BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-055N15
Chromosome14 (Build37)
Map Location 15,349,289 - 15,448,978
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC667152
Upstream geneSynpr, A430083B19Rik, EG382844, LOC100042045, Gm281, Thoc7, Atxn7, Psmd6, Olfr720, LOC667125, LOC100042543, Olfr31, Il3ra, LOC627139, Olfr721-ps1
Downstream geneLOC100042147, Slc4a7, Nek10, Lrrc3b
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-055N15.bB6Ng01-055N15.g
ACCDH878187DH878188
length954913
definitionDH878187|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-055N15, 5' end.DH878188|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-055N15, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(15,448,014 - 15,448,978)(15,349,289 - 15,350,201)
sequence
gaattcagtggagaaaatatactgtgatctaaatgttcttgacacaactg
ttatccacatgcaaaagaatgaatcttataacataaattttttttttgct
caaaatggatagtgtgttagtgtaccaagacaaaggttgtgctgtgctag
agttatctagggaagttccggggacagcctggagatagaggggggaaagg
aggactctggagaggaatcagtgtggttttcatggaagggatgggaagag
aaggagaacatctatgcaaagattggtcatcctgtaaaacctcttctgcc
tgacattcttgaacctggggctaggggtcctgagtatgaaggcccagtga
gggcatggtcacaggaatgaggctctggggtgtatggtttgaatgaaagg
tgtggctgaaggtgagttttgcaatcaattcttcatcataagtataacct
ggtcctaggaaggtaggtcccttcagggttagcagagcctgggtggcttc
caggggacagactacatttcctgttgcctttgcagcaggtgcagtcaagt
agtcagtaaccagtttataatgaatggaatgtgcatggaatccatctgtt
ttcagtttaacccgtacaaattctctgtacagaattcctccgagctatct
actctgatgtctagaatgaacaacatcaaaggtgattccagaagccatca
tctacccagtgatcccacttatagtatcatttccttgttgatgtggtcac
tattagggacatttgttacctgttttgtctggttgtgtcacattctgttt
tgagtagtgtgtagtagactgaacactggtttacataagacaaaccttgg
ttcaatacatttccacctcttgttgttgggtctaaaactctttcaaataa
aattaacagtgttaccagtatgatatagagagatgaagtacaacacaaat
cact
gaattcactgggtggtggtggcacatgcctttaatcccagcaccggggag
gcagaggcaggaggatttctgagttcgaggccagtctacaaagtgagttc
caggacagccagggatattcagagaaaccctgtctaaaaataaataaata
aataaataaataaataaataaatagaataaaataaaataaaataaaattt
atctaattttgggctggagagatagcttagcagttaagagcaccaacttt
ttctgaaggttgtgagttcaaatcccagcaaccacatgctggctcacaac
catctgtagtgagatctgatgccctcttatgggatgtctgaagacagcta
cagtgtacttacatataataaataaataaatataaaaaaaaaccctctcc
aaacaatgtgctgagccttccacactcagtgctcgtggagtgggtttcag
gaagctccagggaccctggctgcacctgtttttgtctcgagtgatgtacg
ctcaccaactttctttcaccttgttggatccctattctctctaaactctt
tctcagacctgctattctgattaccctcaaaattagggtggagtttctga
gatgtcattgcagcctgtgtccagcaggaagcagtggcatttagtgacct
tccaggttcagatttatatgaggcagaactaagaaaaccaagcagaagtc
catgcaacctcccagcttaatatggtgggtattacatttccctggcctta
ttccctaattccagctcatacctgatgtgcattatgatgatacagctctt
gctgttaatactgactactacagtatcaacatgttatcagtatcaccagt
attaacaatgatatgtaaggtttttcctttcctttctcttctctctctct
cttctcttatctt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_15448014_15448978
seq2: B6Ng01-055N15.b_49_1002 (reverse)

seq1  AGTGTTTTGTGTTTGTTACTTCATCTCTCCTTATATCATACTGGTAAACA  50
      |||| ||||||||   |||||||||||||  |||||||||||||| ||||
seq2  AGTGATTTGTGTT--GTACTTCATCTCTC--TATATCATACTGGT-AACA  45

seq1  CTGTTAATTTTATTTTGAAGAGTTTTTAAGAACCAAACAAACAAGAGGTG  100
      |||||||||||||||  |||||||||  ||| ||||   |||||||||||
seq2  CTGTTAATTTTATTTGAAAGAGTTTT--AGACCCAA--CAACAAGAGGTG  91

