BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-067H12
Chromosome14 (Build37)
Map Location 119,722,841 - 119,931,557
singlet/doubletdoublet
Overlap geneHs6st3
Upstream geneLOC435422, Abcc4, Cldn10, Dzip1, Dnajc3a, LOC100043828, Ugcgl2, LOC619601
Downstream geneEG621324, LOC100043830, Oxgr1, Gabarapl2-ps, LOC100043831, Mbnl2, Rap2a
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-067H12.bB6Ng01-067H12.g
ACCDH886349DH886350
length1,206895
definitionDH886349|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-067H12, 5' end.DH886350|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-067H12, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(119,930,330 - 119,931,557)(119,722,841 - 119,723,733)
sequence
gaattcaagaaatctccatttcttatcaacatcccaaatcctttgttata
aaatttaaaaattaaatatttaaattgaaaaagatctttttgatataaat
tagtattttcctttcaagtgaatctgaaccacttcagttctcttttaaat
tgtggggttcttttttgtgtgtgtgtttatttatttatatacatgcacaa
gtgcaaggtacatgtgtagatgttagagaataactttcagtatcaggttc
atgccttccaacaagttggctctggggattgataggtccttgggcttggt
ggcaagtacctgtatattttgagccatctcgtttgtcatttaaacacatt
gacatcttcaagagaacctaaacatttattcaccatactgagggcacttt
acaatgaacttgccacctgggacagtatacacatggattgtaaactgctg
gctgtcacttcttgtaatcactctggattttcacaaaatgcagaagagag
actggtattaatgatagaaagtcagggccaatgaacggtcaagttgagag
aagctgaaagaagacagcagcaatgtgaactccagaaatccagaaaagtt
taacattggtttcaggacaaacagcagaagtaatgaaagccaccaggcat
agctatcttcctcatcatatgagtcactggtctgaaactggttctttgag
tccactaccaaccaaccaacacacacaaagtcactcacatacaaacacat
acacacacacacacacatgtacacattcatatacatgtacacactcatac
atacactctcctgtatacatcactggagtaatcatctcatctctccctta
tggggttgttggaacaatggaattgggaacctgaaacaagtacagagtgg
gagacacaactgcatttatccatagtagtatcagaccatgtttacttgta
tcaatcacatgacaactgggacagcgatagtggactgacagcacttattt
gaagtaggtcagatttcatcagacaggaagtgggtagcattggaatggag
atgagtctagaactatgtgggagtatgggctgccattcagcaggtctctg
agctccttctgtcaccctatccttgttactcttaaaccatgcattagagc
attcagcaacgctactccatgtgccgacaacttaacccctctctgccatt
accttt
gaattctgggctattgttatggcatataggattaatgataggctacaata
gcattgcatattaaaagaatagcctgagagctacagaatcactcaagctc
cgaagtcaagtgtggatggatcactggatgcttttatttctagtattttg
tttatcaggcagtgttgccttgccagaaagcagagatgctgttgggaacc
aggtacataactgtccagctgtgatgttctctctctctctctctctctct
ctctctttccctctctcctctctctgtctatgtctctctgtatctttctc
tctctgtctctctctgtctctctgtctctctttctctctcaccttctctt
ctctctgtctatgtctctctgtgtctttctctctctctttcctctctctg
tctctctctgcctctgtctctctctctgggtgttcacttcaggtttttca
tttcaccatatataatatagatactataaatgatatatttaaatcgaact
gtttcaattcagcattattcagttttatataacatgagaatatggtacac
ctgtatccagtaatatggtgataactgactaaatgttacagagaatttct
ttaataacttttattttttgttctactgggggtcaaactcaagtcttgac
acattcttgggcaaatgctccaccacagatctgtgtcctaacccctaaag
atttagaaaaaaatttaatttattctttttttaaagtaacacttttatct
ttctttgaggccatacaacatatttttatcatattttgtcctcatccttc
tctactccaaatgctccaggatcaatatactctttctattgatctatact
accacttcactactagtgctgccgctttcctcctcctcctcctcc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_119930330_119931557
seq2: B6Ng01-067H12.b_44_1249 (reverse)

seq1  AAAGGTAAATGTGCAGAGAAGGGTTAAGGATGTCAGGCACATGGAGAAGG  50
      |||||| |||| ||||||| ||||||| | |||| ||||||||||| | |
seq2  AAAGGT-AATG-GCAGAGAGGGGTTAA-GTTGTC-GGCACATGGAGTA-G  45

seq1  CGTTTGCTGGAATAGCTCTAAAATGCATTGTTTAGAGAGATACAAAGGAT  100
      || ||||| |||| |||||  ||||||| ||||| |||| ||  ||||||
seq2  CG-TTGCT-GAAT-GCTCT--AATGCATGGTTTA-AGAG-TAACAAGGAT  88

