BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-017O22
Chromosome14 (Build37)
Map Location 122,915,934 - 122,916,780
singlet/doubletsinglet
Overlap genenone
Upstream geneLOC100043577, Dock9, LOC668843, Phgdhl1, Gpr18, Ebi2, Timm8a2, Tm9sf2, LOC621710, Clybl, 1700108J01Rik, EG328479, EG432907, Zic5, Zic2, ENSMUSG00000075465, LOC668847
Downstream genePcca, BC006662, 4930594M22Rik, Tmtc4, Vgcnl1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-017O22.bB6Ng01-017O22.g
ACCDH851471DH851472
length1,182859
definitionDH851471|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-017O22, 5' end.DH851472|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-017O22, 3' end.
singlet/doublet---singlet
BLAST hitno hit dataunique
sequence
gaattctcacctgaggaataccgaatggcagagaagcacctgaaaaaatg
ttcaacatccttaatcatcagggaaatgcaaatcaaaacaaccctgagat
tccacctcacaccagtcagaatggctaagatcaaaaattcaggtgacagc
agatgctggcgtggatgtggagaaagaagaacactcctccattgttggtg
ggattgcaggcttgtacaaccactctggaaatcagtctggcagttccaca
gaaaattggacatagtactaccggaggatccagcaatacctctcctgggc
atatatccagaagatgccccaactggtaagaaggacacatgctccactat
gtttatagcagccttatttataatagctagaagctggaaagaacccagat
gcccctcaacagaggaatggatacagaaaatgtggtacatctacacaatg
gagtactactcagctattaaaaagaatgaatttatgaaattcctagccaa
atggatggacctggagggcatcatcctcagtgaggtaacacattcacaaa
ggaactcacacaatatgtactcactgataagtggatattagcccaaaacc
taggatacccaagatataaaatacaatttcctaaacacatgaaactcaag
agaaatgaagactgaagtgtggacactatgcccctccttagaagtgggaa
caaaacacccatggaaggagtttcagagacaaagttttggagctgagatg
aaaggatggaccatgtagagactgtcatatctagggatccaccccataat
cagcatccaaatgctgacaccattgcatacactagcaagattttatcgaa
aggacccagatgtagctgtctcttgtgagactatgccggggcctagcaaa
cacagaagtggatgctcacagtcagctaatggatggatcaccagggctcc
caatggaaggagctagagaaagtacccaaggagctaaagggatctgcaac
ctataggtggaacacattatgaactaaccagtaccccgagctcttgactc
tagcttgcatagtatcaaagatggcctagttcggcatacctggaaagaag
agtccattgactcgcaaacttaatggcccagtacagggaaacgctcaggc
caataagttggactgggtgggagttagggaaa
gaattcactgttaattgtgctaaaccggatcacttggctcttaggctttt
gttttgtgtgagaagagtatgaaagattttggagggttggagggatggct
cagtggttaagagcacttactgctcttccagagaatctgaattaaatccc
agcaatcacttcaggcatctcacaaatacctgtatctctagctctaaggc
acctgataacctcttctgcctttcaagaagcacctatatacatgtgacac
agatatgcacacacacatctgtaaacatgtgacatatatatgcctaacac
atctgtatatatgtgacatacatataactaacacaatgtatacatgtgtc
atacatatgcctaacacacctgtatacatgtgacatacatataacacaat
gtatacatgtggcacacatacccctatatacatgtgacacacatatgcac
acacacatctgtaaacatgtgacatatatatgcctaacacatctgtatac
atgtgacatacatatgcgtaacacacctgtatacatgtgacatacatata
actaacacacctgtatacatgtgacatacatataactaacacaatgtata
catgttggcacacatacccctatatacatgtgacacatgtacatctatat
aatatatgtgacacacacctaaataaatataaataattgttttgaaaaga
aaagattttggaaattttgggctataaagaggcatttgaattcctataag
cagagttttaatgagctcaagctaccctcaaataaaatgattctcccttc
ctaagtctcacagagtgctaatgataataggtgtctggtgccataacctg
gccttagat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_122915934_122916780
seq2: B6Ng01-017O22.g_69_927

