BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-489G15.T7 (MSMg01no489_g15.b1) | MSMg01-489G15.TJ (MSMg01no489_g15.g1) |
ACC | AG567903 | AG567904 |
length | 1,359 | 776 |
length of high quality (start - end) | --- | 592 (76 - 667) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no489_g15.b1 PHD_FILE: MSMg01no489_g15.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:12:38 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no489_g15.g1 PHD_FILE: MSMg01no489_g15.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:12:38 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | TTCCTACTCACATCTATATATTTATTCCATTTGTGAGGAGGGGTGGATTA
TTTCACAAAAAAAAAGAGAGACGGGGACAGCGCGATTTCGGGGTTTTCTC
CCCTAAAAAAATGAGGGAGAGTCNTCTCCCACACATAAAACCCGCCACTA
CACGCTACCGAGCTCTATGTATTGCCATATGCTCGAACGAGACACCCATA
TAAGCATGTTAGTTCCTAATTTATCTCACGTTCTATGTAGACATTAGCCC
ATCGTATGACTTCAATCACGCCTTTAACGCACCCACGCTGTGATGATTTT
TCGCGCGGGGATATGACTTCGTACACGAGCGNACGTCGGCCTTCAATGTA
TATTTAGCGGCGTCACGGGGCGTGGTTAATCTGATAAGAAGGATAAAGTA
ACTTTATCCATATCTTTACTTGCCTCACGATATGACGCAACATTATAATC
GGTTTGAATTTTACGGCATGCTAATATAATCTAGACGTGTGAGTCAAAAT
ATCACAAAGGTGAAGCTCAAGTGAAGAGGGAGAAATCGGTATATCCAGTT
CGGGTTGTGAGTATGTAACGGATNTGCATTAACAGTATTTCCGCACCGTT
GCGCGATTCTTGCATAACGTTAATAACATACGCGTCGTTATCATAACCGT
ATAGTCAGTATATGATAAAACAGTCAAGAAATGGATGTGGCGGGAGATGA
GTGAGGGGGGGTGACACCACCCACCCCACACTGCGCGTGCTGTATAGCTT
AGCGGGACATAGCGGTCTATTACTCTAATATGAGTCGATATATGCTTAAA
TAATCGCTACCCAGTACACCCCCCCACACGTACTTTACTCTGCTTGTAGT
TATATCATGTCCTGCGCTATACATGGTGCGCACGATAGATATATAGTATC
ATATTTATAGTATATCCTCACCACGACAAGTTAAAGCAACACATTATGTA
TTACTATGTGAAGACGGTTATTAGACAGATTGATGAGCCCGATGGCAACG
ATAGATAAAGCGGTGATTATGAGTGAAGTACTTGATTTGGCCTATAGCAA
GTACACAGACGATATACGACATATGGTAAGCGTNGCAGCCACGCGGATTA
TTACCGAGCATATTAGTTTGCCGCGCTGGGAGGCGCAAACACAGACAGAC
AGGGGCGCTACGTCGTATACACCGGCTCACGCTTNCAACAACCGCTCATC
GCTACAACATCAATAATTACGATAACGTTATATAATTTACCCGACCGCAC
GCCCACATCTATATACTAACGATCTCTCACACATAGCGTCTCTCATCACT
ATTATATTATTAACACCATACGCGCTACTCTTACATTGACCACGATTCAC
AACTATGAT
| NCGATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXACCAGCACACCCACCGGTCCTTGAA
ACCCGGAGAAGGGTTGGGGGTTCACTGGTTCAGGAGACCAGGAAGGGACG
GTTGGATCTTCCCCCACGTTTTCCCACGTCGCTGCATGCTCAGGCAGGCT
CAGCGCTGCCACCTGGCGGCTGCCTCTCCCGGATTGGGAGGAGCTGTCTG
CACGCACCAGTTCCACAGATCTTGAAGGGTGTGCCAGGCCTCTATCTGGG
GAAAGAGGGCAGAAGCTTTTTTTAATGCTTCCTATCTATGTGGCCCGTGC
AGACACACTTGTTTTCTGCTTGTTCTCAAGAGTAAGAGGGAAATCCGTTG
GCGTTGAACGGCATGGGTATAAAGAGCTGACTTGAGCCTGCTGGTTATGA
GGGGTGAGAAAGTGGTGAAATTATTAGAAATATATGTTTCTTATCTCTGT
GTAGTCTAACAGTGAATATGAACGACAGCTTTCATTTATCCTGCTTAATA
TTTTTCGAATAAGAATTCAACACACTGGTCTGGAGAGATAACTCAGCCCT
TGATAAAGGCTAAGGCTCACAACCAAAACCTAAAAAATACTGTTTCAATA
CAGCCCCCCTTTCCTAGTCCAGNTTCAATACAACTTCCTCAGCACCAAGA
ATGGAGTAGTGCAAGGGGTTGGGGGGGTGGGGAACAAAAACAAGCCCACC
GAAAGGTTTTACCGAAAACAGGGGTG
|
quality values | Open.Hide. 8 8 8 10 10 8 9 10 9 9 9 9 9 6 6 6 6 8 10 11 10 13 15 10 10 10 10 10 10 11 12 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 10 8 8 10 10