seq1  GAGGTGGACAGAGGAAGCTGAGAGACCTGCTGAATAGCAGCGCATTAACT  150
       |||  |||||| | |||| ||||||||||||||| ||||| |||  |||
seq2  -AGGGTGACAGAAGGAGCTCAGAGACCTGCTGAATGGCAGCCCAT--ACT  135

seq1  CCCACATAGTTCCTAGACTCATCTCCATTCCAATTGCTTACCCACTTCCT  200
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||
seq2  CCCACATAGTT-CTAGACTCATCTCCATTCCAA-TGC-TACCCACTTCCT  182

seq1  GTCTGAATGAAATCTGACCTTACTTCAAATAAGTGCTTGTCAGT-CACTA  249
      ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||
seq2  GTCTG-ATGAAATCTGACC-TACTTCAAATAAGTGC-TGTCAGTCCACTA  229

seq1  TCGCTGTCCCAGTTGTCATGTGATTGATACAAGTAAACATGGTCTGATAC  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGCTGTCCCAGTTGTCATGTGATTGATACAAGTAAACATGGTCTGATAC  279

seq1  TACTATGGATAAAATGCAGTTGTGTCTCCCACTCTGTACTTGTTTCAGGT  349
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTATGGAT-AAATGCAGTTGTGTCTCCCACTCTGTACTTGTTTCAGGT  328

seq1  TCCCAATTCCATTGTTTCCAACAACCCCATAAGGGAGAGATGAGATGATT  399
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCAATTCCATTG-TTCCAACAACCCCATAAGGGAGAGATGAGATGATT  377

seq1  ACTCCAGTGATGTATACAGGAGAGTGTATGTATGAGTGTGTACATGTATA  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCCAGTGATGTATACAGGAGAGTGTATGTATGAGTGTGTACATGTATA  427

seq1  TGAATGTGTACATGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTTTGTATGTGAGTGAC  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAATGTGTACATGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTTTGTATGTGAGTGAC  477

seq1  TTTGTGTGTGTTGGTTGGTTGGTAGTGGACTCAAAGAACCAGTTTCAGAC  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTGTGTGTTGGTTGGTTGGTAGTGGACTCAAAGAACCAGTTTCAGAC  527

seq1  CAGTGACTCATATGATGAGGAAGATAGCTATGCCTGGTGGCTTTCATTAC  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGACTCATATGATGAGGAAGATAGCTATGCCTGGTGGCTTTCATTAC  577

seq1  TTCTGCTGTTTGTCCTGAAACCAATGTTAAACTTTTCTGGATTTCTGGAG  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGCTGTTTGTCCTGAAACCAATGTTAAACTTTTCTGGATTTCTGGAG  627

seq1  TTCACATTGCTGCTGTCTTCTTTCAGCTTCTCTCAACTTGACCGTTCATT  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCACATTGCTGCTGTCTTCTTTCAGCTTCTCTCAACTTGACCGTTCATT  677

seq1  GGCCCTGACTTTCTATCATTAATACCAGTCTCTCTTCTGCATTTTGTGAA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCCTGACTTTCTATCATTAATACCAGTCTCTCTTCTGCATTTTGTGAA  727

seq1  AATCCAGAGTGATTACAAGAAGTGACAGCCAGCAGTTTACAATCCATGTG  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCCAGAGTGATTACAAGAAGTGACAGCCAGCAGTTTACAATCCATGTG  777

seq1  TATACTGTCCCAGGTGGCAAGTTCATTGTAAAGTGCCCTCAGTATGGTGA  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATACTGTCCCAGGTGGCAAGTTCATTGTAAAGTGCCCTCAGTATGGTGA  827

seq1  ATAAATGTTTAGGTTCTCTTGAAGATGTCAATGTGTTTAAATGACAAACG  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAATGTTTAGGTTCTCTTGAAGATGTCAATGTGTTTAAATGACAAACG  877

seq1  AGATGGCTCAAAATATACAGGTACTTGCCACCAAGCCCAAGGACCTATCA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATGGCTCAAAATATACAGGTACTTGCCACCAAGCCCAAGGACCTATCA  927

seq1  ATCCCCAGAGCCAACTTGTTGGAAGGCATGAACCTGATACTGAAAGTTAT  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCCCAGAGCCAACTTGTTGGAAGGCATGAACCTGATACTGAAAGTTAT  977

seq1  TCTCTAACATCTACACATGTACCTTGCACTTGTGCATGTATATAAATAAA  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTAACATCTACACATGTACCTTGCACTTGTGCATGTATATAAATAAA  1027

seq1  TAAACACACACACAAAAAAGAACCCCACAATTTAAAAGAGAACTGAAGTG  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAACACACACACAAAAAAGAACCCCACAATTTAAAAGAGAACTGAAGTG  1077

