BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-173B23.T7 (MSMg01no173_b23.b1) | MSMg01-173B23.TJ (MSMg01no173_b23.g1) |
ACC | AG368826 | AG368827 |
length | 714 | 748 |
length of high quality (start - end) | 320 (46 - 365) | 291 (75 - 365) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no173_b23.b1 PHD_FILE: MSMg01no173_b23.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:43:44 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no173_b23.g1 PHD_FILE: MSMg01no173_b23.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:43:44 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | plural | no hit data |
---|
sequence | CTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGG
AATTCCTTCCTGGTTTGCAGATCCATCTCTTGTATTTGTACACCAATCTG
TTAGAGAGAAATAAAGGGAAAGGTACATACACACACCACACACAATACAC
ATACATAAATACACATATCTCACAAATATACACTACACATAGATGACAGA
GCACATAGAGGTTCTTCTCTATTTCTATGTACAAGGGATTCACTGCAATG
CTTATGACCCAGTTACGTCCCAAAGCCCATATCACACCAGGGAATGGAGT
TTCAGTGTGAAGTGGGCTGGAACAGGGATAGCACATTTCCATCCCAATAG
CAGATCTTATAGGAAATTTGTACACACCCCCGCTCTGAGAAAGTAAGCAA
AGTAGCTGGATAGCTGTTCAATATGCAGCAGTCAGATGTTTTTCTATATA
GCAGAGAGAACTCTATGTTAATGTCATTTGACTGGGTGTAATAGTACATT
TATTTTTGCTTTCCAAAGCATTGTTTGTTTTGTTTTGTTTGTAAGTTTTT
CATAGAATACTTTATTCATATTCTTTCACTTCCTCCTCATTTTCCCAGAA
TTCTCCCTCACTACATATTTACTTATATATATTTACCTTACAGAACACAA
AACCAATCCACATAAATTATAGTGGTCTAGTGGCCATAATTGTAAAACAT
GACTTGCATTTAAA
| ACGATGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTGGGATATTTCAGAGAATACATAAA
TGCTAGTTCCCTGGAAGATTGGCCCGTTGTCCTTTGATCTTGGTTTTTAT
CGCTTGCTGTGTTTGAGCTTTGATCAGTAGTTATGTGCATAGAAGACAGA
AAAAAACAAAATAAGATATATTGACAGAGAAGATGAAATATCCCCAAGGC
ACTCAACACCCCCCCAATCAGCAGACAGTACACTTATAATAACGACTCTC
CATTTCCCATGTATGCTTTTCTCCCCACTCATAACAACAGTTAGGGGATA
GAATGAGTGGACTTTTTTGTTACAGACCCCTGCAAGAAAGACGAACATAT
AAAGTAGCTTAGGTCTAGCTACAGACAGTAAGAGGAAATCTCTAGAAAGA
GTCTGGAGGGGTTGACAGGCAGGGCAGAGGGGAGAGTGGTCCTGAGGTGT
CTACATGAAGCTCACAGACCATCAGTCCATGATGGCAGAGAGGCCAGTAA
GGATCAGTGAGGCTCCATGGACATACATTTCTGAGTTGGTGGGGACACAG
GAGAAGCTCAGAGGAGATCATCTGTCCTCTGTTCAGGTGCTTGCTTTTGT
CTGTGCTGAGCTGATATGAAAAAGGTGATGAGAACTTGAGCCTCACATCA
GGGCCTGAGACTCCTCTGCTCTGAGGAAGCAGGTATCACCTGACAGCC
|
quality values | Open.Hide. 8 8 8 8 8 8 13 16 30 37 29 27 28 22 22 30 37 30 30 33 37 37 44 47 48 35 30 30 32 32 36 47 53 53 57 57 57 57 57 57 42 42 28 29 29 36 37 39 43 42
51 43 43 54 54 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 48 59 59 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 47 50 50 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 50 50 50 50 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 57 57 52 52 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 62 62 62 62 57 57 57 57 68 68 68 59 59
57 57 57 59 59 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 59 59 68 68 68 68 57 57 48 48 48 50 57 68 59 59 59
59 59 59 59 54 54 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 59 59 47 39 32 32 32 42 42 42 59 59 68 68 59 59 53 50 48 47 47 50 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 32 24 15 12 11 11 12 11 13 10 9 10 9 10 10 11 12 14 12 12 9 10 10 10 11 15 15 12 24 41 47 50 50 50 48 50 59 59 59 59
