| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-332D24.T7 (MSMg01no332_d24.b1) | MSMg01-332D24.TJ (MSMg01no332_d24.g1) |
| ACC | AG448331 | AG448332 |
| length | 1,332 | 1,291 |
length of high quality (start - end) | --- | 274 (132 - 405) |
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no332_d24.b1 PHD_FILE: MSMg01no332_d24.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:18:30 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no332_d24.g1 PHD_FILE: MSMg01no332_d24.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:18:30 2005 |
| singlet/doublet | --- | singlet |
|---|
| BLAST hit | no hit data | unique |
|---|
| sequence | NGGAAGAGCGNCNNAACCACTGGGCGCCACAXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXCGCGGAANTACGAGNNCGAANAGGAAAGTAGTCACGGCCCCCCCCGG
NNGCCCGGGNNNGNNNGNNNNNGGNNTGCATTAAAAAAACCCCCGCCCAN
NAANANNNNAGANAAANNGCCGGNCAANGGGCACCGGCAGAAAGGAGGCC
CGACAAACGGAGACACGCAAACAGAGACAAAAACACGAAGGACCCCACAC
AAAAAGGAAACGGAGCGCGAACGACANCAACACGANACACGCACGAACAC
GGAAGAAAGGAGACAGAGCGGCCCAGCACNCCAACGACGAAGGACAGAAA
ACACCCGGCGAGCACACGAGGCCGCAGACAACGCGCGCACCGCGAACACA
AACGCCCAGAACCACCCCGGAACCGAACCCACGAGCGCCAACCGAATATT
GCACGCCCACGGCCCACAANCCCGCACCCACCCACCCGGGAAAAAACCGG
CCGCCCACCAACCACNCCCGCAAACAAAGCCACAAGCGCCCCACACAGCG
CCAACACCACGCCGCAGCCGAACCAACCGAAGCCCCCCCCCCCGCCACCA
CCAAGCGAACCCCCCCCCCACCCCCCGCACCAACAACCGCACCCCGCCGC
CCCCACCACCCCCCCGCCCCCGGCAGCACCCCACCCCCGCCCCGCCCCCC
CCAACCACCCCCACACGACCCCCCACCCCCGCCCCCCCCCGCCCCCCCCG
GCCCCCCCCCCCCCCCCCACCCCCCCCACACGCCCCCCGCCCCCACCCCC
CCCCCCCACCCCGCCACCCCACCCCCCCCCCCCCCACCCACCCCCCCCCC
CCCCCCGCCCCGGCCCACCGCCCCCCGCCCCCCCCCCCCCCCCCCACCCC
CACCACCCAACCAACCCCCCCCCCCCCCCCCCCACAGCCCCCACCCCGCC
CCACCCCCCACCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
CACCCCCCACCCCGCCCCGACCCACCGCCACCCCCCCCGCCACCCCCCCC
CCCCCCACCGCACCACCCCCCCCCCCACGCACACCCCCCCCCCCCCACCC
CCCGCCCCCCACACACCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCACCCACCCCAC
ACCACACACCCACCCCCCCCCACACCCGCCCAACCGCCCCCACCCCCCCC
GCACCACACCCCCGCGCCCACACGCCCACCCACCCCCGCCCCACCCCACG
CGCCCCCCACAGCCCGCCCCACAACCCCCCGACCCCGCGCCCCGACCCCC
