BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-146M18.T7 (MSMg01no146_m18.b1) | MSMg01-146M18.TJ (MSMg01no146_m18.g1) |
ACC | AG350238 | AG350239 |
length | 1,246 | 1,251 |
length of high quality (start - end) | 610 (143 - 752) | 541 (94 - 634) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no146_m18.b1 PHD_FILE: MSMg01no146_m18.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:09:00 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no146_m18.g1 PHD_FILE: MSMg01no146_m18.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:09:00 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | plural | no hit data |
---|
sequence | NCGATTCTTTNNNNNTGCAATGGGCGCTAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXCGCGGAATTCTCTTGACTCCCTACCACAATTAAAACTCCAAATCAGGA
GAGGCCTTTATATGTTATCCCTTCAACAAAGGGGATCCCGCGAAGCCTTA
GGAGAAGAGTGTTATTTTTATGTAAACCACTCATGCATAGTTAGGGAATC
CATAGCCCTACTCAGGAAAAGATTGCAGGAAAGGAAAATAGAAGAGTAAG
AGTCTCAAAAGTGGTATGTCTCTTTTAACTGCTCTCCTTGGTTGACCACC
TTAGTTTCAGGCATAACTATTCTCCTCATCATATTACTATTAATTCTGAC
ATGTGGACCTTATGCTTTAGTTAATCCTTTAGTCAGGTTTGTCAAAGAAC
ACATTTATTTTGTTCAACTAATGATTCTTAGACAACAATATCAGCTTATA
GGAACATCTCAAGGATTCAAGATGGGTCCTTCTTTTATGGGGAATGAAAG
GAATGAATTGGCCTTAGCCAGGGTGACTCCCTGACAGGTAGAAAACTAGG
AATTTAGGAAACCAGATCTGAGTTTTTACATTCCAGAACTGGACAAGTCA
TTTACTTGAACAACCATAGGCTTATGCAACCATGATCCATTCCCACCTGC
AAAAGGATAGTTAAAAGAGCTTGTGGCTAAGAGGTGAAGAACCACCCCCC
TTGACATGAAGCAAGAATAGTAAAATATGCTTGAAGCACGACCCTAACCA
ATTACACCAACTCCCAGAGATAGAACATGAATTCTAGATATGGATCACCC
ACTCCTCCCTAATATTCCCCCCTTTGACTTTAAAACTGAATCTGTAAATT
CATTTGGCGATCCTTCCATCCTGATGGAATTGGTTCCCTGCCTGCAGGAA
TTTGTTCAATAAATACTCCTGGGCTTTTGGCAATTACTTGAGTCTGGGGC
CATGAATCCTCGTGGATTCTTGGAATGTTAATTTAGTAATGCTCATTGTT
TTTTTCCCCCATTTTTTGGTTCCAAATATATTTTGGCTTTCCCTTTTTAA
TTTTGTCCTGCCTTAAATTTTTCTTTATTAAATTGCTCTTGTGACCCAAA
AAAAATCCTCTGTTTTTGTGTCAATTTCCTCTCTCCCCTTCTATTCTTAT
TAAGTTTTCCTCTCTTCTCTCTTTATTTATTTTCTTTTTTACTTTTCTCC
TTTTCCTATTTATCTTTCCTTTTTTATTTATTTTCTTTTTCTCTTT
| NCCCCGATCTTTTTTTTAAGAGGTGAGCCTGGGGXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCTCTTAGAGAACCTAGATCA
CTGGAGGGACAGGATACAGTCCCATACAGTAATGACAGGCCCCCCTAGAG
ATAACCAGATGGCGAGAGGCAAGAACAAGAACATAAGCAACAGAAAAGAA
GGTTACTTGGCAGCCACAAAGTGAGTTCTAGGACAGCCAGGGCTATACAG
AGAAACGTTGTCTCAGAAAAAAAAAGGGGGGGGGGAGAAGAAGAAGAAGA
AGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAG
AAGGTGGTTACTCGGCATCATCAAAAGCCAGTTCTCCCACCATAGCATGT
CCGGAATACCCCATTTTTCCACAATAACAATATTAGAATTTAAAATCACT
TATAATAATGACGATGATGATGGTAGAAGACTTGTAAATAACTCCCTTAA
