BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-015A05
Chromosome14 (Build37)
Map Location 77,059,930 - 77,216,107
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream gene4930564B18Rik, Cog3, Slc25a30, LOC100043189, Tpt1, LOC100038852, Gtf2f2, LOC668504, Kctd4, 1200011I18Rik, Nufip1, LOC100043752, 2900040C04Rik, Tsc22d1, 2810032E02Rik
Downstream geneLOC100043753, LOC100043201, 9030625A04Rik, Ccdc122, D230005D02Rik, LOC100043755, LOC676171, EG629678, Gm1587
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-015A05.bB6Ng01-015A05.g
ACCDH849395DH849396
length5741,059
definitionDH849395|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-015A05, 5' end.DH849396|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-015A05, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(77,059,930 - 77,060,503)(77,215,047 - 77,216,107)
sequence
gaattcacccaggcagggtttatgtgactttgggcaaagcatcaatttga
ccttttgttccactgacatgataacactgctttctttcttgatttgggta
ggagtcaaggaatacattagttatgagtactttttccacttaggatgttt
ctgcccagaggcaccattactgtaaaggagccactgtacccaggagctgg
gcaaaccgcttcctgtgtgggttctcacattctttctggttgactttgag
caaggtgactatttagcctgttgggaatgctcacctcaaaggaaactgtc
agccctatttctcagagccattctgaggctcgaagaggtagcacacttgg
atatggtttcaagtttattcatgtctatgaacttgtgtcctgattctagt
agacaaggagagaatggacctctttaggtaccttaatgcctatgtatgct
ctgtgttgtcccatttcatgctcaggccaccaaatcttgaatatatatat
gcatgttggagtgtggggttgacactagagttgtgtcttccacgcttgct
aagcagtaagtctggtgtgtgtgt
gaattcagaaggagcataatagttgagcattctggagcaccttcggcatg
tgccgaccacaacaaccctataggtttcatacggttaccacccctggttt
gtggataagggaactgaaaggtttaggaaaggaaggaattccaagctcag
gaagtacacgctgaagacacgcagtaggctttagcgtgccctccggagag
gtgaggctgatacctcagcacagcagggtggaactcggtctctcgcttcc
acccattatatctgaagagattattaagccatgagcaacaaactaattgt
ggctggcagcaaacgcgaaggtctctccttacagacggtgcagtgttcag
tttccctaaaacgatcctggtggctctgttgctccccactctccctgact
cagaactgtcctgttctgtccggaacagctctatggttggggttgatatc
aattgcacagctgcgtgttctcttggcaagtgaatccaggatgcccaacc
acgtctgcctgcttccacaccagcctcctggccagggacagctataaaag
tattctatctctaaacacggcaacaatatctattgcgatataaagtcttt
cccaacgctatgacctaagaaatagatcatgctcttttgtggagttttaa
aacgcaacaggcatttcctacctttggaaaataccatgcttttagggttt
tccaggtgcttcttgtgcactctttccaaatatccctaagtctacttatt
attattgtgcccacttttacagattacaggagaaaaactaaacataccag
agtggctcgtttttaagtgttcagagtatcaaatgcttcgtagcaattag
ctaatagatctgagctaaactgggactcaattcgggtaactaactttaac
cttaacagcttcctgctaagccagtgtgctcaactgctctatgctacttg
ccagcagttttgaattctgattgtattgttaccctttacccaggcctggg
ttttgttttgtttgttggtggctttttcttgtttctcaaaataaattaca
cggattaat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_77059930_77060503
seq2: B6Ng01-015A05.b_41_614

seq1  GAATTCACCCAGGCAGGGTTTATGTGACTTTGGGCAAAGCATCAATTTGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACCCAGGCAGGGTTTATGTGACTTTGGGCAAAGCATCAATTTGA  50

seq1  CCTTTTGTTCCACTGACATGATAACACTGCTTTCTTTCTTGATTTGGGTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTTTGTTCCACTGACATGATAACACTGCTTTCTTTCTTGATTTGGGTA  100

