BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-007O07
Chromosome14 (Build37)
Map Location 82,910,696 - 83,039,177
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream genenone
Downstream geneLOC100043773
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-007O07.bB6Ng01-007O07.g
ACCDH844329DH844330
length8721,034
definitionDH844329|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-007O07, 5' end.DH844330|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-007O07, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(82,910,696 - 82,911,513)(83,038,142 - 83,039,177)
sequence
gaattcagtaatgatagaaaaatactgaaaaaagaaaaatctgaaatgaa
gtggaaattaaaaacccataaatatattgtacaactgatggaagcttccc
taacaatacactatttgggagaaagaatatcagtattgaacatgaggtaa
ggttggattgcttaaacaaaaataataataataacaagttacagaaataa
ccctcaaaattatagacgtaaaaggagaaggttctaagtcaaggtataga
atttattctctataaaataatataagtaatcctaagtctatggagaaagt
gccaagtcaggtcaagaggcaaactgaataccaaataaagaaggccaaaa
acatagcttcccatgactgatcatagtaaaaccctaaacataaacttaga
aaatataaaaagtgtgttgatgttgattacatacctgaatttgagtcaac
catgtttctataattaatccttcactaatacttctgtacaactagacaca
ttcattggttcaccctggtaaagttgagttgggtagtttctttagctata
ctgtcctgctattcataaatttctaggaagaatcactcaatacaattcat
acccacatatgaccagcagaaccattgatgacttaagcaacatcatttga
gtgagctgtttttatacaaagagcagtgctaatcatgtgctgagtttagt
atggcttactttcctcatatgataaggagatggcttaatcctttagtatc
agctgcattttgtttgtaatgtttagagaaaaatgcatcaagtgcccaca
atggacagtgaattctgaaggggaccgtcccagaaagctgtcttctatcc
ctatgaagaccaggactggaac
gaattcaaacaaagttcatggagggctggttttaaatgacttgttcctgt
ttgcttgtttagcctgctctcttgtgtgacataggaaaaattgcccaaaa
gtggaaccacccacattggacttggtcccacatgaatccctgttcaagaa
aacagtgcacacagagcaatcaagaggggctattttctcaattgatgctc
tctctctctctctctctctcaattatctccagcttgtgtcaaattgttat
aaaacagggccaacaaagcactttggaagctctgggaattattaggaact
gtgagtgttgagctatgtattactaacatggaaaaagaccacaagttaaa
gctcagagtatacttcaggacaagtcatgcccctccccatttagagtcaa
atcaatatgttatatgcgtgacctctattcttgacattatacctggtgac
actgcacatttcacaaaattgtcatgtttttcagtgaggtacagctgtag
gacttgaaacatgttaattgagtgctaattgtctatctaaaacaaatatg
tcacttgcaatttaaatttattgaggtaacaaactaaatttctattaaaa
aatgcttcaggttcttctgttcatcgccatctaaaataaaattcaccgaa
gcataaaaaataagaaggatttacatggccatcttagataagctcttcag
caatcaggcataaaacacacctatgtaaactttcctttcctatcttctcc
cttttctatattaatctagaaacatataatcaaactagatgagaaattag
agacatgatttgaaatatgtgtggggtcatttcttgtacctgataaatta
taccatcagatttccaataaaaataactggtacactttatatatgaaata
actgtataaataaaggattaagttatttcttattttttttgctagaaagg
ccaacaattgtatcagaaataaagactgattggtattagtcaataatttg
atttattcttaattttctttgtcttttaatggat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_82910696_82911513
seq2: B6Ng01-007O07.b_104_914

seq1  AAACCCATAAATATATTGTACAACTGATGGAAGCTTCCCTAACAATACAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACCCATAAATATATTGTACAACTGATGGAAGCTTCCCTAACAATACAC  50

seq1  TATTTGGGAGAAAGAATATCAGTATTGAACATGAGGTAAGGTTGGATTGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTGGGAGAAAGAATATCAGTATTGAACATGAGGTAAGGTTGGATTGC  100

seq1  TTAAACAAAAATAATAATAATAACAAGTTACAGAAATAACCCTCAAAATT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAACAAAAATAATAATAATAACAAGTTACAGAAATAACCCTCAAAATT  150