TGAAAAATATGAGAACACAGATAAGCAGGTAGAAGCCTTATGGAAATATA
AAAATCCCTTAAAGAAATATAGGAAAACACAACCAAATAGGTGAAGGAAT
TAAACAAAACAATCCAGGATTTAAAAATGGAAATAGAAATAATAAAGAAA
TCAAAAAAGGGATACAATCCTGTAGATGAAAAACATAGGAAAGAGATCAG
GAGTCATAGATTAAGCATCACCCACAGATTACTTGAGATTAGAGAGAATA
TCTCTGGTGTCTAAGATACTACTGAAAACCCTGACTAATTTGTCTTAGAT
TATACAAATTGTATATATCTCCCTAACTGAATCTTTCAGTATATTCTGGA
TATTATTGAAAATACTAATCTAATGTTTCCATGTTTAACACGTTTACTAA
TCTGGTATTTCCTGAAAAATTGTCCAATTTTCTTTATCTATTCCTTTTGT
TCAATGTCTTTTTCTAATTTTCATTATTCTTCTACCCTACTTTCTTTCCT
CCTATGATATATTTTTTTCTCCTTATTTTTTTTCTTTTCCTTTATATATT
CCTCTACTCTTGCTCTTTTTTGTTAAATCTTTACTATCTTCTATGTGTTC
GTTTTCTCTTTTTTCCTCTCCTTCTTTCTCTTATTTATATTTTCATTTAT
TTTCATTTTCATTTCTCTATTACTCCTCTTCATTTTTTTCTCTTTCTTCT
CTTAGTCTTCTTTTCTTCCTTTATTTGACTCTTTTTTTTTTTACTTTCTT
T
|
quality values | Open.Hide. 0 3 8 8 8 8 8 9 10 3 0 0 0 0 0 3 9 7 6 8 6 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 15 19 19 9 8 8 12 15 16 24 25 42 40 34 37 34 42 42 42
48 50 53 53 57 57 57 57 43 43 42 42 42 36 36 36 36 31 31 39 37 33 33 33 21 17 8 8 6 6 6 7 8 8 10 11 9 9 9 9 9 9 12 28 33 43 42 50 50 44
44 53 53 53 53 57 38 36 36 31 31 31 30 28 22 21 10 10 10 13 13 8 8 8 8 9 11 11 12 12 23 15 21 30 23 23 8 8 8 8 8 10 8 19 27 47 37 39 44 44
53 53 59 59 59 59 59 59 57 57 53 47 47 47 47 47 47 47 47 47 47 47 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 53 50 48 47 57 57 57 59 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 48 57 57 59 59 59 59 59 59 68 68 59 59 57 57 57 57 57 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 54 54 54 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 44 48 43 39 39 47 59 59 68 53 50 48 48 48 53 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 29 29 18 20 18 14 14 12 12 11 24 22 40 59 59 59 39 40 40 44 44 53 50 57 43 43 28 28 28 43 43 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 59 59 43 37
37 39 39 39 35 37 37 39 44 44 44 35 35 44 44 44 48 37 37 35 42 42 43 47 57 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 43
44 44 59 59 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 59 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 38 38 14 14 14 38 38 52 52 59 59 59 52 52 52 57 57 68 68 68 57 59 57
57 38 38 18 18 12 38 38 20 20 23 44 44 68 68 44 44 35 32 32 44 44 57 57 59 59 59 59 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 48 48 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 54 57 57 32 32 12 12 12 23 21 10 10 10 21 21 43 19 21 10 10 10 13 19 33 37 39 39 36 43 59 57 48 31 23 12 11 11 21 25 37
