BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-010G01
Chromosome14 (Build37)
Map Location 59,880,851 - 60,025,965
singlet/doubletdoublet
Overlap genePhf11, EG236451, D14Ertd668e, EG628705, Setdb2
Upstream geneEG668177, EG668182, 1700129C05Rik, EG380907, Rcbtb1, EG628693
Downstream geneCab39l, Cdadc1, Tmem46, Atp8a2, LOC668162, LOC628768, Nupl1, Mtmr6, 2600011E07Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-010G01.bB6Ng01-010G01.g
ACCDH846061DH846062
length1,0061,044
definitionDH846061|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-010G01, 5' end.DH846062|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-010G01, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(60,024,958 - 60,025,965)(59,880,851 - 59,881,909)
sequence
gaattccattttgtcattttttagctagttcccaataggcaggtattaag
tttacttccaaatgtgtcctggttaaaaaacaatatttatcaacaatctt
acacataaatatctgcgcagatggtcctatacacaacattttaaatatag
tgttgatgagtcaggagataaatgtgttcataataaatagcaatccccat
ttgggagttctatgttgacattctgtcagcatgtctgaatggctatacta
aattggttcttgctattaactacatggctaagaactgtgggagattgcat
attacttaaactgagaaggacaaaatcagtgagatgtgtaagaaacaagg
atgctatgtctaacctctggtttttgttttgttttgtttaacagcatagt
tgctgtccaaatctctgggtgcagaatgtttttgtagaaacacatgacag
gaatttcccattggtggccttcttcaccaacaggtttgtgatttattttg
cttatacaatttaattctgtagctgtagcttttaagatagtaaatatgaa
aagatgcaacataaccccaaacatctggtatcataaaatagtcagtttac
ctaaattgttaactagtcagtaaaaatttaaagggttggaattaatactt
tttttttagatattttcttcatttacatttccatccatttgcctaagaat
ttcataaattcattgtttttaattgctgagtagtactccattgtgtaaat
gtaccacattttctgtattaattcctctgttgacggacatctgagttctt
cccagcttctggctattataaatgaggctgctatgaacatagtggagcat
gtgtccttatttcaagttggaacatctttctgggtatatgcccaagagag
gtattgcggatcttccggtagtactatgtccattttcttgaggaccgcca
gactgatttccagagttgttgtaccagcttgcaatccccgaacaatggag
aagtgt
gaattcaagtccatgtatttatatacacacatagtagttgaagtagtata
ttaaacttttagtgcatgttatttttgttcaattcagtgtgtgcatgtgt
ttgctatgacacagtcatttcagctacatagtgagaccctgtcccaaaca
agcaaacaaaaaaaaaaaatcctcaaagaagaaaagaatatttttgcaca
ctaaattcacagggactggagagatggaccaatgggtagagccctagctg
tacaggcacaggaacctgagttatccactcctcagtactgcataaagtca
caggtaggatgtgtacccctctcaggactttaaggacacagacaaaagga
ctgctagcttgctggccacccagtctagatgaaattgcaagccaggttca
ggacagtatctctcaaggggccaagatgtagcttgataaagtgtaacacc
caatttccatattgattcacatacaccaaagaatgcaatagataggcagc
aagggattcagacaaaatgaaagacacagggagggtgagattagagaaat
cgagtctggactcattattagtaaactcatttcaaaggaaaatgctttta
tttggtgccttaatgcaacactgatatattattgatgactcattcatgcc
tcctatgtttttgtctcaccctctcaaatacagaaaccaacagatctcta
attggtctcaagtcctattcaagaataaggatatcatgtgccacgtgctc
tcgtggaatcagcttgacagatgaaagtctggaattttctcatgagcaaa
gagttactacaggctacattccatgccaagagcaagttgatatactatcc
tgataaaggggaactctccagacaggataaattttacaggacctaagaat
ttagagctccgtgataacacagtaatcttcagttctatcagagtaacacc
ccttgtgctattacactaaagtgtgaatctgctggcactagctgatccta
gcatggcttgttatcctaaactttctcatgaaacaagagtacaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_60024958_60025965
seq2: B6Ng01-010G01.b_45_1050 (reverse)

seq1  ACACTCCTCCATTGTTCGTGGGATTGCAAGCTGGTACAACAACTCTGGAA  50
      ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACTTCTCCATTGTTCG-GGGATTGCAAGCTGGTACAACAACTCTGGAA  49

seq1  ATCAGTCTGGCGGTTCCTCAGAAAATTGGACATAGTACTACCGGAAGATC  100
      ||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| 
seq2  ATCAGTCTGGCGG-TCCTCAAGAAAATGGACATAGTACTACCGGAAGAT-  97

