BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-161N08.T7 (MSMg01no161_n08.b1) | MSMg01-161N08.TJ (MSMg01no161_n08.g1) |
ACC | AG361136 | AG361137 |
length | 1,254 | 1,269 |
length of high quality (start - end) | 320 (77 - 396) | 381 (70 - 450) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no161_n08.b1 PHD_FILE: MSMg01no161_n08.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:28:53 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no161_n08.g1 PHD_FILE: MSMg01no161_n08.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:28:54 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | NNGGCGCATTGCGGCCTATAGACTCCATAGGGAGAGGATCCGCGGAATTC
ATTCAAACTATATGGCATACCATTCAATTATATTTTTACCTCTTGTTCCT
TTTTCTGTTTGTTTGTTTTTGTTTGTTTGCCCGTTTTTTGAGACAGGGTT
TCTTTGTTTATCTCTGGCTGTTCTGGAACTCACTCTGTAAACCAGGCTGG
CCTCGAACTCAGAAATCCACCTGCCTCTGCCTCCCAAGTGCTGGGATTAA
AGGCGTGCACCACCACGACCGGCCCTGTTGTTCTTGATACAGCTCTTACT
ATATAGCCCTGACTGGCCTAGAACTAGATAGATCAGGCTGGTCTTCAGCT
CACAGAAATCTGCCTGGTTAAGCCTTGGAAGTGCTATGTTTAAGAACATT
TGTTCCAAATAAGTCCTGCTTAAATAATTTGTCAATCTATGTATATGTTT
TTATTTCCCCCCCCCCCGGGTTTTAAAGAGTCCGACAAAAAAGGAATGTA
AAGCAGGATTATTTCTCATAGTTCTTTCTCTAAGATATCAATTACTCTCA
TTCTAAGGGACTATGATAAGATTAAAATAACACTCTTTAGTGCCTAAACA
AGGATAAAGGGCAATGAAACTATAAAAATGGACGTTTATTTACCTCAATA
AACACAAAGAAAAAATGTGTACAAGTTCACAGGTAGCTGAATGCTTATGC
ATTTCAATATGATATGAGATGGAGATCACCAGTGTTCATTCTCAGGCTAG
GAAACAAAGAAGCAAACTATGTTTCCTTATATGGAAAAACAGTGTTAGTA
CCAATAACATCCTTATTTCTTAAAATTTCTATGAAAGCAAATGACATAAT
ACTGTGGCTTTCAATTCAGTGCTTACAGTTAATAAATATGCAATGAGTGT
TAATTTTTGTAATGAACAGTGACATACAAAAGTACTTAAATTCTCCCTTA
AAAACCAATTGCCTAGCCTTTTAAAACCTGCTGGCCTTTTCCCTTAAATT
TACATCAATTCCGGACTTTTTTTCTCCCGTTTAACTAATAATAAAAATTT
CCTTTTTTTGTCTTATCAAATTAATTTTGAACTTTTCTTTTACATCTTCT
TCCTCTAATATTCTTTTTTTAACATTCTATCATCACCTGTTCTTGTCTTT
TTCCCTTTTTTTACACATTTTTTTATACATCCACCTAATCTTTTCTCTAA
CTGCTCCTCTCTCTTCCCATCACCTAATTAAAATCTTCTCCTCATCCTCT
TCCC
| NNTTTTTCATGGTAGCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXTCATTATTGACAGAATTGTAATACCACTTTT
TGATGATTCTAGGTCCTTATGATTTAATGTAAATTTTTATTCCTATTTAT
TTTTTGTTTTCCATCATAGAAACTGTTGAATATTTCATTAATGCTCGATA
GATATACTGACCCTTACAATTGATTTTTCTTTTTTTGTTTCTAAACCAAA
CATCTCTTGTTGTGGATATTAAGAGAAAATGATTGAATGACTTTGATTTC
CAATTTTCCAAGCATTTTCAAATTTCCTCCACCCAGTCACCCATTAGCCT
GGGAGTATCCTTTAGACATGGATGTGATCTCATTTATCACTATACACATG
GTACCAGCAGTTTAGTTAATTACTAAATACTGGTTTGGTGAATGTTCTTT
TTTTTTCCCCCCCCCCCCAAATATTTAACATCCAAATAAAAAAAAAGTCT
GTGACTCTGAATAAACTGCAGTTTCCCATCCCATGCCTTAGGTAGAACAT
TCGAGAAAATGTAGACCAAGTTTTCCAAGATAGCATGAATTGGATTAACA
TTATTGTTTCTGGGAAAGTGGAACAGGGTGAGAAGAATAGTTCTTAAATC
ATATATATCCTTTATACTTCCCAAAATTCTCACACAGGAAGGCAGCAAAC
