BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-058F02
Chromosome14 (Build37)
Map Location 46,817,222 - 46,924,263
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream gene5730420B22Rik, LOC100041611, 6330416L11Rik, Ero1l, Psmc6, Styx, Gnpnat1, Plekhc1, EG382884, Ddhd1, EG637379, LOC666834, LOC100041685, LOC625377, LOC218963
Downstream geneLOC100041724, Bmp4, LOC100041732, LOC100041754, Cdkn3, Cnih, Gmfb, Cgrrf1, Samd4, Gch1, Wdhd1, Socs4, LOC670795, C130032J12Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-058F02.bB6Ng01-058F02.g
ACCDH879929DH879930
length1,148975
definitionDH879929|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-058F02, 5' end.DH879930|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-058F02, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(46,923,081 - 46,924,263)(46,817,222 - 46,818,212)
sequence
gaattctcacacttggatacaccatattgagatgctaaagagagcttgat
aataaagaggaagagagggaaaaagaaaaaaaaaaccgagaaagagaaga
gaagaaaagtcaagaaaagaaatcacccagtataaacttgtaaacagcaa
atcccaaattcggggacaatgacactgaagaccagcccaggtccacaaat
tctacaaggtccacagcgccacttgcaaatgtgcttctttgcgggatata
tgtttactagaggatatagaaagtagctgcaatgagagccaactttaccc
agagttaatggtgtgatgttcagatctatctgttcagccacaggcaaact
gcagagaggattgccatgcatcttacaggggctgctggctccaggctcag
catccttcccttgatgaggtcactccacggtgatggccctttccatcaat
aacttagggcagcaaaacacttgcccttgcccagcagaaaggaccacata
agatgagagagggtcttctcccgcctgtgcatatgtacttctgaatgatg
gtcttttctcaagtaggagtagttctgacatagaaagccacacagatgaa
tgtgagcactaattgatacagatactatttaaggagtctcatccaatact
ttttaagacaggcaggtaatattaagtaagcagcgtgatcataatgggct
gatagcaagtggcttctctcagggttatcacagagagaaggagactcaag
catatgcacacacacacatgcacacacacacacatgcacacacacacaca
tgcacgtgcacacacacatgcacacacacatgcacacgcatacacacatg
catacacacatgcacacacacatgcacacacatacacacatgcacacaca
cacacatgcacacgcatacacacatgcacacacacacatatacatgcacg
ctcacattcatatctctcagcttctggtctacagagagtcagaatttgag
atctttgtgtaaatgttttacaaacataatttcttttagaacatctgagg
accacacaaaatatctgggtaagactaagcattaagttgtagcttaaggt
gactaaaacaaagctatattgctatgaggaatgaataattattcagtc
gaattcatttagaaaaagcagtatattcttatgtaaagaaagataactca
tcaccgaccacggcttgtaagcttaaacagagggtgttgggtgatttgtg
gggttagaattataaaaacatagtcgcagagtcctatgttaataaagcac
atgaactaacactcagaactttccatattcttaattacctagtgaatctg
aggtgaaaattaagtgaaatttcttgtacatttccccaaagtttctgggg
aatgtgagctaaatgtagttctgaccattcagagatgctggaggaagggg
agtcgaggaccccgtgagcctttctcatgtggttaaaggcccactgccca
ctggcttgcggaatgagatgagatcctgtcgatgactgtcactcaacaat
gaccccagcactttctgagagccaggaggagaggaggagtatgcctggag
gtggagcaaatgagcgattagtgaaaaacaaaacaaacaaacaaacaaaa
aagctagggtgattcattaccatccagttcaccagctcagctcgaacaca
tctgttccataagcaatgctaacttgatagaaaggccttcagagagatct
ggagatggggccagtctagtctcagcaaggaagacaggatgtgagaccaa
agtctcaggaggggaactggggaggcagaaagtagtgggaaaggtaagta
tatacaaccttttttctttctttgtagacccaatgaacccaggagaagaa
atctccccgagtcattcctgagggaacccataggagggctcagaaagtga
gtaaattaagtgacttgtccaagcaagctttttatcatggagggtggctt
ttcacatggttttggagtgaacggttgctaggaatatgacagattgagga
acagaccgtaaatgaattccggtgtgtgcaaacgggggggtggcagatga
tctatgtactaatgtacaaatacat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_46923081_46924263
seq2: B6Ng01-058F02.b_44_1191 (reverse)

seq1  GACTGAAAATAATATAATTCATTTCCCTCATAGCAATATAGGCCTTGTGT  50
      ||||||| |    || |||||||  ||||||||||||||| || ||||  
seq2  GACTGAATA----ATTATTCATT--CCTCATAGCAATATA-GCTTTGT--  41

seq1  GTTTAGTCACACTAAAGCTACAAACCATAAATGGCTGTAGTCTATACCAC  100
       ||||||||| || |||||||||  | |||   ||| |||||| |||| |
seq2  -TTTAGTCAC-CTTAAGCTACAA--CTTAA--TGCT-TAGTCT-TACC-C  82

