BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-035P07
Chromosome14 (Build37)
Map Location 86,489,750 - 86,566,713
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC668603
Downstream geneLOC100043301, EG629815, LOC100043306, LOC100043778, LOC100043310, LOC100043311, Diap3
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-035P07.bB6Ng01-035P07.g
ACCDH864284DH864285
length654939
definitionDH864284|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-035P07, 5' end.DH864285|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-035P07, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(86,489,750 - 86,490,403)(86,565,749 - 86,566,713)
sequence
gaattctcattttactatatctgtgctcagctttaagccacaactcagtg
gctcctacatgagctccttcctttctgacaaggcagatcagtctaactcc
aggccactgcagggtcttattattcatacctaaattatagtgttcatggc
attataccataattgttactttctatctaagcctaccctgcagacccagg
caacttcaacatcccatcttgtgtacatttggagcctcagctctccacac
atggtagctcattaagtgtgattttgatattcaacttaatgcatttttaa
tctctcaacaaacatgcacataagtatttagagtccagttggcaagattc
tcaccacagctctacgatagctatgattaagttagatattttataggccc
ttgttgagcttaatctctactggaaacactattgtgttcataaaaagaga
agtaggcagtgatatgtttagtggaggtgtggtatggcatgggggaaggc
agtgcctctgtaggccagtgctgatacatcagcactgaggtaccaggcac
aggaaggtatagaatagaaaagagtttatttggggcatggggaggggaat
tgagggaatagagacagagaaaggcagaaagagattaagagtataggagt
agag
gaattcccttagctttccatgttcctgtcatgtaactcccaaacaccaaa
gatcaactccaaccaggctaggtttatcctgctcctgcagacctttcaag
cctcttatgagaatcagtattctttcctttgcacacttctttcctttgcc
ttgcttgctcccaggttccagcagaattccaggatcagacgctctctgac
cttttatgtattcccttctgtgttccctccacgtcaatttgaactcctga
tcactgttgaaaacagagcgccttagtcaccttcagatccacattgttaa
ggagagccgacacctagcaactcattatttataacctatctgttctttga
gaaggacttgtagacaccctgtatgtgtatagttttctattttgaaatgc
atcctgacacacatcctcgcatttaatcctcatgacgagcttgccaggaa
gcaatggagatttcatctggtttgaaatgagaacagtcagtctcagagag
atcaggacccacagagtttacaaaacagcctcaggccaggagactggtaa
tgacaagggttagagtacaggttttgactgcttttactatggtcataccg
tatgctactgtatggcgaaagtgtgggactatcttagtaaatagaaaaga
tacctttaaaagtttgtttaatgatatcactattttagaacattttaaga
acttctgcatacttatcaaagccatacttattctactttgagagttcaac
cagccattcataattaaataatagggcagattttgctaatatacatcttt
gctgtgcttaagtattcagctgcaccacaacatctgataggcatatgaga
cgatgtatctgaaaataagatatctgcagtagatagctggcggtgagctc
actgcaatactatagtctctatacctgtcatattaagta
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_86489750_86490403
seq2: B6Ng01-035P07.b_46_699

seq1  GAATTCTCATTTTACTATATCTGTGCTCAGCTTTAAGCCACAACTCAGTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCATTTTACTATATCTGTGCTCAGCTTTAAGCCACAACTCAGTG  50

seq1  GCTCCTACATGAGCTCCTTCCTTTCTGACAAGGCAGATCAGTCTAACTCC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCCTACATGAGCTCCTTCCTTTCTGACAAGGCAGATCAGTCTAACTCC  100

seq1  AGGCCACTGCAGGGTCTTATTATTCATACCTAAATTATAGTGTTCATGGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCCACTGCAGGGTCTTATTATTCATACCTAAATTATAGTGTTCATGGC  150

seq1  ATTATACCATAATTGTTACTTTCTATCTAAGCCTACCCTGCAGACCCAGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTATACCATAATTGTTACTTTCTATCTAAGCCTACCCTGCAGACCCAGG  200

seq1  CAACTTCAACATCCCATCTTGTGTACATTTGGAGCCTCAGCTCTCCACAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACTTCAACATCCCATCTTGTGTACATTTGGAGCCTCAGCTCTCCACAC  250

seq1  ATGGTAGCTCATTAAGTGTGATTTTGATATTCAACTTAATGCATTTTTAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGTAGCTCATTAAGTGTGATTTTGATATTCAACTTAATGCATTTTTAA  300

seq1  TCTCTCAACAAACATGCACATAAGTATTTAGAGTCCAGTTGGCAAGATTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTCAACAAACATGCACATAAGTATTTAGAGTCCAGTTGGCAAGATTC  350

seq1  TCACCACAGCTCTACGATAGCTATGATTAAGTTAGATATTTTATAGGCCC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACCACAGCTCTACGATAGCTATGATTAAGTTAGATATTTTATAGGCCC  400

seq1  TTGTTGAGCTTAATCTCTACTGGAAACACTATTGTGTTCATAAAAAGAGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTGAGCTTAATCTCTACTGGAAACACTATTGTGTTCATAAAAAGAGA  450

seq1  AGTAGGCAGTGATATGTTTAGTGGAGGTGTGGTATGGCATGGGGGAAGGC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAGGCAGTGATATGTTTAGTGGAGGTGTGGTATGGCATGGGGGAAGGC  500

seq1  AGTGCCTCTGTAGGCCAGTGCTGATACATCAGCACTGAGGTACCAGGCAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGCCTCTGTAGGCCAGTGCTGATACATCAGCACTGAGGTACCAGGCAC  550