seq1  GAAATGTATTGGAACCAAGGTTTGTCTTATGTAAAACCAGTGTTCAGTCT  150
      |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  GAAATGTATT-GAACCAAGGTTTGTCTTATGT-AAACCAGTGTTCAGTCT  139

seq1  ACTACACACTACTCAAAACAGAATGTGACACAACCAGACAAAACAGGTAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTACACACTACTCAAAACAGAATGTGACACAACCAGACAAAACAGGTAA  189

seq1  CAAATGTCCCTAATAGTGACCACATCAACAAGGAAATGATACTATAAGTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATGTCCCTAATAGTGACCACATCAACAAGGAAATGATACTATAAGTG  239

seq1  GGATCACTGGGTAGATGATGGCTTCTGGAATCACCTTTGATGTTGTTCAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATCACTGGGTAGATGATGGCTTCTGGAATCACCTTTGATGTTGTTCAT  289

seq1  TCTAGACATCAGAGTAGATAGCTCGGAGGAATTCTGTACAGAGAATTTGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAGACATCAGAGTAGATAGCTCGGAGGAATTCTGTACAGAGAATTTGT  339

seq1  ACGGGTTAAACTGAAAACAGATGGATTCCATGCACATTCCATTCATTATA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGGGTTAAACTGAAAACAGATGGATTCCATGCACATTCCATTCATTATA  389

seq1  AACTGGTTACTGACTACTTGACTGCACCTGCTGCAAAGGCAACAGGAAAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTGGTTACTGACTACTTGACTGCACCTGCTGCAAAGGCAACAGGAAAT  439

seq1  GTAGTCTGTCCCCTGGAAGCCACCCAGGCTCTGCTAACCCTGAAGGGACC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGTCTGTCCCCTGGAAGCCACCCAGGCTCTGCTAACCCTGAAGGGACC  489

seq1  TACCTTCCTAGGACCAGGTTATACTTATGATGAAGAATTGATTGCAAAAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCTTCCTAGGACCAGGTTATACTTATGATGAAGAATTGATTGCAAAAC  539

seq1  TCACCTTCAGCCACACCTTTCATTCAAACCATACACCCCAGAGCCTCATT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACCTTCAGCCACACCTTTCATTCAAACCATACACCCCAGAGCCTCATT  589

seq1  CCTGTGACCATGCCCTCACTGGGCCTTCATACTCAGGACCCCTAGCCCCA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGTGACCATGCCCTCACTGGGCCTTCATACTCAGGACCCCTAGCCCCA  639

seq1  GGTTCAAGAATGTCAGGCAGAAGAGGTTTTACAGGATGACCAATCTTTGC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTCAAGAATGTCAGGCAGAAGAGGTTTTACAGGATGACCAATCTTTGC  689

seq1  ATAGATGTTCTCCTTCTCTTCCCATCCCTTCCATGAAAACCACACTGATT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGATGTTCTCCTTCTCTTCCCATCCCTTCCATGAAAACCACACTGATT  739

seq1  CCTCTCCAGAGTCCTCCTTTCCCCCCTCTATCTCCAGGCTGTCCCCGGAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTCCAGAGTCCTCCTTTCCCCCCTCTATCTCCAGGCTGTCCCCGGAA  789

seq1  CTTCCCTAGATAACTCTAGCACAGCACAACCTTTGTCTTGGTACACTAAC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCCTAGATAACTCTAGCACAGCACAACCTTTGTCTTGGTACACTAAC  839

seq1  ACACTATCCATTTTGAGCAAAAAAAAAATTTATGTTATAAGATTCATTCT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACTATCCATTTTGAGCAAAAAAAAAATTTATGTTATAAGATTCATTCT  889

seq1  TTTGCATGTGGATAACAGTTGTGTCAAGAACATTTAGATCACAGTATATT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGCATGTGGATAACAGTTGTGTCAAGAACATTTAGATCACAGTATATT  939

seq1  TTCTCCACTGAATTC  965
      |||||||||||||||
seq2  TTCTCCACTGAATTC  954

seq1: chr14_15349289_15350201
seq2: B6Ng01-055N15.g_69_981

seq1  GAATTCACTGGGTGGTGGTGGCACATGCCTTTAATCCCAGCACCGGGGAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACTGGGTGGTGGTGGCACATGCCTTTAATCCCAGCACCGGGGAG  50