seq1  GAATTCACTGTTAATTGTGCTAAACCGGATCACTTGGCTCTTAGGCTTTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACTGTTAATTGTGCTAAACCGGATCACTTGGCTCTTAGGCTTTT  50

seq1  GTTTTGTGTGAGAAGAGTATGAAAGATTTTGGAGGGTTGGAGGGATGGCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTTGTGTGAGAAGAGTATGAAAGATTTTGGAGGGTTGGAGGGATGGCT  100

seq1  CAGTGGTTAAGAGCACTTACTGCTCTTCCAGAGAATCTGAATTAAATCCC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGGTTAAGAGCACTTACTGCTCTTCCAGAGAATCTGAATTAAATCCC  150

seq1  AGCAATCACTTCAGGCATCTCACAAATACCTGTATCTCTAGCTCTAAGGC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAATCACTTCAGGCATCTCACAAATACCTGTATCTCTAGCTCTAAGGC  200

seq1  ACCTGATAACCTCTTCTGCCTTTCAAGAAGCACCTATATACATGTGACAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTGATAACCTCTTCTGCCTTTCAAGAAGCACCTATATACATGTGACAC  250

seq1  AGATATGCACACACACATCTGTAAACATGTGACATATATATGCCTAACAC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATATGCACACACACATCTGTAAACATGTGACATATATATGCCTAACAC  300

seq1  ATCTGTATATATGTGACATACATATAACTAACACAATGTATACATGTGTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTGTATATATGTGACATACATATAACTAACACAATGTATACATGTGTC  350

seq1  ATACATATGCCTAACACACCTGTATACATGTGACATACATATAACACAAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACATATGCCTAACACACCTGTATACATGTGACATACATATAACACAAT  400

seq1  GTATACATGTGGCACACATACCCCTATATACATGTGACACACATATGCAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATACATGTGGCACACATACCCCTATATACATGTGACACACATATGCAC  450

seq1  ACACACATCTGTAAACATGTGACATATATATGCCTAACACATCTGTATAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACATCTGTAAACATGTGACATATATATGCCTAACACATCTGTATAC  500

seq1  ATGTGACATACATATGCGTAACACACCTGTATACATGTGACATACATATA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGACATACATATGCGTAACACACCTGTATACATGTGACATACATATA  550

seq1  ACTAACACACCTGTATACATGTGACATACATATAACTAACACAATGTATA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTAACACACCTGTATACATGTGACATACATATAACTAACACAATGTATA  600

seq1  CATG-TGGCACACATACCCCTATATACATGTGACACATGTACATCTATAT  649
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGTTGGCACACATACCCCTATATACATGTGACACATGTACATCTATAT  650

seq1  AATATATGTGACACACACCTAAATAAATATAAATAATTGTTTTTGAAAAG  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  AATATATGTGACACACACCTAAATAAATATAAATAATTG-TTTTGAAAAG  699

seq1  -AAAGATTTTGG-AACTTTGGGCTAT-AAGAGGCA-TTGAATT-CTATAA  744
       ||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||
seq2  AAAAGATTTTGGAAATTTTGGGCTATAAAGAGGCATTTGAATTCCTATAA  749

seq1  GCAGAG-TTTAATGAGCTCAAGCTACCCTCAAAT-AAATGATTCT-CCTT  791
      |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||
seq2  GCAGAGTTTTAATGAGCTCAAGCTACCCTCAAATAAAATGATTCTCCCTT  799

seq1  CCTAAGTCTCACAG-GTGCT-ATGAATATAGGTGTCTGTCACCAT-ACCT  838
      |||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||   |||| ||||
seq2  CCTAAGTCTCACAGAGTGCTAATGATAATAGGTGTCTGGTGCCATAACCT  849

seq1  GG-CTTAGAT  847
      || |||||||
seq2  GGCCTTAGAT  859