| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-454O01.T7 (MSMg01no454_o01.b1) | MSMg01-454O01.TJ (MSMg01no454_o01.g1) |
|---|
| ACC | AG541550 | AG541551 |
|---|
| length | 753 | 1,094 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 356 (69 - 424) | --- |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no454_o01.b1 PHD_FILE: MSMg01no454_o01.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:26:13 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no454_o01.g1 PHD_FILE: MSMg01no454_o01.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:26:13 2005 |
|---|
| singlet/doublet | singlet | --- |
|---|
| BLAST hit | unique | no hit data |
|---|
| sequence | NGGTCTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCG
CGGAATTCCAGATTTCCCTTTTAACATTATAACATTGTTAAGAAATCCCA
TCCATGATTTGATCATCCTGGGTCACAGGACCGAGGCCCACATTTATCTC
TTCCTGTCTGAGAATCAGTTTGAGGTCCAGCATCCAGAAACATGGGCAAG
CACTGGTGAGCCACCCTGGAAGATGCTAACAAGTGCCCCAAGCTTGGGGT
GAAGGGGGTGCTCTAACTAACATTTCAAAACTTTAGTAAAGTCACTCATT
TAGAAATCTGACTATCGTATTTTCTCCCCCTTTTTCCCTATTTCTAGGAA
ATATTTTCAAGAAGCGTGTGATGTCCCTGAACCGGAAGAGAAGTTTAATA
TGGACAAATACACGGATTTGGTGACCGTCAGCAAGCCAGTTATTTATATC
TCCATAGAAGAAATCATCAATACACATTTAGTAAGTGGGTCAAAGAGGGG
TCTCGGTCCCAGACCCTGGACAGACTGCCATTCACTGTTAAGTGCCTAGT
CCTCCCAGAAATTGCCTGTGTGCTTGGCTCTGTTTTTAAACCCTGTGGCC
TTCTTCCCTAATTATTCCCCTGCGTCCCCTACCCTTAGTATTATCTCTCC
ACCTGTTTTGATCGCCTTTGTTCTCCCCTTTTCACACCCCCGCGATATTA
TCACTACTTTTTACCCCTCTTTTTTATTCTCTATCTCCGTCCACTCTCTT
TCG
| GTACGCCACCCCAATATCCCGCCCACCCGGCCCGTGCCAGCGCCGCCACC
GTCTCTTTACCCACACCAAGAGGACGCTACGCGCCTAAGTCCGCGTTTTT
TCCCCCCCTGCAACCACATACCAAATTAGAATATTAACCCACAACACTAT
CCCGCGCCCCCCCCCACACCCACAACCAAACATTAACAAACCACACACAT
ATACATGAAGAAAAGAGGCCACAACACAGACCAACTTACATTCCCTATTG
ACAATCCCAAACAAATAGCCCCCCTGTTTTCTTCGCCGTGTCTACCTTTT
TTATACCAGTGCCCACACACGCACGTTGTTGTGTTTACNNTTACAACAAA
AATACTGGGGGGAGGAAAGATTACAAAGAAAGTGGAGAGAATACTTCTCC
CCCGGGTGGGGGTGNTGGGGGGGGCCCCGGGCCCGTGGGGTCACGTACCA
AAAACAATTGTTTAAGGGGTNTGGGAACAAACCTTAAAATAGAGGGTATA
TTTGTTCCTCCCGCGCCGGAGAGAAATTCCCTTTTAAATAAAGGGAAAGA
CCCTCCTACAAGGGGCTTTCCACACCTTTTAAACCCCAAAAAAACCCACT
CCACTTCCCCGGGGGGGGGTCGTGAAAAAAAAGTGGNCACAACCCCCAAA
GGGGCGGGGGAAAAAAAAGCCCCCCCGGGGGTGGGGTGGGGCCCAAAAGA
AACCCTCCCGCCCCAACCCACCAACCAACAATAGGTCAACCAGGGTGCCC
CCCGGGGTCTCCCTCCGGGTGAGGAGAAAAACCACCCCCCCACGGGGGAG
AATATAATTTTAACAACAGAAGCGCCCCCCCCTTGTGTGGGGTGGGTGCC
CCCCAAAACAAGAGGGAGTGGTCCTTCTCCCGAGAAAGAACATAAAAATT
ATTCTCTTTGGTGTGGGGCGGGCGCCCCCCCCCGCCGCCGAAGGAGGAGG
GGCCAAAAAATAATCCCTCCTCGTGGGGAGGGAAGACCCCCCCCTCTCTT
GCGGTGGGGGGAGGGGGGTTTGTTTTAAAATAACAGATGGCGCCGCATAC
ACGCGNCTTACTAATCCACTCCCCACCATCCGCCATACTAAATC
