BAC Information

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BAC

Clone NameB6Ng01-065N17
Chromosome14 (Build37)
Map Location 82,796,583 - 82,935,089
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream genenone
Downstream geneLOC100043773
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-065N17.bB6Ng01-065N17.g
ACCDH885210DH885211
length439898
definitionDH885210|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-065N17, 5' end.DH885211|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-065N17, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(82,796,583 - 82,797,027)(82,934,180 - 82,935,089)
sequence
ttaacattaaaatattcctgtcttattttaatgaaacaaatctggtacta
aatttttaaagcatgattttataatacagattattttactttgattaaat
agagtgctactgctttttagtgtaaatacacataaatatatgtctatatg
taatatgtatatatatgtatatgtatatatgtacatgtatacacacacac
acacacacacacacacacacacacactcattggagaatatgggtgtcatg
gaacaaaataagattgccagcaaatgctagcattcagaaaatagttcaca
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acatgcacacacacacacacacacacacacacacacacacacacatatat
atatatatatatatatatatatatatatatatatatata
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tgtgttataatgaagtacttaacttaaaaccaatatattcttaagattat
cattcttaatattatttttgagaatattattatacagtgtgaaatcatta
tgaatgaaatttactaactgaactatgtaagcattttatctctcttaaac
tttatttttgcatatttatatgtagatggtgggcatgcattgcctatgag
tggaggcttgaggtttctggaagatttctttgcttattgcttatttattg
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ccccctttctctctgcctttggtgtcctgggactacagacagattgccat
gcccacctggttcttggaatctgtatttaggtttcatgctttcagagcaa
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agcctttttaatgcttaaaaataggattaggtatatctcttaattatgat
gcacaagataatttcaggagaaaaagtagaaattttttttggggggggtc
ttttgtttagtttgcccataaacttttttgtgcctaatgtagacccatat
agagaaaaaccttaaaatttttttgtaatgttcctattatcacatttctt
gttatcaaaaaatagagagcagagagttagttcagctcttatggcctcgg
agtataacagacaaagaacaaactcaaatgaaagttaactttgagagaat
gattgccgcctaggccgagtaccaaataagtaaataaaataatgtcac
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_82796583_82797027
seq2: B6Ng01-065N17.b_51_495

seq1  GAATTCTTAACATTAAAATATTCCTGTCTTATTTTAATGAAACAAATCTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTAACATTAAAATATTCCTGTCTTATTTTAATGAAACAAATCTG  50

seq1  GTACTAAATTTTTAAAGCATGATTTTATAATACAGATTATTTTACTTTGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACTAAATTTTTAAAGCATGATTTTATAATACAGATTATTTTACTTTGA  100

seq1  TTAAATAGAGTGCTACTGCTTTTTAGTGTAAATACACATAAATATATGTC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAATAGAGTGCTACTGCTTTTTAGTGTAAATACACATAAATATATGTC  150

seq1  TATATGTAATATGTATATATATGTATATGTATATATGTACATGTATACAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATGTAATATGTATATATATGTATATGTATATATGTACATGTATACAC  200

seq1  ACACACACACACACACACACACACACACACACTCATTGGAGAATATGGGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACACACACACACACACACACACACACACTCATTGGAGAATATGGGT  250

seq1  GTCATGGAACAAAATAAGATTGCCAGCAAATGCTAGCATTCAGAAAATAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCATGGAACAAAATAAGATTGCCAGCAAATGCTAGCATTCAGAAAATAG  300

seq1  TTCACAGTTACAATTTTAATGCCATCACTTGTTTCAAAAATTAACACTAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCACAGTTACAATTTTAATGCCATCACTTGTTTCAAAAATTAACACTAT  350

seq1  ATATGTACATGCACACACACACACACACACACACACACACACACACACAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGTACATGCACACACACACACACACACACACACACACACACACACAC  400

seq1  ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA  445
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA  445

seq1: chr14_82934180_82935089
seq2: B6Ng01-065N17.g_70_967 (reverse)

seq1  GTGACAATTATTTTCATTTAACTTATCTTGGTACTCGAGCCTAGGCTGGC  50
      ||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||| |||
seq2  GTGAC-ATTATTTT-ATTT-ACTTAT-TTGGTACTCG-GCCTAGGC-GGC  44