ATCAGAAGAAAATTGTGGTTTAGAGTCAGACAACTACTTTTAAATGGTGA
CATTTATTAACCAACTGAAAATTCTCCACAAAAAAGTCTGGTTAGATGAA
AGGGAAACTGTCTTTTGCTTGCCTGTGGTAGTGNCAGTGTCAGGCCTTGC
TGGCTGACAGAGGACTACGCAGCCTTTGTTCCCTTTCCATGGTCCAAATG
TCTAACTTCATTGCCTCCTAGGCAAAACAGAAGTCAAACCCTTTGTGAGT
AAAAGAAAATTTTCTGGGGGAAATTTCCTTCCTGGGCAAATTCTCTTATT
GGTTTCAATTTGAAAAATAACTCCCCCCCGCCAAGAGTTCTCAAAAAATT
TTTTTTCTCCACACAATATTTTTTTTCAAAAACCTCTTTTGGTTTTTTGT
TAAAAAAGCCCTTTTCCCTTATTAAATGGGTTTTTTCTCCCTCCTCACCC
CCCCACAAAAAGTTTTTCTTCATCGTAATTAAAAAAATTTAAGGTCCCCC
TCTTCTCTTTCTTTTATTCTTTGTTGGTACTTCTTCACTCTTATAATGTG
TTATACTCTTAGTCCTTAA
|
quality values | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 9 7 8 8 8 10 9 8 8 8 15 12 10 8 8 11 13 8 8 8 8 8 17 19 42 39 34 37 37 33 33 40 29 29 28 33 33 28 28 36 43 37 42 34
34 29 29 22 22 22 24 29 29 36 36 31 33 34 25 16 9 8 8 8 8 8 10 11 11 15 18 21 28 30 37 41 41 47 53 53 53 42 42 38 43 39 33 33 34 34 37 37 48 48
57 50 48 53 50 48 43 37 25 29 31 33 31 37 43 48 48 57 48 48 48 48 47 50 47 43 29 17 10 10 10 10 12 13 26 30 59 59 59 59 48 48 48 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 48 50 48 50 43 51 43 48 48 57 57 50 50 68 68 50 50 57 57 54 57 57 57 57 46 46 43 43 43 39 39 39 39 57 57 57 59 59 57 57 48 48 48 57 57
48 44 57 44 44 48 57 57 57 57 43 43 43 59 59 57 57 57 57 54 57 57 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 54 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57
57 59 59 59 59 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 54 54 57 57 57 68 68 68
68 68 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 57 59 57 57 57 57 44 43 43 43 43 41 41 41 50 50 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 57 57 59 57 57 57 43 43 52
57 57 57 54 57 57 50 50 43 50 50 57 47 48 57 59 59 59 59 59 59 59 54 57 57 57 48 57 57 57 48 57 48 48 48 59 59 59 68 68 59 59 36 24 16 12 12 12 11 12
12 13 13 18 18 18 18 24 28 41 41 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 48 59 59 59 59 59 59 59 59 59 48 47 47 35 35 39 41 22 22 11
8 7 7 9 12 17 18 18 18 16 16 11 9 8 8 10 9 17 12 30 41 59 59 59 59 47 39 37 28 28 20 23 20 20 20 11 11 12 16 17 17 11 10 10 11 12 12 11 12 12
18 28 30 47 47 48 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 48 48 48 48 59 59 59 59 59 59 54 47 47 41 41 48 59 59 59 59 68 59 59 59 59 54 54 57 57 59 59
59 68 68 59 59 59 59 59 57 47 59 43 54 54 57 57 57 57 57 48 48 57 57 48 57 48 44 57 43 43 42 47 35 42 42 47 44 59 47 48 48 48 57 57 57 47 46 43 43 44
57 57 57 57 57 57 54 46 40 36 30 30 30 44 44 43 43 37 37 37 43 44 48 48 59 48 54 57 57 43 43 43 43 43 48 59 59 59 59 57 48 47 42 34 34 33 32 35 59 37
