BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-057O21
Chromosome14 (Build37)
Map Location 16,368,891 - 16,482,346
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC667152, LOC100042147, Slc4a7, Nek10, Lrrc3b
Downstream geneLOC667205, 1700062C10Rik, LOC667209, EG435389, Oxsm, Ngly1, Top2b, Rarb
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-057O21.bB6Ng01-057O21.g
ACCDH879646DH879647
length1,006979
definitionDH879646|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-057O21, 5' end.DH879647|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-057O21, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(16,368,891 - 16,369,896)(16,481,369 - 16,482,346)
sequence
gaattccttctgtgtcctggatgttccaccttctatacaagtgtttccta
tatgctatgggtttttaattgacaattgatgcatccatacaatacacaag
atgttctctcttaaaatggaagaggaaactctacctttctaaatgaacag
aggcccataaaagattctgtctctttatcccatatcttaagaggtagttt
ggtcacaagtgagtccctttccaatgagaggggaaatgtcctaagcacta
gtgggaggagatggctataagacttcaccctcatagaatgtgctggtgtc
atgactttggacttgccagccccagagctgtgagcaacatatcccgttct
gctcatgagttcctgctctcaggaatttagtagcctgaatagatgagata
gaagcaaagccaccataccacatttgaaacttgttagccatgcagaatat
tactctccagcccaaatctgccaagttagagacagcattttaatagcata
tctgagaattatgtgcacttgaagactgacatcactcttgcaatcagggg
acacactcccaggctgtttccgtggtggagatttctacttctacccactg
taagttccactgaggccattcatgaaaacagagaatacttcctgctagag
acacaagattaaataaaatatgtgcactgctagataggtacagtttaact
gctaactggatgatgcctacggagccagaaaatcagctttcctctgctga
tgcctcctaagattatctaaaagtttgtatgtgagagcaagtgttgacta
caaaatgtttgctacatggtacatatctgattaacacagccaatacattg
ttagtgctattatgtgacatgctaatttctaataataacacaactatttt
tgttttataaaatctttttgaattttatgaaactactttatgtggattaa
aagtgaaatcccaagtaggaaatttcttttgatttgaagggagcttacta
gagagt
gaattctatccctacatatacctacatatgactaaggtaaccatctgctt
ttacccactctgtctctttagcagtcataccaatgggacaaatcttcaac
actccatgcacatcctgaactctgaaaaagtgtactcaggtttgatgcga
cactcagttggaaggaagtcaggcttttgctctttgtattcagacaagta
cacagccatcattttgcaggactggttacagagaaataaatgacttcccc
tcaccattctgtgactctgcccattaactaagctttttatatccagtgtt
tagggactgacctacatccttagaaactgaggaattggggacgagaagaa
gttggtgaatttatccaagcataaacaacacatagttttactgacatgaa
tatctgtgtgataaaattacagacttggtgcttagtgggtgggctttaca
gtcctggatcagatactgaagccaccctactcttcaatttcttcattact
aaaatatgaggagtagcagtttctcccagctagttctgggtgactttaac
tgagtctgtttatgtggatgtatgtcaggagctactagtatgattgttag
gaatgttttgtccaaatttaaatgtcctgttctagctatttaaattctcc
agcccatagaaggaatatatatatatatacatatatatatatatacatac
atatatatacatatatatgtatatatctatttatacatatagttttactt
ctgtgtaacatcagcaagagacaaattgctttttaagtatgtgtaagaat
acagttatataattgtatagtgttttaacatccaagcaaagattttgggc
actcaagtgacataacttgcttttagtggcaacatgggaagacacgatct
ttggctcatctcactaatcacttattttggaggtcatctcacctggagta
gtggataatatttagttctgataagaaaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_16368891_16369896
seq2: B6Ng01-057O21.b_47_1052

seq1  GAATTCCTTCTGTGTCCTGGATGTTCCACCTTCTATACAAGTGTTTCCTA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTTCTGTGTCCTGGATGTTCCACCTTCTATACAAGTGTTTCCTA  50

seq1  TATGCTATGGGTTTTTAATTGACAATTGATGCATCCATACAATACACAAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGCTATGGGTTTTTAATTGACAATTGATGCATCCATACAATACACAAG  100

seq1  ATGTTCTCTCTTAAAATGGAAGAGGAAACTCTACCTTTCTAAATGAACAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTTCTCTCTTAAAATGGAAGAGGAAACTCTACCTTTCTAAATGAACAG  150