seq1  GGAGTCAAGGAATACATTAGTTATGAGTACTTTTTCCACTTAGGATGTTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGTCAAGGAATACATTAGTTATGAGTACTTTTTCCACTTAGGATGTTT  150

seq1  CTGCCCAGAGGCACCATTACTGTAAAGGAGCCACTGTACCCAGGAGCTGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCCCAGAGGCACCATTACTGTAAAGGAGCCACTGTACCCAGGAGCTGG  200

seq1  GCAAACCGCTTCCTGTGTGGGTTCTCACATTCTTTCTGGTTGACTTTGAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAACCGCTTCCTGTGTGGGTTCTCACATTCTTTCTGGTTGACTTTGAG  250

seq1  CAAGGTGACTATTTAGCCTGTTGGGAATGCTCACCTCAAAGGAAACTGTC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGGTGACTATTTAGCCTGTTGGGAATGCTCACCTCAAAGGAAACTGTC  300

seq1  AGCCCTATTTCTCAGAGCCATTCTGAGGCTCGAAGAGGTAGCACACTTGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCCTATTTCTCAGAGCCATTCTGAGGCTCGAAGAGGTAGCACACTTGG  350

seq1  ATATGGTTTCAAGTTTATTCATGTCTATGAACTTGTGTCCTGATTCTAGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGGTTTCAAGTTTATTCATGTCTATGAACTTGTGTCCTGATTCTAGT  400

seq1  AGACAAGGAGAGAATGGACCTCTTTAGGTACCTTAATGCCTATGTATGCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACAAGGAGAGAATGGACCTCTTTAGGTACCTTAATGCCTATGTATGCT  450

seq1  CTGTGTTGTCCCATTTCATGCTCAGGCCACCAAATCTTGAATATATATAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGTTGTCCCATTTCATGCTCAGGCCACCAAATCTTGAATATATATAT  500

seq1  GCATGTTGGAGTGTGGGGTTGACACTAGAGTTGTGTCTTCCACGCTTGCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATGTTGGAGTGTGGGGTTGACACTAGAGTTGTGTCTTCCACGCTTGCT  550

seq1  AAGCAGTAAGTCTGGTGTGTGTGT  574
      ||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCAGTAAGTCTGGTGTGTGTGT  574

seq1: chr14_77215047_77216107
seq2: B6Ng01-015A05.g_67_1125 (reverse)

seq1  ATTAATCAGTGTTAATTATATTTTGAGAAACAAGAAAAACCCTACAACAA  50
      ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||
seq2  ATTAATCCGTG-TAATT-TATTTTGAGAAACAAGAAAAAGCCACCAACAA  48

seq1  AC-AAACAAAACCCAGGCATGGTTAGAAGTGTAACAAATACAATTCAGAA  99
      || ||||||||||||||| ||| || ||| ||||| ||||||| ||||||
seq2  ACAAAACAAAACCCAGGCCTGGGTA-AAGGGTAAC-AATACAA-TCAGAA  95

seq1  TTCAAAACTGCTGGCAAGTAGCATAGAGCAGTTGAGCACACTGGCTTAGC  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAAAACTGCTGGCAAGTAGCATAGAGCAGTTGAGCACACTGGCTTAGC  145

seq1  AGGAAGCTGTTAAGGTTAAAGTTAGTTACCCGAATTGAGTCCCAGTTTAG  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAGCTGTTAAGGTTAAAGTTAGTTACCCGAATTGAGTCCCAGTTTAG  195

seq1  CTCAGATCTATTAGCTAATTGCTACGAAGCATTTGATACTCTGAACACTT  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGATCTATTAGCTAATTGCTACGAAGCATTTGATACTCTGAACACTT  245