seq1  ATAGACGTAAAAGGAGAAGGTTCTAAGTCAAGGTATAGAATTTATTCTCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGACGTAAAAGGAGAAGGTTCTAAGTCAAGGTATAGAATTTATTCTCT  200

seq1  ATAAAATAATATAAGTAATCCTAAGTCTATGGAGAAAGTGCCAAGTCAGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAAATAATATAAGTAATCCTAAGTCTATGGAGAAAGTGCCAAGTCAGG  250

seq1  TCAAGAGGCAAACTGAATACCAAATAAAGAAGGCCAAAAACATAGCTTCC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAGAGGCAAACTGAATACCAAATAAAGAAGGCCAAAAACATAGCTTCC  300

seq1  CATGACTGATCATAGTAAAACCCTAAACATAAACTTAGAAAATATAAAAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGACTGATCATAGTAAAACCCTAAACATAAACTTAGAAAATATAAAAA  350

seq1  GTGTGTTGATGTTGATTACATACCTGAATTTGAGTCAACCATGTTTCTAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTTGATGTTGATTACATACCTGAATTTGAGTCAACCATGTTTCTAT  400

seq1  AATTAATCCTTCACTAATACTTCTGTACAACTAGACACATTCATTGGTTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTAATCCTTCACTAATACTTCTGTACAACTAGACACATTCATTGGTTC  450

seq1  ACCCTGGTAAAGTTGAGTTGGGTAGTTTCTTTAGCTATACTGTCCTGCTA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCTGGTAAAGTTGAGTTGGGTAGTTTCTTTAGCTATACTGTCCTGCTA  500

seq1  TTCATAAATTTCTAGGAAGAATCACTCAATACAATTCATACCCACATATG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATAAATTTCTAGGAAGAATCACTCAATACAATTCATACCCACATATG  550

seq1  ACCAGCAGAACCATTGATGACTTAAGCAACATCATTTGAGTGAGCTGTTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAGCAGAACCATTGATGACTTAAGCAACATCATTTGAGTGAGCTGTTT  600

seq1  TTATACAAAGAGCAGGTGCTAATCATGTGCTGAGTTTAGTATGGCTTACT  650
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATACAAAGAGCA-GTGCTAATCATGTGCTGAGTTTAGTATGGCTTACT  649

seq1  TTCCTCATATGAT-AGGAGATGGCTTATTCCTTTAGTATCAGCTGCATTG  699
      ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| 
seq2  TTCCTCATATGATAAGGAGATGGCTTAATCCTTTAGTATCAGCTGCATTT  699

seq1  TGTTTGTAATGGTTTAGAGAAAAATGCAATCAGTGCACACAATTGGACAG  749
      |||||||||| |||||||||||||||||   ||||| ||||| |||||||
seq2  TGTTTGTAAT-GTTTAGAGAAAAATGCATCAAGTGCCCACAA-TGGACAG  747

seq1  TGAACATTCTTGAGGGGA-CGTCACAGAAAGCTTGTCTTCTATCACCATA  798
      |||  |||||  |||||| |||| |||||||| ||||||||||  || ||
seq2  TGA--ATTCTGAAGGGGACCGTCCCAGAAAGC-TGTCTTCTAT--CCCTA  792

seq1  TGAAGACCAGGGACTGGAAC  818
      ||||||||| ||||||||||
seq2  TGAAGACCA-GGACTGGAAC  811

seq1: chr14_83038142_83039177
seq2: B6Ng01-007O07.g_68_1101 (reverse)

seq1  ATCCATTTAAAAGACAAAGAAAATAAAGAATAAAATCAAAATTATTTGAC  50
      ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||
seq2  ATCCA-TTAAAAGACAAAGAAAATTAAGAAT-AAATC-AAATTA-TTGAC  46

seq1  TAATACCAATCAGTCTGTATCTCTGATAACAATTGTTGGCCTTTCTAGC-  99
      |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| 
seq2  TAATACCAATCAGTCTTTATTTCTGAT-ACAATTGTTGGCCTTTCTAGCA  95

seq1  AAAAATATAAGAAATAACTTAAT-CTTTATTTATACAGTTATTTCATATA  148
      ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAAATAAGAAATAACTTAATCCTTTATTTATACAGTTATTTCATATA  145