30 28 32 37 43 43 41 41 41 41 59 39 39 31 31 37 39 47 47 47 59 59 48 47 43 37 37 33 41 37 33 33 33 33 40 39 39 36 43 43 42 39 35 35 35 42 42 57 57 57
57 57 40 39 35 35 39 37 39 30 39 39 36 36 36 39 39 39 39 35 37 37 32 21 25 21 24 31 39 37 37 39 37 37 30 24 19 10 10 13 10 10 10 19 21 34 34 28 23 16
18 19 22 19 18 11 10 11 16 18 23 33 34 29 32 27 23 11 12 12 25 22 15 10 10 9 9 9 9 9 9 9 9 11 11 15 15 19 12 12 12 25 21 25 18 21 10 10 10 21
21 28 19 14 14 19 17 17 24 16 14 14 16 17 28 37 48 48 37 37 30 35 35 37 30 19 18 19 19 9 9 10 22 23 13 13 10 15 8 9 10 10 13 10 19 22 21 21 19 22
18 18 18 17 19 11 9 10 8 9 10 16 25 26 12 12 11 11 11 14 19 24 30 32 27 9 9 9 9 16 17 12 12 10 11 13 24 22 22 10 8 8 8 8 12 14 11 9 9 9
9 8 10 8 8 8 11 8 9 11 17 15 10 12 19 16 10 8 8 8 8 8 15 9 10 11 14 23 11 9 9 9 8 10 12 12 12 10 8 8 8 8 8 7 10 9 9 9 9 9
8 10 8 8 8 13 8 8 8 8 9 8 8 9 9 10 10 10 10 12 12 14 14 12 10 10 9 9 8 8 9 9 9 8 8 8 8 10 10 10 6 6 6 6 6 6 8 8 8 9
10 10 10 12 17 13 12 8 8 6 6 6 8 12 10 10 12 10 9 9 14 9 9 6 9 6 6 6 8 8 8 9 16 14 10 10 8 8 8 10 9 12 12 12 15 10 8 8 8 8
9 15 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 13 9 9 9 11 10 16 18 14 10 10 8 8 10 14 15 15 13 11 11 11 11 11 11 11 12
15 24 18 12 11 10 8 8 8 9 13 9 11 11 10 19 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 8 8 7 6 8 6 6 8 10 8 6 6 8 6 6 6 6 8 6 6 8 7 6
8 8 8 9 9 15 9 9 9 10 13 10 10 11 8 8 6 6 10 6 6 8 11 13 16 10 15 9 9 9 19 16 18 16 15 10 10 11 15 9 9 9 8 9 8 12 7 7 8 8
10 13 13 13 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 6 7 6 6 6 6 8 10 11 8 6 6 8 8 10 12 12 15 7 9 9 7 10 8 6 6 6 6 10 6 6 6 | Open.Hide. 0 3 6 6 6 8 8 8 8 7 8 12 25 27 29 21 17 9 9 7 6 6 6 6 6 6 9 6 6 6 6 6 6 8 11 11 7 6 6 6 8 7 8 12 11 15 8 9 9 23
19 28 24 24 28 30 32 35 35 37 37 37 35 35 36 38 38 53 53 44 44 39 37 42 47 23 19 9 7 8 7 8 7 8 7 7 7 9 8 8 8 8 10 19 15 33 33 50 44 36
36 50 50 50 53 57 42 53 53 53 36 36 31 31 31 31 28 25 23 23 10 13 13 11 13 13 25 25 33 33 33 28 36 39 39 39 39 23 23 11 11 12 12 12 13 17 10 21 27 41
50 50 50 53 50 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 57 57 59 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 68 68 68 59 59 59 59 68 59 59 68 68 59 59 57 57 57 59 59
57 57 57 59 52 52 52 52 52 52 59 59 59 59 59 59 59 68 59 59 59 59 59 59 54 54 54 59 59 59 59 57 57 57 57 57 48 42 42 35 35 35 28 28 28 42 42 47 47 47
57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 59 57 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 48 48 48 57 57 57 57 59 59 59 40 40 43 59 59