9 9 10 8 8 8 8 8 9 17 18 20 17 18 11 20 11 12 12 12 12 10 10 8 8 10 8 8 8 8 8 6 8 8 8 8 8 9 9 9 8 8 8 10 9 9 9 9 9 9
9 10 9 9 9 10 18 20 13 12 7 7 6 6 8 8 11 11 10 10 9 9 3 0 3 8 8 8 12 11 10 8 10 10 12 13 14 13 13 11 11 10 10 10 8 8 8 9 8 8
6 6 10 6 8 8 8 8 11 12 12 9 9 9 9 10 9 9 8 8 8 10 15 9 9 9 9 10 10 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 6 6 6 6 8 6
6 6 6 8 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 9 9 10 10 8 10 10 10 8 8 8 13 10 10 11 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 13 9 8 8 6
6 6 6 6 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 9 9 9 6 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 7 8 6 6 6 6 11
11 8 8 8 8 10 10 6 6 6 6 6 6 6 8 12 12 10 10 9 9 9 7 8 10 8 8 9 9 9 3 0 3 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 9 10 10 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 6 6 8 8 9 9 9 11 13 13 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 10 9 9 9
10 10 10 13 12 12 11 11 11 11 11 11 12 11 11 8 8 8 8 10 8 9 9 10 12 10 12 9 9 9 10 9 9 10 10 10 13 8 11 8 8 8 10 13 10 10 10 8 8 8
9 8 8 11 11 11 9 9 9 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 13 13 11 11 8 10 10 10 10 8 10 11 11 8 10 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 6 7 7 9
6 8 8 6 6 6 8 8 8 7 7 7 8 8 10 11 11 11 11 15 15 11 11 11 8 6 6 6 11 6 8 8 10 10 12 10 10 10 9 6 6 6 7 10 8 8 8 8 6 6
6 6 8 8 8 8 10 8 8 8 10 8 8 10 10 6 6 8 6 6 8 8 3 0 3 8 8 8 8 18 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 8 8 8 8 7 9 7 7 7
8 8 8 8 8 8 8 10 8 9 10 11 11 10 11 12 10 10 10 10 9 9 13 6 8 8 8 8 8 8 8 11 10 8 8 10 10 8 10 11 11 11 10 8 8 6 6 8 8 10
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 6 6 7 13 10 11 10 8 6 6 6 6 12 9 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8
8 8 9 10 13 15 11 13 7 7 6 6 8 8 10 10 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 9 9 9 8 8 10 12 9 9 8 6 6 6 6 6 6 6 8 8 10
10 10 6 6 6 6 9 9 7 7 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 6 6 8 6 8 10 8 8 8 8 6 6 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 7 7 8 7
8 8 10 10 8 8 8 8 6 6 6 6 8 9 8 8 6 6 6 6 6 6 11 11 8 8 8 8 6 8 6 7 10 8 13 9 9 9 9 10 10 10 11 10 10 10 8 8 6 6
6 6 10 11 17 11 10 10 10 9 8 8 8 8 8 10 10 10 11 10 8 8 8 8 8 8 10 10 12 13 15 12 12 13 19 13 10 10 8 8 6 6 6 8 9 10 10 11 8 8
8 8 8 8 10 10 12 9 6 6 6 8 8 10 10 8 10 9 9 6 10 6 6 6 6 8 10 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8
8 6 6 10 10 8 8 6 8 6 6 8 6 8 6 6 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 6 9 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8
9 9 9 10 8 8 6 10 6 6 8 8 8 6 6 6 8 8 10 12 10 9 10 8 6 6 6 6 10 8 8 6 8 8 8 6 6 6 6 6 8 13 15 9 6 6 6 6 6 8
