BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-052E05
Chromosome14 (Build37)
Map Location 14,663,122 - 14,790,731
singlet/doubletdoublet
Overlap geneGm281, Thoc7
Upstream geneEG432822, LOC100042022, LOC100042026, EG328354, Synpr, A430083B19Rik, EG382844, LOC100042045
Downstream geneAtxn7, Psmd6, Olfr720, LOC667125, LOC100042543, Olfr31, Il3ra, LOC627139, Olfr721-ps1, LOC667152, LOC100042147, Slc4a7, Nek10
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-052E05.bB6Ng01-052E05.g
ACCDH875667DH875668
length1,093988
definitionDH875667|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-052E05, 5' end.DH875668|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-052E05, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(14,663,122 - 14,664,217)(14,789,738 - 14,790,731)
sequence
gaattcaaggaccctgttttcctggtgtactggctagttttgtgtcaact
tgacacagctggagttatcacagagaaaggagcttcagttgaggaaatgc
cttcatgagatccaactgtaaggcattttctcaattagtgatcaaggggg
aaaggccccttgtgggtgggaccatctctgggctggtagtcttggttcta
taagagagcaagctgagcaagccaggggaagcaagccagtaaagaacatc
cctccatggcttctgcatctgctcctgctttctgacctgcttgagttcca
atcctgacttcctttggtgatgaacagcaatgtggaagtataagctgaat
aaaccctttcctccccaacttgcttcttggtcttgatgtttgtgcaggaa
tagaaaccctgaccaagacacctgtgtagactttcttttggtttatgatt
ttatgtgttgatgttattcagagttaaataaatagctagtgccacgaata
tgttctacatctaccttagatggttctatgtaacaatttctaggtgtcta
atatatggttggtctcaaataaagaaagatatcctataaaagacaaattg
gtgactataacatttatgtgaatctgtatagaaccagcaataatagagtc
aacatcatgtcgccttgtgaacttgaaacaatatcatcagatgggaagat
gtcatctgtttttcagctggctccatggataacaaatgtaaatccttgtg
ttaaaactatagcatttcctcaagttctgagtctctttgaagtcacagga
gtaattgagttgtacgttatgagttagtgtaactcttaaaacagttactt
ctagggtttacatatcatgcttgacattgtatagctaatgtcaacttgac
atatgtttgtgattaaaagaaataactaaagtatgtacaaaaagccattt
caagcgcatttcaaatcttgtgaatctctgtatgacagtttagtttgaag
ccatttgacatttgtcccagcaataccttgtcagggtatgattgtctgta
attggatagggttgtgctgacaggtgcttcatcttctctcttc
gaattcactcacatcttgtgtacaaattgctcacaccttttgtacgagta
attgttgctgtgataatgaaaataagtgctagtctttgttagtgtttaat
tgagttgatcttaatttaattgatctttagaagacctctgtaggcatcaa
acccaattacaaaatagtgcagtcagtctgggtgtggtgactcacgcctc
ctatcccagcactccagacgtaaaggctgaatggtgtctgtgagttcaag
ggccaccaagacgacacagagagactctggtcagtcagtcatggtacctc
agccctgtaacagccattaggagactaaggcagagccaggatagtccgag
ctaccagaggaggttaagttggttggggctattgatttggtttatttgac
ttgtgcacattttgcaaaacctttataaatagtaatactacattcttatg
taatgatgcacagaacttaaagtgtacagctggcatggtcacaaagcata
gtttaaatatttttagttaccagacttaatattggaggtatttagtccct
ctctgtttccttctgcatttatgtttgacatcccaggtgggtgatgagaa
ctggactcgggtcctcaggaagagcagtgagcattcttaaccactgaact
gtctccagcccaaggtgtgccttttccttccagcacttgacagaccgaag
cagacaacttctgggagtttgaagccagcaaatttcagggcaagaccttt
gtcccaaaatgtgtgtgtgacagaagtgtgtgtgagagtgtgtgtgtgtg
tactcagaaattctgcattttaatctctttaaggactatgtcttatttac
cttgatctcttcagttggttgggtaattaaagcttgaaacattagtattt
taaaacacatttagatgatcagataatcttattttggacaacgttcagag
tagctattctaaaggttctgcttagggtgtctttgggc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_14663122_14664217
seq2: B6Ng01-052E05.b_43_1135

seq1  GAATTCAAGGACCCTGTTTTCCTGGTGTACTGGCTAGTTTTGTGTCAACT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAGGACCCTGTTTTCCTGGTGTACTGGCTAGTTTTGTGTCAACT  50

seq1  TGACACAGCTGGAGTTATCACAGAGAAAGGAGCTTCAGTTGAGGAAATGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACACAGCTGGAGTTATCACAGAGAAAGGAGCTTCAGTTGAGGAAATGC  100

