacttcataccacattccctgtctctcatgtccatcataattgtc
actcagatctgctctgacccaacagcctgagggtctgtgtgtaacacact
catggtgtggtcacatggttacagccatagaacaggtactacatgttgaa
agcttgactcttgtacattgcagtgt
aacagtcctccaaggatagacatactcaaaaagaatagaaggaagaaaaa
acccctccaatacagcaagagacaaataaaactccacagccgcctctgac
tctgctgcctgcctttggcccctttgccttaactgggctgccctgtctag
ccacagcaggagaagatacaccgagtcccactgcaacttgacacatgaag
acagactgagatccccatttctgagaagaaagggagggctgtagaatgag
gagggggagggagagagggga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr13_57413209_57414390
seq2: B6Ng01-350H16.b_45_1220

seq1  GAATTCTGTCCCACGGTGGAGCTGGTTCTAGGAAGTGCGCACTCAGCGAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGTCCCACGGTGGAGCTGGTTCTAGGAAGTGCGCACTCAGCGAA  50

seq1  GGCTTCAGGAGGGCTTGTGGCTGAGTGAGACTTCCTTTATAATCCTCAGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTTCAGGAGGGCTTGTGGCTGAGTGAGACTTCCTTTATAATCCTCAGC  100

seq1  GATTTCTTCCTTGGCATATTCCTTCCCCCAATGTAGTTGTACACAAGTCC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTTCTTCCTTGGCATATTCCTTCCCCCAATGTAGTTGTACACAAGTCC  150

seq1  CTCTATGACAAAGACTGTATGTCTCAGCTTGCTTTATAGCTTTTCTGTCC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTATGACAAAGACTGTATGTCTCAGCTTGCTTTATAGCTTTTCTGTCC  200

seq1  ATGTCACTAGGGTGAACCAGTGGAGCTTAGAGCAGATGAGTAAGATGCCG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTCACTAGGGTGAACCAGTGGAGCTTAGAGCAGATGAGTAAGATGCCG  250

seq1  AACTTGAACTCACAGACATCCACCTGCCTCTCCGTTCCTAGTACAGATAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTTGAACTCACAGACATCCACCTGCCTCTCCGTTCCTAGTACAGATAA  300

seq1  GACCGAGGAAAAATTTTCCCTAGCCTCTTTACGAACACAGTCACACATGC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCGAGGAAAAATTTTCCCTAGCCTCTTTACGAACACAGTCACACATGC  350

seq1  ATGCACACACATACATACATACATTCACACATACAGAGACTCAAAAACAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCACACACATACATACATACATTCACACATACAGAGACTCAAAAACAC  400

seq1  ATTTACACAGAGAGAAATGCATGAATACACACAGACTCACAAACACACAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTACACAGAGAGAAATGCATGAATACACACAGACTCACAAACACACAT  450

seq1  ACACACACAAAAAGAGAAAGACACGTATACACACATACAGACACATACTC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACACAAAAAGAGAAAGACACGTATACACACATACAGACACATACTC  500

seq1  CCACATACCTGCATAAACACACAGGCATACACACACATGCACACTCACAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACATACCTGCATAAACACACAGGCATACACACACATGCACACTCACAT  550

seq1  ATACTCATACATACACATTGACACACACATGCACAGAGAGTGAGAGATAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACTCATACATACACATTGACACACACATGCACAGAGAGTGAGAGATAC  600

seq1  ATGCACACACAGAGACTCACAAATACATATACCCAGATAGGCATATACTC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCACACACAGAGACTCACAAATACATATACCCAGATAGGCATATACTC  650

seq1  TTATATAGGCAGATAAACATGCACAGTTACATACATACACACACACACAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATATAGGCAGATAAACATGCACAGTTACATACATACACACACACACAC  700

seq1  ACATACACACACATGCACATACATAGATGCACAAACATACACATAAACAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATACACACACATGCACATACATAGATGCACAAACATACACATAAACAA  750

seq1  ACACACAAATGCATACACACACATAAGTACAAACAGAGATATATAAACAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACAAATGCATACACACACATAAGTACAAACAGAGATATATAAACAA  800

seq1  AAGCATACATATGCATGCACTCACACACAGACACATATACAGATAAATGC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCATACATATGCATGCACTCACACACAGACACATATACAGATAAATGC  850

seq1  ACATGTACGCCCACACATGCACACACATAGACACATACATACAGATACAC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGTACGCCCACACATGCACACACATAGACACATACATACAGATACAC  900

seq1  ACATGTTAGTGTCTGCATGTACACACACATGCATAGATGTACACATGCAT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGTTAGTGTCTGCATGTACACACACATGCATAGATGTACACATGCAT  950

seq1  GCACTGCTCACAGAATTAGGTCCTAATTATATTCGAAGCTCCTTTCCCTA  1000
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  GCACTGCTCACAGAATTAGGTCCTAATTATATTCGAAGCTCC-TTCCCTA  999

seq1  CTGTATGACTTCATACCACATTCCCTGTCTCTCATGTCCATCATAATTGT  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  CTGTATGACTTCATACCACATTCCCTGTCTCTCATGTCCATCATAATTG-  1048

seq1  TCACTCAGATTCTGCTCTGACCC-ACAGGCTGGAGGGTCTGTGTGTAACA  1099
      ||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||
seq2  TCACTCAGA-TCTGCTCTGACCCAACAGCCT-GAGGGTCTGTGTGTAACA  1096

seq1  CACTCAT-GTGTGGTCACATGTTTACAG-CATAG-ACAGGCACCTAACAT  1146
      ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||   ||| 
seq2  CACTCATGGTGTGGTCACATGGTTACAGCCATAGAACAGGTAC--TACA-  1143

seq1  TTGTTGAAAGCTTGACTCCTCTGTACATGGCAGTGT  1182
       |||||||||||||||||   ||||||| |||||||
seq2  -TGTTGAAAGCTTGACTC--TTGTACATTGCAGTGT  1176