CACCCNCCGGCACCACCACCCACAACCCCCCC
| CGGGTCCCCTNNAACGATGCNAGGCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTATAAAGCCCTCCTGGNCCACGNGA
GCCCTATCTCAAAATCTTATGAATACCCCGATTTGAACTCCAAGATCAAT
GTGTAATGTCTCCCCCAGTCCTCACCAAGGCACATGTTTTAAAGAGCATG
GGCAACTGTTGGAGGTAGTGAGGACCACACTCCAAATGCTGATGGTGTCT
GCCAGGCGCCATTTTAAGATGAAGAGGATGTGTGTAGGCAGAGCAGTGGC
CTTGGAGCCGCAGTCTCTTATCTTTGCCCTCTCTCTGGGGACGAGTCATA
ATGTCCCAAGTCGTTTTTGATTGTTCCAGTTTGGGGTGAGGGTGCTACTG
GTATCCTTTTACAGGAGGCTTGGGTGAGCCCAACATCCCCATCCCCCACC
CCCCACAGTAAAGAACCTGGCCCAATGGTGAGGTCTTCCCTTCAGTGTAA
TCTGGGGGATGGCCTGTCCTGTGAGGTTCTGCTACTCCAGGATCTCAAGG
TGGGTAGAGAGAAAAGGCTAGGGACAGTGACCGATCTCTGTACTCTCGGC
CAAAATAAAAGGAGAGAGACAGACATGACATGAAGGCAAAAATACCAGGA
TCTGCTCTGCTGACATTTGCTTGAGGGCCTAAGTCCAGGGCCCGTGCTCA
TTAGCAAAAGTATCGTGTGTGTGTGTGTGCGTGTGTGTCCGCGCCGTCCC
CCCCCTCTCCTCCCTCTCTCTCCTCCCCCCTCTCCTTCTCTCTTCTATCC
CCCCTACTTCTCCCCTACCTCTCCCCTCTCTCCTCTCTCCCCCTTCCCCC
TTCCCTCACCCCTCCCCCTCTTCTCTTCCTCCTTTTTTCCTTCATCTTTC
CTCTTCCCCTTTCTTCCTTCTCCCTCCCCTCTCCCTCCATCTTCCTCTTC
CTTCCTCTCCCCTCTTCCTCTCCCTCCCATTCCACTCCACCCCCTCCCCA
CCTTCTCTCCTCTCTACCCTCTTTTCCTCTTCTCTCTTTCCTCCCCCTCT
CTTCTTCTCCTTCCTTCCCTCCTTCCTTCCCTTCTCTTCCACCACATCAT
CTACCCTTTCCCTTCTTCTCTCTCCCTCCTCCTATCCTCTTCCCTCCCTC
TCCTTCTCTCCCCCCTTCCTCTCTTCCTTCCTTCATTCTTTCTTCCATTC
ACTCCTCCCACTTTATCTTTATACCCTCCTCCCTCTCTTCTCTCTTCTCT
CTCTCCACTTCCCAATCCTCTTCTACTCTCTCTTTCTTTCT
|
| quality values | Open.Hide. 0 3 6 6 6 6 6 6 6 3 0 3 0 0 3 7 7 9 6 6 6 10 7 6 8 10 8 8 8 8 8 10 9 9 10 10 9 9 9 9 9 9 8 8 13 9 12 10 9 9
9 9 9 10 10 9 9 15 17 3 0 3 9 10 16 13 3 0 0 3 6 7 3 0 3 7 7 7 8 7 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 9 13 17 13 11 9 7 8 3
0 0 3 8 8 6 6 6 3 0 0 0 3 0 0 0 3 0 0 0 0 0 3 3 0 0 3 7 7 6 6 6 6 6 6 16 12 15 18 15 14 11 9 8 8 8 8 12 3 0
0 3 3 0 3 0 0 0 0 3 14 3 0 3 13 3 0 0 3 13 13 13 3 0 3 10 3 0 3 9 9 9 9 10 10 8 8 6 6 6 8 8 6 6 8 10 10 10 8 10
9 9 12 12 10 10 10 10 10 17 13 8 8 8 10 10 7 9 9 15 8 9 6 7 6 8 10 9 10 10 17 22 17 11 10 8 8 8 6 6 8 8 10 11 12 9 9 9 9 9
9 12 16 13 15 9 10 9 8 13 8 8 8 8 7 7 6 10 7 7 8 8 7 8 8 3 0 3 9 8 8 8 8 8 3 0 3 6 6 6 6 8 8 19 8 9 9 10 10 11