seq1  CCGCAATACCTCTCCTGGGCATATACCCAG-AAGATGTTCCAACTTGTAA  149
      |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||
seq2  CCGCAATACCTCTCTTGGGCATATACCCAGAAAGATGTTCCAACTTGAAA  147

seq1  TAAGGACACATGCTCCACTATGTTCATAGCAGCCTCATTTATAATAGCCA  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGGACACATGCTCCACTATGTTCATAGCAGCCTCATTTATAATAGCCA  197

seq1  GAAGCTGGGAAGAACTCAGATGTCCGTCAACAGAGGAATTAATACAGAAA  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGCTGGGAAGAACTCAGATGTCCGTCAACAGAGGAATTAATACAGAAA  247

seq1  ATGTGGTACATTTACACAATGGAGTACTACTCAGCAATTAAAAACAATGA  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGGTACATTTACACAATGGAGTACTACTCAGCAATTAAAAACAATGA  297

seq1  ATTTATGAAATTCTTAGGCAAATGGATGGAAATGTAAATGAAGAAAATAT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTATGAAATTCTTAGGCAAATGGATGGAAATGTAAATGAAGAAAATAT  347

seq1  CTAAAAAAAAAGTATTAATTCCAACCCTTTAAATTTTTACTGACTAGTTA  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAAAAAAAAGTATTAATTCCAACCCTTTAAATTTTTACTGACTAGTTA  397

seq1  ACAATTTAGGTAAACTGACTATTTTATGATACCAGATGTTTGGGGTTATG  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAATTTAGGTAAACTGACTATTTTATGATACCAGATGTTTGGGGTTATG  447

seq1  TTGCATCTTTTCATATTTACTATCTTAAAAGCTACAGCTACAGAATTAAA  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCATCTTTTCATATTTACTATCTTAAAAGCTACAGCTACAGAATTAAA  497

seq1  TTGTATAAGCAAAATAAATCACAAACCTGTTGGTGAAGAAGGCCACCAAT  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTATAAGCAAAATAAATCACAAACCTGTTGGTGAAGAAGGCCACCAAT  547

seq1  GGGAAATTCCTGTCATGTGTTTCTACAAAAACATTCTGCACCCAGAGATT  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAAATTCCTGTCATGTGTTTCTACAAAAACATTCTGCACCCAGAGATT  597

seq1  TGGACAGCAACTATGCTGTTAAACAAAACAAAACAAAAACCAGAGGTTAG  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGACAGCAACTATGCTGTTAAACAAAACAAAACAAAAACCAGAGGTTAG  647

seq1  ACATAGCATCCTTGTTTCTTACACATCTCACTGATTTTGTCCTTCTCAGT  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATAGCATCCTTGTTTCTTACACATCTCACTGATTTTGTCCTTCTCAGT  697

seq1  TTAAGTAATATGCAATCTCCCACAGTTCTTAGCCATGTAGTTAATAGCAA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAGTAATATGCAATCTCCCACAGTTCTTAGCCATGTAGTTAATAGCAA  747

seq1  GAACCAATTTAGTATAGCCATTCAGACATGCTGACAGAATGTCAACATAG  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACCAATTTAGTATAGCCATTCAGACATGCTGACAGAATGTCAACATAG  797

seq1  AACTCCCAAATGGGGATTGCTATTTATTATGAACACATTTATCTCCTGAC  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTCCCAAATGGGGATTGCTATTTATTATGAACACATTTATCTCCTGAC  847

seq1  TCATCAACACTATATTTAAAATGTTGTGTATAGGACCATCTGCGCAGATA  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATCAACACTATATTTAAAATGTTGTGTATAGGACCATCTGCGCAGATA  897

seq1  TTTATGTGTAAGATTGTTGATAAATATTGTTTTTTAACCAGGACACATTT  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATGTGTAAGATTGTTGATAAATATTGTTTTTTAACCAGGACACATTT  947

seq1  GGAAGTAAACTTAATACCTGCCTATTGGGAACTAGCTAAAAAATGACAAA  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAGTAAACTTAATACCTGCCTATTGGGAACTAGCTAAAAAATGACAAA  997

seq1  ATGGAATTC  1008
      |||||||||
seq2  ATGGAATTC  1006

seq1: chr14_59880851_59881909
seq2: B6Ng01-010G01.g_64_1107

seq1  GAATTCAAGTCCATGTATTTATATACACACATAGTAGTTGAAGTAGTATA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAGTCCATGTATTTATATACACACATAGTAGTTGAAGTAGTATA  50

seq1  TTAAACTTTTAGTGCATGTTATTTTTGTTCAATTCAGTGTGTGCATGTGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAACTTTTAGTGCATGTTATTTTTGTTCAATTCAGTGTGTGCATGTGT  100

