MoG+ -Mouse Genome database with high added value-

BAC Information

BAC name
Region	Chromosome -
Gene	search by nearby gene name.
Format	rows / page	Page	1

BAC

Clone Name	B6Ng01-070P09
Chromosome	14 (Build37)
Map Location	16,658,827 - 16,659,531
singlet/doublet	singlet
Overlap gene	none
Upstream gene	Nek10, Lrrc3b
Downstream gene	LOC667205, 1700062C10Rik, LOC667209, EG435389, Oxsm, Ngly1, Top2b, Rarb
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BAC End Information

BAC end	BAC-end 1	BAC-end 2
end name	B6Ng01-070P09.b	B6Ng01-070P09.g
ACC	DH888798	DH888799
length	992	1,211
definition	DH888798\|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-070P09, 5' end.	DH888799\|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-070P09, 3' end.
singlet/doublet	singlet	---
BLAST hit	unique	no hit data
sequence	gaattcctaattacaaatgtgatttgtaagaaatcttagaataattcaca gccatggttctgaacctgcatagtaactatactaatggaccagtgaacat gcagcaatctcaggaaacactgatattctctgtcatactgagggctgaca tgaagttgatgaagtcctacacaacacgggcccataccaaaagcatcatt taaaacatgaaacctagccttccggtccacaccagcaccggggttcctta cacggagtcttcggacacctgcaaggtccctcacaggaccctccacggga tcttaagacctctggtgagtgggacacaacttctgccaggaggcaggttc gaacaccagatatctgggtaccttccctgcaagaggagagcttgcctgca gagagtactctgaccactgaaactaaggagagagctagtctccagggtct gctgatagaggctaacataatcacctgaggaacaagctctaaccagagac aactataacaactagctccagagattacagatggtgaaaggcaaatgtaa gaatcctactaacagaaatcaagaccactcaccatcatcagaacgcagca ctcccaccccacctagtcctgggaagtccaacacacccgaaaagctagac cctgatttaaaaacatatctcatgatgatggtagaggacatcaagtagga cttcgataacttacttaaagaaatatataagaatacacttaacaagtaga agaccttaaagaggaaacacaaaaatcccttaaagtattgcagaaaaaca tgaccaaacaggtgatggaattgaataaaaccatccaagacctaaaaagg gaagtagacacaataaagaaaacccgaagtgaggcaacgctggagataga aaccctaggaaagaaatctggaaccatagatgcgagcaccagcaacagaa tacaagagatggaagagagaatctcagtgcagaagattccat	gaattccaaatggctgagaagcacttaaagaaatgttcaacatccatagt catcagggaaatgcaaatcaaaacgaccctgagattccacctcacaccag tcagaaaggctaagatcaaaaacacatgtgacagcagatgttggtaagga tgtggagaaagagtaatactcctcctttgctgatgggactacaagatgat aaaaccactttggaaatcagtctggtggtttctgagaaaatttgaaatag ttctacctagctgcaccactcctgggcacatacccaaaagatgttccaat atatgcatcactatgttcatttataattatttataatagccagaagttgt aaacaactcagatgtccctcaacagaatgtatacagaaaatgtggtacag atacacagtggtgtactacacaatggagattgaaaacaatgacttcatga aactcacaggcaaatggatggaactagaaaataaatacactgagtggagt aacaaaagaacacacatggtgtgtattcactaatgctccacttcctgaaa gttccacaaccttcccagtcagcactgtcaccttggtgctgagtgttgaa acatgtgagcccatggtttcacattgaaccaccaaaggaaatacttgttt gaggaggcagctatgaacctaagtggtcaccaaaaggtgacttacttgtg tgagtgtgaccccaggctgtagagaagagctgaggagagggttgggtgaa gatatcaaatcctctcttaccacaaactccagcttaccaatagcacatgg gcttgtaagagttgacacagtgatgtgattctcatataattcagagaact tgtcagagttattcatacctgttaagaaagagatcagtgcatggtctggt gggagtgtcaattctgatcagattctcaagtcttctgggtgtcactgttt ccagatctagatttttctgaatcttttattctgtcagaaagccagatatc atatgaattcaattgagcatgcattaatcagggtccctggcaccactcag caatcagatggcattcatgtaggaaaatctttttctttttttttaagtgt aaacaactcggttactgttaaaacacacacacacactaaacaaacttgaa aatcgacttaaatcagagagcagtaatccatgtaaatccataggagagtc ggcctctacgt
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Alignment Information