59 59 57 48 48 48 59 59 37 30 25 12 10 10 10 10 11 10 10 10 11 18 31 41 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 48 47 47 53 47 47 47 48 48 48 48 57 48 48 48 59
59 59 59 59 59 59 57 37 37 31 31 20 20 20 20 28 31 39 39 39 44 40 39 31 31 30 32 30 30 35 47 44 57 47 43 43 43 47 47 47 47 48 48 48 48 54 59 47 43 43
44 57 43 43 37 57 57 57 57 57 50 50 37 37 43 43 52 52 52 52 52 57 57 43 43 39 43 43 43 50 52 52 52 52 52 52 57 57 57 57 57 52 43 43 52 52 52 50 43 39
39 39 39 43 59 59 57 57 44 44 33 33 33 43 43 52 52 52 50 50 43 37 37 32 32 32 43 35 35 33 31 31 31 33 36 36 36 29 33 33 37 42 42 37 37 35 42 37 47 42
42 30 32 17 17 17 18 20 20 25 28 28 28 40 36 37 32 31 31 41 30 29 30 24 24 20 24 24 31 31 28 15 15 18 15 20 20 20 20 16 13 12 13 10 10 12 11 15 11 19
12 12 11 12 11 12 12 15 26 17 18 18 23 23 18 18 11 21 16 18 19 17 17 12 12 18 28 28 13 13 12 16 12 16 16 19 21 24 22 30 17 17 23 18 20 18 24 19 19 29
22 17 15 15 12 12 18 19 13 14 28 30 15 17 17 18 16 12 10 9 8 8 8 8 8 10 9 10 10 9 15 9 9 9 10 12 10 10 11 9 8 8 9 9 8 8 9 8 8 8
8 12 12 11 12 12 8 8 7 7 10 8 8 8 8 9 16 16 21 11 10 8 8 10 8 8 10 10 9 9 9 11 12 12 12 11 12 10 8 8 8 8 8 8 10 11 9 9 9 9
9 15 19 19 12 11 11 11 12 16 9 8 8 8 8 8 10 10 17 10 12 8 11 10 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 6 7 10 10 10 10 10 8 8 9 8 8 8 8 8 10
15 9 9 9 13 10 15 10 10 13 10 10 11 9 8 8 8 8 10 11 8 9 10 8 8 8 8 12 8 8 6 7 8 8 15 8 8 6 8 6 7 8 7 8 10 10 9 9 10 8
8 8 8 8 9 10 10 12 12 10 9 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 10 8 8 8 8 16 28 18 15 10 8 8 10 8 11 7 7 8 8 8 10 10 16 10 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 9 9 9 11 10 10 10 10 15 15 12 16 15 12 10 10 8 8 6 7 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 6 6 8 8 10 8 8 8 8 8 7 6
8 8 11 10 9 9 8 8 8 6 7 8 8 9 8 8 10 7 7 7 7 8 8 8 10 10 10 8 12 12 12 8 8 8 10 12 13 7 7 10 8 10 8 8 6 6 8 8 8 6
6 10 8 10 8 8 8 8 6 6 8 8 6 6 8 8 21 21 19 20 11 11 11 13 8 8 8 8 8 10 10 6 6 8 8 8 8 13 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 10 9
9 9 8 8 8 8 8 8 11 17 15 14 11 13 12 10 8 8 6 6 6 8 7 7 8 8 8 10 10 11 15 8 8 8 10 8 13 11 11 11 11 13 8 8 8 8 10 8 10 10
10 9 8 8 6 7 8 12 8 6 6 8 12 6 6 6 7 10 7 7 8 8 9 8 8 6 7 8 8 8 8 8 8 10 12 12 23 14 11 8 8 8 8 13 21 10 8 8 8 8
8 8 8 7 8 8 10 8 12 7 7 8 8 9 11 11 9 12 11 11 12 10 10 8 10 8 8 6 6 8 8 10 6 6 7 7 6 8 10 13 7 6 6 6 8 8 10 12 10 8
8 |