seq1  AGGCCCATAAAAGATTCTGTCTCTTTATCCCATATCTTAAGAGGTAGTTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCCCATAAAAGATTCTGTCTCTTTATCCCATATCTTAAGAGGTAGTTT  200

seq1  GGTCACAAGTGAGTCCCTTTCCAATGAGAGGGGAAATGTCCTAAGCACTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCACAAGTGAGTCCCTTTCCAATGAGAGGGGAAATGTCCTAAGCACTA  250

seq1  GTGGGAGGAGATGGCTATAAGACTTCACCCTCATAGAATGTGCTGGTGTC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGGAGGAGATGGCTATAAGACTTCACCCTCATAGAATGTGCTGGTGTC  300

seq1  ATGACTTTGGACTTGCCAGCCCCAGAGCTGTGAGCAACATATCCCGTTCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGACTTTGGACTTGCCAGCCCCAGAGCTGTGAGCAACATATCCCGTTCT  350

seq1  GCTCATGAGTTCCTGCTCTCAGGAATTTAGTAGCCTGAATAGATGAGATA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCATGAGTTCCTGCTCTCAGGAATTTAGTAGCCTGAATAGATGAGATA  400

seq1  GAAGCAAAGCCACCATACCACATTTGAAACTTGTTAGCCATGCAGAATAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGCAAAGCCACCATACCACATTTGAAACTTGTTAGCCATGCAGAATAT  450

seq1  TACTCTCCAGCCCAAATCTGCCAAGTTAGAGACAGCATTTTAATAGCATA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTCTCCAGCCCAAATCTGCCAAGTTAGAGACAGCATTTTAATAGCATA  500

seq1  TCTGAGAATTATGTGCACTTGAAGACTGACATCACTCTTGCAATCAGGGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGAGAATTATGTGCACTTGAAGACTGACATCACTCTTGCAATCAGGGG  550

seq1  ACACACTCCCAGGCTGTTTCCGTGGTGGAGATTTCTACTTCTACCCACTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACTCCCAGGCTGTTTCCGTGGTGGAGATTTCTACTTCTACCCACTG  600

seq1  TAAGTTCCACTGAGGCCATTCATGAAAACAGAGAATACTTCCTGCTAGAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGTTCCACTGAGGCCATTCATGAAAACAGAGAATACTTCCTGCTAGAG  650

seq1  ACACAAGATTAAATAAAATATGTGCACTGCTAGATAGGTACAGTTTAACT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACAAGATTAAATAAAATATGTGCACTGCTAGATAGGTACAGTTTAACT  700

seq1  GCTAACTGGATGATGCCTACGGAGCCAGAAAATCAGCTTTCCTCTGCTGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAACTGGATGATGCCTACGGAGCCAGAAAATCAGCTTTCCTCTGCTGA  750

seq1  TGCCTCCTAAGATTATCTAAAAGTTTGTATGTGAGAGCAAGTGTTGACTA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTCCTAAGATTATCTAAAAGTTTGTATGTGAGAGCAAGTGTTGACTA  800

seq1  CAAAATGTTTGCTACATGGTACATATCTGATTAACACAGCCAATACATTG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAATGTTTGCTACATGGTACATATCTGATTAACACAGCCAATACATTG  850

seq1  TTAGTGCTATTATGTGACATGCTAATTTCTAATAATAACACAACTATTTT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGTGCTATTATGTGACATGCTAATTTCTAATAATAACACAACTATTTT  900

seq1  TGTTTTATAATATCTTTTTGAATTTTATGATACTACTTTATGT-GATTAA  949
      |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||
seq2  TGTTTTATAAAATCTTTTTGAATTTTATGAAACTACTTTATGTGGATTAA  950

seq1  AAGTGAAAACCCAAAGTAGGAAATTTC-TATGAGTTGAAGGGCAGCTACA  998
      |||||||| ||| |||||||||||||| | ||| |||||||| ||||   
seq2  AAGTGAAATCCC-AAGTAGGAAATTTCTTTTGATTTGAAGGG-AGCTTAC  998

seq1  TAGAGAGT  1006
      ||||||||
seq2  TAGAGAGT  1006

seq1: chr14_16481369_16482346
seq2: B6Ng01-057O21.g_69_1047 (reverse)

seq1  TTTTCTTATCAGAACTAAATATTATCCACTACTGCAGGGTGAGGTGACCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||
seq2  TTTTCTTATCAGAACTAAATATTATCCACTACTCCA-GGTGAGATGACCT  49

