BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-065I21
Chromosome14 (Build37)
Map Location 71,637,540 - 71,750,963
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100043132
Upstream genePpp3cc, LOC100043115, Slc39a14, EG668450, Piwil2, Polr3d, Phyhip, Bmp1, Sftpc, Lgi3, Reep4, Hr, Nudt18, Rai16, Epb4.9, Fgf17, Npm2, Xpo7, LOC668443, Dok2, Gfra2
Downstream geneLOC100043136, LOC668477
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-065I21.bB6Ng01-065I21.g
ACCDH884994DH884995
length1,122366
definitionDH884994|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-065I21, 5' end.DH884995|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-065I21, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(71,749,825 - 71,750,963)(71,637,540 - 71,637,911)
sequence
gaattccagatgctgggctacaagaataactacctaagaccttctggtgg
gggtctccaggttaggtgctctaaggcagacacagaaacagtgaaggagt
tagttaagttcctgatggtctcaagttttgatatttcaaacattgctatg
ccttgccagttccataccagttcttctattggcatggtccacatgcccca
cagctctgcagtaaagtttctagattatatggtaattctatttttaatat
ttaaagggatttcactgattttcaaaatgactctagccacttaccctctg
ttcattttgctgtttttctgtgctatttataatgactttcttttattttt
aattacatcctatttatatgtgtaagggtttgtgaccataagcacagtgc
ctacagaggccagaaaagtgcataggctacccttctgagctgcagacata
agagctgagaattagactccagtcctcttcaaaggcagcaagtgcccttg
atcactaagccatttctccaaccccaggacagtctttataaaatggagtc
tttacagatgttcctaacaagatgataagttatcatgggggaaaaaatat
gtcccctttgaccctttttaccattcagagttgatattctgcctgatatc
tacactgagctacctgagactatatgagttgccagggtgctgatctgctg
ggatggcaagtagacataaaccatatgctacctaagaggctgaggaccag
accaggaggcgacagtgactggtcactgagtaagcataagggcctgagtt
ttaagccccaggacccttgtgttagacatggctgtgccttcctgcaaatg
ccatctttctgagagacagaaacagaggattctgagcctttctggcttcc
agcctacctctaggtttagtgaagactctgtctcaagggaatgagaggag
aatgatagagcagaacactcacctcctcctcctcttggcttcctcatgcg
tgaccagggatgggcgcatgccaccacgatagcgaaagcaggcatggacc
ggatgcaccacactctcacacacacacgacccccacaaacacaatatggt
gcttccagctagcttcgggaaa
taagatatctataagcaagagaagagggaaaaattccatgtcaaatttcc
agaaggggagataaggttagatagagtagtgtgaaagtctggtatagagt
gttgaatgagagcagaagcccagagtgagtaagttgcaggtcagattaga
aacttaggtctgtgggctgatccctatgcaaagcatgaggttcttatgtc
cagacatgtaattcatacatcaacagagaggtacatactgctaaaggttg
gtgtggatgggaagaatcagggaagagttaacagaattagaagtagaatt
ggatgttgtcatctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtacat
atgtgtgtatgtgtgt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_71749825_71750963
seq2: B6Ng01-065I21.b_48_1169 (reverse)

seq1  TTTCCTGAAGCTTAGCTGGTAAGACCATATTTGTGTTTGGTGTGTGTGTG  50
      ||||| ||||| ||||||| |  ||||||||        |||| |||| |
seq2  TTTCCCGAAGC-TAGCTGGAAGCACCATATT--------GTGTTTGTGGG  41

seq1  TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGTGCATCCCTGTTCATGCCTGCTGTC  100
       ||  ||||||||||| | ||||||||||| || || |||||||||| ||
seq2  GGT-CGTGTGTGTGTGAGAGTGTGGTGCAT-CCGGTCCATGCCTGCTTTC  89

seq1  TGCTATCTGTGTGTGCATGCGCACATCCCTGTTCACGCATGAGGAGGCC-  149
       |||||| |||   |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| 
seq2  -GCTATC-GTGGTGGCATGCGCCCATCCCTGGTCACGCATGAGGAAGCCA  137

seq1  AGAGGAGGAGGAGGTTGAGTGTTCTGCTCTATCATTCTTCCTCTCATTCC  199
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  AGAGGAGGAGGAGG-TGAGTGTTCTGCTCTATCATTC-TCCTCTCATTCC  185

seq1  CTTGAGACAGAGTCTTTCACTAAACCTAGAGGTAGGCTGGAAGCCAGAAA  249
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGAGACAGAGTC-TTCACTAAACCTAGAGGTAGGCTGGAAGCCAGAAA  234

seq1  GGCTCAGAAATCCTCTGTTTCTGTCTCTCAGAAAAGATGGCATTTGCAGG  299
      ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  GGCTCAG-AATCCTCTGTTTCTGTCTCTCAG-AAAGATGGCATTTGCAGG  282

seq1  AAGGCACAGCCATGTCTAACACAAGGGTCCTGGGGCTTAAAACTCAGGCC  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGCACAGCCATGTCTAACACAAGGGTCCTGGGGCTTAAAACTCAGGCC  332

seq1  CTTATGCTTACTCAGTGACCAGTCACTGTCGCCTCCTGGTCTGGTCCTCA  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTATGCTTACTCAGTGACCAGTCACTGTCGCCTCCTGGTCTGGTCCTCA  382

