BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-069P24
Chromosome14 (Build37)
Map Location 20,419,742 - 20,557,556
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEG432825, LOC673583, EG664855
Upstream geneUbe2e2, LOC627741, LOC100042299, LOC675069, LOC100042322, LOC632470, EG632477, EG632498, EG667341, LOC667344, LOC619996, EG434616, LOC675165, 1700110I01Rik, EG664814, LOC100039452, LOC100038983, LOC100039441
Downstream geneNid2, 2700060E02Rik, LOC100039534, Gng2, 1810063B07Rik, Kcnk5, LOC100039106, Kcnk16, Nudt13, Ecd, AA536717, Dnajc9, Mrps16, Ttc18, Anxa7, Zmynd17, Ppp3cb, Usp54, Myoz1, Synpo2l, Sec24c, Fut11, Chchd1, 2310021P13Rik, Ndst2, Camk2g
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-069P24.bB6Ng01-069P24.g
ACCDH888138DH888139
length7691,078
definitionDH888138|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-069P24, 5' end.DH888139|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-069P24, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(20,556,790 - 20,557,556)(20,419,742 - 20,420,822)
sequence
gaattcttcttacacaagttgcactacttaagcttttttgcaagtctcag
actttatcacatccacagggaagcagagccaggctcttctttctcaacat
tctttctggtcagagcagaatgaagaggatttgatttcgtgcacagcaat
tctcaacctaagcctgcttgtggtttcctcgggcctgtttctgaacgcac
ccaaccccatgctggatgaggaccctcagaggggcctgggcaatgatgtt
tagtccatctgttgaagctttaaagtcaggagaaataaaaaagccaaaga
aacaggagaaataactgcaaagactgcagagggacaggaggagtgccagg
ctcatgagccactcaggacctctcagcactgtgggaacaactagttgaca
catttactcccccacccttgtttttgaacaaacaaacaaagtcttgctat
atagcctgggctagcctcaaactctttatctcccatctttagcctctcaa
gttctgtggctagaggaatgcatcaccacacctctattgtagaccacagg
catgcctttccttccttgtcttttcttagtgtgtggggtaagtatggggc
tgtgtgtgactgtatgtgtgcctgcctgccacctctctctcctgggaaag
gatctctcactggcctagagtttcatagccttgctggctgccagtgagtc
tatcttttcagtactggaattttcaatcacaggccagcacacctgtttgc
cactctccctccctccctc
gaattcagtgttcatcctgtgttagggcatggcccaagaagcaaataatg
tgctgaattgaggattcaataatcatgtgcaaacaggctgtatcatggac
tacccaagccaattgcatgccacatcctagttccttaaaactgggtcccc
ttggtgctaattaaacttactatcctgggcagaggacagcaaagccaggg
gacctaatggagctagctgaccttcaagagcttcctgggcaagcatgaag
gaatagactacttctatgacaattttccaatacactgtgccacaggcaag
ggtcctataggtatctgtaatgactttcctcttatttttaaggcagggat
tctcattccttggttcctgttgttatgtgaattcccagaggacacaacta
ttatttacaggtgaaaggctttatcacacctcctcccccaggagattcct
gtgtgacagccagggaacaccaggagcaaacttccctggtgatcactttg
gacctctatggactcacaccaacaggacctgcaaactgtgcatcacacaa
atcctcagaccccatcaaaggtcccagagcctcagtcctgaacaaaacac
acacagctaagttcacacacatagacacaattagaatgccaaataaatcg
agagaggtgccatcgctcagaatatgatgaacaatatcagagtaaaggtg
tgatagcctgcaggcattgcattcacacactgagaggcaacaagtgtgag
caggtccttccagctgtttgacagcaacaatcagattgcaagcaccccaa
ggtcaagtacaaaagaagatgataataaacacacagcaccttgtttatcc
aacaattaaacacctgtcagggcaacttaattgaatgatgggagatgaca
cacttcattcatgggaaggaattggggtaacagatggcacaatacaggca
cagggtactgggcatattcctacctgtagttcaaattcctcatacatgta
aaggttcaggattccacacatttcctccatgtcatgctgatcttcctcaa
ttccaatttcaattctctacttatttat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_20556790_20557556
seq2: B6Ng01-069P24.b_48_816 (reverse)

seq1  GAGGGAGGGAGGGAGAGTGGCAAACAGGTGTGCTGGCCTGTGATTG-AAA  49
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  GAGGGAGGGAGGGAGAGTGGCAAACAGGTGTGCTGGCCTGTGATTGAAAA  50