8 8 8 11 11 11 13 11 6 6 6 6 8 8 10 10 8 8 8 8 9 15 15 15 8 8 8 7 3 0 3 6 6 7 6 6 6 8 11 11 7 8 8 8 12 8 8 8 8 8
8 10 10 9 9 13 9 10 10 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 9 6 6 6 6 6 10 10 10 8 8 6 6 6 8 13 9 11 6 6 6 6 10 8 16 9 9 9 8 8
12 8 12 12 24 22 12 12 7 7 8 6 8 8 10 8 8 8 8 8 8 12 15 12 10 9 12 12 12 9 10 10 12 8 6 6 10 8 12 9 9 9 10 10 11 7 6 6 6 7
7 10 10 9 11 10 6 10 6 6 8 8 8 8 13 13 17 15 3 0 3 9 10 10 10 10 8 7 9 9 12 8 8 6 6 8 8 8 6 6 8 9 8 8 9 9 9 9 9 8
8 8 8 8 8 10 10 9 10 9 9 9 9 9 3 0 3 7 8 8 8 6 6 8 10 11 8 8 8 8 8 8 11 13 12 11 9 9 9 9 9 8 7 7 10 13 13 15 13 13
8 10 7 6 6 8 8 8 8 10 11 9 8 8 8 8 8 8 15 8 9 8 8 8 8 8 10 18 18 11 9 9 9 9 11 16 9 9 10 9 10 10 6 6 8 8 10 13 8 8
8 12 12 8 10 9 9 9 8 10 8 10 8 9 8 8 8 8 6 6 8 10 16 15 10 8 8 8 8 8 8 8 9 9 10 9 9 10 12 12 10 9 12 15 8 8 8 6 8 8
9 18 15 15 13 8 8 6 6 8 8 15 18 17 10 8 8 7 8 8 8 6 6 7 6 8 6 6 8 12 12 9 9 9 9 10 12 8 8 8 12 8 8 8 8 15 15 15 10 8
10 10 10 10 8 10 12 12 12 10 11 6 9 7 8 8 8 8 8 10 11 8 11 9 13 10 11 11 8 8 8 8 8 8 8 8 13 10 10 6 7 8 8 8 8 8 10 13 8 8
8 8 10 8 12 17 19 14 14 14 17 20 11 11 11 8 11 6 6 10 12 13 10 9 9 10 8 13 10 8 8 6 6 11 11 15 10 10 10 10 15 10 10 10 9 9 15 18 24 29
22 14 14 9 9 10 10 10 10 9 8 8 8 8 10 8 8 8 11 7 9 11 10 10 9 9 9 9 12 15 10 10 10 12 10 9 9 8 10 9 9 14 14 19 15 13 15 12 11 12
21 32 33 19 19 10 10 10 10 10 6 6 8 8 10 9 8 9 9 9 8 8 9 10 13 9 9 8 16 19 15 10 10 10 10 10 10 10 17 19 15 22 12 13 9 9 10 10 8 8
8 8 8 8 10 8 13 6 9 10 8 11 8 6 6 8 11 17 12 12 15 12 12 12 14 18 18 11 11 16 10 8 8 8 10 8 6 6 8 10 17 11 11 13 15 11 6 6 8 12
15 8 9 9 13 9 8 10 7 6 8 10 19 17 26 22 37 23 24 20 23 15 18 11 11 12 18 14 16 11 11 11 17 19 20 18 18 23 17 15 10 10 13 13 17 22 16 14 10 10
10 10 8 8 8 8 13 8 6 6 10 10 8 8 8 10 10 8 8 8 10 17 10 10 10 8 8 8 6 7 8 8 8 10 10 18 15 10 8 8 7 8 9 9 9 14 10 10 9 15
18 16 23 16 11 9 10 10 9 6 8 6 6 6 6 8 10 10 10 11 14 18 23 17 15 7 8 8 8 8 8 12 13 13 14 14 14 14 12 11 11 19 17 19 13 8 8 8 10 10
10 10 8 8 8 8 8 9 8 15 8 8 8 8 9 8 11 11 15 11 10 15 10 7 7 9 7 13 11 11 11 9 9 9 9 10 8 9 9 10 8 8 8 10 10 12 13 7 6 8
