BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-026N07
Chromosome14 (Build37)
Map Location 75,048,674 - 75,232,613
singlet/doubletdoublet
Overlap geneHtr2a, LOC668508, Esd, Lrch1
Upstream geneLOC100043734, EG629578, LOC629583
Downstream geneENSMUSG00000075519, LOC100043169, 5031414D18Rik, 4921509B22Rik, LOC100043176, Lcp1, Cpb2, Zc3h13, Gm912, Spert, 4930564B18Rik, Cog3, Slc25a30
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-026N07.bB6Ng01-026N07.g
ACCDH857748DH857749
length974331
definitionDH857748|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-026N07, 5' end.DH857749|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-026N07, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(75,231,641 - 75,232,613)(75,048,674 - 75,048,969)
sequence
gaattccttattacagtttgctgtgactttcttattaaacttgtgacaag
ccacaacttgcagatgagccggagaccttctccttgatggccctggacaa
ataggcatgtctgaatgtttccttacagtagaaccaggtcaggttgcgag
catctgtagccttctgtagactaaatctcacttaaactcaactaaaacct
ttggaacttgttgaacttgtgtgtgtatgtgtgtttgcatgtttataaat
gtatttggaggccagagataagtcttgggtgtcttccttaatgggttctc
catttgcatacgtgtctctctgtgtgtttgtgtatgcacaagtgttggta
tggtagtgcatttatgtgtgtacacgtaacatatgtgcctgttcccgtgc
atggggaagccagagaaggatgttcagggttctctgtcactctctgccat
attcccaggagacatgatctctcggagaacctagacgctgtatttcggca
agactggcaggacagcaggccccagcagtcctctcttagccttccactca
cagtgcagaggacgatagacacacagcaccacacttggctttgagattca
ctctggagatctgcctcaggtcctcatactcctgctataaggactcctac
tgagtgaggccagactccgggacttctaccttattttttgaggtgggatc
tctcactgactgagctattctagctgaccagcaagccccaggaatcttct
agttcccgtccctcctcccagggctgggattacaggcagctgcttctggc
ccagctttttaacacagttgctggagatacaaattcaatgccttacaagg
gtttcactggccgagccatctcttggaaatttgcttctttttctgtcccg
atcctgctgacagatgaggtgtgtctggtgagaggtgctctatcatggcc
acatgttacagttgactacagctg
tatttgtatatggcctactttgctttcaactaacagttaaagattttaca
gaatctattgtagaactttcctccagtgtactgatatattctgttttctg
gataagttgatgaatacagagctaaacttggattcatggggtttttttcc
agcttccttaagtgaaagtcagaggttgccatttttttcctttgaggtct
ttatgtaaggtaggagtatgtatagaacttagtcctaacgctctggtgca
tatatatatatatgtgggtgtgtgtatatatatatatgtgcgagagcgtg
aggactgagtgctatacatactcctacctta
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_75231641_75232613
seq2: B6Ng01-026N07.b_49_1022 (reverse)

seq1  CAGCTGCTAGTCAACTGTAACATGTGGCCATGATAGAGCACCTCTCACCA  50
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTG-TAGTCAACTGTAACATGTGGCCATGATAGAGCACCTCTCACCA  49

seq1  GACACACCTCATCTGTCAGCAGGATC-GGACAGAAAAAGAAGCACATTTC  99
      |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||
seq2  GACACACCTCATCTGTCAGCAGGATCGGGACAGAAAAAGAAGCAAATTTC  99

seq1  C-AGAGATGGCTCGGCCAGTGAAACCCTTGTAAGGCATTGAATTTGTATC  148
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGAGATGGCTCGGCCAGTGAAACCCTTGTAAGGCATTGAATTTGTATC  149

seq1  TCCAGCAACTGTGTTAAAAAGCTGGGCCAGAAGCAGCTGCCTGTAATCCC  198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGCAACTGTGTTAAAAAGCTGGGCCAGAAGCAGCTGCCTGTAATCCC  199

seq1  AGCCCTGGGAGGAGGGACGGGAACTAGAAGATTCCTGGGGCTTGCTGGTC  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCCTGGGAGGAGGGACGGGAACTAGAAGATTCCTGGGGCTTGCTGGTC  249

seq1  AGCTAGAATAGCTCAGTCAGTGAGAGATCCCACCTCAAAAAATAAGGTAG  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTAGAATAGCTCAGTCAGTGAGAGATCCCACCTCAAAAAATAAGGTAG  299

