BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-074H11
Chromosome14 (Build37)
Map Location 118,987,272 - 119,155,441
singlet/doubletdoublet
Overlap geneAbcc4
Upstream geneGpc6, 5730405N03Rik, LOC100043822, Dct, Tgds, Gpr180, LOC100043824, LOC100043539, Sox21, LOC100043825, EG668814, LOC435422
Downstream geneCldn10, Dzip1, Dnajc3a, LOC100043828, Ugcgl2, Hs6st3, LOC619601, EG621324
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-074H11.bB6Ng01-074H11.g
ACCDH891309DH891310
length887918
definitionDH891309|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-074H11, 5' end.DH891310|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-074H11, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(118,987,272 - 118,988,158)(119,154,524 - 119,155,441)
sequence
gaattctagtccttactgacttccacacaataccccatactatgctttat
tccagccagactacccctagcttcaatatttattcatgatgaacttggta
cagaactccaacccattttctctggaaatgttgcacaaaagcggaactta
cattatgaacattcctcaatataatttttgctcgaagcacttctggctct
agaactagcattggggagaaatctttcaaaatacaacactgtaggacctt
gcaccttcaatcccagaaggcaatggccaaggaatgcacacatgccgagc
tctaaatgagctggaaactcaaacagcacagatcccaaatcactggatgg
ctcacagtagatgacacacttaacatcgtaggcatagaactatccgcctt
cacagaagacattcacaaggctagcattaactcacatactaaatactata
aagaataactatcattctaacaagaactatgataaactggatagaagacc
aaaaaaatatatatatactttatgtgagataaaatgtcacaggctcaatg
atgccaatattgagatttttcccccgagttttgttcattgcaaaatgagt
aacatttatgatagagtggacaaggatgaaatataaatatgcatgtaata
tttaatatatgccttagtggaaaataatttgaaataattaagcaaaatgt
catccttttaactttctgtaatacaacatgatcatcattttgaacaagtt
agcagctccccaaatcttatgttctaaatgttctatttgacaactgtgaa
cacaaagctagctcgttctctctctctctctgtctctgtctctgtctctc
tctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
gaattcctcagtctcccagacctcttccccatccacccacaacccagtgt
ttctatcccccatctgctttccttcagatgcatccaggagctgagaggca
gtcgttcttagagaaactaccactcatatccaagggcacagccagagttg
aacagctacacccacaagtgcaggggaaagcaggggaaaggcagaaatga
tgaggatacaaaataacaggttcgatgctcctctctgctttcaaactgag
tgacagctgggcttagaacatgaatcaaagtcagacattgttgcatagac
actggaaccaggaaccccacagcgtcacaggtaggactagggacaaacaa
ggtagacaactctggtcaaaggcttatactcagggatctttaaagcaccc
ttttaccccccacagagctctcttccccatgtaaaactttaggataggga
gggtctgttgtgtaaactgaactgtggactccaaagctgaaaaacagcaa
tgaaccccattttgcccttcagcctgctctgttgcagctcattgcagaag
ctgaattctaaacagtgatgtcttgcaatctgttgtctgcaggtttattt
tattgtggcagcttgaatccagggcctccagaatgtgaaggacatgctca
gacatgtaaacgttctattttattaagtatatattatgtatattatgtat
atatttaataaatacatttatatatttatttttatattttaaatattgca
cataaatactttattataagtctatacttatataaattttaatgtttata
ttatatgtaaataataatatatgaattatataaatatagaacatatatta
ataataatgttatgttatattgatatgatgtaaatatataatatatgttg
tataatgtataaattata
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_118987272_118988158
seq2: B6Ng01-074H11.b_43_929

seq1  GAATTCTAGTCCTTACTGACTTCCACACAATACCCCATACTATGCTTTAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTAGTCCTTACTGACTTCCACACAATACCCCATACTATGCTTTAT  50