seq1  AGATATGTTTGTGTGGTCCTCAGAATGTTCTAAAAAGAAAATTAATTGTT  150
      |||||| |||||||||||||||| |||||||||||   ||||||  ||||
seq2  AGATAT-TTTGTGTGGTCCTCAG-ATGTTCTAAAA--GAAATTA--TGTT  126

seq1  TTGGTAAAAACATTTTACACAAAGATCTCAAATTTCTGACTTCTCTTGTA  200
      |  || |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| 
seq2  T--GT-AAAACA-TTTACACAAAGATCTCAAA-TTCTGAC-TCTC-TGT-  168

seq1  AGACCAGAAGCTTGAGAGATATGAATGTGGAGCGGTGCATGTATATGTGT  250
      ||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||
seq2  AGACCAGAAGC-TGAGAGATATGAATGT-GAGC-GTGCATGTATATGTGT  215

seq1  GTGTGTGCATGTGTGTATGCGTGTGCATGTGTGTGTGTGTGCATGTGTGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTGCATGTGTGTATGCGTGTGCATGTGTGTGTGTGTGCATGTGTGT  265

seq1  ATGTGTGTGCATGTGTGTGTGCATGTGTGTATGCATGTGTGTATGCGTGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGTGTGCATGTGTGTGTGCATGTGTGTATGCATGTGTGTATGCGTGT  315

seq1  GCATGTGTGTGTGCATGTGTGTGTGCACGTGCATGTGTGTGTGTGTGCAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATGTGTGTGTGCATGTGTGTGTGCACGTGCATGTGTGTGTGTGTGCAT  365

seq1  GTGTGTGTGTGTGCATGTGTGTGTGTGCATATGCTTGAGTCTCCTTCTCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTGTGTGTGCATGTGTGTGTGTGCATATGCTTGAGTCTCCTTCTCT  415

seq1  CTGTGATAACCCTGAGAGAAGCCACTTGCTATCAGCCCATTATGATCACG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGATAACCCTGAGAGAAGCCACTTGCTATCAGCCCATTATGATCACG  465

seq1  CTGCTTACTTAATATTACCTGCCTGTCTTAAAAAGTATTGGATGAGACTC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTTACTTAATATTACCTGCCTGTCTTAAAAAGTATTGGATGAGACTC  515

seq1  CTTAAATAGTATCTGTATCAATTAGTGCTCACATTCATCTGTGTGGCTTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAAATAGTATCTGTATCAATTAGTGCTCACATTCATCTGTGTGGCTTT  565

seq1  CTATGTCAGAACTACTCCTACTTGAGAAAAGACCATCATTCAGAAGTACA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATGTCAGAACTACTCCTACTTGAGAAAAGACCATCATTCAGAAGTACA  615

seq1  TATGCACAGGCGGGAGAAGACCCTCTCTCATCTTATGTGGTCCTTTCTGC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGCACAGGCGGGAGAAGACCCTCTCTCATCTTATGTGGTCCTTTCTGC  665

seq1  TGGGCAAGGGCAAGTGTTTTGCTGCCCTAAGTTATTGATGGAAAGGGCCA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGCAAGGGCAAGTGTTTTGCTGCCCTAAGTTATTGATGGAAAGGGCCA  715

seq1  TCACCGTGGAGTGACCTCATCAAGGGAAGGATGCTGAGCCTGGAGCCAGC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACCGTGGAGTGACCTCATCAAGGGAAGGATGCTGAGCCTGGAGCCAGC  765

seq1  AGCCCCTGTAAGATGCATGGCAATCCTCTCTGCAGTTTGCCTGTGGCTGA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCCCTGTAAGATGCATGGCAATCCTCTCTGCAGTTTGCCTGTGGCTGA  815

seq1  ACAGATAGATCTGAACATCACACCATTAACTCTGGGTAAAGTTGGCTCTC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGATAGATCTGAACATCACACCATTAACTCTGGGTAAAGTTGGCTCTC  865

seq1  ATTGCAGCTACTTTCTATATCCTCTAGTAAACATATATCCCGCAAAGAAG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGCAGCTACTTTCTATATCCTCTAGTAAACATATATCCCGCAAAGAAG  915

seq1  CACATTTGCAAGTGGCGCTGTGGACCTTGTAGAATTTGTGGACCTGGGCT  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATTTGCAAGTGGCGCTGTGGACCTTGTAGAATTTGTGGACCTGGGCT  965

seq1  GGTCTTCAGTGTCATTGTCCCCGAATTTGGGATTTGCTGTTTACAAGTTT  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCTTCAGTGTCATTGTCCCCGAATTTGGGATTTGCTGTTTACAAGTTT  1015

seq1  ATACTGGGTGATTTCTTTTCTTGACTTTTCTTCTCTTCTCTTTCTCGGTT  1100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACTGGGTGATTTCTTTTCTTGACTTTTCTTCTCTTCTCTTTCTCGGTT  1065

seq1  TTTTTTTTCTTTTTCCCTCTCTTCCTCTTTATTATCAAGCTCTCTTTAGC  1150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTTTTCTTTTTCCCTCTCTTCCTCTTTATTATCAAGCTCTCTTTAGC  1115