8 8 8 7 9 8 8 8 8 6 6 9 10 15 13 15 13 12 8 13 9 7 8 7 8 13 6 8 8 9 9 13 13 13 9 9 9 13 10 11 9 9 8 17 13 9 8 8 8 8
8 8 8 8 6 6 8 8 10 15 10 12 6 6 6 6 6 10 10 13 6 6 8 8 8 10 8 11 8 8 12 10 10 10 12 8 8 7 7 8 11 10 10 16 13 16 9 10 6 6
6 6 6 10 17 10 13 6 6 6 8 8 8 23 9 9 9 12 16 10 14 12 11 11 11 15 15 11 12 9 9 10 11 18 8 8 6 6 6 6 11 8 6 6 8 15 8 11 15 15
9 9 8 11 3 0 3 8 6 6 6 8 6 6 6 8 8 8 8 8 7 7 8 8 9 11 11 9 10 17 17 12 | Open.Hide. 6 6 6 6 8 8 8 8 11 3 0 0 3 9 6 6 6 6 6 3 0 3 6 6 10 7 7 8 6 8 8 12 9 9 9 3 0 3 13 15 19 8 9 13 19 19 21 10 19 14
24 21 26 24 29 29 33 24 28 29 29 38 53 53 50 50 50 50 42 37 23 23 9 9 8 6 6 6 8 10 11 11 10 11 10 10 9 10 11 16 3 0 3 27 21 21 3 0 3 21
21 33 39 42 42 33 31 31 31 31 31 25 25 15 9 6 6 6 6 6 10 23 22 22 18 13 9 9 9 9 10 10 21 30 34 43 50 50 48 48 48 48 48 53 48 48 48 48 42 57
43 53 53 53 53 53 53 44 44 36 42 42 48 57 57 48 42 42 42 47 47 48 54 54 57 48 48 37 43 43 48 57 57 48 50 50 51 50 50 57 57 57 57 59 44 44 30 28 32 34
30 28 14 28 28 42 42 47 43 43 47 48 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 47 47 42 43 37 42 37 42 42 37 30 35 43 44 57 57 57 59 59 59 68 68 68 59 59 48 59
47 42 41 35 35 44 39 37 37 32 32 39 44 43 54 68 68 54 59 59 57 57 48 57 57 57 59 48 59 59 59 59 48 48 48 59 59 59 48 48 48 48 41 40 40 39 39 32 32 18
19 32 34 34 39 40 43 37 43 39 37 39 39 57 59 59 53 50 50 50 50 47 59 59 59 43 37 37 41 59 59 59 59 50 41 39 37 39 39 37 37 37 39 43 44 44 53 57 57 57
57 57 57 48 48 47 46 43 43 44 48 48 48 59 59 59 59 68 57 57 57 57 46 59 43 43 43 43 43 43 59 59 34 34 20 20 23 32 36 37 30 39 47 48 59 59 59 43 43 36
39 24 24 12 12 13 13 11 14 12 10 9 10 23 26 37 35 35 35 34 32 37 28 28 28 37 32 43 43 43 39 43 36 43 43 43 43 43 43 43 48 47 43 43 43 43 43 43 43 39
43 43 43 37 39 34 43 48 59 47 47 47 23 23 18 14 18 22 20 19 20 22 28 34 28 37 31 35 35 39 39 39 43 33 39 37 37 42 42 42 39 34 25 20 30 34 48 48 32 34
23 24 23 23 23 28 20 20 19 32 18 18 12 18 24 20 20 20 30 32 30 37 37 37 44 32 32 13 24 24 32 32 32 28 28 24 24 18 24 24 24 24 19 19 21 28 26 29 29 13