seq1  TCCAGCCAGACTACCCCTAGCTTCAATATTTATTCATGATGAACTTGGTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGCCAGACTACCCCTAGCTTCAATATTTATTCATGATGAACTTGGTA  100

seq1  CAGAACTCCAACCCATTTTCTCTGGAAATGTTGCACAAAAGCGGAACTTA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAACTCCAACCCATTTTCTCTGGAAATGTTGCACAAAAGCGGAACTTA  150

seq1  CATTATGAACATTCCTCAATATAATTTTTGCTCGAAGCACTTCTGGCTCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTATGAACATTCCTCAATATAATTTTTGCTCGAAGCACTTCTGGCTCT  200

seq1  AGAACTAGCATTGGGGAGAAATCTTTCAAAATACAACACTGTAGGACCTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAACTAGCATTGGGGAGAAATCTTTCAAAATACAACACTGTAGGACCTT  250

seq1  GCACCTTCAATCCCAGAAGGCAATGGCCAAGGAATGCACACATGCCGAGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACCTTCAATCCCAGAAGGCAATGGCCAAGGAATGCACACATGCCGAGC  300

seq1  TCTAAATGAGCTGGAAACTCAAACAGCACAGATCCCAAATCACTGGATGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAAATGAGCTGGAAACTCAAACAGCACAGATCCCAAATCACTGGATGG  350

seq1  CTCACAGTAGATGACACACTTAACATCGTAGGCATAGAACTATCCGCCTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCACAGTAGATGACACACTTAACATCGTAGGCATAGAACTATCCGCCTT  400

seq1  CACAGAAGACATTCACAAGGCTAGCATTAACTCACATACTAAATACTATA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGAAGACATTCACAAGGCTAGCATTAACTCACATACTAAATACTATA  450

seq1  AAGAATAACTATCATTCTAACAAGAACTATGATAAACTGGATAGAAGACC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAATAACTATCATTCTAACAAGAACTATGATAAACTGGATAGAAGACC  500

seq1  AAAAAAATATATATATACTTTATGTGAGATAAAATGTCACAGGCTCAATG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAAATATATATATACTTTATGTGAGATAAAATGTCACAGGCTCAATG  550

seq1  ATGCCAATATTGAGATTTTTCCCCCGAGTTTTGTTCATTGCAAAATGAGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCCAATATTGAGATTTTTCCCCCGAGTTTTGTTCATTGCAAAATGAGT  600

seq1  AACATTTATGATAGAGTGGACAAGGATGAAATATAAATATGCATGTAATA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACATTTATGATAGAGTGGACAAGGATGAAATATAAATATGCATGTAATA  650

seq1  TTTAATATATGCCTTAGTGGAAAATAATTTGAAATAATTAAGCAAAATGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAATATATGCCTTAGTGGAAAATAATTTGAAATAATTAAGCAAAATGT  700

seq1  CATCCTTTTAACTTTCTGTAATACAACATGATCATCATTTTGAACAAGTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCCTTTTAACTTTCTGTAATACAACATGATCATCATTTTGAACAAGTT  750

seq1  AGCAGCTCCCCAAATCTTATGTTCTAAATGTTCTATTTGACAACTGTGAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGCTCCCCAAATCTTATGTTCTAAATGTTCTATTTGACAACTGTGAA  800

seq1  CACAAAGCTAGCTCGTTCTCTCTCTCTCTCTGTCTCTGTCTCTGTCTCTC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAAAGCTAGCTCGTTCTCTCTCTCTCTCTGTCTCTGTCTCTGTCTCTC  850

seq1  TCTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT  887
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT  887

seq1: chr14_119154524_119155441
seq2: B6Ng01-074H11.g_65_982 (reverse)

seq1  TATAATTTATACATTATACAACATATATTATATATTTACATCATATCAAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAATTTATACATTATACAACATATATTATATATTTACATCATATCAAT  50

seq1  ATAACATAACATTATTATTAATATATGTTCTATATTTATATAATTCATAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAACATAACATTATTATTAATATATGTTCTATATTTATATAATTCATAT  100

