BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-068B24
Chromosome14 (Build37)
Map Location 58,322,182 - 58,453,503
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLats2, Sap18, F630043A04Rik, Mrp63, Zdhhc20
Upstream genePspc1, LOC100043499, 9830124H08Rik, LOC100042797, LOC219106, LOC668118, Zmym2, LOC100042817, B020004C17Rik, Gja3, Gjb2, LOC100043515, Gjb6, LOC668140, Cryl1, LOC668090, AU040096, Ift88, Il17d, N6amt2, Xpo4
Downstream geneEfha1, LOC668160, Fgf9, LOC100043554
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-068B24.bB6Ng01-068B24.g
ACCDH886806DH886807
length1,113853
definitionDH886806|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-068B24, 5' end.DH886807|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-068B24, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(58,452,382 - 58,453,503)(58,322,182 - 58,323,034)
sequence
gaattcccattgactgcactaattatgaatcttaagtaactttccctttg
gaccaaaggagtgagtcagctttggcaccatggtttaaagttgtatgtag
tatgaattcctcttcatttcagctcttttgactttcattctataaaaaca
gtgacttaagagatagcagttactgctaggcatgctggcgcctgctggcc
gtctcagcacttgggagtgtgaatcaggttggtctagctcactctcagca
ccaccagcagcctgtgctgcatgaagcctgtgctaaacagcccgagagga
aacgaagatcaattactaaccagaaatacaacttcaatttggtagtgtgc
atgctactttcagaaatattctagtatttcagtgtttctatatttatacc
aagggatttgcatgcacctggcatagtttgcccctttaacatactattac
gtagaagtatcaaatttctgagttcttatcatttgtttattagcagagta
aaaccatttctagttttccactttggtagcctttatagccagctttttgc
cacattctaaaatatttagctgccttttgttgtttcggttttgtttcatt
ttagtgctgggaatcaaatccagggccttctgcatactaggcaagtcccc
taccactgagctacatccctggcccgagctgaagctgttcatacgtgtca
gtggccgctcattagggaccagcaagggaccagcatgggaatcagggaag
gctggctgtttagtatgtgaactggcattgcgtctgctatcaggggggga
ctacattgaaacagagctttgccaaaatttcaaacacttgaacatttgtg
aagaaaatggagttgaatttcacgtcttgcccttgccattaaaacatcag
acaggagacttggtttactgggtacagaggtacttgactgttgagtacct
gcggcacctgaccctgtcactgtgccaccaaagcagctgcagtgtaccag
ctattgacatgacatgtttacaaagttgagttttgtcttcataaaaggat
gattttaaaaactttttacatagttatgacctcattggttaagcataaca
gtagcctaaatat
gaattcaattctcagcaaacacgtggtagctcacaactatctatagtggg
gtctgatgccttcttcgggcatgcaggtatacatgcagacagagcactca
caggaaggaatgaagaaacgaagggagggagggaggaactttagtgactg
gcttggtggatccagactgaagctacgaagacaggttaccttagagaagg
agatcccagttcacctctgtgctaactctgggatccctggaaatgcatgg
atgggcacatttatgagacatttactgaatgcctcctgttgacaacgtcc
tctgctatctgcagcagttaaggagttgcccaagacagtcgtcatgaagc
ccctggagctctgtccacatccatacagctctgtcccctaaaagtgtttg
cagaatgaacacacaacaggagagggcagtgacattaccgtgaattgaaa
agatggttcccgtctacccagggaaagcatagatcctttcaaggacagat
gtacttggaaaaggtggaaagcccatccaagtggagacagttactcaggg
ctgatgggctagacagaaaggagctgtaggtggagcacaccaggagggta
gcggcaacacccaggcgcatgtaataggacagggaacccccacctagggt
tgggctatcactggctttgcctatttgtaatatcaagggaactttcaaac
acagacacacataatctgaagatgaagctgggggcaacacggggtgcaga
gcttcaggcactctggggcagagatgaaggaagcagaaggtgacatggcc
aggcagctaagagaagaagcactgagagggggtaggttttggtgagaatg
gta
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_58452382_58453503
seq2: B6Ng01-068B24.b_46_1158 (reverse)

seq1  ATATTTAAGCTAACTTGTTATGCTTTAAACACATTGA-GTCATAACTATG  49
      ||||||| ||||   ||||||||||  ||| || ||| ||||||||||||
seq2  ATATTTAGGCTA--CTGTTATGCTT--AAC-CAATGAGGTCATAACTATG  45