seq1  AAAAACGAGCCACTCTGGTATGTTTAGTTTTTCTCCTGTAATCTGT-AAA  298
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  AAAAACGAGCCACTCTGGTATGTTTAGTTTTTCTCCTGTAATCTGTAAAA  295

seq1  GTGGGCACAATAATAATAAGTAGACTTAGGGATATTTGG-AAGAGTGCAC  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  GTGGGCACAATAATAATAAGTAGACTTAGGGATATTTGGAAAGAGTGCAC  345

seq1  AAGAAGCACCTGGAAAACCCTAAAAGCATGGTATTTTCCAAAGGTAGGAA  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAAGCACCTGGAAAACCCTAAAAGCATGGTATTTTCCAAAGGTAGGAA  395

seq1  ATGCCTGTTGCGTTTTAAAACTCCACAAAAGAGCATGATCTATTTCTTAG  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCCTGTTGCGTTTTAAAACTCCACAAAAGAGCATGATCTATTTCTTAG  445

seq1  GTCATAGCGTTGGGAAAGACTTTATATCGCAATAGATATTGTTGCCGTGT  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCATAGCGTTGGGAAAGACTTTATATCGCAATAGATATTGTTGCCGTGT  495

seq1  TTAGAGATAGAATACTTTTATAGCTGTCCCTGGCCAGGAGGCTGGTGTGG  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGAGATAGAATACTTTTATAGCTGTCCCTGGCCAGGAGGCTGGTGTGG  545

seq1  AAGCAGGCAGACGTGGTTGGGCATCCTGGATTCACTTGCCAAGAGAACAC  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCAGGCAGACGTGGTTGGGCATCCTGGATTCACTTGCCAAGAGAACAC  595

seq1  GCAGCTGTGCAATTGATATCAACCCCAACCATAGAGCTGTTCCGGACAGA  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGCTGTGCAATTGATATCAACCCCAACCATAGAGCTGTTCCGGACAGA  645

seq1  ACAGGACAGTTCTGAGTCAGGGAGAGTGGGGAGCAACAGAGCCACCAGGA  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGGACAGTTCTGAGTCAGGGAGAGTGGGGAGCAACAGAGCCACCAGGA  695

seq1  TCGTTTTAGGGAAACTGAACACTGCACCGTCTGTAAGGAGAGACCTTCGC  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGTTTTAGGGAAACTGAACACTGCACCGTCTGTAAGGAGAGACCTTCGC  745

seq1  GTTTGCTGCCAGCCACAATTAGTTTGTTGCTCATGGCTTAATAATCTCTT  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTGCTGCCAGCCACAATTAGTTTGTTGCTCATGGCTTAATAATCTCTT  795

seq1  CAGATATAATGGGTGGAAGCGAGAGACCGAGTTCCACCCTGCTGTGCTGA  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGATATAATGGGTGGAAGCGAGAGACCGAGTTCCACCCTGCTGTGCTGA  845

seq1  GGTATCAGCCTCACCTCTCCGGAGGGCACGCTAAAGCCTACTGCGTGTCT  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTATCAGCCTCACCTCTCCGGAGGGCACGCTAAAGCCTACTGCGTGTCT  895

seq1  TCAGCGTGTACTTCCTGAGCTTGGAATTCCTTCCTTTCCTAAACCTTTCA  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGCGTGTACTTCCTGAGCTTGGAATTCCTTCCTTTCCTAAACCTTTCA  945

seq1  GTTCCCTTATCCACAAACCAGGGGTGGTAACCGTATGAAACCTATAGGGT  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCCCTTATCCACAAACCAGGGGTGGTAACCGTATGAAACCTATAGGGT  995

seq1  TGTTGTGGTCGGCACATGCCGAAGGTGCTCCAGAATGCTCAACTATTATG  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTGTGGTCGGCACATGCCGAAGGTGCTCCAGAATGCTCAACTATTATG  1045

seq1  CTCCTTCTGAATTC  1061
      ||||||||||||||
seq2  CTCCTTCTGAATTC  1059