BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-024H07
Chromosome14 (Build37)
Map Location 101,275,135 - 101,383,948
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneKlf12, LOC100043413, EG668683, EG668684
Downstream gene1700110M21Rik, LOC100043421, LOC382936, Tbc1d4, Commd6, Uchl3, Lmo7, LOC100043795, LOC545567
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-024H07.bB6Ng01-024H07.g
ACCDH856085DH856086
length1,1201,096
definitionDH856085|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-024H07, 5' end.DH856086|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-024H07, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(101,275,135 - 101,276,276)(101,382,843 - 101,383,948)
sequence
gaattcattttataaaatcttcacaggaacttgggttcttaaacatcttg
cagaatcctctaagtatatttatagtacaattcacttctctttaattcat
ttatagaaaaaaattagatcctcagtgacatattttcttaaactatatct
attgcatcacatcctatagtctcagacagggtatttatagtgcacataac
catgtaaagacttgggtatggattctataatcatgcagtccatttcagaa
gtcaacaaagatgatgagaaacaggctatgtttgtgctactttcaaaagg
atgctcacaatcctactctctggcctctggccctttctaattggtgttgc
atgtggagagtctctgcatgcctgtggctagagtcctgctccatcatgct
tgtgatttaccactggatgtggagacagtcctgctccatcatgcttgtaa
ttgtttggatgtttccttagaattagactttcaagtgtcctttgaataaa
attttttttcactctgtgtttgctattgtacttttattttacaggaagcc
gacagtttacataatggtaaaacaatcatggattttggatgcaaaatcaa
aaacaaaaaaccccagaaatccaaaacccaaaacaaacaaaccaaaaaaa
tccaccaccgcaacctacaaaacctttgtcttaagtatttctgttcctta
caaactttataaccttcgttagtataatttcattctctgaaacccagatg
ccaactctcagaaaggtgaaattggttaaagaaagtctatagtaaacatg
aacggctttaggaagtggtgccactacttcctaatattcatgtatcaatt
taaatatagtcttctaagattacctattgctcctttaaaatgtagtaaat
tgggatgggaatacaaatcagggcagagaatttatgtagtagtcaccaaa
tcccaagttaatgcccatatcacgccaacacacacacacatacacacaca
cacacacacaaagcaattaataaagacccatatttgatgacttttaattg
aatgaacccagtaagatttattctatgtgggatcttagtttataacatta
atacatgtctaaaaactgaa
gaattcaccagaataactcggaggaagaaacagaccctgtattaaagact
aagaggaggtaatgagccatctggcagacatagaacaaataagagttgca
agagctaattgggaactagagtataaatgtaagtctttgagtcattattc
agacctagggtgggcatagaaattccttataggtatagaaggaaaactcc
ggtatatttgcatgactaggatctaataacaacttaaaatgtgtataaaa
gctgtatacacatacatacatacatacatacatacatacatacatacata
cacacacatacatacatacatacatatatacatacacacacacatacata
aacccacacatatatacatagacacatacatacatacagctagctctgga
actttcagtttcttatgcagaatgagaaggcatgcactggatgtttgtgc
attttgaatgtaaaaggaaacctaacctattagactattaggtgtggagt
gggtcaagtctgatagttttatatatactactaatagttatataactgtg
aactattagtaggtgactatacaactacactgagggagtcctgatggctg
tgttaatgaatcatagtgtagtctatccagaaagggaatataatttttac
catttgtgcagaattgttctccaactgttatgagtggcaccaatggagca
tgatgatctgaagaagaggataaatgtggagtcagaaagcaagtgccact
aaagacagtacttgcctctcagattcgtggacttaaactgtctctaaaat
agtctttctctctaactgtagcacgtagcattgttataggaaaagagccc
aagaattttatacgcatatcacatccaggatgaggagactttaagacatt
gctggttagtattaaatgactgtgaataaggatatacagctaaaacatta
tacagaaatgctgtcctaataagtatttataagaagctaatagcaggtga
agttcaaaataatttgttcgaaatgggtttgctttgtaacctgtttttgg
catgaactagccatgctgtgcctttggccactgaagttggcgataa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_101275135_101276276
seq2: B6Ng01-024H07.b_43_1162

seq1  GAATTCATTTTATAAAATCTTCACAGGAACTTGGGTTCTTAAACATCTTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATTTTATAAAATCTTCACAGGAACTTGGGTTCTTAAACATCTTG  50

seq1  CAGAATCCTCTAAGTATATTTATAGTACAATTCACTTCTCTTTAATTCAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAATCCTCTAAGTATATTTATAGTACAATTCACTTCTCTTTAATTCAT  100

seq1  TTATAGAAAAAAATTAGATCCTCAGTGACATATTTTCTTAAACTATATCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATAGAAAAAAATTAGATCCTCAGTGACATATTTTCTTAAACTATATCT  150

seq1  ATTGCATCACATCCTATAGTCTCAGACAGGGTATTTATAGTGCACATAAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGCATCACATCCTATAGTCTCAGACAGGGTATTTATAGTGCACATAAC  200