seq1  TTGCTATGACACAGTCATTTCAGCTACATAGTGAGACCCTGTCCCAAACA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCTATGACACAGTCATTTCAGCTACATAGTGAGACCCTGTCCCAAACA  150

seq1  AGCAAACAAAAAAAAAAAATCCTCAAAGAAGAAAAGAATATTTTTGCACA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAAACAAAAAAAAAAAATCCTCAAAGAAGAAAAGAATATTTTTGCACA  200

seq1  CTAAATTCACAGGGACTGGAGAGATGGACCAATGGGTAGAGCCCTAGCTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAATTCACAGGGACTGGAGAGATGGACCAATGGGTAGAGCCCTAGCTG  250

seq1  TACAGGCACAGGAACCTGAGTTATCCACTCCTCAGTACTGCATAAAGTCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAGGCACAGGAACCTGAGTTATCCACTCCTCAGTACTGCATAAAGTCA  300

seq1  CAGGTAGGATGTGTACCCCTCTCAGGACTTTAAGGACACAGACAAAAGGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGTAGGATGTGTACCCCTCTCAGGACTTTAAGGACACAGACAAAAGGA  350

seq1  CTGCTAGCTTGCTGGCCACCCAGTCTAGATGAAATTGCAAGCCAGGTTCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTAGCTTGCTGGCCACCCAGTCTAGATGAAATTGCAAGCCAGGTTCA  400

seq1  GGACAGTATCTCTCAAGGGGCCAAGATGTAGCTTGATAAAGTGTAACACC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACAGTATCTCTCAAGGGGCCAAGATGTAGCTTGATAAAGTGTAACACC  450

seq1  CAATTTCCATATTGATTCACATACACCAAAGAATGCAATAGATAGGCAGC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATTTCCATATTGATTCACATACACCAAAGAATGCAATAGATAGGCAGC  500

seq1  AAGGGATTCAGACAAAATGAAAGACACAGGGAGGGTGAGATTAGAGAAAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGGATTCAGACAAAATGAAAGACACAGGGAGGGTGAGATTAGAGAAAT  550

seq1  CGAGTCTGGACTCATTATTAGTAAACTCATTTCAAAGGAAAATGCTTTTA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGAGTCTGGACTCATTATTAGTAAACTCATTTCAAAGGAAAATGCTTTTA  600

seq1  TTTGGTGCCTTAATGCAACACTGATATATTATTGATGACTCATTCATGCC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGGTGCCTTAATGCAACACTGATATATTATTGATGACTCATTCATGCC  650

seq1  TCCTATGTTTTTGTCTCACCCTCTCAAATACAGAAACCAACAGATCTCTA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTATGTTTTTGTCTCACCCTCTCAAATACAGAAACCAACAGATCTCTA  700

seq1  ATTGGTCTCAAGTCCTATTCAAGAATAAGGATATCATGTGCCACGTGCTC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGGTCTCAAGTCCTATTCAAGAATAAGGATATCATGTGCCACGTGCTC  750

seq1  TCGTGGAATCAGCTTGACAGATGAAAGTCTGGAATTTTCTCATGAGCAAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGTGGAATCAGCTTGACAGATGAAAGTCTGGAATTTTCTCATGAGCAAA  800

seq1  GAGTTACTACAGGCTACATTCCATGCCAAGAGCAAGTTGATATACTATCC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTTACTACAGGCTACATTCCATGCCAAGAGCAAGTTGATATACTATCC  850

seq1  TGATAAAGGGGGAACTCTCCAGACAGGATAAATTTTACAGGACCTAAGAA  900
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATAAA-GGGGAACTCTCCAGACAGGATAAATTTTACAGGACCTAAGAA  899

seq1  TTTAGAGCTCCGTGATAACACAGTAATCTTCAGTCCTATCAAGAGTTAAC  950
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||
seq2  TTTAGAGCTCCGTGATAACACAGTAATCTTCAGTTCTATC-AGAG-TAAC  947

seq1  AACCCCCTGGTGCTATTAACACTAAAGTGTGAAATTCTTGCCTGGCACTA  1000
      |  ||||| |||||||| |||||||||||||||  |||   |||||||||
seq2  A--CCCCTTGTGCTATT-ACACTAAAGTGTGAA--TCT--GCTGGCACTA  990

seq1  GGCTGATCCTAGGCATGGCTTGTTATCCCTAAACTTTCTCATGAAACAAA  1050
       |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||
seq2  -GCTGATCCTA-GCATGGCTTGTTAT-CCTAAACTTTCTCATGAAAC-AA  1036

seq1  GAGTTACAA  1059
      ||| |||||
seq2  GAG-TACAA  1044