seq1  ATTATTATTTACATATAATATAAACATTAAAATTTATATAAGTATAGACT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTATTATTTACATATAATATAAACATTAAAATTTATATAAGTATAGACT  150

seq1  TATAATAAAGTATTTATGTGCAATATTTAAAATATAAAAATAAATATATA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAATAAAGTATTTATGTGCAATATTTAAAATATAAAAATAAATATATA  200

seq1  AATGTATTTATTAAATATATACATAATATACATAATATATACTTAATAAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGTATTTATTAAATATATACATAATATACATAATATATACTTAATAAA  250

seq1  ATAGAACGTTTACATGTCTGAGCATGTCCTTCACATTCTGGAGGCCCTGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGAACGTTTACATGTCTGAGCATGTCCTTCACATTCTGGAGGCCCTGG  300

seq1  ATTCAAGCTGCCACAATAAAATAAACCTGCAGACAACAGATTGCAAGACA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCAAGCTGCCACAATAAAATAAACCTGCAGACAACAGATTGCAAGACA  350

seq1  TCACTGTTTAGAATTCAGCTTCTGCAATGAGCTGCAACAGAGCAGGCTGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACTGTTTAGAATTCAGCTTCTGCAATGAGCTGCAACAGAGCAGGCTGA  400

seq1  AGGGCAAAATGGGGTTCATTGCTGTTTTTCAGCTTTGGAGTCCACAGTTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGCAAAATGGGGTTCATTGCTGTTTTTCAGCTTTGGAGTCCACAGTTC  450

seq1  AGTTTACACAACAGACCCTCCCTATCCTAAAGTTTTACATGGGGAAGAGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTTACACAACAGACCCTCCCTATCCTAAAGTTTTACATGGGGAAGAGA  500

seq1  GCTCTGTGGGGGGTAAAAGGGTGCTTTAAAGATCCCTGAGTATAAGCCTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCTGTGGGGGGTAAAAGGGTGCTTTAAAGATCCCTGAGTATAAGCCTT  550

seq1  TGACCAGAGTTGTCTACCTTGTTTGTCCCTAGTCCTACCTGTGACGCTGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACCAGAGTTGTCTACCTTGTTTGTCCCTAGTCCTACCTGTGACGCTGT  600

seq1  GGGGTTCCTGGTTCCAGTGTCTATGCAACAATGTCTGACTTTGATTCATG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGTTCCTGGTTCCAGTGTCTATGCAACAATGTCTGACTTTGATTCATG  650

seq1  TTCTAAGCCCAGCTGTCACTCAGTTTGAAAGCAGAGAGGAGCATCGAACC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTAAGCCCAGCTGTCACTCAGTTTGAAAGCAGAGAGGAGCATCGAACC  700

seq1  TGTTATTTTGTATCCTCATCATTTCTGCCTTTCCCCTGCTTTCCCCTGCA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTATTTTGTATCCTCATCATTTCTGCCTTTCCCCTGCTTTCCCCTGCA  750

seq1  CTTGTGGGTGTAGCTGTTCAACTCTGGCTGTGCCCTTGGATATGAGTGGT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGTGGGTGTAGCTGTTCAACTCTGGCTGTGCCCTTGGATATGAGTGGT  800

seq1  AGTTTCTCTAAGAACGACTGCCTCTCAGCTCCTGGATGCATCTGAAGGAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTTCTCTAAGAACGACTGCCTCTCAGCTCCTGGATGCATCTGAAGGAA  850

seq1  AGCAGATGGGGGATAGAAACACTGGGTTGTGGGTGGATGGGGAAGAGGTC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGATGGGGGATAGAAACACTGGGTTGTGGGTGGATGGGGAAGAGGTC  900

seq1  TGGGAGACTGAGGAATTC  918
      ||||||||||||||||||
seq2  TGGGAGACTGAGGAATTC  918