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 0 3 6 6 8 10 8 8 8 13 19 30 30 33 25 24 23 18 12 15 10 10 10 15 19 37 41 40 28 25 23 19 15 7 10 6 8 6 6 7 7 12 12 13 13 12 12 13 19 28
47 47 36 31 31 31 33 33 30 21 17 11 14 14 10 9 9 9 12 21 28 37 28 28 28 28 28 28 46 48 47 47 47 50 50 50 59 59 59 59 59 59 47 48 48 50 50 54 48 48
42 47 47 42 41 41 54 54 57 53 50 50 50 50 50 50 48 57 57 57 57 47 47 47 57 57 50 57 57 57 57 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68
68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 50 50 50 50 50 50 59 59 57 57 57 57 57 57 52 52 57 57 57 59 59 68 68 59 59 54 54 54 54 54 57 57 57 57 59 57 57 57 57
57 54 57 57 57 57 57 57 57 50 57 52 52 52 57 59 59 59 57 57 50 47 47 50 50 50 59 57 57 57 57 48 48 48 50 57 57 59 57 57 57 59 59 59 59 44 42 33 33 35
42 43 42 42 42 42 59 59 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 59 59 68 59 59 68 59 59 59 57 57 57 59 54 57 57 57 57 57 59 59
59 39 39 35 47 47 57 57 57 57 48 48 48 43 39 28 23 14 14 12 10 8 8 8 8 10 13 19 41 59 59 59 53 59 59 59 59 59 48 48 48 59 59 59 59 57 57 57 50 50
50 57 57 57 59 57 48 48 48 43 39 39 35 35 34 36 25 28 32 37 34 31 23 23 34 36 59 59 27 22 20 25 25 25 30 34 33 39 43 43 33 34 25 25 37 37 34 43 39 37
37 28 23 23 22 22 31 32 42 41 28 18 14 14 14 19 24 31 27 28 15 13 13 24 25 26 21 14 13 13 15 15 20 19 15 15 25 25 32 31 31 37 27 34 28 30 25 30 30 47
30 34 23 20 22 21 21 13 13 11 18 12 12 13 14 12 22 15 14 14 14 27 21 25 25 28 30 30 28 19 19 12 11 16 13 17 15 16 25 14 15 15 20 19 23 14 15 13 18 18
19 28 24 21 13 11 16 16 24 15 14 14 19 26 24 24 17 12 10 10 10 10 9 9 9 10 8 8 18 20 14 13 10 9 11 15 13 10 10 10 11 13 16 16 12 12 12 15 13 8
8 8 8 8 8 10 12 11 10 12 10 10 10 11 13 11 15 11 11 11 11 12 12 12 12 14 14 9 10 10 8 8 8 15 19 10 10 10 9 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 12
12 11 10 9 9 10 8 8 9 9 22 26 12 12 14 22 22 25 25 14 9 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 10 10 10 9 8 8 6 6 8 6 8 8 8 8 8 8 6 6
9 11 8 8 6 6 7 10 10 10 10 8 8 8 8 10 10 14 11 11 8 10 8 10 8 17 13 16 19 19 10 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 10 13
10 9 8 8 8 8 8 10 14 17 11 9 9 9 10 10 8 8 8 8 11 13 8 10 7 6 8 6 9 11 17 11 11 11 10 10 10 10 8 8 10 8 10 9 8 8 8 10 8 8
8 8 8 | Open.Hide. 9 9 9 9 14 13 12 10 10 11 9 8 8 9 10 9 9 10 10 10 10 10 6 6 6 6 8 6 8 8 8 8 8 11 11 8 8 8 8 10 10 11 8 8 8 8 8 8 8 8
6 6 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 9 12 12 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 11 9 11 11 10 10 11 10 8 10 10 9 10 10 10 11 10 10 8 10 10 10