seq1  CC-AAATAAGTGATTAGTTGGATGAGCC-AAGATCGTGTCATTCCATGTT  98
      || |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| | |||||||
seq2  CCAAAATAAGTGATTAGTGAGATGAGCCAAAGATCGTGTCTTCCCATGTT  99

seq1  GCCACTAAAAGCAAGTTATGTCACTTGAGTGCCCAAAATCTTTGCTTGGA  148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCACTAAAAGCAAGTTATGTCACTTGAGTGCCCAAAATCTTTGCTTGGA  149

seq1  TGTTAAAACACTATACAATTATATAACTGTATTCTTACACATACTTAAAA  198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTAAAACACTATACAATTATATAACTGTATTCTTACACATACTTAAAA  199

seq1  AGCAATTTGTCTCTTGCTGATGTTACACAGAAGTAAAACTATATGTATAA  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAATTTGTCTCTTGCTGATGTTACACAGAAGTAAAACTATATGTATAA  249

seq1  ATAGATATATACATATATATGTATATATATGTATGTATATATATATATAT  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGATATATACATATATATGTATATATATGTATGTATATATATATATAT  299

seq1  GTATATATATATATATTCCTTCTATGGGCTGGAGAATTTAAATAGCTAGA  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATATATATATATATTCCTTCTATGGGCTGGAGAATTTAAATAGCTAGA  349

seq1  ACAGGACATTTAAATTTGGACAAAACATTCCTAACAATCATACTAGTAGC  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGGACATTTAAATTTGGACAAAACATTCCTAACAATCATACTAGTAGC  399

seq1  TCCTGACATACATCCACATAAACAGACTCAGTTAAAGTCACCCAGAACTA  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTGACATACATCCACATAAACAGACTCAGTTAAAGTCACCCAGAACTA  449

seq1  GCTGGGAGAAACTGCTACTCCTCATATTTTAGTAATGAAGAAATTGAAGA  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGGGAGAAACTGCTACTCCTCATATTTTAGTAATGAAGAAATTGAAGA  499

seq1  GTAGGGTGGCTTCAGTATCTGATCCAGGACTGTAAAGCCCACCCACTAAG  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGGGTGGCTTCAGTATCTGATCCAGGACTGTAAAGCCCACCCACTAAG  549

seq1  CACCAAGTCTGTAATTTTATCACACAGATATTCATGTCAGTAAAACTATG  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCAAGTCTGTAATTTTATCACACAGATATTCATGTCAGTAAAACTATG  599

seq1  TGTTGTTTATGCTTGGATAAATTCACCAACTTCTTCTCGTCCCCAATTCC  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTGTTTATGCTTGGATAAATTCACCAACTTCTTCTCGTCCCCAATTCC  649

seq1  TCAGTTTCTAAGGATGTAGGTCAGTCCCTAAACACTGGATATAAAAAGCT  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGTTTCTAAGGATGTAGGTCAGTCCCTAAACACTGGATATAAAAAGCT  699

seq1  TAGTTAATGGGCAGAGTCACAGAATGGTGAGGGGAAGTCATTTATTTCTC  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTTAATGGGCAGAGTCACAGAATGGTGAGGGGAAGTCATTTATTTCTC  749

seq1  TGTAACCAGTCCTGCAAAATGATGGCTGTGTACTTGTCTGAATACAAAGA  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAACCAGTCCTGCAAAATGATGGCTGTGTACTTGTCTGAATACAAAGA  799

seq1  GCAAAAGCCTGACTTCCTTCCAACTGAGTGTCGCATCAAACCTGAGTACA  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAAAGCCTGACTTCCTTCCAACTGAGTGTCGCATCAAACCTGAGTACA  849

seq1  CTTTTTCAGAGTTCAGGATGTGCATGGAGTGTTGAAGATTTGTCCCATTG  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTTCAGAGTTCAGGATGTGCATGGAGTGTTGAAGATTTGTCCCATTG  899

seq1  GTATGACTGCTAAAGAGACAGAGTGGGTAAAAGCAGATGGTTACCTTAGT  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATGACTGCTAAAGAGACAGAGTGGGTAAAAGCAGATGGTTACCTTAGT  949

seq1  CATATGTAGGTATATGTAGGGATAGAATTC  978
      ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATATGTAGGTATATGTAGGGATAGAATTC  979