seq1  TTCCAGTACTGAAAAGATAGACTCACTGGCAGCCAGCAAGGCTATG-AAC  98
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  TTCCAGTACTGAAAAGATAGACTCACTGGCAGCCAGCAAGGCTATGAAAC  100

seq1  TCTAGGCCAGTGAGAGATCCTTTCCCAGGAGAGAGAGGTGGCAGGCAGGC  148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAGGCCAGTGAGAGATCCTTTCCCAGGAGAGAGAGGTGGCAGGCAGGC  150

seq1  ACACATACAGTCACACACAGCCCCATACTTACCCCACACACTAAGAAAAG  198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACATACAGTCACACACAGCCCCATACTTACCCCACACACTAAGAAAAG  200

seq1  ACAAGGAAGGAAAGGCATGCCTGTGGTCTACAATAGAGGTGTGGTGATGC  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAGGAAGGAAAGGCATGCCTGTGGTCTACAATAGAGGTGTGGTGATGC  250

seq1  ATTCCTCTAGCCACAGAACTTGAGAGGCTAAAGATGGGAGATAAAGAGTT  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCCTCTAGCCACAGAACTTGAGAGGCTAAAGATGGGAGATAAAGAGTT  300

seq1  TGAGGCTAGCCCAGGCTATATAGCAAGACTTTGTTTGTTTGTTCAAAAAC  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGGCTAGCCCAGGCTATATAGCAAGACTTTGTTTGTTTGTTCAAAAAC  350

seq1  AAGGGTGGGGGAGTAAATGTGTCAACTAGTTGTTCCCACAGTGCTGAGAG  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGGTGGGGGAGTAAATGTGTCAACTAGTTGTTCCCACAGTGCTGAGAG  400

seq1  GTCCTGAGTGGCTCATGAGCCTGGCACTCCTCCTGTCCCTCTGCAGTCTT  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCTGAGTGGCTCATGAGCCTGGCACTCCTCCTGTCCCTCTGCAGTCTT  450

seq1  TGCAGTTATTTCTCCTGTTTCTTTGGCTTTTTTATTTCTCCTGACTTTAA  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAGTTATTTCTCCTGTTTCTTTGGCTTTTTTATTTCTCCTGACTTTAA  500

seq1  AGCTTCAACAGATGGACTAAACATCATTGCCCAGGCCCCTCTGAGGGTCC  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTTCAACAGATGGACTAAACATCATTGCCCAGGCCCCTCTGAGGGTCC  550

seq1  TCATCCAGCATGGGGTTGGGTGCGTTCAGAAACAGGCCCGAGGAAACCAC  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATCCAGCATGGGGTTGGGTGCGTTCAGAAACAGGCCCGAGGAAACCAC  600

seq1  AAGCAGGCTTAGGTTGAGAATTGCTGTGCACGAAATCAAATCCTCTTCAT  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCAGGCTTAGGTTGAGAATTGCTGTGCACGAAATCAAATCCTCTTCAT  650

seq1  TCTGCTCTGACCAGAAAGAATGTTGAGAAAGAAGAGCCTGGCTCTGCTTC  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCTCTGACCAGAAAGAATGTTGAGAAAGAAGAGCCTGGCTCTGCTTC  700

seq1  CCTGTGGATGTGATAAAGTCTGAGACTTGCAAAAAAGCTTAAGTAGTGCA  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGTGGATGTGATAAAGTCTGAGACTTGCAAAAAAGCTTAAGTAGTGCA  750

seq1  ACTTGTGTAAGAAGAATTC  767
      |||||||||||||||||||
seq2  ACTTGTGTAAGAAGAATTC  769

seq1: chr14_20419742_20420822
seq2: B6Ng01-069P24.g_67_1144

seq1  GAATTCAGTGTTCATCCTGTGTTAGGGCATGGCCCAAGAAGCAAATAATG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGTGTTCATCCTGTGTTAGGGCATGGCCCAAGAAGCAAATAATG  50

seq1  TGCTGAATTGAGGATTCAATAATCATGTGCAAACAGGCTGTATCATGGAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGAATTGAGGATTCAATAATCATGTGCAAACAGGCTGTATCATGGAC  100

seq1  TACCCAAGCCAATTGCATGCCACATCCTAGTTCCTTAAAACTGGGTCCCC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCCAAGCCAATTGCATGCCACATCCTAGTTCCTTAAAACTGGGTCCCC  150

