| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-466C07.T7 (MSMg01no466_c07.b1) | MSMg01-466C07.TJ (MSMg01no466_c07.g1) |
|---|
| ACC | AG550158 | AG550159 |
|---|
| length | 730 | 1,333 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 549 (80 - 628) | --- |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no466_c07.b1 PHD_FILE: MSMg01no466_c07.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:41:31 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no466_c07.g1 PHD_FILE: MSMg01no466_c07.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:41:31 2005 |
|---|
| singlet/doublet | singlet | --- |
|---|
| BLAST hit | unique | no hit data |
|---|
| sequence | TTTTCTCTCTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXCGCGGAATTCATGATTTGCGCATTACAGAAAACAAAAGACTTGAGTT
GATAGAGCTAAGCAGTCTAGATGTGATCCTACCTAGCATTGTCCCATTGC
TGTTTGACTCCATTCTGTCCTGCATGGTGGTCAGAGAAACCAGAAATCTC
TCTCTGGAACACAATTTTTCTCTGGAAGGCTCTGGGATTTTACATCCATC
AGCATGATGTTCCTAGATAAATGGAAATTCACTGGGGAACACTGTTTAAA
TAGTTTTTAGTCAAATGAATTATTTATGTCCCTTTAGGGTATCTTTGTCC
AACAGTCTGGAAACAGTATCTACTTGCTTCTAACACTATAGCCTTAGGGT
ATAATAGGCCTTTGTCTGAACAAATGCCATAAAAGGAATACAAGTGGAAA
CCAAGAATAAAACTCATCCAGTTACTGTCAGGAGACCAGGAATCAGAAAC
ATTTGTCTATAACTTCTTGGCTTTGGCCACTTGGGTAACAGCTTTCCTGA
CCAATACCTTCTTGGTTTGAGATAGGGTGTCACCTTGAAGCCTAAGTTGG
CTTTAACATATGACACTCCTGCTTCAGGTTCTTAAGGTTCTACCATGGTC
CAAGATCAAACTTTATGAGCTGTCTCACTGCCCCTCTATATTCACGTTTT
AACCTAATAGTATCATAACACATATATTGC
| TGCCCCTCGCCGCCAGGGNNCCNCAGTNTNTTTAACCCTGCGCGGGGCCG
TCNTCAGCTCATTACCCTGATCTATATATCCCAGTATNCATCGTTAGCTA
GGCGCGTCCGCATGTAGGTGACCGGCCGCGCAATGCAACTACCATGACGC
TACCGCGCCGCCGCGCGAGCGCGTATGTGAGCGTCTCGTCTGAGAGACGA
TGGCAGTAGCAGCAGAGGCGCAACGCGGAGACTAATATCCATGATTCCTA
TCGAATATAGTCACTTGGAGACATACGACTGCTGACAGATCGACATGTAT
CTTAATGGTAGGTCGACTGATTACTACTCACCGGCTGATAAACGAGCCGC
ATACAATATCATGGCTGGCAGACATAGTAGTTCGTGTCGGTGGGTCTAGT
TGCTGTCTTGACTGATGCGATCCTGATANTCTATACCGACCATCACATAT
ATAATCTTATACGAATACTTCTATATCTGTCTAACCTGCATTCACCGCCC
TGCAGCTGAGCGCTCCCTCGTGTCCAACCCGCCTGCGAGCTACGATACGC
ACTATCTATTTAGTAAGTAAATCCTCACGCCGTCTCGCGCTCCGGCACTG
TTCGCGAGTGCCGTGGGTCTGCTGTTCCCTCATACAGTTATGAAGATGTG
TAGATAGACGCGATGTGGGCGGCGCGTCGTGGGCGCATAGACGAATGTAT
ATAGACTGATTGTCGCGCGATATGTAACTAGCAAGACGTCGACCATCGTA
TAGATAACAGGCGACATGTACAATATATAATACACNTGTCACGCTCGCGA
GTACGGCCTATATGCAGTTGGTATCATGCTATCTAGATGACTCGATCCTT
GANGTGTCTCGTCTAATCTACAGCAGATGACAGACCCGCACAAGAAGCGG
CTCCTCGCTCCGATGAAGTAGAGAAGTGTGAAGCGGACGTCGCGCTCTCT
ACTCACTTCTATATTCATTCCGTCTACGTATCACAACGACCCAGCATATA
TACAATGAGAAATGACGAGGCACGCAACAGCCCGTAGGAGCAGCAGTTGC
AGTGCTGTATATGAGCACGGTGTCTCGTAGTGTGATGAATATGCGCGAAG
ATAAATCGACACAATAACTGAAGACGACACGACACACCCGCTCGCCATAC
CGACTATATGATGTATCAGCTTTAGTAGATGNATTGCTGACTAGTATTAT
GGCGATCGATGTTGCTGATAGTTNTGACGCCATGATGCTGCGNTGCGCGC
TACGTCGTGATGCCTGCGGCATCTCCGCNATTGNTTAACAGACGCGCNCA
CGAGGTATATAATTGCTATATTNTATATATAAN