13 11 11 12 22 28 30 23 31 28 37 35 35 32 32 30 37 34 39 31 31 24 25 17 29 29 39 31 31 31 31 32 33 37 28 28 30 26 26 28 21 21 12 18 15 18 12 15 15 15
15 19 30 30 30 43 35 35 37 35 32 28 28 23 23 19 18 16 12 11 11 18 18 15 14 15 24 21 14 19 19 29 31 16 22 11 11 11 24 23 37 31 37 33 26 26 16 15 19 21
19 19 28 28 17 20 26 26 29 37 39 40 40 35 28 28 20 17 12 13 13 21 27 32 28 20 15 16 17 18 16 18 11 11 11 13 17 18 21 21 16 18 13 13 15 15 15 15 15 15
19 23 11 11 11 17 17 21 17 17 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 13 12 8 10 8 8 10 8 8 10 10 11 11 11 11 11 11 10 10 8 8 9 9 9 9 10 12 16 15
17 17 8 8 8 8 8 8 11 10 10 8 8 7 7 9 9 8 8 8 8 10 8 10 10 13 15 19 10 9 9 8 8 10 10 10 10 8 8 7 7 8 8 8 8 8 8 10 10 8
8 10 10 12 9 12 10 10 13 10 9 9 10 13 10 9 8 8 6 6 8 10 10 10 8 8 10 8 8 10 15 15 15 12 10 10 9 7 8 8 12 15 16 13 12 11 11 11 11 15
16 18 14 13 12 8 6 6 8 8 13 11 12 10 10 11 13 10 10 10 8 8 10 15 8 8 10 9 9 8 10 6 6 8 8 10 12 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 10 14 16
19 13 10 8 8 8 10 12 12 10 10 8 15 13 15 18 12 12 11 11 11 8 8 9 9 10 15 14 15 15 14 8 8 8 7 7 10 6 6 8 8 8 8 10 10 11 6 7 8 8
9 9 10 16 10 12 7 6 8 8 8 8 8 7 9 12 10 7 7 8 8 10 10 10 10 9 8 8 6 6 12 15 20 20 17 14 10 11 11 11 8 8 8 8 10 10 10 8 8 8
8 12 12 12 10 8 8 6 6 8 8 11 11 11 11 11 10 10 11 11 11 11 11 11 8 8 11 13 10 10 9 8 8 8 10 10 11 11 8 12 12 11 10 10 13 13 10 10 9 10
10 10 8 8 8 10 13 13 10 13 18 13 10 10 8 8 8 15 17 12 11 9 9 10 10 10 10 8 8 8 10 15 15 13 11 16 11 11 11 10 10 8 8 8 6 6 8 9 10 10
15 9 9 8 13 8 8 10 8 9 9 9 10 11 10 8 8 6 6 8 8 8 8 11 11 10 8 8 8 17 10 8 8 8 8 8 8 21 21 18 14 10 11 11 10 10 10 12 12 10
8 8 8 8 8 11 14 15 10 9 9 15 8 8 8 15 17 24 21 24 10 10 9 10 9 13 13 10 10 8 11 10 10 7 6 8 8 15 12 12 10 10 8 6 6 8 8 8 8 6
6 8 13 10 10 14 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 11 10 10 10 8 8 6 6 10 8 7 12 6 8 8 8 8 8 8 11 11 9 9 10 9 6 8 8 8 8 8 9 12 12
9 9 9 7 8 7 6 8 8 9 8 8 19 10 10 10 10 10 10 8 8 8 10 8 10 10 10 10 9 20 18 8 8 8 8 8 13 9 9 9 9 |