59 57 53 53 53 53 53 53 57 59 59 59 59 59 59 57 57 59 43 43 43 59 59 47 34 34 23 18 18 12 11 11 11 15 12 12 15 21 24 37 41 59 59 59 59 48 48 48 39 39
35 35 35 39 47 47 57 57 57 57 50 54 54 54 48 48 48 48 48 48 48 57 59 59 43 43 43 59 59 59 59 59 59 57 59 59 57 57 59 59 54 44 44 30 30 30 44 44 68 54
57 57 57 59 59 59 68 59 59 57 57 42 42 32 32 32 37 47 48 48 47 47 43 43 47 59 48 47 46 39 39 30 30 30 32 32 25 22 22 34 28 37 37 59 59 59 59 48 40 40
40 34 34 23 23 18 18 23 28 34 39 40 37 37 37 37 47 48 48 57 59 59 59 50 30 29 28 20 18 23 29 32 28 32 19 7 8 6 6 8 13 21 41 41 41 39 39 32 25 27
28 28 30 39 32 34 28 30 28 32 29 29 21 15 10 10 9 10 10 10 23 23 43 39 37 37 28 28 18 18 11 10 10 15 15 19 18 13 12 9 9 9 23 17 28 21 21 13 24 24
22 20 9 10 10 10 15 12 14 15 15 34 28 32 16 12 11 10 16 19 19 14 12 12 11 11 11 12 12 11 12 11 11 12 8 8 8 8 8 9 12 12 19 24 16 16 14 14 17 13
21 14 14 12 12 12 11 11 8 9 7 7 7 7 | Open.Hide. 6 6 6 7 8 8 8 8 8 13 15 12 10 10 10 21 30 42 50 50 50 53 53 57 57 57 57 57 57 57 57 44 43 39 39 39 23 21 10 10 10 21 21 32 32 32 43 43 54 54
54 54 54 54 54 54 54 57 57 48 50 41 36 41 41 41 41 41 26 41 42 46 50 48 57 57 57 50 50 47 50 50 51 53 53 53 48 48 48 47 51 47 47 50 50 50 50 53 50 47
47 50 53 57 59 59 59 59 59 59 57 53 50 48 28 25 12 11 15 15 16 13 9 10 9 10 10 23 30 41 46 46 59 59 41 47 53 53 53 50 57 59 59 59 59 59 50 50 50 53
50 50 59 59 59 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 50 53 57 68 57 59 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 50 50 50 50 50 50 57 57 57 57 57 68 57 57 59 59 59 59 59 59
57 59 59 52 52 52 52 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 59 54 57 57 57 57 57 57 59 59 43 43 36 41 32 33 37 39 43 57 57 57 68 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57
57 48 48 48 48 59 59 41 25 15 11 16 9 11 11 16 11 12 12 12 23 18 11 11 11 11 11 11 12 11 11 11 11 15 12 18 28 41 41 50 50 50 53 50 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 59 57 57 59 59 59 59 43 43 47 47 59 59 50 50 48 48 46 40 40 32 28 21 13 12 12 12 12 12 11 12 12 30 30 48 48 48 47 47 59 59 48 48 48 48 48
59 48 48 59 57 59 59 47 43 39 39 39 43 43 54 46 42 37 30 30 41 41 35 32 32 42 42 43 43 43 43 43 43 46 46 57 44 42 35 35 35 44 44 68 68 68 68 59 59 59
59 59 59 54 54 57 59 59 54 48 48 48 57 57 57 57 59 59 59 57 59 59 57 43 43 43 44 46 47 48 57 44 42 32 30 37 37 43 43 43 43 46 37 37 37 39 37 37 37 44
42 47 47 42 42 32 35 35 42 59 59 54 48 47 48 43 43 43 40 47 42 47 47 57 46 46 46 46 59 48 48 47 47 46 46 40 47 37 36 35 28 28 18 18 18 30 32 41 41 32
32 23 23 23 23 23 28 26 28 23 28 28 37 37 43 43 43 57 57 57 43 43 42 35 35 42 47 47 47 47 43 43 48 46 43 43 36 39 43 43 43 48 39 42 42 48 42 34 22 22
22 29 33 39 30 39 28 28 11 11 11 23 20 23 21 21 18 19 15 15 13 15 26 18 20 18 18 19 23 23 14 14 8 13 8 8 8 15 14 23 20 28 22 18 12 10 10 12 18 28
19 14 14 9 9 8 15 9 9 9 9 9 10 15 11 11 17 10 10 10 13 13 22 18 23 16 11 9 10 9 10 9 11 12 12 12 9 9 9 10 10 19 15 8 8 8 10 10 |