37 39 37 37 32 30 30 30 37 32 27 28 32 37 37 39 39 35 33 32 24 20 20 20 28 21 25 11 11 11 23 23 30 14 13 13 13 22 25 29 29 30 34 28 30 33 34 30 33 33
33 33 39 34 31 20 20 28 34 37 28 28 22 22 19 30 30 23 23 32 19 18 16 16 11 16 12 19 13 14 10 10 16 16 20 20 15 13 8 8 10 13 12 12 16 10 13 13 13 21
24 30 29 29 20 15 10 10 10 10 13 11 11 15 15 32 32 37 33 33 33 30 30 25 25 23 19 8 8 8 15 13 9 9 9 8 8 8 8 9 10 8 8 8 10 17 19 15 12 8
8 8 8 9 9 11 15 30 25 22 21 21 20 23 20 23 30 18 10 10 8 8 9 11 8 9 10 14 12 16 12 12 12 15 15 15 15 12 14 13 24 8 8 8 8 8 10 10 15 12
18 18 19 9 9 8 8 13 13 13 12 10 12 12 21 16 11 11 11 14 11 15 15 12 10 10 16 16 21 21 12 12 14 11 13 15 15 19 22 19 15 13 13 13 12 10 10 9 8 13
10 10 9 9 9 9 17 15 9 8 9 10 10 10 8 8 6 6 6 6 8 10 8 9 9 10 10 12 9 9 9 7 8 8 10 10 12 10 10 11 14 13 8 8 8 8 8 8 8 8
8 15 8 8 8 8 8 8 10 10 11 11 11 13 11 11 11 13 15 13 10 10 10 17 9 9 8 10 10 8 9 9 10 10 17 15 11 10 9 9 11 12 12 11 11 12 19 18 11 10
7 6 8 8 8 8 8 10 8 11 10 13 9 9 10 10 10 8 10 10 11 10 9 8 8 8 8 8 8 10 13 8 9 9 9 9 6 6 7 7 8 8 10 11 10 16 11 9 9 9
9 9 8 11 13 9 9 8 8 10 8 8 6 6 6 8 8 8 10 10 11 15 12 11 11 15 16 11 8 8 6 6 8 8 9 9 9 9 9 6 6 7 6 8 8 15 13 10 8 8
8 8 8 8 8 8 10 8 8 6 6 8 6 7 6 8 8 11 13 11 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 12 12 8 10 8 8 8 6 6 8 13
17 23 18 19 12 12 9 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 10 13 12 16 16 10 10 10 8 8 7 9 12 12 11 8 8 8 8 8 8 13 7 7 8 8 11 10 8 8 8 8 8
8 9 9 9 8 8 8 8 8 8 15 11 9 12 12 19 10 10 8 8 9 9 10 10 8 8 8 11 12 11 11 11 8 6 6 6 8 8 8 10 8 9 9 9 9 8 8 12 12 8
8 8 8 8 | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 6 6 6 7 7 6 6 6 6 8 7 7 8 9 9 9 15 12 9 9 9 16 12 19 19 19 9 10 10 21 19 29 17 28 18 29 34 36 36 37 37 37 37 42
40 40 42 43 43 48 57 43 57 43 34 33 40 40 46 34 34 47 47 47 41 41 41 48 48 48 48 48 48 48 47 47 47 57 48 54 54 48 47 23 23 11 11 11 23 23 43 48 57 57
57 57 48 48 48 48 47 36 36 37 34 37 37 47 42 42 38 38 36 47 37 48 33 33 33 30 22 15 12 11 11 12 12 21 29 34 37 37 37 37 36 36 36 36 42 42 42 43 47 53
53 59 59 48 48 48 59 48 48 57 48 48 47 47 42 31 31 25 25 28 41 34 47 47 47 57 48 48 48 54 54 54 57 57 57 57 57 54 57 47 47 47 47 47 47 48 48 44 57 43
43 43 57 57 57 57 48 48 48 57 59 54 57 57 57 57 57 57 57 57 50 57 54 59 59 59 57 57 57 59 59 68 59 59 57 57 52 59 52 57 52 52 52 57 57 57 59 59 59 57
54 52 52 52 57 57 57 57 52 57 57 43 43 39 39 39 57 57 57 57 57 43 43 43 52 52 59 59 57 57 57 59 57 57 57 57 54 52 57 52 52 52 59 57 57 57 59 57 57 54
57 57 68 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 59 57 57 48 48 44 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 46 48 41 41 20 41 28 41 41
