BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-068F08
Chromosome14 (Build37)
Map Location 9,260,017 - 9,492,796
singlet/doubletdoublet
Overlap gene4930452B06Rik
Upstream geneLOC100042286, LOC100042263, LOC100042258, LOC100042272, LOC100041874, LOC100042304, LOC100041881, LOC100042312, LOC100041893, ENSMUSG00000058570, EG666976, Flnb, Dnase1l3, Abhd6, Rpp14, Pxk, Pdhb, Kctd6, Acox2, BC055107, Oit1, LOC667005
Downstream geneLOC100041948, Fhit
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-068F08.bB6Ng01-068F08.g
ACCDH886951DH886952
length684771
definitionDH886951|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-068F08, 5' end.DH886952|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-068F08, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(9,492,114 - 9,492,796)(9,260,017 - 9,260,786)
sequence
gaattctttttaaaggagatttattttgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtg
tgtgtgtgtgtgtgtgccactggtctgcatgtgctagtggaggcagagaa
gacagcatctgatcccctggaggcataggtggttgtgagctgtccagcat
gggtgctagaaactgaacttgggtcctctagaagagcaacgagtgctctc
cactgcttagccatttctctagcccttttgcttaactttttagatagcct
taattgttacattttaatttatattgaatttaaataaattatatttagaa
ttttcagagttacaggagatgtgaataataattaattccatttgagctag
tcctgaaagcagagaaggtgtagtgtcaatttagcacaggttaggtactt
ttgctgctgtggtatggggtggtaatcagccgtgtacctagacagagatg
tgcacagggagcaagaagcagctctcccccaaaccagatgagtgactttg
gaatccctgacattaaagaactttttcttttttttttcatttgaagggat
gatattttcacacaaccagaaattagccatgtggttagtgtggttttatg
ttccgtccccagcaagtctcaggaagaaagcatcatcaaagttttgagtc
tacttttaagtctcctgggtgagggagggggagg
gaattcagcccctcccccacttctacccatccccccttatgaagacaaat
ggcaaccccatgtttctagtccctccctgccttgagcatgcacttctcca
tgcccactgcactggctgatctggaatggaagttctgtttgttgaagggc
aactgggcaatgcggatccttgacatatcaaggctgtgagcctaatgagt
ttcccctctgacaattgagggagaactatgcagagtaagagataatgagt
atggagattcccaagctcctggcaaggttcacgtaaggcccttccaatgg
catgcagaccactggaatcctcaccggaagttctccaagtgggagaggaa
cccacctagaagtgaggatcatggattactctgccctctgcatctgagag
cctctgggaaattagctttccaacctgatttgcaaggtcagaaacttaaa
gaagtagtctttgatcattcttgctatgaccaactagatgactgaatccc
aacctgcctactaggagaaagagaaaattaaattttcttgtcaataattc
tatgaccaccttacctggagtgtaaaatgactaatgtgggtgctgctaca
caaacacagggacatagctcatgctgaactttcatggtgtgaattccctt
cctccctggggttttccaggcactgatgcacaccaagtgggaaaggatga
aggggagtctggaacaggtggggtagcgggagtccagctgtgagttccag
ggtggtggtgggggtgtcttt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_9492114_9492796
seq2: B6Ng01-068F08.b_44_727 (reverse)

seq1  CCTCCCCCTCCCTCACCCAGGAGACTTAAAAGTAGACTC-AAACTTTGAT  49
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  CCTCCCCCTCCCTCACCCAGGAGACTTAAAAGTAGACTCAAAACTTTGAT  50

seq1  GATGCTTTCTTCCTGAGACTTGCTGGGGACGGAACATAAAACCACACTAA  99
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGCTTTCTTCCTGAGACTTGCTGGGGACGGAACATAAAACCACACTAA  100

seq1  CCACATGGCTAATTTCTGGTTGTGTGAAAATATCATCCCTTCAAATGAAA  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACATGGCTAATTTCTGGTTGTGTGAAAATATCATCCCTTCAAATGAAA  150

seq1  AAAAAAAGAAAAAGTTCTTTAATGTCAGGGATTCCAAAGTCACTCATCTG  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAAAGAAAAAGTTCTTTAATGTCAGGGATTCCAAAGTCACTCATCTG  200

seq1  GTTTGGGGGAGAGCTGCTTCTTGCTCCCTGTGCACATCTCTGTCTAGGTA  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTGGGGGAGAGCTGCTTCTTGCTCCCTGTGCACATCTCTGTCTAGGTA  250

seq1  CACGGCTGATTACCACCCCATACCACAGCAGCAAAAGTACCTAACCTGTG  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACGGCTGATTACCACCCCATACCACAGCAGCAAAAGTACCTAACCTGTG  300

seq1  CTAAATTGACACTACACCTTCTCTGCTTTCAGGACTAGCTCAAATGGAAT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAATTGACACTACACCTTCTCTGCTTTCAGGACTAGCTCAAATGGAAT  350

seq1  TAATTATTATTCACATCTCCTGTAACTCTGAAAATTCTAAATATAATTTA  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATTATTATTCACATCTCCTGTAACTCTGAAAATTCTAAATATAATTTA  400