seq1  TAAAAAGTTTTTTAAAAATCATTCTTTTATGAAGACAAAACTCAACTTTG  99
      ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAAAGTTTTT--AAAATCATCCTTTTATGAAGACAAAACTCAACTTTG  93

seq1  TAAACATGTTCATGTCAATAGCTGGTACACTGCAGCTGCTTTGGTTGGCA  149
      |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  TAAACATG-TCATGTCAATAGCTGGTACACTGCAGCTGCTTTGG-TGGCA  141

seq1  CAGTGACAGGGTCAGGTGCCGCAGGTACTCAACAGTCAAGTACCTCTGTA  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGACAGGGTCAGGTGCCGCAGGTACTCAACAGTCAAGTACCTCTGTA  191

seq1  CCCAGTAAACCAAGTCTCCTGTCTGATGTTTTTAATGGCAAGGGCAAGAC  249
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  CCCAGTAAACCAAGTCTCCTGTCTGATG-TTTTAATGGCAAGGGCAAGAC  240

seq1  CTGAAATTCAACTCCATTTTCTTCACAAATGTTCAAGTGTTTGAAATTTT  299
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAAATTCAACTCCATTTTCTTCACAAATGTTCAAGTGTTTGAAATTTT  290

seq1  GGCAAAGCTCTGTTTCAATGTAGTCCCCCCCTGATAGCAGACGCAATGCC  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAAAGCTCTGTTTCAATGTAGTCCCCCCCTGATAGCAGACGCAATGCC  340

seq1  AGTTCACATACTAAACAGCCAGCCTTCCCTGATTCCCATGCTGGTCCCTT  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTCACATACTAAACAGCCAGCCTTCCCTGATTCCCATGCTGGTCCCTT  390

seq1  GCTGGTCCCTAATGAGCGGCCACTGACACGTATGAACAGCTTCAGCTCGG  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGGTCCCTAATGAGCGGCCACTGACACGTATGAACAGCTTCAGCTCGG  440

seq1  GCCAGGGATGTAGCTCAGTGGTAGGGGACTTGCCTAGTATGCAGAAGGCC  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAGGGATGTAGCTCAGTGGTAGGGGACTTGCCTAGTATGCAGAAGGCC  490

seq1  CTGGATTTGATTCCCAGCACTAAAATGAAACAAAACCGAAACAACAAAAG  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGATTTGATTCCCAGCACTAAAATGAAACAAAACCGAAACAACAAAAG  540

seq1  GCAGCTAAATATTTTAGAATGTGGCAAAAAGCTGGCTATAAAGGCTACCA  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGCTAAATATTTTAGAATGTGGCAAAAAGCTGGCTATAAAGGCTACCA  590

seq1  AAGTGGAAAACTAGAAATGGTTTTACTCTGCTAATAAACAAATGATAAGA  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTGGAAAACTAGAAATGGTTTTACTCTGCTAATAAACAAATGATAAGA  640

seq1  ACTCAGAAATTTGATACTTCTACGTAATAGTATGTTAAAGGGGCAAACTA  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCAGAAATTTGATACTTCTACGTAATAGTATGTTAAAGGGGCAAACTA  690

seq1  TGCCAGGTGCATGCAAATCCCTTGGTATAAATATAGAAACACTGAAATAC  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCAGGTGCATGCAAATCCCTTGGTATAAATATAGAAACACTGAAATAC  740

seq1  TAGAATATTTCTGAAAGTAGCATGCACACTACCAAATTGAAGTTGTATTT  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAATATTTCTGAAAGTAGCATGCACACTACCAAATTGAAGTTGTATTT  790

seq1  CTGGTTAGTAATTGATCTTCGTTTCCTCTCGGGCTGTTTAGCACAGGCTT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGTTAGTAATTGATCTTCGTTTCCTCTCGGGCTGTTTAGCACAGGCTT  840

seq1  CATGCAGCACAGGCTGCTGGTGGTGCTGAGAGTGAGCTAGACCAACCTGA  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGCAGCACAGGCTGCTGGTGGTGCTGAGAGTGAGCTAGACCAACCTGA  890

seq1  TTCACACTCCCAAGTGCTGAGACGGCCAGCAGGCGCCAGCATGCCTAGCA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCACACTCCCAAGTGCTGAGACGGCCAGCAGGCGCCAGCATGCCTAGCA  940

seq1  GTAACTGCTATCTCTTAAGTCACTGTTTTTATAGAATGAAAGTCAAAAGA  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAACTGCTATCTCTTAAGTCACTGTTTTTATAGAATGAAAGTCAAAAGA  990

seq1  GCTGAAATGAAGAGGAATTCATACTACATACAACTTTAAACCATGGTGCC  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGAAATGAAGAGGAATTCATACTACATACAACTTTAAACCATGGTGCC  1040