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 8 8 10 8 8 10 8 8 8 8 10 8 8 10 12 16 23 34 43 39 32 28 28 32 37 35 32 29 35 36 37 41 42 27 24 22 16 15 6 6 6 6 6 6 6 7 10 9 8 8
8 10 10 15 23 28 34 30 29 28 28 31 25 21 21 10 12 12 17 9 9 7 7 8 10 10 13 20 25 21 23 23 28 37 37 39 47 47 53 57 57 57 57 53 53 57 57 57 57 53
53 53 68 50 50 57 57 59 59 59 57 68 68 68 68 68 68 57 53 50 50 53 53 68 68 57 57 57 57 57 54 59 59 59 57 57 68 68 68 68 57 59 57 57 57 57 54 57 54 48
48 48 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 48 50 48 57 57 57 52 52 52 52 52 52 52 59 52 52 52 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 59
57 57 59 59 59 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 59 59 59 59 59 59 59 52 57 57 68 68 57 57 59 57 57 50 50 50 50 51 51 68 68 68 57 57 57 57 57 68 57 44
44 28 28 42 42 57 48 48 48 57 59 68 68 68 68 68 68 68 57 57 48 48 48 57 48 54 54 54 54 48 48 41 42 43 59 59 57 57 57 42 57 43 42 39 32 32 39 43 47 57
59 59 59 35 35 39 37 37 50 50 50 50 59 59 59 36 25 23 13 11 9 10 9 9 9 9 12 25 30 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 53 47 48
57 50 48 59 59 59 48 57 48 57 57 54 54 57 57 54 57 59 59 42 48 48 48 48 48 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 68 68 68
68 57 68 57 57 57 57 57 43 43 57 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 54 57 57 59 59 50 38 38 33 44 44 59 68 68 68 57 57 57 43 43 57 59 59 59 59 57 48 44
48 44 44 46 57 57 59 68 68 59 59 57 59 47 48 48 48 57 44 44 57 57 57 57 57 57 48 48 48 48 48 53 48 44 39 39 36 28 41 40 40 43 34 34 23 32 41 48 59 57
59 59 59 59 59 48 48 57 57 57 57 50 50 59 59 59 47 46 43 46 46 47 59 44 39 39 31 25 37 37 39 34 32 34 41 48 44 39 47 47 47 50 57 57 47 48 48 48 48 39
39 39 39 39 44 43 41 41 59 43 41 37 30 28 26 32 26 39 43 37 37 30 37 28 33 32 39 34 32 23 28 28 28 33 34 39 28 30 25 25 12 15 24 19 14 28 28 34 28 30
30 34 34 37 35 35 47 47 39 43 39 36 36 28 28 28 33 29 31 37 35 34 32 19 13 11 15 14 20 18 23 28 27 24 17 20 14 16 12 23 23 28 19 17 15 15 12 11 11 12
11 16 13 29 14 15 14 21 24 37 37 47 37 37 37 26 25 18 19 18 24 12 13 13 15 15 18 17 24 12 12 11 16 11 15 19 22 15 15 18 26 21 8 8 6 6 10 6 8 8
9 8 10 9 8 15 15 11 11 8 8 8 6 6 6 10 12 12 12 12 11 8 8 8 8 12 15 8 8 8 | Open.Hide. 7 7 7 7 7 9 9 10 8 8 6 6 8 6 6 8 6 3 0 0 3 3 0 3 8 8 3 0 3 0 3 8 7 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 7 6 6 10 9
9 3 0 3 10 8 8 8 8 8 8 8 6 7 7 8 6 6 6 6 6 6 11 12 10 9 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 3 0 3 9 8 8 8 8 8 8 12 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 11 12 12 12 12 12 6 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 7 8 8 10 15 9 8 8 6 6 8 6 6 6 6 6 8 9 9 10 10 10 8
8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 10 10 9 8 7 6 6 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 8 8 8 6 6 8 8 12 11 11 11 12 12 8 8 8 8 8 8 11 12 8 8
