BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-106C08.T7 (MSMg01no106_c08.b1) | MSMg01-106C08.TJ (MSMg01no106_c08.g1) |
ACC | AG320310 | AG320311 |
length | 1,266 | 1,342 |
length of high quality (start - end) | 673 (85 - 757) | 513 (87 - 599) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no106_c08.b1 PHD_FILE: MSMg01no106_c08.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:06:09 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no106_c08.g1 PHD_FILE: MSMg01no106_c08.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:06:10 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | TTCCTTNNNNNAACATTGCGCGCTAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCG
CGGAATTCTGTCATATGTACCCTAATCTGTTAATATGTGCTTGACCTATA
AAACTTATACAGCTATACCTTATTATTTCATTGTTGAATACTTGGGCTTT
CTAATTAAGGGCTAACATAAATAATGTGGTTGTACATCCCTGTACACTTG
TTTTGAAGAACAGACGCATACCCTTGTCTAGTTTGGAGACTAGAATAACA
TTGGGAGGCATGGCCCATGTGTACTTTCTGGTTCTCCAGACACAGCCACA
GTGTTTTTCAGTGTGACAGAAAAACATTGCATGCCTGTAGTAACTTACCA
GAGTTTCTATTGTCACCCCCACCTCCCACTCCTTGCAACAACATTTGGTA
TTTTCGATTATTTAAATTTTTTTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTCTTA
GACAGGGTTTCTCTGTGTAGCCCTGGCTGTCCTGGAACTTACTCTGTAGT
CCAGGCTGGCCTTGAATTCAGAAATCCACCTGCCTCTGCCTCCCAAGTGC
TAGGATTAAAGGCGTGTGCCACCACTGCCCAGCCGGTTATTTAAATTTAG
TTAATCTAGTGGCTGCAGGCATATCTTGTTATAGTTTTATTTTTCATTTC
CACAATCACTAGAGATACTTGACTCCCTTTAAAAATTTTATTGATAATTT
TAATATTCTCTTGTGTGAAATGCCTGTCTAAACCTTTTTAGCCTATTTCC
CTTTTAACCATGAATTTGCAGAAATTCTTATATACTCTGCAAAAAATTAC
TTTGTAATTTGCCCAAGCAAATGGGTCCTTACTTTTTATTCTTTTATGGT
GTTTTGAAATGAATATGTTATCATCTTAATACAACTTAGATATTGATAAT
TTTCTTTTGCGGTACTTTAATGAGTGTTGTTGTTGTTGTTGGGGATGCAG
GATTACTCACTTTATTTTTTTGACTCTTTTATTCAATTCTTTTTTCTTCT
TTTCATATTTTTCTATACACTTATTTTACTTCTTTTTCTCTTCATCTTAT
CTTACATATTTTTACTCTTTTTCCTTCCATTTTTTCTTTTTTCTACTTTC
TTTTCTCTTCTTTCTCGCTATCTCCTATTTCTTTTTTCTTACTTTTTCTT
CTTTTTTCACCTTCGATTATTCTCTCTTCATTCATCTTCTCTTCTTTTTC
TATACATCATTCCNTAATACTATTCTATACTCCTATTTATTNTCTTTATA
CTTTCCTCTCTTATTT
| NCCCATATTCTTTNNAAGCATGGATGCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCTTTCTTATCCCCTGGGCGATG
AAGCGTGACCCAGCGAGCCCTGTTTCCCACTGACTTTGGAACTGCTCAGT
GTGGTTTAGCTCGCACTGTTATTTTTATGATCCCATGTCGTCTTGGAACA
GGAGTGATGTGTGTCATCTGTAAAGCAGAGTTGCAGGACTCAAATGCTCT
CGGGAGCCAGGAGGGTAAGATGAATGAACCAAGGCGGAGTGTCAGGACAT
GTGGCCGCAATCCCTCAGTCTTCAGGGGACTGACAGGAGATGTGCTTCTG
ACATCTCTCCTTGTGTATGCACGGTGTGCTACGGCTGAGGGTAGTTCAGC
AGAAAAGCACTTGCCTAATTTGCACAAGGCCCTGGTTGGTCTACAGGTCC
AATCAATCAGCCAACCAGTCAGTCAGTGATAACATAGAGAGGTTAATCCC
TATTCCACTTTACACAAGGCATCTCACAGAAATGCTGGTCTGGGCTTGCC
ACATCTTTAAGAGATCTCTGAAAGCTGCGTTTACATGTGAAGCCTCATAG