seq1  CATGTAAAGACTTGGGTATGGATTCTATAATCATGCAGTCCATTTCAGAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGTAAAGACTTGGGTATGGATTCTATAATCATGCAGTCCATTTCAGAA  250

seq1  GTCAACAAAGATGATGAGAAACAGGCTATGTTTGTGCTACTTTCAAAAGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAACAAAGATGATGAGAAACAGGCTATGTTTGTGCTACTTTCAAAAGG  300

seq1  ATGCTCACAATCCTACTCTCTGGCCTCTGGCCCTTTCTAATTGGTGTTGC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCTCACAATCCTACTCTCTGGCCTCTGGCCCTTTCTAATTGGTGTTGC  350

seq1  ATGTGGAGAGTCTCTGCATGCCTGTGGCTAGAGTCCTGCTCCATCATGCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGGAGAGTCTCTGCATGCCTGTGGCTAGAGTCCTGCTCCATCATGCT  400

seq1  TGTGATTTACCACTGGATGTGGAGACAGTCCTGCTCCATCATGCTTGTAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGATTTACCACTGGATGTGGAGACAGTCCTGCTCCATCATGCTTGTAA  450

seq1  TTGTTTGGATGTTTCCTTAGAATTAGACTTTCAAGTGTCCTTTGAATAAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTTGGATGTTTCCTTAGAATTAGACTTTCAAGTGTCCTTTGAATAAA  500

seq1  ATTTTTTTTCACTCTGTGTTTGCTATTGTACTTTTATTTTACAGGAAGCC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTTTTTCACTCTGTGTTTGCTATTGTACTTTTATTTTACAGGAAGCC  550

seq1  GACAGTTTACATAATGGTAAAACAATCATGGATTTTGGATGCAAAATCAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAGTTTACATAATGGTAAAACAATCATGGATTTTGGATGCAAAATCAA  600

seq1  AAACAAAAAACCCCAGAAATCCAAAACCCAAAACAAACAAACCAAAAAAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACAAAAAACCCCAGAAATCCAAAACCCAAAACAAACAAACCAAAAAAA  650

seq1  TCCACCACCGCAACCTACAAAACCTTTGTCTTAAGTATTTCTGTTCCTTA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCACCACCGCAACCTACAAAACCTTTGTCTTAAGTATTTCTGTTCCTTA  700

seq1  CAAACTTTATAACCTTCGTTAGTATAATTTCATTCTCTGAAACCCAGATG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAACTTTATAACCTTCGTTAGTATAATTTCATTCTCTGAAACCCAGATG  750

seq1  CCAACTCTCAGAAAGGTGAAATTGGTTAAAGAAAGTCTATAGTAAACATG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAACTCTCAGAAAGGTGAAATTGGTTAAAGAAAGTCTATAGTAAACATG  800

seq1  AACGGCTTTAGGAAGTGGTGCCACTACTTCCTAATATTCATGTATCAATT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACGGCTTTAGGAAGTGGTGCCACTACTTCCTAATATTCATGTATCAATT  850

seq1  TAAATATAGTCTTCTAAGATTACCTATTGCTCCTTTAAAAATGTAGTAAA  900
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  TAAATATAGTCTTCTAAGATTACCTATTGCTCCTTT-AAAATGTAGTAAA  899

seq1  TTGGGATGGGAATACAAATCAGGGCAGAGAATTTATGTAGTAGTCACCAA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGGATGGGAATACAAATCAGGGCAGAGAATTTATGTAGTAGTCACCAA  949

seq1  ATCCCAAGTTCAATGCCCAATATCACGCCAAACACACACACACATACACA  1000
      |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  ATCCCAAGTT-AATGCCC-ATATCACGCC-AACACACACACACATACACA  996

seq1  CACACACACACACAAAGCAAATAAATAAAAGACCCAATAATTTGAATGAA  1050
      |||||||||||||||||||| |||   |||||||||   ||||| ||| |
seq2  CACACACACACACAAAGCAATTAA--TAAAGACCCA--TATTTG-ATG-A  1040

seq1  CTTTTAAATTGAAATGAAACCCAGTACAGATTTATTCTATGTTGGGAATC  1100
      ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||  || |||
seq2  CTTTT-AATTG-AATG-AACCCAGTA-AGATTTATTCTATGT--GGGATC  1084

seq1  TTAAGTATTAATAACATAATAACATTGTCTATAAAAACTGAA  1142
      |||    || ||||||| |  ||| ||||  |||||||||||
seq2  TTA---GTTTATAACATTAATACA-TGTC--TAAAAACTGAA  1120

seq1: chr14_101382843_101383948
seq2: B6Ng01-024H07.g_69_1162 (reverse)

seq1  ATCGCAACATTCAGTAGGCAAAAGCACAGGCATGGCTAGTTTCATGCCAA  50
      ||||| |  |||||| | |||| ||||| |||||||||| ||||||||||
seq2  ATCGCCAACTTCAGTGGCCAAAGGCACA-GCATGGCTAG-TTCATGCCAA  48