seq1  GCAGAGGCAGGAGGATTTCTGAGTTCGAGGCCAGTCTACAAAGTGAGTTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGAGGCAGGAGGATTTCTGAGTTCGAGGCCAGTCTACAAAGTGAGTTC  100

seq1  CAGGACAGCCAGGGATATTCAGAGAAACCCTGTCTAAAAATAAATAAATA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGACAGCCAGGGATATTCAGAGAAACCCTGTCTAAAAATAAATAAATA  150

seq1  AATAAATAAATAAATAAATAAATAGAATAAAATAAAATAAAATAAAATTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAAATAAATAAATAAATAAATAGAATAAAATAAAATAAAATAAAATTT  200

seq1  ATCTAATTTTGGGCTGGAGAGATAGCTTAGCAGTTAAGAGCACCAACTTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTAATTTTGGGCTGGAGAGATAGCTTAGCAGTTAAGAGCACCAACTTT  250

seq1  TTCTGAAGGTTGTGAGTTCAAATCCCAGCAACCACATGCTGGCTCACAAC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGAAGGTTGTGAGTTCAAATCCCAGCAACCACATGCTGGCTCACAAC  300

seq1  CATCTGTAGTGAGATCTGATGCCCTCTTATGGGATGTCTGAAGACAGCTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTGTAGTGAGATCTGATGCCCTCTTATGGGATGTCTGAAGACAGCTA  350

seq1  CAGTGTACTTACATATAATAAATAAATAAATATAAAAAAAAACCCTCTCC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGTACTTACATATAATAAATAAATAAATATAAAAAAAAACCCTCTCC  400

seq1  AAACAATGTGCTGAGCCTTCCACACTCAGTGCTCGTGGAGTGGGTTTCAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACAATGTGCTGAGCCTTCCACACTCAGTGCTCGTGGAGTGGGTTTCAG  450

seq1  GAAGCTCCAGGGACCCTGGCTGCACCTGTTTTTGTCTCGAGTGATGTACG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGCTCCAGGGACCCTGGCTGCACCTGTTTTTGTCTCGAGTGATGTACG  500

seq1  CTCACCAACTTTCTTTCACCTTGTTGGATCCCTATTCTCTCTAAACTCTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCACCAACTTTCTTTCACCTTGTTGGATCCCTATTCTCTCTAAACTCTT  550

seq1  TCTCAGACCTGCTATTCTGATTACCCTCAAAATTAGGGTGGAGTTTCTGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCAGACCTGCTATTCTGATTACCCTCAAAATTAGGGTGGAGTTTCTGA  600

seq1  GATGTCATTGCAGCCTGTGTCCAGCAGGAAGCAGTGGCATTTAGTGACCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGTCATTGCAGCCTGTGTCCAGCAGGAAGCAGTGGCATTTAGTGACCT  650

seq1  TCCAGGTTCAGATTTATATGAGGCAGAACTAAGAAAACCAAGCAGAAGTC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGGTTCAGATTTATATGAGGCAGAACTAAGAAAACCAAGCAGAAGTC  700

seq1  CATGCAACCTCCCAGCTTAATATGGTGGGTATTACATTTCCCTGGCCTTA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGCAACCTCCCAGCTTAATATGGTGGGTATTACATTTCCCTGGCCTTA  750

seq1  TTCCCTAATTCCAGCTCATACCTGATGTGCATTATGATGATACAGCTCTT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCCTAATTCCAGCTCATACCTGATGTGCATTATGATGATACAGCTCTT  800

seq1  GCTGTTAATACTGACTACTACAGTATCAACATGTTATCAGTATCAACCAG  850
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  GCTGTTAATACTGACTACTACAGTATCAACATGTTATCAGTATC-ACCAG  849

seq1  TATTAACAATGATATGTAAGGTTTTTTCCTTTCCTTTTCTCTTCTCT---  897
      ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||   
seq2  TATTAACAATGATATGTAAGG-TTTTTCCTTTCC-TTTCTCTTCTCTCTC  897

seq1  TCTCTTCTCTTCTCTT  913
      ||||||||||| ||||
seq2  TCTCTTCTCTTATCTT  913