CTTAAAGACAACAGCAATAGCTCAAATTTCAATTTTCTGTGAGCCAACTA
AACCACCACCAGGTCAGAGGCATTATTTTAAAACACCCGCAGATGTGGTC
CTGAGGGTTGCTGTCAGCACATCAGAACTAGGAAGCGGGAGATGTCTCCC
CACCCTGCCACCTTAGTTTCCTGCAAAGCAGACTTACAATTCCCATTACT
GCGCCTCCATCTGAACGAACTCATTATGGGAAGACAGTTTTCTAGGTTGA
ATGCTCTGTGCGTTGTTTGCCCTTTTTTTTTTTTTCCCTATTATTTATCC
TCACCCTTAACCTAAATGTTCAGGTGGAAAAAAAGGGAATTTTAAAGGTT
CGGGTAAAATAACTTAACCCAGCACCATGCTTGCTTTCGAAATTATGTGC
TTGGCAAGAATAACTTTAAGTGCCTGTTCAAAATCCACCTTTGAAAGCTT
TGCCGGGGTAGTGGTTTCTTTCTCAGTACATCCTCTCCTCAATGCGAAAT
GTTTTATATATCTTTTTTCTTCATTTTACTAAAATTTTATATAAACGGCG
CGGTCCTCCCCTCCCTGGCTGAAATCCTGTGTTGTGTCGTTGTGTATTCT
CCATTTTGTTCCNACTGTTTCTCCTCCTCCTTCTCNCTACTATCATGTGA
TATTACTCCGTGCCTACCTGTACTTCCTCTATAAACGTGTCTGTTGTGCT
CTCTACACTCTTTGCCTAAATTTGATCACAACATCTCTTCTA
|
quality values | Open.Hide. 8 8 8 6 8 3 0 0 0 0 0 3 14 9 9 10 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 10 16 19 8 8 8 12 13 15 15 19 29 28 20 24 24 29 32 33 39 47 48 43
50 50 50 50 47 47 53 37 37 36 38 35 35 36 35 35 31 31 31 31 31 30 21 17 9 9 9 9 9 10 11 17 11 14 12 26 26 37 37 31 36 36 36 36 38 38 38 42 42 43
43 42 57 50 50 53 53 53 50 50 33 30 28 25 21 14 10 10 10 17 19 24 26 33 33 33 33 41 48 50 50 50 50 50 50 50 57 57 50 50 50 50 53 53 57 57 59 68 68 47
47 47 47 47 51 53 50 48 48 57 51 50 50 50 50 50 51 51 51 51 51 51 51 50 68 68 68 68 68 68 50 50 50 51 51 68 68 57 57 46 46 37 37 46 48 57 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 50 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 57 57 54 57 57 57 57 68 68 68 68
68 57 57 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 57 57 68 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 59 59 59 59 59 68 68 57 57 57 57 57 57 62 68 68 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 68 68 68 68 62 62 62
62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 62 62 62 62 54 62 62
68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 41 41 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 41 41 17
17 17 41 38 62 52 62 62 62 62 62 62 57 59 57 59 59 57 45 45 52 59 57 57 52 52 52 57 57 57 59 59 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 59 57 57 44 44 35 35 35
59 59 57 57 52 52 57 57 52 52 52 57 57 68 68 68 57 44 44 33 33 33 44 44 57 59 54 52 52 52 57 54 54 57 57 59 59 57 54 54 57 59 59 57 57 57 57 57 57 59
57 50 48 48 48 57 57 57 59 59 59 57 59 59 59 59 59 59 47 43 43 59 47 48 54 57 54 54 57 57 43 43 47 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 35 35
35 43 43 48 54 48 48 42 47 35 35 35 59 39 39 39 35 35 39 39 43 57 57 48 48 48 48 47 47 47 59 59 43 35 28 28 43 59 59 59 59 59 47 48 48 48 48 48 48 48
