Query= MSMg01no521_o24.b1 MSMg01no521_o24.b1 CHROMAT_FILE:
MSMg01no521_o24.b1 PHD_FILE: MSMg01no521_o24.b1.phd.1 CHEM: term DYE:
big TIME: Wed May 18 20:55:24 2005
(448 letters)
>mm_chr13_78502305_78503152
Length = 848
Score = 700 bits (362), Expect = 0.0
Identities = 404/436 (92%), Gaps = 28/436 (6%)
Strand = Plus / Plus
Query: 5 gaattccagaccagcctcgaccacatagttacatcttggagagatagataattagataga 64
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 233 gaattccagaccagcctcgactacatagttacatcttggagagatagataat-------- 284
Query: 65 tagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatgataaatagatagag 124
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct: 285 --------------------tagatagatagatagatagatagatgatagatagatagag 324
Query: 125 aatcttccttgcctcttattcctaacaatgcagtattatcaagtacttaattagcactta 184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 325 aatcttccttgcctcttattcctaacaatgcagtattatcaagtacttaattagcactta 384
Query: 185 tattgaattatgtactgtgactgacttagaggtgatttaaggtatatatcttgatgtttt 244
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 385 tattgaattatgtactgtgactgacttagaggtgatttaaggtatatatcttgatgtttt 444
Query: 245 agttatattgcactgttttgtgtagagatttaagcatctatatatttgagtatcccctgg 304
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 445 agttatattgcactgttttgtgtagagatttaagcatctatatatttgagtatcccctgg 504
Query: 305 atgatgacaccaatctcccaaggatatcaagtaatagctgtagtaccaatctgaaatatt 364
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 505 atgatgacaccaatctcccaaggatatcaagtaatagctgtagtaccaatctgaaatatt 564
Query: 365 aatagcacgtctcccaaattctcttgatatttatcattgttggaagaactttattttgtg 424
|||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 565 aatagcacgtcttctaaattctcttgatatttatcattgttggaagaactttattttgtg 624
Query: 425 tgcattgtccacgtgt 440
||||||||||||||||
Sbjct: 625 tgcattgtccacgtgt 640
Score = 103 bits (53), Expect = 3e-26
Identities = 56/57 (98%), Gaps = 1/57 (1%)
Strand = Plus / Minus
Query: 57 tagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatgata 113
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct: 713 tagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagataga-gata 658
Score = 103 bits (53), Expect = 3e-26
Identities = 53/53 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 57 tagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagat 109
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 717 tagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagat 665
Score = 97.4 bits (50), Expect = 2e-24
Identities = 56/58 (96%), Gaps = 1/58 (1%)
Strand = Plus / Minus
Query: 69 tagatagatagatagatagatagatagatagatagatagat-gataaatagatagaga 125
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||
Sbjct: 717 tagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagaga 660
Score = 93.5 bits (48), Expect = 3e-23
Identities = 54/56 (96%), Gaps = 2/56 (3%)
Strand = Plus / Minus
Query: 46 agatagata-attagatagatagatagatagatagatagatagatagatagataga 100
||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 716 agatagataga-tagatagatagatagatagatagatagatagatagatagataga 662
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.34 0.600 1.10
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 2, Extension: 1
Number of Sequences: 1
Number of Hits to DB: 80
Number of extensions: 16
Number of successful extensions: 16
Number of sequences better than 10.0: 1
Number of HSP's gapped: 8
Number of HSP's successfully gapped: 8
Length of query: 448
Length of database: 848
Length adjustment: 10
Effective length of query: 438
Effective length of database: 838
Effective search space: 367044
Effective search space used: 367044
X1: 8 (15.9 bits)
X2: 517 (999.5 bits)
X3: 517 (999.5 bits)
S1: 8 (16.4 bits)
S2: 8 (16.2 bits)
| |
