BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-073G18
Chromosome14 (Build37)
Map Location 14,061,308 - 14,276,287
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEG328354, Synpr
Upstream genePtprg, 3830406C13Rik, EG667072, Fezf2, Cadps, EG432822, LOC100042022, LOC100042026
Downstream geneA430083B19Rik, EG382844, LOC100042045, Gm281, Thoc7, Atxn7, Psmd6, Olfr720, LOC667125, LOC100042543, Olfr31, Il3ra, LOC627139, Olfr721-ps1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-073G18.bB6Ng01-073G18.g
ACCDH890560DH890561
length976599
definitionDH890560|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-073G18, 5' end.DH890561|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-073G18, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(14,275,303 - 14,276,287)(14,061,308 - 14,061,906)
sequence
gaattccaggccaaggaaatgcacactctgaaaaactaaagccaaaacca
caagattaatgatgcctgatggtcagcacccaatgttgtcctctgacctc
taacatatacatatatatgtaagtaccacacatacatgcacatacaaatg
catacatgtgcacacatgcatacacatacatccatgcacatatatgcata
cacatacacccatgcatgcacgcacacacatatacatacacatgcataca
tatacatccatgcacacacacacacacacaccccctagctcacaggccca
ctgaagagggaaggggaaagatattgatgaagtgattatgtgtatgacat
tttatttattttgtcatttattttcctagcacacagcaagacaaaaaata
atgccattatccagaaaaataatgagaggttaagcaaaagtctagctcat
gagtgattgaattaaattttgaatttgggtgtcttgaacagcaaaacgca
cttccgttccaaaagcttatgtggcactccattcgcatgtatgggatatg
tacatgcttgcgcacatatatatctttctgaggaattctgctaaatcctc
ccagaaacatagttaggtagtatcagccatcttctacaaaaagcagtaga
gctggcaagttggatcagaagatagagagcacctgttgtttcttcctgag
gaatagggttctattccttgcacctacatggtgctcaaaatcatctataa
ctccaagcttaaggatctaatggtctcttttggcctttgtaggcaccaag
catgcacatggtgcatgaacctatatataggggaagcactcatcaaatta
aaattaattaaaatttaaatttagaaggatagcaggctctttctgccttg
tctctgtggctgcaaagtggatgatctacactcaattacaatatcatctc
aaattaataatatactcatctatccc
gaattccatgtataatgttgggtcatatgtcaggaccctgccatttctta
gaagacttaaagcaatatgtaattctggggaaaatagccttgaacagtga
taggatggcttggatgaaagagatcacctcatgatacagtgacctgcaaa
gtcatagatgattcacacacagctcagctaagctcagataggagccaata
aataacaaagcccaacagtagactaacaacacaaacacttagaaatactc
atccagaagaaatgaagaactaggcttacatcttaaatgtgattaaagca
ggattttcaatgttaagaataattttcatcaaagatgcctcttaccttga
aaaagtggcaaataaacccctggctcaaagcagactagtgacttcttctt
atgttgagctgaagctttgtgagctagaggaacactgtgttgtgcttctg
tagtctgccagggcagagtgagctagactcagtccaacctcatatcttgg
tggtttaacagatagacatttagcttgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
gttttctggaaatatgcacctgcacacactggggccagaagtgcccttt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_14275303_14276287
seq2: B6Ng01-073G18.b_42_1017 (reverse)

seq1  GGGATAGATGAGTATAATTATTAAATATTGAGATGAATATTGTAATTGAG  50
      ||||||||||||||| ||||||||   |||||||| ||||||||||||| 
seq2  GGGATAGATGAGTAT-ATTATTAA--TTTGAGATG-ATATTGTAATTGA-  45

seq1  GTGTAGATCATCCACTTTGCAGCCACAGAAGACAAGGCAGAAAGAGGCCT  100
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||
seq2  GTGTAGATCATCCACTTTGCAGCCACAG-AGACAAGGCAGAAAGA-GCCT  93

seq1  GCTATCCTTCTAAATTTTAAATTTTAATTTAATTTAATTTGATGAGTGCT  150
      |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||
seq2  GCTATCCTTCTAAA-TTTAAATTTTAATTAATTTTAATTTGATGAGTGCT  142

seq1  TCCCCTATATATAGGTTCATGCACCATGTGCATGCTTGGTGCCTACAAAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCCTATATATAGGTTCATGCACCATGTGCATGCTTGGTGCCTACAAAG  192

seq1  GCCAAAAGAGACCATTAGATCCCTTAAGCTTGGAGTTATAGATGATTTTG  250
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAAAAGAGACCATTAGAT-CCTTAAGCTTGGAGTTATAGATGATTTTG  241

seq1  AGCAACCATGTAGGTGCTAGGAATAGAACCCTATTCCTCAGGAAG-AACA  299
      ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  AGC-ACCATGTAGGTGCAAGGAATAGAACCCTATTCCTCAGGAAGAAACA  290

seq1  ACAGGTGCTCTCTATCTTCTGATCCAACTTGCCAGCTCTACTGCTTTTTG  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGGTGCTCTCTATCTTCTGATCCAACTTGCCAGCTCTACTGCTTTTTG  340

seq1  TAGAAGATGGCTGATACTACCTAACTATGTTTCTGGGAGGATTTAGCAGA  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAAGATGGCTGATACTACCTAACTATGTTTCTGGGAGGATTTAGCAGA  390