32 37 37 36 42 42 43 47 43 48 48 34 34 28 30 30 42 42 43 40 43 43 48 43 48 48 57 57 57 57 48 59 59 59 59 59 59 59 59 48 47 47 59 30 21 12 11 12 12 11
11 11 15 25 32 47 59 59 59 59 59 39 47 35 59 47 59 59 59 48 48 48 48 48 59 57 47 43 47 39 39 35 59 59 43 47 37 37 35 35 37 37 41 23 17 8 8 8 8 9
20 27 24 24 16 16 16 18 20 30 37 24 21 18 14 10 10 11 33 33 59 59 59 59 47 28 18 11 11 11 16 19 20 15 12 9 9 9 19 15 10 8 8 9 14 9 10 10 16 22
15 32 32 46 46 48 59 59 59 48 59 59 59 59 39 36 43 40 43 44 43 59 39 47 48 59 59 57 57 57 59 57 54 54 54 48 48 40 40 26 44 44 44 37 37 37 44 44 54 57
57 44 44 43 44 44 48 44 47 47 32 32 32 36 26 44 44 59 59 59 59 59 57 57 48 43 44 43 43 42 42 42 57 57 54 57 57 57 57 46 57 43 46 46 57 57 57 57 57 57
57 57 57 54 54 48 59 48 48 43 40 40 34 43 43 43 43 43 43 36 47 39 43 43 43 43 48 48 37 37 32 30 30 30 30 30 30 30 28 34 21 28 24 28 28 31 31 41 39 39
39 41 41 41 48 48 48 48 59 57 57 43 43 36 36 36 39 47 41 37 37 32 31 31 37 43 43 41 39 39 35 39 32 37 37 41 41 37 31 31 37 37 37 41 41 39 34 30 25 30
28 22 18 11 12 12 14 15 18 33 32 39 39 39 35 35 25 32 32 21 29 12 12 12 24 24 32 23 23 23 23 21 14 18 18 34 34 59 44 23 14 14 12 12 13 11 10 10 10 16
22 37 39 39 39 41 39 32 26 26 22 25 23 25 25 34 34 32 32 29 32 30 30 28 27 22 22 28 32 37 39 41 40 47 28 28 14 18 22 18 19 18 18 18 20 23 34 34 30 27
27 27 12 10 10 13 14 18 30 33 28 28 24 29 32 32 41 37 37 37 35 31 25 24 22 15 12 12 17 24 16 16 3 0 3 17 17 18 11 16 17 18 13 17 11 9 10 10 8 8
8 8 8 8 14 17 16 9 9 9 8 11 8 8 10 10 15 9 10 8 8 9 8 9 13 18 25 25 28 27 24 17 17 20 20 14 11 9 13 13 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8
8 8 8 8 9 10 10 14 9 8 8 8 10 15 15 19 12 9 9 10 8 8 9 9 10 10 10 15 13 12 11 11 11 11 13 13 12 13 15 18 15 15 10 8 8 8 8 10 11 16
18 17 23 10 10 10 10 9 11 10 9 9 9 10 12 10 9 8 8 9 9 9 8 9 12 9 10 10 10 8 8 7 6 6 6 9 10 10 9 9 9 9 8 8 8 8 8 10 17 11
10 11 10 11 15 11 10 8 16 15 12 12 12 22 25 15 12 8 8 8 8 8 8 9 16 19 15 13 11 9 9 9 8 8 8 8 8 12 15 12 11 11 12 23 14 17 16 15 11 14
16 19 22 21 21 10 9 9 9 8 6 6 6 6 8 6 6 8 10 10 8 8 10 10 9 10 16 12 9 9 8 8 8 8 6 6 6 12 10 11 16 21 19 14 14 12 12 12 11 11
13 17 18 24 28 22 12 11 9 9 12 10 12 9 11 11 13 10 8 8 6 6 8 8 10 10 10 10 10 10 10 11 17 14 15 9 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 10 26 26
39 35 18 17 11 11 9 13 9 8 8 8 12 15 20 13 14 11 10 8 8 6 6 6 6 8 8 7 8 8 10 9 9 19 17 13 6 6 8 8 13 9 8 8 10 10 10 11 12 16
10 9 8 7 7 7 10 8 10 6 7 7 8 8 8 6 6 8 8 8 10 8 8 8 10 10 10 10 15 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 11 13 7 6 8 8 10 8 8
7 8 8 8 10 8 8 12 13 10 6 6 6 6 8 10 14 15 14 |