seq1  CTTCATGAGATCCAACTGTAAGGCATTTTCTCAATTAGTGATCAAGGGGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCATGAGATCCAACTGTAAGGCATTTTCTCAATTAGTGATCAAGGGGG  150

seq1  AAAGGCCCCTTGTGGGTGGGACCATCTCTGGGCTGGTAGTCTTGGTTCTA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGGCCCCTTGTGGGTGGGACCATCTCTGGGCTGGTAGTCTTGGTTCTA  200

seq1  TAAGAGAGCAAGCTGAGCAAGCCAGGGGAAGCAAGCCAGTAAAGAACATC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGAGAGCAAGCTGAGCAAGCCAGGGGAAGCAAGCCAGTAAAGAACATC  250

seq1  CCTCCATGGCTTCTGCATCTGCTCCTGCTTTCTGACCTGCTTGAGTTCCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCCATGGCTTCTGCATCTGCTCCTGCTTTCTGACCTGCTTGAGTTCCA  300

seq1  ATCCTGACTTCCTTTGGTGATGAACAGCAATGTGGAAGTATAAGCTGAAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCTGACTTCCTTTGGTGATGAACAGCAATGTGGAAGTATAAGCTGAAT  350

seq1  AAACCCTTTCCTCCCCAACTTGCTTCTTGGTCTTGATGTTTGTGCAGGAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACCCTTTCCTCCCCAACTTGCTTCTTGGTCTTGATGTTTGTGCAGGAA  400

seq1  TAGAAACCCTGACCAAGACACCTGTGTAGACTTTCTTTTGGTTTATGATT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAAACCCTGACCAAGACACCTGTGTAGACTTTCTTTTGGTTTATGATT  450

seq1  TTATGTGTTGATGTTATTCAGAGTTAAATAAATAGCTAGTGCCACGAATA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATGTGTTGATGTTATTCAGAGTTAAATAAATAGCTAGTGCCACGAATA  500

seq1  TGTTCTACATCTACCTTAGATGGTTCTATGTAACAATTTCTAGGTGTCTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTCTACATCTACCTTAGATGGTTCTATGTAACAATTTCTAGGTGTCTA  550

seq1  ATATATGGTTGGTCTCAAATAAAGAAAGATATCCTATAAAAGACAAATTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATATGGTTGGTCTCAAATAAAGAAAGATATCCTATAAAAGACAAATTG  600

seq1  GTGACTATAACATTTATGTGAATCTGTATAGAACCAGCAATAATAGAGTC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGACTATAACATTTATGTGAATCTGTATAGAACCAGCAATAATAGAGTC  650

seq1  AACATCATGTCGCCTTGTGAACTTGAAACAATATCATCAGATGGGAAGAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACATCATGTCGCCTTGTGAACTTGAAACAATATCATCAGATGGGAAGAT  700

seq1  GTCATCTGTTTTTCAGCTGGCTCCATGGATAACAAATGTAAATCCTTGTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCATCTGTTTTTCAGCTGGCTCCATGGATAACAAATGTAAATCCTTGTG  750

seq1  TTAAAAACTATAGCATTTCCTCAAGTTCTGAGTCTCTTTGAAGTCACAGG  800
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TT-AAAACTATAGCATTTCCTCAAGTTCTGAGTCTCTTTGAAGTCACAGG  799

seq1  AGTAATTGAGTTGTACGTTATGAGTTAGTGTAACTCTTATAAACAGTCAC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||
seq2  AGTAATTGAGTTGTACGTTATGAGTTAGTGTAACTCTTA-AAACAGTTAC  848

seq1  TTCTAGGG-TTACATATCATGCTTGACATTGTATAGCTAATGTCAACTTG  899
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTAGGGTTTACATATCATGCTTGACATTGTATAGCTAATGTCAACTTG  898

seq1  ACATATGTTTGTGATTAAAAGAAATAACTAAAGTATGTACCAGAAGCCAT  949
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||
seq2  ACATATGTTTGTGATTAAAAGAAATAACTAAAGTATGTACAAAAAGCCAT  948

seq1  TTCAAAGCGCATTTCAAAATCTTGTGAATCTCTGTCATGACAGTTTAGTT  999
      ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  TTC-AAGCGCATTTC-AAATCTTGTGAATCTCTGT-ATGACAGTTTAGTT  995

seq1  TGAGGCCA-TTGACATTTGTCCCAGCAATAACATTGTCAGGG-ATGATTG  1047
      ||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||
seq2  TGAAGCCATTTGACATTTGTCCCAGCAAT-ACCTTGTCAGGGTATGATTG  1044

seq1  -CTGTATATAGATAGGG-TGTGCAGACAGGTGCTTCATCATTCTCATCTT  1095
       |||||  | ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||
seq2  TCTGTAATTGGATAGGGTTGTGCTGACAGGTGCTTCATC-TTCTC-TCTT  1092