seq1  ATTCCTCAGAAAGATATATATGTGCGCAAGCATGTACATATCCCATACAT  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCCTCAGAAAGATATATATGTGCGCAAGCATGTACATATCCCATACAT  440

seq1  GCGAATGGAGTGCCACATAAGCTTTTGGAACGGAAGTGCGTTTTGCTGTT  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCGAATGGAGTGCCACATAAGCTTTTGGAACGGAAGTGCGTTTTGCTGTT  490

seq1  CAAGACACCCAAATTCAAAATTTAATTCAATCACTCATGAGCTAGACTTT  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGACACCCAAATTCAAAATTTAATTCAATCACTCATGAGCTAGACTTT  540

seq1  TGCTTAACCTCTCATTATTTTTCTGGATAATGGCATTATTTTTTGTCTTG  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTAACCTCTCATTATTTTTCTGGATAATGGCATTATTTTTTGTCTTG  590

seq1  CTGTGTGCTAGGAAAATAAATGACAAAATAAATAAAATGTCATACACATA  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGTGCTAGGAAAATAAATGACAAAATAAATAAAATGTCATACACATA  640

seq1  ATCACTTCATCAATATCTTTCCCCTTCCCTCTTCAGTGGGCCTGTGAGCT  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCACTTCATCAATATCTTTCCCCTTCCCTCTTCAGTGGGCCTGTGAGCT  690

seq1  AGGGGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCATGGATGTATATGTATGCATGTGTA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCATGGATGTATATGTATGCATGTGTA  740

seq1  TGTATATGTGTGTGCGTGCATGCATGGGTGTATGTGTATGCATATATGTG  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATATGTGTGTGCGTGCATGCATGGGTGTATGTGTATGCATATATGTG  790

seq1  CATGGATGTATGTGTATGCATGTGTGCACATGTATGCATTTGTATGTGCA  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGGATGTATGTGTATGCATGTGTGCACATGTATGCATTTGTATGTGCA  840

seq1  TGTATGTGTGGTACTTACATATATATGTATATGTTAGAGGTCAGAGGACA  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATGTGTGGTACTTACATATATATGTATATGTTAGAGGTCAGAGGACA  890

seq1  ACATTGGGTGCTGACCATCAGGCATCATTAATCTTGTGGTTTTGGCTTTA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATTGGGTGCTGACCATCAGGCATCATTAATCTTGTGGTTTTGGCTTTA  940

seq1  GTTTTTCAGAGTGTGCATTTCCTTGGCCTGGAATTC  985
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTTTCAGAGTGTGCATTTCCTTGGCCTGGAATTC  976

seq1: chr14_14061308_14061906
seq2: B6Ng01-073G18.g_69_667

seq1  GAATTCCATGTATAATGTTGGGTCATATGTCAGGACCCTGCCATTTCTTA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCATGTATAATGTTGGGTCATATGTCAGGACCCTGCCATTTCTTA  50

seq1  GAAGACTTAAAGCAATATGTAATTCTGGGGAAAATAGCCTTGAACAGTGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGACTTAAAGCAATATGTAATTCTGGGGAAAATAGCCTTGAACAGTGA  100

seq1  TAGGATGGCTTGGATGAAAGAGATCACCTCATGATACAGTGACCTGCAAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGATGGCTTGGATGAAAGAGATCACCTCATGATACAGTGACCTGCAAA  150

seq1  GTCATAGATGATTCACACACAGCTCAGCTAAGCTCAGATAGGAGCCAATA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCATAGATGATTCACACACAGCTCAGCTAAGCTCAGATAGGAGCCAATA  200

seq1  AATAACAAAGCCCAACAGTAGACTAACAACACAAACACTTAGAAATACTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAACAAAGCCCAACAGTAGACTAACAACACAAACACTTAGAAATACTC  250

seq1  ATCCAGAAGAAATGAAGAACTAGGCTTACATCTTAAATGTGATTAAAGCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCAGAAGAAATGAAGAACTAGGCTTACATCTTAAATGTGATTAAAGCA  300

seq1  GGATTTTCAATGTTAAGAATAATTTTCATCAAAGATGCCTCTTACCTTGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATTTTCAATGTTAAGAATAATTTTCATCAAAGATGCCTCTTACCTTGA  350

seq1  AAAAGTGGCAAATAAACCCCTGGCTCAAAGCAGACTAGTGACTTCTTCTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGTGGCAAATAAACCCCTGGCTCAAAGCAGACTAGTGACTTCTTCTT  400

seq1  ATGTTGAGCTGAAGCTTTGTGAGCTAGAGGAACACTGTGTTGTGCTTCTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTTGAGCTGAAGCTTTGTGAGCTAGAGGAACACTGTGTTGTGCTTCTG  450

seq1  TAGTCTGCCAGGGCAGAGTGAGCTAGACTCAGTCCAACCTCATATCTTGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTCTGCCAGGGCAGAGTGAGCTAGACTCAGTCCAACCTCATATCTTGG  500

seq1  TGGTTTAACAGATAGACATTTAGCTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTTTAACAGATAGACATTTAGCTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT  550

seq1  GTTTTCTGTTTATATGCACATATACACACTGGGGCCATAGGTGCCCTTT  599
      ||||||||   |||||||| |  |||||||||||||| | |||||||||
seq2  GTTTTCTGGAAATATGCACCTGCACACACTGGGGCCAGAAGTGCCCTTT  599