6 6 6 6 8 6 6 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 10 8 7 7 7 11 12 10 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8
8 6 6 8 8 6 6 6 6 6 8 6 6 8 8 8 11 8 8 8 8 10 11 10 10 10 6 6 6 6 6 6 8 8 11 11 11 11 12 11 11 11 11 11 10 8 8 8 8 6
6 8 8 10 10 10 8 8 6 6 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 11 8 8 6 6 6 6 8 8 8 6 6 6 6 6
7 8 8 8 8 8 10 8 9 9 8 8 8 8 9 9 10 11 8 8 8 6 7 10 11 6 6 8 10 6 6 8 8 8 8 6 6 8 8 10 11 10 10 7 7 8 8 6 6 8
6 8 8 8 8 8 10 11 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 10 10 3 0 3 7 8 8 8 8 8 10 11 8 8 8 6 6 6 8 6 8 8 6 6
6 6 8 8 9 8 8 6 6 6 6 6 6 8 7 7 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 7 7 7 9 10 13 10 10 13 11 10 9 9 9 8 8 6 9 9 9 12 12 12
8 8 6 6 6 6 10 8 8 8 8 8 8 9 9 10 9 12 8 8 8 8 10 8 8 8 7 6 10 8 9 9 8 8 8 10 8 10 9 9 9 9 10 8 8 8 10 9 10 10
10 10 10 10 10 9 8 8 8 8 8 6 6 10 8 10 9 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 6 10 11 16 12 8 8 8 8 10 10 6 6 8 10 9 9
9 10 10 12 8 8 6 6 8 6 8 8 10 13 15 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 7 11 12 12 9 9 12 12 10 13 8
8 8 8 9 8 6 6 6 8 6 9 7 8 8 8 9 8 8 11 8 8 8 10 9 9 8 8 6 7 8 8 14 7 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10
11 11 12 12 12 12 8 8 6 6 8 8 8 8 8 9 12 10 6 6 8 8 8 8 9 9 9 10 10 10 10 8 8 8 9 11 13 10 10 8 8 6 6 6 6 8 6 6 8 8
10 8 8 8 8 8 8 10 11 9 9 9 9 9 9 10 6 6 6 6 8 8 12 9 9 9 8 8 8 8 8 6 7 9 3 0 3 8 8 8 6 8 6 6 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 10 10 10 11 7 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 11 13 15 11 11 10 10 8 8 8 8 8 10 10 8 9 9 10 8 8 9 10 8 12 9 9 10 11 8 10 10
8 3 0 3 8 10 8 8 8 10 8 10 8 10 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 6 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 9 9 6 7 7 12 6 8 8 6 6 6 6 6
8 8 8 9 9 9 8 10 8 6 8 6 6 6 6 8 8 6 6 6 6 8 6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 8 8 6 6 6 6 12 12 10 10 10 9 9 9 9 10
12 15 12 10 11 10 8 6 6 6 6 6 8 8 8 6 6 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 10 8 9 9 6 8 7 7 8 8 8 8 8 8 8 11 8 10
8 8 6 8 7 6 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 8 8 9 10 12 10 9 7 11 7
7 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 10 10 10 13 13 12 9 8 10 11 8 7 7 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 10 14 8 8 8 8 9 9 9 9 6 6
6 6 8 8 11 11 9 8 8 8 8 6 6 8 8 10 9 8 8 8 8 8 10 6 6 6 6 8 8 10 10 8 8 6 6 6 6 8 6 8 8 8 9 9 10 10 8 8 6 6
6 6 8 6 8 8 8 8 8 8 9 10 10 8 6 8 8 6 6 6 6 6 6 10 8 8 9 9 8 8 3 0 3 9 9 9 9 8 9 10 10 8 8 9 9 9 9 10 10 10
6 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 3 0 3 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 3 0 3 6 8 8 11 11 10
10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 7 9 9 12 10 3 0 3 6 6 3 0 3 8 8 7 6 8 6 6 8 8 15 10 3 0 3 6
8 8 6 6 6 6 8 10 8 8 6 6 6 10 9 9 9 12 12 8 8 3 0 3 9 10 8 9 8 8 8 3 0 |
|---|