seq1  ATCTCAATATGGTGTATCCAAGTGTGAGAATTC  1183
      |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTCAATATGGTGTATCCAAGTGTGAGAATTC  1148

seq1: chr14_46817222_46818212
seq2: B6Ng01-058F02.g_66_1040

seq1  GAATTCATTTAGAAAAAGCAGTATATTCTTATGTAAAGAAAGATAACTCA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATTTAGAAAAAGCAGTATATTCTTATGTAAAGAAAGATAACTCA  50

seq1  TCACCGACCACGGCTTGTAAGCTTAAACAGAGGGTGTTGGGTGATTTGTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACCGACCACGGCTTGTAAGCTTAAACAGAGGGTGTTGGGTGATTTGTG  100

seq1  GGGTTAGAATTATAAAAACATAGTCGCAGAGTCCTATGTTAATAAAGCAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTTAGAATTATAAAAACATAGTCGCAGAGTCCTATGTTAATAAAGCAC  150

seq1  ATGAACTAACACTCAGAACTTTCCATATTCTTAATTACCTAGTGAATCTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAACTAACACTCAGAACTTTCCATATTCTTAATTACCTAGTGAATCTG  200

seq1  AGGTGAAAATTAAGTGAAATTTCTTGTACATTTCCCCAAAGTTTCTGGGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTGAAAATTAAGTGAAATTTCTTGTACATTTCCCCAAAGTTTCTGGGG  250

seq1  AATGTGAGCTAAATGTAGTTCTGACCATTCAGAGATGCTGGAGGAAGGGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGTGAGCTAAATGTAGTTCTGACCATTCAGAGATGCTGGAGGAAGGGG  300

seq1  AGTCGAGGACCCCGTGAGCCTTTCTCATGTGGTTAAAGGCCCACTGCCCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCGAGGACCCCGTGAGCCTTTCTCATGTGGTTAAAGGCCCACTGCCCA  350

seq1  CTGGCTTGCGGAATGAGATGAGATCCTGTCGATGACTGTCACTCAACAAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGCTTGCGGAATGAGATGAGATCCTGTCGATGACTGTCACTCAACAAT  400

seq1  GACCCCAGCACTTTCTGAGAGCCAGGAGGAGAGGAGGAGTATGCCTGGAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCCCAGCACTTTCTGAGAGCCAGGAGGAGAGGAGGAGTATGCCTGGAG  450

seq1  GTGGAGCAAATGAGCGATTAGTGAAAAACAAAACAAACAAACAAACAAAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGAGCAAATGAGCGATTAGTGAAAAACAAAACAAACAAACAAACAAAA  500

seq1  AAGCTAGGGTGATTCATTACCATCCAGTTCACCAGCTCAGCTCGAACACA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTAGGGTGATTCATTACCATCCAGTTCACCAGCTCAGCTCGAACACA  550

seq1  TCTGTTCCATAAGCAATGCTAACTTGATAGAAAGGCCTTCAGAGAGATCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTTCCATAAGCAATGCTAACTTGATAGAAAGGCCTTCAGAGAGATCT  600

seq1  GGAGATGGGGCCAGTCTAGTCTCAGCAAGGAAGACAGGATGTGAGACCAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGATGGGGCCAGTCTAGTCTCAGCAAGGAAGACAGGATGTGAGACCAA  650

seq1  AGTCTCAGGAGGGGAACTGGGGAGGCAGAAAGTAGTGGGAAAGGTAAGTA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCTCAGGAGGGGAACTGGGGAGGCAGAAAGTAGTGGGAAAGGTAAGTA  700

seq1  TATACAACCTTTTTTCTTTCTTTGTAGACCCAATGAACCCAGGAGAAGAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATACAACCTTTTTTCTTTCTTTGTAGACCCAATGAACCCAGGAGAAGAA  750

seq1  ATCTCCCCGAGTCATTCCTGAGGGAACCCATAGGAGGGCTCAGAAAGTGA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTCCCCGAGTCATTCCTGAGGGAACCCATAGGAGGGCTCAGAAAGTGA  800

seq1  GTAAATTAAGTGACTTGTCCAAGCAAAGCTTTTTATCATGGAGGGTGGCT  850
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAATTAAGTGACTTGTCCAAGC-AAGCTTTTTATCATGGAGGGTGGCT  849

seq1  TTTACACATGGTTTTGGAGTGAACGGTTGCTAGGAAATATGACAGAATGA  900
      ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||
seq2  TTT-CACATGGTTTTGGAGTGAACGGTTGCTAGG-AATATGACAGATTGA  897

seq1  GGAAACAGACCGTAAATGATATTCCGGGTGTGTGCAAGATCGGGTGGGGT  950
      || |||||||||||||||| ||||| ||||||||||  | |||| |||||
seq2  GG-AACAGACCGTAAATGA-ATTCC-GGTGTGTGCA--AACGGG-GGGGT  941

seq1  GGGCAAGATGATCTAATGTAACTAAATGTAACCAAATACAT  991
      ||   ||||||||| |||| ||| ||||||  |||||||||
seq2  GG--CAGATGATCT-ATGT-ACT-AATGTA--CAAATACAT  975