seq1  TTTAAATTCAATATAAATTAAAATGTAACAATTAAGGCTATCTAAAAAGT  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAAATTCAATATAAATTAAAATGTAACAATTAAGGCTATCTAAAAAGT  450

seq1  TAAGCAAAAGGGCTAGAGAAATGGCTAAGCAGTGGAGAGCACTCGTTGCT  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGCAAAAGGGCTAGAGAAATGGCTAAGCAGTGGAGAGCACTCGTTGCT  500

seq1  CTTCTAGAGGACCCAAGTTCAGTTTCTAGCACCCATGCTGGACAGCTCAC  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTAGAGGACCCAAGTTCAGTTTCTAGCACCCATGCTGGACAGCTCAC  550

seq1  AACCACCTATGCCTCCAGGGGATCAGATGCTGTCTTCTCTGCCTCCACTA  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCACCTATGCCTCCAGGGGATCAGATGCTGTCTTCTCTGCCTCCACTA  600

seq1  GCACATGCAGACCAGTGGCACACACACACACACACACACACACACACACA  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACATGCAGACCAGTGGCACACACACACACACACACACACACACACACA  650

seq1  CACACACAAAATAAATCTCCTTTAAAAAGAATTC  683
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACACAAAATAAATCTCCTTTAAAAAGAATTC  684

seq1: chr14_9260017_9260786
seq2: B6Ng01-068F08.g_70_840

seq1  GAATTCAGCCCCTCCCCCACTTCTACCCATCCCCCCTTATGAAGACAAAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGCCCCTCCCCCACTTCTACCCATCCCCCCTTATGAAGACAAAT  50

seq1  GGCAACCCCATGTTTCTAGTCCCTCCCTGCCTTGAGCATGCACTTCTCCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAACCCCATGTTTCTAGTCCCTCCCTGCCTTGAGCATGCACTTCTCCA  100

seq1  TGCCCACTGCACTGGCTGATCTGGAATGGAAGTTCTGTTTGTTGAAGGGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCCACTGCACTGGCTGATCTGGAATGGAAGTTCTGTTTGTTGAAGGGC  150

seq1  AACTGGGCAATGCGGATCCTTGACATATCAAGGCTGTGAGCCTAATGAGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTGGGCAATGCGGATCCTTGACATATCAAGGCTGTGAGCCTAATGAGT  200

seq1  TTCCCCTCTGACAATTGAGGGAGAACTATGCAGAGTAAGAGATAATGAGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCCCTCTGACAATTGAGGGAGAACTATGCAGAGTAAGAGATAATGAGT  250

seq1  ATGGAGATTCCCAAGCTCCTGGCAAGGTTCACGTAAGGCCCTTCCAATGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGAGATTCCCAAGCTCCTGGCAAGGTTCACGTAAGGCCCTTCCAATGG  300

seq1  CATGCAGACCACTGGAATCCTCACCGGAAGTTCTCCAAGTGGGAGAGGAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGCAGACCACTGGAATCCTCACCGGAAGTTCTCCAAGTGGGAGAGGAA  350

seq1  CCCACCTAGAAGTGAGGATCATGGATTACTCTGCCCTCTGCATCTGAGAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCACCTAGAAGTGAGGATCATGGATTACTCTGCCCTCTGCATCTGAGAG  400

seq1  CCTCTGGGAAATTAGCTTTCCAACCTGATTTGCAAGGTCAGAAACTTAAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTGGGAAATTAGCTTTCCAACCTGATTTGCAAGGTCAGAAACTTAAA  450

seq1  GAAGTAGTCTTTGATCATTCTTGCTATGACCAACTAGATGACTGAATCCC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGTAGTCTTTGATCATTCTTGCTATGACCAACTAGATGACTGAATCCC  500

seq1  AACCTGCCTACTAGGAGAAAGAGAAAATTAAATTTTCTTGTCAATAATTC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCTGCCTACTAGGAGAAAGAGAAAATTAAATTTTCTTGTCAATAATTC  550

seq1  TATGACCACCTTACCTGGAGTGTAAAATGACTAATGTGGGTGCTGCTACA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGACCACCTTACCTGGAGTGTAAAATGACTAATGTGGGTGCTGCTACA  600

seq1  CAAACACAGGGACATAGCTCATGCTGAACTTTCATGGTGTGAATTCCCTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAACACAGGGACATAGCTCATGCTGAACTTTCATGGTGTGAATTCCCTT  650

seq1  CCTCCCTGGGG-TTTCCAGGCACTGATGCACACCAAGTGGGAAAGGATGA  699
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCCCTGGGGTTTTCCAGGCACTGATGCACACCAAGTGGGAAAGGATGA  700

seq1  AGGGGAGTCTGGAACAGGTGGGGTAGCGGGAGTCCAGCTGTGAGTTCCAG  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGGAGTCTGGAACAGGTGGGGTAGCGGGAGTCCAGCTGTGAGTTCCAG  750

seq1  GGTGGTGGTGGGGGTGTCTTT  770
      |||||||||||||||||||||
seq2  GGTGGTGGTGGGGGTGTCTTT  771