seq1  AAGTCCCGGAGTCTGGCCTCACTCAGTAGGAGTCCTTATAGCAGGAGTAT  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTCCCGGAGTCTGGCCTCACTCAGTAGGAGTCCTTATAGCAGGAGTAT  349

seq1  GAGGACCTGAGGCAGATCTCCAGAGTGAATCTCAAAGCCAAGTGTGGTGC  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGACCTGAGGCAGATCTCCAGAGTGAATCTCAAAGCCAAGTGTGGTGC  399

seq1  TGTGTGTCTATCGTCCTCTGCACTGTGAGTGGAAGGCTAAGAGAGGACTG  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTGTCTATCGTCCTCTGCACTGTGAGTGGAAGGCTAAGAGAGGACTG  449

seq1  CTGGGGCCTGCTGTCCTGCCAGTCTTGCCGAAATACAGCGTCTAGGTTCT  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGGCCTGCTGTCCTGCCAGTCTTGCCGAAATACAGCGTCTAGGTTCT  499

seq1  CCGAGAGATCATGTCTCCTGGGAATATGGCAGAGAGTGACAGAGAACCCT  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCGAGAGATCATGTCTCCTGGGAATATGGCAGAGAGTGACAGAGAACCCT  549

seq1  GAACATCCTTCTCTGGCTTCCCCATGCACGGGAACAGGCACATATGTTAC  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACATCCTTCTCTGGCTTCCCCATGCACGGGAACAGGCACATATGTTAC  599

seq1  GTGTACACACATAAATGCACTACCATACCAACACTTGTGCATACACAAAC  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTACACACATAAATGCACTACCATACCAACACTTGTGCATACACAAAC  649

seq1  ACACAGAGAGACACGTATGCAAATGGAGAACCCATTAAGGAAGACACCCA  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACAGAGAGACACGTATGCAAATGGAGAACCCATTAAGGAAGACACCCA  699

seq1  AGACTTATCTCTGGCCTCCAAATACATTTATAAACATGCAAACACACATA  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACTTATCTCTGGCCTCCAAATACATTTATAAACATGCAAACACACATA  749

seq1  CACACACAAGTTCAACAAGTTCCAAAGGTTTTAGTTGAGTTTAAGTGAGA  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACACAAGTTCAACAAGTTCCAAAGGTTTTAGTTGAGTTTAAGTGAGA  799

seq1  TTTAGTCTACAGAAGGCTACAGATGCTCGCAACCTGACCTGGTTCTACTG  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGTCTACAGAAGGCTACAGATGCTCGCAACCTGACCTGGTTCTACTG  849

seq1  TAAGGAAACATTCAGACATGCCTATTTGTCCAGGGCCATCAAGGAGAAGG  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGGAAACATTCAGACATGCCTATTTGTCCAGGGCCATCAAGGAGAAGG  899

seq1  TCTCCGGCTCATCTGCAAGTTGTGGCTTGTCACAAGTTTAATAAGAAAGT  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCCGGCTCATCTGCAAGTTGTGGCTTGTCACAAGTTTAATAAGAAAGT  949

seq1  CACAGCAAACTGTAATAAGGAATTC  973
      |||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGCAAACTGTAATAAGGAATTC  974

seq1: chr14_75048674_75048969
seq2: B6Ng01-026N07.g_69_364

seq1  GAATTCTATTTGTATATGGCCTACTTTGCTTTCAACTAACAGTTAAAGAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTATTTGTATATGGCCTACTTTGCTTTCAACTAACAGTTAAAGAT  50

seq1  TTTACAGAATCTATTGTAGAACTTTCCTCCAGTGTACTGATATATTCTGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTACAGAATCTATTGTAGAACTTTCCTCCAGTGTACTGATATATTCTGT  100

seq1  TTTCTGGATAAGTTGATGAATACAGAGCTAAACTTGGATTCATGGGGTTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTGGATAAGTTGATGAATACAGAGCTAAACTTGGATTCATGGGGTTT  150

seq1  TTTTCCAGCTTCCTTAAGTGAAAGTCAGAGGTTGCCATTTTTTTCCTTTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCCAGCTTCCTTAAGTGAAAGTCAGAGGTTGCCATTTTTTTCCTTTG  200

seq1  AGGTCTTTATGTAAGGTAGGAGTATGTATAGAACTTAGTCCTAACGCTCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTCTTTATGTAAGGTAGGAGTATGTATAGAACTTAGTCCTAACGCTCT  250

seq1  GGTGCATATATATATATATGTGGGTGTGTGTATATATATATATGTG  296
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGCATATATATATATATGTGGGTGTGTGTATATATATATATGTG  296