8 8 10 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 10 8 10 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 11 11 8 8 8 3 0 3 11 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 7 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 10 10 8 10 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 6 7 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 6 6 8 8 10 12 17 8 8 8 8 8 8 10 9 8 8 8 8 11 3 0 3 6 6 6 7 6 9 9 9 8 9 9 9 9 9
9 9 9 9 8 8 6 6 6 8 8 6 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 9 6 6 6 6 6 6 6 6 7 7 15 13 6 6 6 6 6 6 10 10 9 8
8 8 10 8 9 9 9 8 8 6 6 8 6 6 8 6 8 8 10 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 8 10 10 9 9 10 10 8 8 10 8 6 6 7 6 8 8 10 10 8 6
6 6 6 6 6 6 6 8 7 7 10 10 10 6 6 8 8 10 16 16 10 8 7 7 7 8 9 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 11 8 9 6 8 6 6 6 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 | Open.Hide. 0 3 6 6 13 10 10 10 11 21 28 47 41 44 44 41 41 44 39 39 41 42 50 50 50 50 42 47 37 27 23 9 9 9 9 11 13 10 10 10 10 15 13 21 18 23 34 34 44 47
41 41 37 37 37 37 26 23 12 9 9 9 9 11 11 12 20 16 15 10 10 19 19 33 33 33 33 36 39 47 53 53 53 53 53 53 57 57 53 53 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57
57 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 57 54 54 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 57 51 47 57 57 57 57 68 57 57 57 57 47 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 50 50 50 50 50 50 54 54 54 57 59 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 59 59 68 68 68 59 59 52
57 52 59 59 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 57 50 50 50 50 50 51 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 47 46 46 44
43 43 44 57 59 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 54 59 54 54 48 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59
59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 41 37 22 22 10 10 12 14 14 20 28 28 28 34 36 41 50 50 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68
68 68 68 68 68 68 68 57 57 59 54 54 59 59 68 68 68 68 68 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 54 59 59 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 68 68 59 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 68 68 68 68 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59
59 59 59 59 59 57 59 59 59 59 59 57 59 57 68 57 68 68 68 68 57 59 57 57 57 54 54 54 57 59 54 54 54 54 57 57 59 59 59 59 59 59 48 48 48 59 59 59 59 48
57 57 59 59 59 59 59 47 47 41 41 41 32 29 29 32 37 37 39 40 40 40 48 48 39 39 57 57 57 46 57 57 57 43 43 39 39 39 43 40 40 40 39 39 30 30 26 30 34 41
37 37 37 32 29 32 35 31 26 30 24 23 15 15 15 19 26 37 37 36 37 34 31 25 25 25 34 32 26 26 32 39 47 59 41 41 17 17 17 23 23 11 11 11 24 24 34 32 33 34
28 28 28 29 24 39 39 43 41 37 37 39 31 25 21 21 12 12 14 17 23 3 0 3 10 13 12 18 23 23 28 24 25 30 30 28 20 20 18 12 11 12 15 19 14 11 10 10 10 10
13 13 13 18 15 11 15 11 11 11 23 22 29 12 11 11 11 9 9 12 25 24 35 18 19 11 8 8 8 8 8 8 8 8 10 11 14 15 7 6 6 6 6 6 9 18 11 11 9 9
9 9 9 9 9 12 12 8 8 6 6 8 8 8 9 9 14 6 6 8 8 8 8 13 13 13 |