BAC Information

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BAC

Clone NameB6Ng01-015A03
Chromosome14 (Build37)
Map Location 91,536,446 - 91,537,239
singlet/doubletsinglet
Overlap genenone
Upstream geneLOC100043336
Downstream geneEG639558, EG665377
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-015A03.g
ACCDH849392
length804
definitionDH849392|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-015A03, 3' end.
singlet/doublet---singlet
BLAST hitno hit dataunique
sequence
gaattctaaaattttggattgtttctccatctggcattaatttcttctgt
ataattctgaaaattcataagttcattgttctgtagcaatgttttcatat
taaatttgtgttttatgttgatatttatttaagggttattctattataat
attgaaaatacaagaaattattttcataattttaagaaattccttttgaa
ttagatataattttcttgatatataaaactatatttgttttggaaaatag
tcactatattgtaataaaatgaatgtttcttgcccatgtttgttagattg
ttctgttatatgtagtgtattaaacatatgtctgtaccttagcactttgt
tttctttggtgatattttcctactatttatttatttacttatttattcat
cggtctgttgataaaagtgcgatactttataattgttactttggttgtat
ttaagatgaaatctcattatgtaagtccagaataactttgaacactgcgt
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acatttataactgtgttggttctgcttcttgctttatacaccatactgtt
tgtttttagaaattggatgctttgacctctgttgtgtatgtatttattat
ttataagttttgtaagctctgatgtattttttctttattcagacaccctg
acttctctgtctctatgacagattatgctcatttgtcttgatatcatgag
agtacatacaccatgaatatttgcaatactcttacttggaatatcgttct
ctat
quality valuesOpen.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_91536446_91537239
seq2: B6Ng01-015A03.g_69_863

seq1  GAATTCTAAAATTTTGGATTGTTTCTCCATCTGGCATTAATTTCTTCTGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTAAAATTTTGGATTGTTTCTCCATCTGGCATTAATTTCTTCTGT  50

seq1  ATAATTCTGAAAATTTATAAGTTCATTGTTCTGTAGCAATGTTTTCATAT  100
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAATTCTGAAAATTCATAAGTTCATTGTTCTGTAGCAATGTTTTCATAT  100

seq1  TAAATTTGTGTTTTATGTTGATATTTATTTAAGGGTTATTCTATTATAAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAATTTGTGTTTTATGTTGATATTTATTTAAGGGTTATTCTATTATAAT  150

seq1  ATTGAAAATACAAGAAATTATTTTCATAATTTTAAGAAATTAGTTTTGAA  200
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||
seq2  ATTGAAAATACAAGAAATTATTTTCATAATTTTAAGAAATTCCTTTTGAA  200

seq1  TTTGATATAATTTTCTTGATATATAAAACTATATTTGTTTTGGAAAATAG  250
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGATATAATTTTCTTGATATATAAAACTATATTTGTTTTGGAAAATAG  250

seq1  TCACTATATTGTAATAAAATGAATGTTTCTTGCACATGTTTGTTAGATTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  TCACTATATTGTAATAAAATGAATGTTTCTTGCCCATGTTTGTTAGATTG  300

seq1  TTCTGTTATATGTAGTGTATTAAACATATGTCTGTACCTTAGCACTTTGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGTTATATGTAGTGTATTAAACATATGTCTGTACCTTAGCACTTTGT  350

seq1  TTTCTTTGGTGATATTTTCCTACTATTTATTTATTTACTTATTTATTCAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTTTGGTGATATTTTCCTACTATTTATTTATTTACTTATTTATTCAT  400

seq1  CGGTCTGTTGATAAAAGTGCGATACTTTATAATTGTTACTTTGGTTGTAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGTCTGTTGATAAAAGTGCGATACTTTATAATTGTTACTTTGGTTGTAT  450

seq1  TTAAGATGAAATCTCATTATGTAAGTCCAGAATAACTTTGAACACTGTGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  TTAAGATGAAATCTCATTATGTAAGTCCAGAATAACTTTGAACACTGCGT  500

seq1  TGAGGTCATAGGGAAATGGAACCATGAATATCAGGAAATTAGATTCTGAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGGTCATAGGGAAATGGAACCATGAATATCAGGAAATTAGATTCTGAT  550

seq1  ACATTTATAACTGTGTTGGTTCTGCTTCTTGCTTTATACACAATACTGTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  ACATTTATAACTGTGTTGGTTCTGCTTCTTGCTTTATACACCATACTGTT  600

seq1  TG-TTTTAGAAATTGGATGCTTTGACATTTGTTGTGTATGTATTTATTAT  649
      || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTTTAGAAATTGGATGCTTTGACCTCTGTTGTGTATGTATTTATTAT  650

seq1  TTATAAGTTTTGTAGGCTCTGATGTATTTTTTCTTTATTCATACACAGTG  699
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||
seq2  TTATAAGTTTTGTAAGCTCTGATGTATTTTTTCTTTATTCAGACACCCTG  700

seq1  ACTTCTTTGTCTCTATGACAGATTATGTTCATTTGTCTTGAGATCATGAG  749
      |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||
seq2  ACTTCTCTGTCTCTATGACAGATTATGCTCATTTGTCTTGATATCATGAG  750

seq1  AATAGATACACCATGAATATTTGCATTACTCTTACTTGGAATATC  794
      | || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  AGTACATACACCATGAATATTTGCAATACTCTTACTTGGAATATC  795