seq1  AAAGCTGACTCACTCCTTTGGTCCAAAGGGAAAGTTACTTAAGATTCATA  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGCTGACTCACTCCTTTGGTCCAAAGGGAAAGTTACTTAAGATTCATA  1090

seq1  ATTAGTGCAGTCAATGGGAATTC  1122
      |||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAGTGCAGTCAATGGGAATTC  1113

seq1: chr14_58322182_58323034
seq2: B6Ng01-068B24.g_66_918

seq1  GAATTCAATTCTCAGCAAACACGTGGTAGCTCACAACTATCTATAGTGGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAATTCTCAGCAAACACGTGGTAGCTCACAACTATCTATAGTGGG  50

seq1  GTCTGATGCCTTCTTCGGGCATGCAGGTATACATGCAGACAGAGCACTCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTGATGCCTTCTTCGGGCATGCAGGTATACATGCAGACAGAGCACTCA  100

seq1  CAGGAAGGAATGAAGAAACGAAGGGAGGGAGGGAGGAACTTTAGTGACTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGAAGGAATGAAGAAACGAAGGGAGGGAGGGAGGAACTTTAGTGACTG  150

seq1  GCTTGGTGGATCCAGACTGAAGCTACGAAGACAGGTTACCTTAGAGAAGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTGGTGGATCCAGACTGAAGCTACGAAGACAGGTTACCTTAGAGAAGG  200

seq1  AGATCCCAGTTCACCTCTGTGCTAACTCTGGGATCCCTGGAAATGCATGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATCCCAGTTCACCTCTGTGCTAACTCTGGGATCCCTGGAAATGCATGG  250

seq1  ATGGGCACATTTATGAGACATTTACTGAATGCCTCCTGTTGACAACGTCC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGGCACATTTATGAGACATTTACTGAATGCCTCCTGTTGACAACGTCC  300

seq1  TCTGCTATCTGCAGCAGTTAAGGAGTTGCCCAAGACAGTCGTCATGAAGC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCTATCTGCAGCAGTTAAGGAGTTGCCCAAGACAGTCGTCATGAAGC  350

seq1  CCCTGGAGCTCTGTCCACATCCATACAGCTCTGTCCCCTAAAAGTGTTTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTGGAGCTCTGTCCACATCCATACAGCTCTGTCCCCTAAAAGTGTTTG  400

seq1  CAGAATGAACACACAACAGGAGAGGGCAGTGACATTACCGTGAATTGAAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAATGAACACACAACAGGAGAGGGCAGTGACATTACCGTGAATTGAAA  450

seq1  AGATGGTTCCCGTCTACCCAGGGAAAGCATAGATCCTTTCAAGGACAGAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATGGTTCCCGTCTACCCAGGGAAAGCATAGATCCTTTCAAGGACAGAT  500

seq1  GTACTTGGAAAAGGTGGAAAGCCCATCCAAGTGGAGACAGTTACTCAGGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACTTGGAAAAGGTGGAAAGCCCATCCAAGTGGAGACAGTTACTCAGGG  550

seq1  CTGATGGGCTAGACAGAAAGGAGCTGTAGGTGGAGCACACCAGGAGGGTA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGATGGGCTAGACAGAAAGGAGCTGTAGGTGGAGCACACCAGGAGGGTA  600

seq1  GCGGCAACACCCAGGCGCATGTAATAGGACAGGGAACCCCCACCTAGGGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCGGCAACACCCAGGCGCATGTAATAGGACAGGGAACCCCCACCTAGGGT  650

seq1  TGGGCTATCACTGGCTTTGCCTATTTGTAATATCAAGGGAACTTTCAAAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGCTATCACTGGCTTTGCCTATTTGTAATATCAAGGGAACTTTCAAAC  700

seq1  ACAGACACACATAATCTGAAGATGAAGCTGGGGGCAACACGGGGTGCAGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGACACACATAATCTGAAGATGAAGCTGGGGGCAACACGGGGTGCAGA  750

seq1  GCTTCAGGCACTCTGGGGCAGAGATGAAGGAAGCAGAAGGTGACATGGCC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTCAGGCACTCTGGGGCAGAGATGAAGGAAGCAGAAGGTGACATGGCC  800

seq1  AGGCAGCTAAGAGAAGAAGCACTGAGAGGGGGTAGGTTTTGGTGAGAATG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCAGCTAAGAGAAGAAGCACTGAGAGGGGGTAGGTTTTGGTGAGAATG  850

seq1  GTA  853
      |||
seq2  GTA  853