8 8 10 11 15 13 9 9 6 6 6 6 6 6 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 8 8 8 6 7 8 8 8 8 10 8 9 10 10 8 6 6 6 8 6 7
8 8 8 8 10 10 12 12 11 9 9 12 10 10 8 8 8 8 8 8 11 11 11 11 8 8 8 8 7 7 6 8 8 9 9 9 9 8 10 8 8 6 6 6 11 10 8 8 6 6
8 8 8 8 10 8 8 9 9 9 9 12 8 8 8 8 8 8 12 9 9 7 7 11 11 9 6 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 6
8 6 6 8 8 11 15 11 11 10 10 10 11 8 8 8 8 6 6 8 8 9 10 10 8 8 8 8 8 11 13 12 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 11
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 10 10 10 10 11 8 8 8 8 10 10 9 9 8 8 6 6 12 10 17 11 10 13 3 0 0 3 8 8 8 8 8 9 9 9 10
11 6 7 7 8 9 8 8 12 11 8 9 10 10 10 10 8 8 6 6 6 6 8 9 9 9 12 10 9 9 10 9 9 8 8 8 9 14 12 10 8 11 11 11 11 10 10 10 8 8
8 8 8 8 8 6 6 6 6 7 7 6 6 3 0 3 12 11 10 8 8 6 7 7 7 8 8 8 8 8 9 10 8 8 7 7 6 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8
8 9 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 12 10 15 13 10 15 11 3 0 3 9 10 13 11 11 11 8 8 8 8 8 8 10 10 7 7 6 6 6 6 9 9 9 9 9 6 6 6
6 7 6 8 8 8 8 6 6 6 7 6 6 6 6 10 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 8 8 7 8 8 8 8 14 14 15 15 8 6 6 6
6 6 8 8 8 8 8 10 10 10 10 10 12 7 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 10 10 8 9 8 6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 16 11 12 18 9 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 12 22 27 32 14 14 14 10 8 8 8 8 6 6 8 12 25 17 12 11 9 9 9 6 6 3 0 3 7 6 8 8 8 10 7 9 7 7 8 7
10 14 12 9 9 9 12 12 17 25 25 26 27 36 36 12 10 8 8 8 9 21 21 26 18 18 18 20 21 21 15 14 14 7 7 6 6 6 7 10 10 10 13 12 12 8 8 8 8 8
8 9 7 7 6 6 6 11 6 6 8 10 8 10 10 10 9 8 8 8 8 8 6 6 6 6 7 7 8 8 8 8 8 8 17 18 10 9 9 6 6 8 8 8 8 8 9 8 12 19
7 7 7 6 6 6 10 11 9 9 9 8 6 6 6 8 8 9 9 6 6 6 6 6 6 6 6 7 13 14 6 6 6 6 6 15 15 27 9 8 8 8 8 8 8 9 21 8 8 6
6 6 6 6 8 8 6 6 8 10 8 8 8 6 6 6 7 6 6 7 8 8 8 8 9 14 21 27 26 21 15 8 8 8 7 8 6 6 6 10 7 6 6 6 7 6 8 8 8 12
10 11 11 12 15 6 6 6 6 6 6 6 6 6 10 8 8 8 8 8 8 8 9 9 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 11 9 6 6 6 6 6 6 6 15 7 15 10 10 10
11 11 7 7 7 8 6 8 9 9 6 6 6 6 6 15 7 9 6 6 6 7 8 8 10 10 22 11 11 11 8 10 6 6 6 7 6 6 8 8 8 6 8 8 8 10 6 8 8 8
8 6 7 6 7 7 9 14 13 7 6 6 8 8 8 9 8 14 9 10 10 10 10 9 9 7 13 6 6 6 10 17 8 8 8 8 8 10 21 29 34 28 16 9 9 8 13 13 13 8
8 8 8 8 8 8 10 13 9 9 9 9 9 12 14 21 15 13 10 10 10 13 13 10 8 8 6 6 10 8 8 8 8 12 11 12 11 6 6 6 6 6 8 8 6 6 8 8 8 8
8 8 8 10 3 0 3 11 11 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 12 12 10 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 10 8 10 9 8 8 8 7 7 |
|---|