seq1  GTTCAGATTCACTTGAAAGGAAAATACTAATTTATATCAAAAAGATCTTT  1149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCAGATTCACTTGAAAGGAAAATACTAATTTATATCAAAAAGATCTTT  1127

seq1  TTCAATTTAAATATTTAATTTTTAAATTTTATAACAAAGGATTTGGGATG  1199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAATTTAAATATTTAATTTTTAAATTTTATAACAAAGGATTTGGGATG  1177

seq1  TTGATAAGAAATGGAGATTTCTTGAATTC  1228
      |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGATAAGAAATGGAGATTTCTTGAATTC  1206

seq1: chr14_119722841_119723733
seq2: B6Ng01-067H12.g_69_963

seq1  GAATTCTGGGCTATTGTTATGGCATATAGGATTAATGATAGGCTACAATA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGGGCTATTGTTATGGCATATAGGATTAATGATAGGCTACAATA  50

seq1  GCATTGCATATTAAAAGAATAGCCTGAGAGCTACAGAATCACTCAAGCTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATTGCATATTAAAAGAATAGCCTGAGAGCTACAGAATCACTCAAGCTC  100

seq1  CGAAGTCAAGTGTGGATGGATCACTGGATGCTTTTATTTCTAGTATTTTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGAAGTCAAGTGTGGATGGATCACTGGATGCTTTTATTTCTAGTATTTTG  150

seq1  TTTATCAGGCAGTGTTGCCTTGCCAGAAAGCAGAGATGCTGTTGGGAACC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATCAGGCAGTGTTGCCTTGCCAGAAAGCAGAGATGCTGTTGGGAACC  200

seq1  AGGTACATAACTGTCCAGCTGTGATGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTACATAACTGTCCAGCTGTGATGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT  250

seq1  CTCTCTTTCCCTCTCTCCTCTCTCTGTCTATGTCTCTCTGTATCTTTCTC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCTTTCCCTCTCTCCTCTCTCTGTCTATGTCTCTCTGTATCTTTCTC  300

seq1  TCTCTGTCTCTCTCTGTCTCTCTGTCTCTCTTTCTCTCTCACCTTCTCTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTGTCTCTCTCTGTCTCTCTGTCTCTCTTTCTCTCTCACCTTCTCTT  350

seq1  CTCTCTGTCTATGTCTCTCTGTGTCTTTCTCTCTCTCTTTCCTCTCTCTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCTGTCTATGTCTCTCTGTGTCTTTCTCTCTCTCTTTCCTCTCTCTG  400

seq1  TCTCTCTCTGCCTCTGTCTCTCTCTCTGGGTGTTCACTTCAGGTTTTTCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTCTCTGCCTCTGTCTCTCTCTCTGGGTGTTCACTTCAGGTTTTTCA  450

seq1  TTTCACCATATATAATATAGATACTATAAATGATATATTTAAATCGAACT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCACCATATATAATATAGATACTATAAATGATATATTTAAATCGAACT  500

seq1  GTTTCAATTCAGCATTATTCAGTTTTATATAACATGAGAATATGGTACAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTCAATTCAGCATTATTCAGTTTTATATAACATGAGAATATGGTACAC  550

seq1  CTGTATCCAGTAATATGGTGATAACTGACTAAATGTTACAGAGAATTTCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTATCCAGTAATATGGTGATAACTGACTAAATGTTACAGAGAATTTCT  600

seq1  TTAATAACTTTTATTTTTTGTTCTACTGGGGGTCAAACTCAAGTCTTGAC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATAACTTTTATTTTTTGTTCTACTGGGGGTCAAACTCAAGTCTTGAC  650

seq1  ACATTCTTGGGCAAATGCTCCACCACAGATCTGTGTCCTAACCCCTAAAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATTCTTGGGCAAATGCTCCACCACAGATCTGTGTCCTAACCCCTAAAG  700

seq1  ATTTAGAAAAAAATTTAATTTATTC-TTTTTTAAAGTAACACTTTTATCT  749
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTAGAAAAAAATTTAATTTATTCTTTTTTTAAAGTAACACTTTTATCT  750

seq1  TTCTTTGAGGCCATACAACATATTTTTATCATA-TTTGTCCTCATCCTTC  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  TTCTTTGAGGCCATACAACATATTTTTATCATATTTTGTCCTCATCCTTC  800

seq1  TCTACTCCAAATGCTCCAGGATCAATATACTCTTTCTATTGATCTATACT  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTACTCCAAATGCTCCAGGATCAATATACTCTTTCTATTGATCTATACT  850

seq1  ACCACTTCACTACTAGTGCTGCCGCTTTCCTCCTCCTCCTCCTCC  893
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCACTTCACTACTAGTGCTGCCGCTTTCCTCCTCCTCCTCCTCC  895