seq1  AATCATTTCTCTCAAAGTATAACTTTCATTTTGAGTTTTGTTCTTTGTCT  100
      ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||
seq2  AATCA-TTCTCTCAAAGT-TAACTTTCA-TTTGAG-TTTGTTCTTTGTCT  90

seq1  GTTTATACTCCGAGGCCATAAGAGCTGAACTTAACTCTCTGCTTCTCTAT  150
      | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||
seq2  G-TTATACTCCGAGGCCATAAGAGCTGAAC-TAACTCTCTGC-TCTCTAT  137

seq1  TTTTTGATAACAAGAAATGTGATAATAGGAACATTAC-AAAAAATTTTAA  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  TTTTTGATAACAAGAAATGTGATAATAGGAACATTACAAAAAAATTTTAA  187

seq1  GGTTTTTCTCTATATGGGTCTACATTAGGCACAAAAAAGTTTATGGGCAA  249
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  GGTTTTTCTCTATATGGGTCTACATTAGGCACAAAAAAGTTTATGGGC-A  236

seq1  AACTAAACAAAAGACCCCCCCC-AAAAAAATTTCTACTTTTTCTCCTGAA  298
      |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTAAACAAAAGACCCCCCCCAAAAAAAATTTCTACTTTTTCTCCTGAA  286

seq1  ATTATCTTGTGCATCATAATTAAGAGATATACCTAATCCTATTTTTAAGC  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTATCTTGTGCATCATAATTAAGAGATATACCTAATCCTATTTTTAAGC  336

seq1  ATTAAAAAGGCTAGCATTAAAGTGTTACTATAGTTCAAACCTTCATTTAG  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAAAAAGGCTAGCATTAAAGTGTTACTATAGTTCAAACCTTCATTTAG  386

seq1  TTTGCTTTTAATTTTAAAAGATAAGTTATAAAGCTGAATAAATAGCTCAA  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGCTTTTAATTTTAAAAGATAAGTTATAAAGCTGAATAAATAGCTCAA  436

seq1  TGGATAAAGTGCTTGCTCTGAAAGCATGAAACCTAAATACAGATTCCAAG  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGATAAAGTGCTTGCTCTGAAAGCATGAAACCTAAATACAGATTCCAAG  486

seq1  AACCAGGTGGGCATGGCAATCTGTCTGTAGTCCCAGGACACCAAAGGCAG  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCAGGTGGGCATGGCAATCTGTCTGTAGTCCCAGGACACCAAAGGCAG  536

seq1  AGAGAAAGGGGGTCCCTTCGAACAGACAGCTAGAATGATTAGCTAAAATC  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAAAGGGGGTCCCTTCGAACAGACAGCTAGAATGATTAGCTAAAATC  586

seq1  TTCAGCCTGAGTCAATAAATAAGCAATAAGCAAAGAAATCTTCCAGAAAC  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAGCCTGAGTCAATAAATAAGCAATAAGCAAAGAAATCTTCCAGAAAC  636

seq1  CTCAAGCCTCCACTCATAGGCAATGCATGCCCACCATCTACATATAAATA  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAAGCCTCCACTCATAGGCAATGCATGCCCACCATCTACATATAAATA  686

seq1  TGCAAAAATAAAGTTTAAGAGAGATAAAATGCTTACATAGTTCAGTTAGT  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAAAAATAAAGTTTAAGAGAGATAAAATGCTTACATAGTTCAGTTAGT  736

seq1  AAATTTCATTCATAATGATTTCACACTGTATAATAATATTCTCAAAAATA  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTTCATTCATAATGATTTCACACTGTATAATAATATTCTCAAAAATA  786

seq1  ATATTAAGAATGATAATCTTAAGAATATATTGGTTTTAAGTTAAGTACTT  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATTAAGAATGATAATCTTAAGAATATATTGGTTTTAAGTTAAGTACTT  836

seq1  CATTATAACACATAGATATAAAGTGCTGTGGATGCTTGTGCTTATACAAA  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTATAACACATAGATATAAAGTGCTGTGGATGCTTGTGCTTATACAAA  886

seq1  GCAGTGGAATTC  910
      ||||||||||||
seq2  GCAGTGGAATTC  898