seq1  TAAAGTGTACCAGTTATTTTTATTGGAAATCTGATGGTATAATTTATCAG  198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAGTGTACCAGTTATTTTTATTGGAAATCTGATGGTATAATTTATCAG  195

seq1  GTACAAGAAATGACCCCACACATATTTCAAATCATGTCTCTAATTTCTCA  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACAAGAAATGACCCCACACATATTTCAAATCATGTCTCTAATTTCTCA  245

seq1  TCTAGTTTGATTATATGTTTCTAGATTAATATAGAAAAGGGAGAAGATAG  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAGTTTGATTATATGTTTCTAGATTAATATAGAAAAGGGAGAAGATAG  295

seq1  G-AAGGAAAGTTTACATAGGTGTGTTTTATGCCTGATTGCTGAAGAGCTT  347
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGGAAAGTTTACATAGGTGTGTTTTATGCCTGATTGCTGAAGAGCTT  345

seq1  ATCTAAGATGGCCATGTAAATCCTTCTTATTTTTTATGCTTCGGTGAATT  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTAAGATGGCCATGTAAATCCTTCTTATTTTTTATGCTTCGGTGAATT  395

seq1  TTATTTTAGATGGCGATGAACAGAAGAACCTGAAGCATTTTTTAATAGAA  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTTTAGATGGCGATGAACAGAAGAACCTGAAGCATTTTTTAATAGAA  445

seq1  ATTTAGTTTGTTACCTCAATAAATTTAAATTGCAAGTGACATATTTGTTT  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTAGTTTGTTACCTCAATAAATTTAAATTGCAAGTGACATATTTGTTT  495

seq1  TAGATAGACAATTAGCACTCAATTAACATGTTTCAAGTCCTACAGCTGTA  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGATAGACAATTAGCACTCAATTAACATGTTTCAAGTCCTACAGCTGTA  545

seq1  CCTCACTGAAAAACATGACAATTTTGTGAAATGTGCAGTGTCACCAGGTA  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCACTGAAAAACATGACAATTTTGTGAAATGTGCAGTGTCACCAGGTA  595

seq1  TAATGTCAAGAATAGAGGTCACGCATATAACATATTGATTTGACTCTAAA  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATGTCAAGAATAGAGGTCACGCATATAACATATTGATTTGACTCTAAA  645

seq1  TGGGGAGGGGCATGACTTGTCCTGAAGTATACTCTGAGCTTTAACTTGTG  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGGAGGGGCATGACTTGTCCTGAAGTATACTCTGAGCTTTAACTTGTG  695

seq1  GTCTTTTTCCATGTTAGTAATACATAGCTCAACACTCACAGTTCCTAATA  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTTTTTCCATGTTAGTAATACATAGCTCAACACTCACAGTTCCTAATA  745

seq1  ATTCCCAGAGCTTCCAAAGTGCTTTGTTGGCCCTGTTTTATAACAATTTG  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCCCAGAGCTTCCAAAGTGCTTTGTTGGCCCTGTTTTATAACAATTTG  795

seq1  ACACAAGCTGGAGATAATTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCATCAATT  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACAAGCTGGAGATAATTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCATCAATT  845

seq1  GAGAAAATAGCCCCTCTTGATTGCTCTGTGTGCACTGTTTTCTTGAACAG  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAAAATAGCCCCTCTTGATTGCTCTGTGTGCACTGTTTTCTTGAACAG  895

seq1  GGATTCATGTGGGACCAAGTCCAATGTGGGTGGTTCCACTTTTGGGCAAT  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATTCATGTGGGACCAAGTCCAATGTGGGTGGTTCCACTTTTGGGCAAT  945

seq1  TTTTCCTATGTCACACAAGAGAGCAGGCTAAACAAGCAAACAGGAACAAG  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCCTATGTCACACAAGAGAGCAGGCTAAACAAGCAAACAGGAACAAG  995

seq1  TCATTTAAAACCAGCCCTCCATGAACTTTGTTTGAATTC  1036
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATTTAAAACCAGCCCTCCATGAACTTTGTTTGAATTC  1034