seq1  GCCTCTTAGGTAGCATATGGTTTATGTCTACTTGCCATCCCAGCAGATCA  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTCTTAGGTAGCATATGGTTTATGTCTACTTGCCATCCCAGCAGATCA  432

seq1  GCACCCTGGCAACTCATATAGTCTCAGGTAGCTCAGTGTAGATATCAGGC  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACCCTGGCAACTCATATAGTCTCAGGTAGCTCAGTGTAGATATCAGGC  482

seq1  AGAATATCAACTCTGAATGGTAAAAAGGGTCAAAGGGGACATATTTTTTC  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATATCAACTCTGAATGGTAAAAAGGGTCAAAGGGGACATATTTTTTC  532

seq1  CCCCATGATAACTTATCATCTTGTTAGGAACATCTGTAAAGACTCCATTT  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCATGATAACTTATCATCTTGTTAGGAACATCTGTAAAGACTCCATTT  582

seq1  TATAAAGACTGTCCTGGGGTTGGAGAAATGGCTTAGTGATCAAGGGCACT  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAAAGACTGTCCTGGGGTTGGAGAAATGGCTTAGTGATCAAGGGCACT  632

seq1  TGCTGCCTTTGAAGAGGACTGGAGTCTAATTCTCAGCTCTTATGTCTGCA  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGCCTTTGAAGAGGACTGGAGTCTAATTCTCAGCTCTTATGTCTGCA  682

seq1  GCTCAGAAGGGTAGCCTATGCACTTTTCTGGCCTCTGTAGGCACTGTGCT  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCAGAAGGGTAGCCTATGCACTTTTCTGGCCTCTGTAGGCACTGTGCT  732

seq1  TATGGTCACAAACCCTTACACATATAAATAGGATGTAATTAAAAATAAAA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGGTCACAAACCCTTACACATATAAATAGGATGTAATTAAAAATAAAA  782

seq1  GAAAGTCATTATAAATAGCACAGAAAAACAGCAAAATGAACAGAGGGTAA  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGTCATTATAAATAGCACAGAAAAACAGCAAAATGAACAGAGGGTAA  832

seq1  GTGGCTAGAGTCATTTTGAAAATCAGTGAAATCCCTTTAAATATTAAAAA  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGCTAGAGTCATTTTGAAAATCAGTGAAATCCCTTTAAATATTAAAAA  882

seq1  TAGAATTACCATATAATCTAGAAACTTTACTGCAGAGCTGTGGGGCATGT  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAATTACCATATAATCTAGAAACTTTACTGCAGAGCTGTGGGGCATGT  932

seq1  GGACCATGCCAATAGAAGAACTGGTATGGAACTGGCAAGGCATAGCAATG  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACCATGCCAATAGAAGAACTGGTATGGAACTGGCAAGGCATAGCAATG  982

seq1  TTTGAAATATCAAAACTTGAGACCATCAGGAACTTAACTAACTCCTTCAC  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGAAATATCAAAACTTGAGACCATCAGGAACTTAACTAACTCCTTCAC  1032

seq1  TGTTTCTGTGTCTGCCTTAGAGCACCTAACCTGGAGACCCCCACCAGAAG  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTCTGTGTCTGCCTTAGAGCACCTAACCTGGAGACCCCCACCAGAAG  1082

seq1  GTCTTAGGTAGTTATTCTTGTAGCCCAGCATCTGGAATTC  1139
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTTAGGTAGTTATTCTTGTAGCCCAGCATCTGGAATTC  1122

seq1: chr14_71637540_71637911
seq2: B6Ng01-065I21.g_67_438

seq1  GAATTCTAAGATATCTATAAGCAAGAGAAGAGGGAAAAATTCCATGTCAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTAAGATATCTATAAGCAAGAGAAGAGGGAAAAATTCCATGTCAA  50

seq1  ATTTCCAGAAGGGGAGATAAGGTTAGATAGAGTAGTGTGAAAGTCTGGTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTCCAGAAGGGGAGATAAGGTTAGATAGAGTAGTGTGAAAGTCTGGTA  100

seq1  TAGAGTGTTGAATGAGAGCAGAAGCCCAGAGTGAGTAAGTTGCAGGTCAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAGTGTTGAATGAGAGCAGAAGCCCAGAGTGAGTAAGTTGCAGGTCAG  150

seq1  ATTAGAAACTTAGGTCTGTGGGCTGATCCCTATGCAAAGCATGAGGTTCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAGAAACTTAGGTCTGTGGGCTGATCCCTATGCAAAGCATGAGGTTCT  200

seq1  TATGTCCAGACATGTAATTCATACATCAACAGAGAGGTACATACTGCTAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTCCAGACATGTAATTCATACATCAACAGAGAGGTACATACTGCTAA  250

seq1  AGGTTGGTGTGGATGGGAAGAATCAGGGAAGAGTTAACAGAATTAGAAGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTTGGTGTGGATGGGAAGAATCAGGGAAGAGTTAACAGAATTAGAAGT  300

seq1  AGAATTGGATGTTGTCATCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATTGGATGTTGTCATCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT  350

seq1  GTACATATGTGTGTATGTGTGT  372
      ||||||||||||||||||||||
seq2  GTACATATGTGTGTATGTGTGT  372