seq1  TTGGTGCTAATTAAACTTACTATCCTGGGCAGAGGACAGCAAAGCCAGGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGTGCTAATTAAACTTACTATCCTGGGCAGAGGACAGCAAAGCCAGGG  200

seq1  GACCTAATGGAGCTAGCTGACCTTCAAGAGCTTCCTGGGCAAGCATGAAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCTAATGGAGCTAGCTGACCTTCAAGAGCTTCCTGGGCAAGCATGAAG  250

seq1  GAATAGACTACTTCTATGACAATTTTCCAATACACTGTGCCACAGGCAAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATAGACTACTTCTATGACAATTTTCCAATACACTGTGCCACAGGCAAG  300

seq1  GGTCCTATAGGTATCTGTAATGACTTTCCTCTTATTTTTAAGGCAGGGAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCCTATAGGTATCTGTAATGACTTTCCTCTTATTTTTAAGGCAGGGAT  350

seq1  TCTCATTCCTTGGTTCCTGTTGTTATGTGAATTCCCAGAGGACACAACTA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCATTCCTTGGTTCCTGTTGTTATGTGAATTCCCAGAGGACACAACTA  400

seq1  TTATTTACAGGTGAAAGGCTTTATCACACCTCCTCCCCCAGGAGATTCCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTTACAGGTGAAAGGCTTTATCACACCTCCTCCCCCAGGAGATTCCT  450

seq1  GTGTGACAGCCAGGGAACACCAGGAGCAAACTTCCCTGGTGATCACTTTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGACAGCCAGGGAACACCAGGAGCAAACTTCCCTGGTGATCACTTTG  500

seq1  GACCTCTATGGACTCACACCAACAGGACCTGCAAACTGTGCATCACACAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCTCTATGGACTCACACCAACAGGACCTGCAAACTGTGCATCACACAA  550

seq1  ATCCTCAGACCCCATCAAAGGTCCCAGAGCCTCAGTCCTGAACAAAACAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCTCAGACCCCATCAAAGGTCCCAGAGCCTCAGTCCTGAACAAAACAC  600

seq1  ACACAGCTAAGTTCACACACATAGACACAATTAGAATGCCAAATAAATCG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACAGCTAAGTTCACACACATAGACACAATTAGAATGCCAAATAAATCG  650

seq1  AGAGAGGTGCCATCGCTCAGAATATGATGAACAATATCAGAGTAAAGGTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAGGTGCCATCGCTCAGAATATGATGAACAATATCAGAGTAAAGGTG  700

seq1  TGATAGCCTGCAGGCATTGCATTCACACACTGAGAGGCAACAAGTGTGAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATAGCCTGCAGGCATTGCATTCACACACTGAGAGGCAACAAGTGTGAG  750

seq1  CAGGTCCTTCCAGCTG-TTGACAGCAACAATCAGATTGCAAGCACCCCAA  799
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGTCCTTCCAGCTGTTTGACAGCAACAATCAGATTGCAAGCACCCCAA  800

seq1  GGTCAAGTACAAAAGAAGATGATAATAAACACACAGCACCTTGTTTATCC  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCAAGTACAAAAGAAGATGATAATAAACACACAGCACCTTGTTTATCC  850

seq1  AACAATTAAACACCTGTCAGGGCAACTTAATTGAATGATGGGAGATGACA  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAATTAAACACCTGTCAGGGCAACTTAATTGAATGATGGGAGATGACA  900

seq1  CACTCCATTCATGGAAGGAAATTGGGTTAACAGATGGCACAATACAGGCA  949
      |||| ||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||| 
seq2  CACTTCATTCATGGGAAGGAATTGGGGTAACAGATGGCACAATACAGGC-  949

seq1  ACAGGGTACTGGGCATAATTCCTACCTGTAGTTCAAA-TCCTCATACATG  998
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  ACAGGGTACTGGGCAT-ATTCCTACCTGTAGTTCAAATTCCTCATACATG  998

seq1  TAAAGGTTCAGGATTCCACACATTTCCTCCATGTCATTGCTGATCTTCCT  1048
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  TAAAGGTTCAGGATTCCACACATTTCCTCCATGTCA-TGCTGATCTTCCT  1047

seq1  CATATCCAATTTCAATTCTCTAACTTTATTTAT  1081
      ||  ||||||||||||||||||   ||||||||
seq2  CAATTCCAATTTCAATTCTCTA--CTTATTTAT  1078