BAC End 1	BAC End 2
seq1: chr14_16658827_16659531 seq2: B6Ng01-070P09.b_45_749 seq1 GAATTCCTAATTACAAATGTGATTTGTAAGAAATCTTAGAATAATTCACA 50 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GAATTCCTAATTACAAATGTGATTTGTAAGAAATCTTAGAATAATTCACA 50 seq1 GCCATGGTTCTGAACCTGCATAGTAACTATACTAATGGACCAGTGAACAT 100 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GCCATGGTTCTGAACCTGCATAGTAACTATACTAATGGACCAGTGAACAT 100 seq1 GCAGCAATCTCAGGAAACACTGATATTCTCTGTCATACTGAGGGCTGACA 150 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GCAGCAATCTCAGGAAACACTGATATTCTCTGTCATACTGAGGGCTGACA 150 seq1 TGAAGTTGATGAAGTCCTACACAACACGGGCCCATACCAAAAGCATCATT 200 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TGAAGTTGATGAAGTCCTACACAACACGGGCCCATACCAAAAGCATCATT 200 seq1 TAAAACATGAAACCTAGCCTTCCGGTCCACACCAGCACCGGGGTTCCTTA 250 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TAAAACATGAAACCTAGCCTTCCGGTCCACACCAGCACCGGGGTTCCTTA 250 seq1 CACGGAGTCTTCGGACACCTGCAAGGTCCCTCACAGGACCCTCCACGGGA 300 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CACGGAGTCTTCGGACACCTGCAAGGTCCCTCACAGGACCCTCCACGGGA 300 seq1 TCTTAAGACCTCTGGTGAGTGGGACACAACTTCTGCCAGGAGGCAGGTTC 350 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TCTTAAGACCTCTGGTGAGTGGGACACAACTTCTGCCAGGAGGCAGGTTC 350 seq1 GAACACCAGATATCTGGGTACCTTCCCTGCAAGAGGAGAGCTTGCCTGCA 400 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GAACACCAGATATCTGGGTACCTTCCCTGCAAGAGGAGAGCTTGCCTGCA 400 seq1 GAGAGTACTCTGACCACTGAAACTAAGGAGAGAGCTAGTCTCCAGGGTCT 450 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GAGAGTACTCTGACCACTGAAACTAAGGAGAGAGCTAGTCTCCAGGGTCT 450 seq1 GCTGATAGAGGCTAACATAATCACCTGAGGAACAAGCTCTAACCAGAGAC 500 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GCTGATAGAGGCTAACATAATCACCTGAGGAACAAGCTCTAACCAGAGAC 500 seq1 AACTATAACAACTAGCTCCAGAGATTACAGATGGTGAAAGGCAAATGTAA 550 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 AACTATAACAACTAGCTCCAGAGATTACAGATGGTGAAAGGCAAATGTAA 550 seq1 GAATCCTACTAACAGAAATCAAGACCACTCACCATCATCAGAACGCAGCA 600 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GAATCCTACTAACAGAAATCAAGACCACTCACCATCATCAGAACGCAGCA 600 seq1 CTCCCACCCCACCTAGTCCTGGGAAGTCCAACACACCCGAAAAGCTAGAC 650 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CTCCCACCCCACCTAGTCCTGGGAAGTCCAACACACCCGAAAAGCTAGAC 650 seq1 CCTGATTTAAAAACATATCTCATGATGATGGTAGAGGACATCAAGTAGGA 700 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CCTGATTTAAAAACATATCTCATGATGATGGTAGAGGACATCAAGTAGGA 700 seq1 CTTCG 705 \|\|\|\|\| seq2 CTTCG 705

BAC End 1

BAC End 2

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACGGAGTCTTCGGACACCTGCAAGGTCCCTCACAGGACCCTCCACGGGA  300

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  CTTCG  705
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