seq1  AGGAAGGTATAGAATAGAAAAGAGTTTATTTGGGGCATGGGGAGGGGAAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAGGTATAGAATAGAAAAGAGTTTATTTGGGGCATGGGGAGGGGAAT  600

seq1  TGAGGGAATAGAGACAGAGAAAGGCAGAAAGAGATAAAGAGTAGAGGAGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||
seq2  TGAGGGAATAGAGACAGAGAAAGGCAGAAAGAGATTAAGAGTATAGGAGT  650

seq1  AGAG  654
      ||||
seq2  AGAG  654

seq1: chr14_86565749_86566713
seq2: B6Ng01-035P07.g_68_1006 (reverse)

seq1  TACTTAAATATTTGACAGAGTATAGAGACTTAATATGTAATTTTGCAGGT  50
      ||||||   || |||||| |||||||||||  ||| |||   ||||| ||
seq2  TACTTA---ATATGACAG-GTATAGAGACT--ATA-GTA---TTGCA-GT  39

seq1  GAGCTTCACCGCCCAGCTAATCCTACTGCAGATATCTTTATTTTTCAGAT  100
      |||| |||||| |||||||   ||||||||||||||||   |||||||||
seq2  GAGC-TCACCG-CCAGCTA--TCTACTGCAGATATCTT--ATTTTCAGAT  83

seq1  ACATCGTCCTCATTATGCCCTTATCAGATTGTTGGTGGTGGCAGCTGAAT  150
      ||||||| |||| ||||||  ||||||| |||| ||||| ||||||||||
seq2  ACATCGT-CTCA-TATGCC--TATCAGA-TGTT-GTGGT-GCAGCTGAAT  126

seq1  ACTTAAGCACAGCAAAGATGTATTATTAGCAAAAATCTGCCCTATTATTT  200
      |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||
seq2  ACTTAAGCACAGCAAAGATGTA-TATTAGC-AAAATCTGCCCTATTATTT  174

seq1  AATTATGAATGGCTGGTTGAACTCTCAAAGTAGAATAAGTATGGCTTTGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTATGAATGGCTGGTTGAACTCTCAAAGTAGAATAAGTATGGCTTTGA  224

seq1  TAAGTATGCAGAAGTTCTTAAAATGTTCTAAAATAGTGATATCATTAAAC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGTATGCAGAAGTTCTTAAAATGTTCTAAAATAGTGATATCATTAAAC  274

seq1  AAACTTTTAAAGGTATCTTTTCTATTTACTAAGATAGTCCCACACTTTCG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACTTTTAAAGGTATCTTTTCTATTTACTAAGATAGTCCCACACTTTCG  324

seq1  CCATACAGTAGCATACGGTATGACCATAGTAAAAGCAGTCAAAACCTGTA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATACAGTAGCATACGGTATGACCATAGTAAAAGCAGTCAAAACCTGTA  374

seq1  CTCTAACCCTTGTCATTACCAGTCTCCTGGCCTGAGGCTGTTTTGTAAAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTAACCCTTGTCATTACCAGTCTCCTGGCCTGAGGCTGTTTTGTAAAC  424

seq1  TCTGTGGGTCCTGATCTCTCTGAGACTGACTGTTCTCATTTCAAACCAGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTGGGTCCTGATCTCTCTGAGACTGACTGTTCTCATTTCAAACCAGA  474

seq1  TGAAATCTCCATTGCTTCCTGGCAAGCTCGTCATGAGGATTAAATGCGAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAATCTCCATTGCTTCCTGGCAAGCTCGTCATGAGGATTAAATGCGAG  524

seq1  GATGTGTGTCAGGATGCATTTCAAAATAGAAAACTATACACATACAGGGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGTGTGTCAGGATGCATTTCAAAATAGAAAACTATACACATACAGGGT  574

seq1  GTCTACAAGTCCTTCTCAAAGAACAGATAGGTTATAAATAATGAGTTGCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTACAAGTCCTTCTCAAAGAACAGATAGGTTATAAATAATGAGTTGCT  624

seq1  AGGTGTCGGCTCTCCTTAACAATGTGGATCTGAAGGTGACTAAGGCGCTC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTGTCGGCTCTCCTTAACAATGTGGATCTGAAGGTGACTAAGGCGCTC  674

seq1  TGTTTTCAACAGTGATCAGGAGTTCAAATTGACGTGGAGGGAACACAGAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTTCAACAGTGATCAGGAGTTCAAATTGACGTGGAGGGAACACAGAA  724

seq1  GGGAATACATAAAAGGTCAGAGAGCGTCTGATCCTGGAATTCTGCTGGAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAATACATAAAAGGTCAGAGAGCGTCTGATCCTGGAATTCTGCTGGAA  774

seq1  CCTGGGAGCAAGCAAGGCAAAGGAAAGAAGTGTGCAAAGGAAAGAATACT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGGGAGCAAGCAAGGCAAAGGAAAGAAGTGTGCAAAGGAAAGAATACT  824

seq1  GATTCTCATAAGAGGCTTGAAAGGTCTGCAGGAGCAGGATAAACCTAGCC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTCTCATAAGAGGCTTGAAAGGTCTGCAGGAGCAGGATAAACCTAGCC  874

seq1  TGGTTGGAGTTGATCTTTGGTGTTTGGGAGTTACATGACAGGAACATGGA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTTGGAGTTGATCTTTGGTGTTTGGGAGTTACATGACAGGAACATGGA  924

seq1  AAGCTAAGGGAATTC  965
      |||||||||||||||
seq2  AAGCTAAGGGAATTC  939