57 57 57 39 37 33 32 35 24 27 21 30 30 32 32 40 39 48 48 48 59 59 57 48 48 48 48 59 59 37 37 37 21 21 9 9 9 17 22 44 47 41 41 46 43 43 48 48 48 50
47 47 47 43 42 43 43 43 57 57 57 57 48 48 42 42 36 36 36 33 37 37 37 40 37 37 37 18 15 9 8 10 10 19 19 31 31 30 37 32 31 18 19 28 34 39 39 40 40 39
39 43 28 24 20 23 22 18 24 32 22 15 9 9 9 9 15 11 12 20 22 35 31 32 37 35 32 30 24 28 18 18 20 24 29 31 39 34 19 24 14 9 8 8 10 10 9 11 17 15
20 19 19 12 16 14 17 12 10 10 10 19 21 17 11 10 10 15 17 30 30 24 19 14 14 14 10 19 16 28 28 28 30 30 39 34 27 24 14 14 12 17 18 18 17 16 16 16 10 10
10 13 13 19 19 14 11 8 8 10 12 9 9 10 10 13 11 11 11 11 10 10 12 12 14 14 15 11 11 10 11 10 10 10 17 10 11 8 8 9 10 10 24 22 24 12 12 12 16 18
28 21 24 14 16 13 16 15 10 11 10 15 9 11 11 13 14 13 8 6 8 6 6 6 8 10 14 15 20 20 16 16 16 21 16 12 8 8 8 13 10 8 6 6 6 8 6 8 9 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 11 11 10 10 10 10 10 10 10 9 8 8 6 6 8 8 8 8 10 11 9 8 8 8 8 8 8 10 8 8 7 7 10 10 10 10 10 8 8 8
7 8 8 6 6 6 7 10 8 9 12 9 8 8 6 6 8 8 8 6 6 8 10 8 10 10 8 8 6 6 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8
8 8 8 8 8 8 9 8 8 10 12 13 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 9 9 11 10 9 8 8 8 8 8 8 10 8 13 8 8 8 8 8 8 8 8 10
8 8 10 11 13 10 10 8 8 8 6 10 6 6 8 8 8 8 8 8 6 6 7 6 8 8 8 10 8 8 10 8 10 10 10 10 7 6 6 6 6 6 8 8 8 13 10 10 8 8
7 7 8 9 12 12 9 9 7 8 8 8 10 8 8 8 8 10 14 15 13 13 8 8 8 6 6 8 8 12 10 10 10 10 9 9 10 10 12 8 9 12 10 13 10 9 9 8 8 6
6 8 8 8 8 8 8 6 6 8 6 6 3 0 3 10 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 12 7 6 8 8 8 8 8 7 7 13 10 13 11 3 0 3 6 8 8 8 8 8 8
6 6 8 8 10 10 13 10 10 10 10 7 7 8 10 7 | Open.Hide. 0 3 6 6 8 8 11 11 9 9 9 9 3 0 0 3 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 6 8 8 13 8 8 9 8 19 15 28 19 17 8 9 8 11 13 10 10
19 22 37 36 37 37 37 37 37 33 28 34 42 47 53 53 53 44 41 50 47 42 26 23 10 9 9 10 12 15 11 9 8 8 8 9 16 19 30 30 31 30 35 28 32 48 42 42 42 37
43 42 50 36 36 36 36 36 33 44 50 50 39 26 19 18 11 11 11 13 10 10 10 19 23 37 39 33 31 31 31 36 36 36 36 42 42 42 43 43 53 50 50 50 50 50 53 53 53 53
68 68 68 68 68 68 53 47 43 43 57 57 57 57 53 50 50 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 50 50 50 39 42 37 36 36 32 44 44 57 59 59
57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 59 59 57 57 57 59 59 59 57 54 54 54 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 52 57 57 57 57 57 57 57 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 57 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 44 44 43 43 43 43 43 52 52 52 62 52 52 52 62 62 52 52 52 52 62 62 62 62