seq1  C  1096
      |
seq2  C  1093

seq1: chr14_14789738_14790731
seq2: B6Ng01-052E05.g_68_1055 (reverse)

seq1  GCCCAAAGGACACCCTTAGCAGAAACCTTTAGAATAGCTTTCTTTGAAAC  50
      ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| | || || |||
seq2  GCCCAAA-GACACCCTAAGCAG-AACCTTTAGAATAGC-TACTCTG-AAC  46

seq1  GTTGTTCAAAGTACAGATTTATCTGATCATCTAAATGTGTTTTAAAAATA  100
      ||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  GTTGTCCAAAATA-AGA-TTATCTGATCATCTAAATGTGTTTT-AAAATA  93

seq1  CTAATGTTTTCAAGCTTTAATTACCAAACAACTTGAAGAGATCAAGGTAA  150
      |||||| |||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||
seq2  CTAATG-TTTCAAGCTTTAATTACCCAACCAACTGAAGAGATCAAGGTAA  142

seq1  ATAAGACATAGTCCTTAAAGAGATTAAAATGCAGAATTTCTGAGTACACA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAGACATAGTCCTTAAAGAGATTAAAATGCAGAATTTCTGAGTACACA  192

seq1  CACACACACTCTCACACACACTTCTGTCACACACACATTTTGGGAC-AAG  249
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  CACACACACTCTCACACACACTTCTGTCACACACACATTTTGGGACAAAG  242

seq1  GTCTTGCCCTGAAATTTGCTGGCTTCAAACTCCCAGAAGTTGTCTGCTTC  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTTGCCCTGAAATTTGCTGGCTTCAAACTCCCAGAAGTTGTCTGCTTC  292

seq1  GGTCTGTCAAGTGCTGGAAGG-AAAGGCACACCTTGGGCTGGAGACAGTT  348
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCTGTCAAGTGCTGGAAGGAAAAGGCACACCTTGGGCTGGAGACAGTT  342

seq1  CAGTGGTTAAGAATGCTCACTGCTCTTCCTGAGGACCCGAGTCCAGTTCT  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGGTTAAGAATGCTCACTGCTCTTCCTGAGGACCCGAGTCCAGTTCT  392

seq1  CATCACCCACCTGGGATGTCAAACATAAATGCAGAAGGAAACAGAGAGGG  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCACCCACCTGGGATGTCAAACATAAATGCAGAAGGAAACAGAGAGGG  442

seq1  ACTAAATACCTCCAATATTAAGTCTGGTAACTAAAAATATTTAAACTATG  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTAAATACCTCCAATATTAAGTCTGGTAACTAAAAATATTTAAACTATG  492

seq1  CTTTGTGACCATGCCAGCTGTACACTTTAAGTTCTGTGCATCATTACATA  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTGTGACCATGCCAGCTGTACACTTTAAGTTCTGTGCATCATTACATA  542

seq1  AGAATGTAGTATTACTATTTATAAAGGTTTTGCAAAATGTGCACAAGTCA  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATGTAGTATTACTATTTATAAAGGTTTTGCAAAATGTGCACAAGTCA  592

seq1  AATAAACCAAATCAATAGCCCCAACCAACTTAACCTCCTCTGGTAGCTCG  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAAACCAAATCAATAGCCCCAACCAACTTAACCTCCTCTGGTAGCTCG  642

seq1  GACTATCCTGGCTCTGCCTTAGTCTCCTAATGGCTGTTACAGGGCTGAGG  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTATCCTGGCTCTGCCTTAGTCTCCTAATGGCTGTTACAGGGCTGAGG  692

seq1  TACCATGACTGACTGACCAGAGTCTCTCTGTGTCGTCTTGGTGGCCCTTG  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCATGACTGACTGACCAGAGTCTCTCTGTGTCGTCTTGGTGGCCCTTG  742

seq1  AACTCACAGACACCATTCAGCCTTTACGTCTGGAGTGCTGGGATAGGAGG  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTCACAGACACCATTCAGCCTTTACGTCTGGAGTGCTGGGATAGGAGG  792

seq1  CGTGAGTCACCACACCCAGACTGACTGCACTATTTTGTAATTGGGTTTGA  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTGAGTCACCACACCCAGACTGACTGCACTATTTTGTAATTGGGTTTGA  842

seq1  TGCCTACAGAGGTCTTCTAAAGATCAATTAAATTAAGATCAACTCAATTA  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTACAGAGGTCTTCTAAAGATCAATTAAATTAAGATCAACTCAATTA  892

seq1  AACACTAACAAAGACTAGCACTTATTTTCATTATCACAGCAACAATTACT  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACACTAACAAAGACTAGCACTTATTTTCATTATCACAGCAACAATTACT  942

seq1  CGTACAAAAGGTGTGAGCAATTTGTACACAAGATGTGAGTGAATTC  994
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTACAAAAGGTGTGAGCAATTTGTACACAAGATGTGAGTGAATTC  988