seq1  CAACAGGTTACATAGCAAAACCCCATCTCGAACAATTTATTTTGAACTTC  100
       ||||||||||| ||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||
seq2  AAACAGGTTACAAAGCAAA--CCCATTTCGAACAAATTATTTTGAACTTC  96

seq1  ACCTGCCTTAATATGCTTCTTATAAATACTTTATTAGGAACAGCATTTCT  150
      ||||||  || || ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||
seq2  ACCTGC--TATTA-GCTTCTTATAAATAC-TTATTAGG-ACAGCATTTCT  141

seq1  GTATAATGTTTTATACTGTATATCCTTATTCACAGTCATTTAATACTAAC  200
      |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATAATGTTTTA-GCTGTATATCCTTATTCACAGTCATTTAATACTAAC  190

seq1  CAGCAATGTCTTAAAGTCTCCTCCTCCTGGATGTGATATGCGTATAAATT  250
      ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
seq2  CAGCAATGTCTTAAAGTCTCCTCATCCTGGATGTGATATGCGTATAAAAT  240

seq1  TCTTTGGCTCTTTTCCTATAACAATGCTACGTGCTACAGTTAAGAGAGAA  300
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  TCTTGGGCTCTTTTCCTATAACAATGCTACGTGCTACAGTT-AGAGAGAA  289

seq1  AGACTATTTTTAGAGACAGTTTAAGTCCACGAATCTGAGAGGCAAGTACT  350
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACTA-TTTTAGAGACAGTTTAAGTCCACGAATCTGAGAGGCAAGTACT  338

seq1  GTCTTTAGTGGCACTTGCTTTCTGACTCCACATTTATCCTCTTCTTCAGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTTTAGTGGCACTTGCTTTCTGACTCCACATTTATCCTCTTCTTCAGA  388

seq1  TCATCATGCTCCATTGGTGCCACTCATAACAGTTGGAGAACAATTCTGCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATCATGCTCCATTGGTGCCACTCATAACAGTTGGAGAACAATTCTGCA  438

seq1  CAAATGGTAAAAATTATATTCCCTTTCTGGATAGACTACACTATGATTCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATGGTAAAAATTATATTCCCTTTCTGGATAGACTACACTATGATTCA  488

seq1  TTAACACAGCCATCAGGACTCCCTCAGTGTAGTTGTATAGTCACCTACTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAACACAGCCATCAGGACTCCCTCAGTGTAGTTGTATAGTCACCTACTA  538

seq1  ATAGTTCACAGTTATATAACTATTAGTAGTATATATAAAACTATCAGACT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGTTCACAGTTATATAACTATTAGTAGTATATATAAAACTATCAGACT  588

seq1  TGACCCACTCCACACCTAATAGTCTAATAGGTTAGGTTTCCTTTTACATT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACCCACTCCACACCTAATAGTCTAATAGGTTAGGTTTCCTTTTACATT  638

seq1  CAAAATGCACAAACATCCAGTGCATGCCTTCTCATTCTGCATAAGAAACT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAATGCACAAACATCCAGTGCATGCCTTCTCATTCTGCATAAGAAACT  688

seq1  GAAAGTTCCAGAGCTAGCTGTATGTATGTATGTGTCTATGTATATATGTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGTTCCAGAGCTAGCTGTATGTATGTATGTGTCTATGTATATATGTG  738

seq1  TGGGTTTATGTATGTGTGTGTGTATGTATATATGTATGTATGTATGTATG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGTTTATGTATGTGTGTGTGTATGTATATATGTATGTATGTATGTATG  788

seq1  TGTGTGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTGTA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTGTA  838

seq1  TACAGCTTTTATACACATTTTAAGTTGTTATTAGATCCTAGTCATGCAAA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAGCTTTTATACACATTTTAAGTTGTTATTAGATCCTAGTCATGCAAA  888

seq1  TATACCGGAGTTTTCCTTCTATACCTATAAGGAATTTCTATGCCCACCCT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATACCGGAGTTTTCCTTCTATACCTATAAGGAATTTCTATGCCCACCCT  938

seq1  AGGTCTGAATAATGACTCAAAGACTTACATTTATACTCTAGTTCCCAATT  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTCTGAATAATGACTCAAAGACTTACATTTATACTCTAGTTCCCAATT  988

seq1  AGCTCTTGCAACTCTTATTTGTTCTATGTCTGCCAGATGGCTCATTACCT  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTCTTGCAACTCTTATTTGTTCTATGTCTGCCAGATGGCTCATTACCT  1038

seq1  CCTCTTAGTCTTTAATACAGGGTCTGTTTCTTCCTCCGAGTTATTCTGGT  1100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTTAGTCTTTAATACAGGGTCTGTTTCTTCCTCCGAGTTATTCTGGT  1088

seq1  GAATTC  1106
      ||||||
seq2  GAATTC  1094