52 52 52 62 62 62 44 43 31 29 26 35 20 20 15 27 24 24 35 44 47 62 62 62 62 62 62 43 43 35 35 43 44 43 52 57 57 57 57 52 52 57 57 57 57 57 57 57 59 59
59 59 57 57 57 57 57 57 43 39 26 38 21 27 27 41 27 33 33 38 38 52 57 52 43 43 35 32 38 32 32 32 43 32 38 27 33 33 38 38 33 33 35 59 43 52 52 52 52 52
57 57 57 59 52 48 48 57 57 46 43 43 50 50 57 59 57 57 48 48 48 57 59 59 57 57 57 44 44 35 37 35 42 42 42 42 39 39 46 57 42 32 27 18 18 30 34 32 32 17
17 17 30 32 48 54 57 42 42 35 39 39 46 48 57 57 54 57 57 57 48 48 48 48 57 48 48 48 48 48 43 37 37 30 30 37 41 59 48 46 46 43 46 37 37 31 28 21 15 10
9 9 17 19 29 22 22 16 21 19 23 23 21 23 20 22 22 37 32 36 28 24 18 15 12 12 21 34 37 36 32 32 30 39 39 43 39 43 43 31 34 28 17 17 22 22 28 32 23 31
23 28 23 23 23 28 33 30 28 28 20 24 28 25 24 23 23 22 20 31 20 19 21 24 28 36 39 37 39 28 28 28 30 25 22 25 25 28 19 18 19 17 17 17 19 13 15 13 18 17
17 21 26 15 15 9 8 8 8 8 19 15 8 8 8 8 11 15 19 15 24 18 18 11 11 10 10 10 10 17 12 14 16 13 13 11 11 11 11 16 13 13 16 16 20 14 14 14 16 18
19 25 23 22 28 28 22 16 14 14 14 14 11 17 15 9 9 10 17 17 28 37 28 22 15 15 12 10 10 10 10 10 15 10 10 10 10 10 14 13 26 29 28 24 19 23 25 15 15 15
16 13 12 11 11 10 10 10 12 10 11 11 12 10 10 10 12 12 17 22 22 21 24 15 24 21 19 13 12 8 8 8 8 8 10 12 22 21 25 21 12 8 8 8 10 10 12 11 13 11
13 10 8 8 8 8 10 10 12 15 10 11 12 12 17 11 10 10 9 9 9 11 9 10 8 8 8 8 10 13 24 20 12 10 9 11 10 8 8 10 10 10 8 9 12 16 20 12 10 10
9 9 9 9 9 11 12 12 11 9 11 8 10 10 8 8 8 11 11 10 12 9 9 10 10 11 11 12 12 12 21 13 9 8 8 8 8 8 15 16 34 20 17 15 15 11 11 12 12 13
14 13 9 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 9 10 9 9 9 10 10 9 9 9 10 8 8 8 9 9 12 12 8 8 8 8 8 8 9 9 8
8 8 8 8 8 10 10 10 7 8 8 10 8 8 12 10 10 9 8 8 8 8 8 8 9 11 12 10 10 11 12 12 11 10 10 10 10 10 10 10 11 10 11 11 12 12 11 11 11 11
10 8 8 8 8 9 10 10 6 6 6 6 8 10 11 8 8 6 6 6 6 6 6 7 8 9 8 8 7 9 10 15 10 11 11 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8
11 11 19 12 9 9 9 9 9 9 7 7 10 9 14 15 12 12 8 6 8 6 6 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 6 6 8 8 9 10 10 9 9 9 9
6 11 7 7 10 8 9 9 9 8 8 8 8 8 8 10 8 8 6 6 8 8 8 10 8 8 9 8 10 10 8 8 10 15 15 10 8 8 8 8 6 8 8 8 8 6 6 6 6 8
10 7 9 13 11 9 8 8 8 13 10 3 0 3 10 9 9 11 12 12 12 8 8 8 10 8 8 8 8 8 10 12 8 8 3 0 3 8 6 6 6 10 10 10 10 10 8 8 8 6
6 6 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 11 6 8 6 6 6 6 8 8 8 7 8 6 6 6 6 7 7 6 6 8 10 10 10 10 12 13 11 10 9 9 9 9 8 8 7 7 7
8 8 8 8 8 6 6 8 8 10 9 10 9 6 6 7 6 6 6 6 6 6 8 8 8 12 10 10 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 |