BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-075A08
Chromosome14 (Build37)
Map Location 100,364,638 - 100,469,091
singlet/doubletdoublet
Overlap geneKlf12
Upstream geneLOC100043787, 2410129H14Rik, 6720463M24Rik, Dis3, D14Ertd581e, LOC100043395, LOC100043397, Klf5, LOC100043400, LOC100043789, LOC668671, LOC668672, EG546623
Downstream geneLOC100043413, EG668683, EG668684
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-075A08.bB6Ng01-075A08.g
ACCDH891701DH891702
length1,1541,028
definitionDH891701|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-075A08, 5' end.DH891702|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-075A08, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(100,364,638 - 100,365,793)(100,468,061 - 100,469,091)
sequence
gaattcagcaaacatgaggtttggaaccttgctaagttctctatctctga
ccctgtgcaagttgcctaaccctgcacaacttcaggttcctcctcacagc
agtggggcactaggatcccaattatcctatgagatttctgggataacagg
caaggtagaatatgtacaccgggcatggaagtcctgtacaccatctttat
cacttagctactgtaacagaactaccaaatgtccatgtaataactgcttg
gtcccagcatggaactatggagcagcagtgggattttaagaaatgcaacc
cagcgaaatagatcaatgggagcatgcccagagccagaaggtaaaaggtt
tttctccaacacatgctccactataatgtgttactacatccccccaaaac
agatgccagccgctcagaccttgtaatatgggtcaagagaacactcttta
caagctgattagcttgggaatttgcaaaaattatgaaaagccaatataag
cgcttcctttcaagtcttatcacaaacaattcagcaatcgactggatctt
agagatacacattttacatgtctttgtttcttttacaggtaatctttaat
ttactttaaactaataattcaaagtttccattatatacaatcattttaat
tataatactaaagcaaatagttattgcttttatagtttagggttaaaaac
cctacattataataagagttataacttattatcaatgaaattaaggcatt
tttataaaaataagtgatattgtgaatttcaatgcaatctgtaaattttt
tttcttggaataatagtttgtccaccacatcagctgtctgtcattctata
tacatttgtcagagagatgggtttgttgtctttttactaggagatttgta
ggaattctcctaggtcaaattgtaagagatgtgtctttcagctatatata
aatgacacctccagtttctatttagtagacaggtttatatgccttattga
actaggaactaacatatctttaaacgtattcaaggtatttaattgggggt
tgcttatagctttggtgggtgagtacatcaagaggaaacttagtggcagt
tcagcaaggcatgcagcgaacctagaacaggtgcttagagcttacatctg
atcc
gaattctgtactggcaacaccctccctgttcttccacttgtgaggaggaa
gctagccttgtggtatatgctatacagaggtgaccctgaatgggtcacta
tcacccccctgtggggctcaaggagcactgtggaagggcacagacagact
gttagagccagaggatggggaaaggaggaagagggggcttttttccttat
atggtatggtcatcatgctttcaacaccagcatgcatggctaggggaagc
tgtccctggggtctttccctgcctggaggactgtgggaggtaacagttgt
tggcagaaagggtgtcattttctcagtggggtagcccctgatatggtgcc
ctctctgcacaaaataacttctcactgaaacaagagattcttgattgagg
gccatacacaaagacatgcaagtaggagagggtcttgctgaggagccttg
cagcaagagagggaggaaatagggaaggagaacaagttttataatcaact
aaaaccccttacataaatgtatgaaacggtaagaaataaagaacgcatga
agtcgctttttggccttttccacttgccagcctggcttccatgcctgttt
tggtactccagatcttaccagcttcattaattttttttttaatgcagtac
ttagcacctatattttagcatggaagtacatagcatattattgtgttttt
ctttatctgaaaaaaatctatacaagacaatagctggcacatagtaaatg
ctcgctcgataccactgattgaatgtcttctaaaaccatgaagctggggg
aaaagaataaagggatcagatgacatgcagttattcagtcaactacagct
aatgagaagatccacacactatacataattaaattagatcccatggattt
tgttatcttgtcattagagagagactcagatgtgctcttttgtctgaccc
gtgctaattggagaagcacagagaggtgtgggtcaccgtgggtagaaaac
tgaagatcttcgggggaagggggggagg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_100364638_100365793
seq2: B6Ng01-075A08.b_47_1200

seq1  GAATTCAGCAAACATGAGGTTTGGAACCTTGCTAAGTTCTCTATCTCTGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGCAAACATGAGGTTTGGAACCTTGCTAAGTTCTCTATCTCTGA  50

seq1  CCCTGTGCAAGTTGCCTAACCCTGCACAACTTCAGGTTCCTCCTCACAGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTGTGCAAGTTGCCTAACCCTGCACAACTTCAGGTTCCTCCTCACAGC  100

seq1  AGTGGGGCACTAGGATCCCAATTATCCTATGAGATTTCTGGGATAACAGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGGGGCACTAGGATCCCAATTATCCTATGAGATTTCTGGGATAACAGG  150

seq1  CAAGGTAGAATATGTACACCGGGCATGGAAGTCCTGTACACCATCTTTAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGGTAGAATATGTACACCGGGCATGGAAGTCCTGTACACCATCTTTAT  200

seq1  CACTTAGCTACTGTAACAGAACTACCAAATGTCCATGTAATAACTGCTTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTAGCTACTGTAACAGAACTACCAAATGTCCATGTAATAACTGCTTG  250

seq1  GTCCCAGCATGGAACTATGGAGCAGCAGTGGGATTTTAAGAAATGCAACC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCCAGCATGGAACTATGGAGCAGCAGTGGGATTTTAAGAAATGCAACC  300

seq1  CAGCGAAATAGATCAATGGGAGCATGCCCAGAGCCAGAAGGTAAAAGGTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCGAAATAGATCAATGGGAGCATGCCCAGAGCCAGAAGGTAAAAGGTT  350

seq1  TTTCTCCAACACATGCTCCACTATAATGTGTTACTACATCCCCCCAAAAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTCCAACACATGCTCCACTATAATGTGTTACTACATCCCCCCAAAAC  400

seq1  AGATGCCAGCCGCTCAGACCTTGTAATATGGGTCAAGAGAACACTCTTTA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATGCCAGCCGCTCAGACCTTGTAATATGGGTCAAGAGAACACTCTTTA  450

seq1  CAAGCTGATTAGCTTGGGAATTTGCAAAAATTATGAAAAGCCAATATAAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGCTGATTAGCTTGGGAATTTGCAAAAATTATGAAAAGCCAATATAAG  500

seq1  CGCTTCCTTTCAAGTCTTATCACAAACAATTCAGCAATCGACTGGATCTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGCTTCCTTTCAAGTCTTATCACAAACAATTCAGCAATCGACTGGATCTT  550

seq1  AGAGATACACATTTTACATGTCTTTGTTTCTTTTACAGGTAATCTTTAAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGATACACATTTTACATGTCTTTGTTTCTTTTACAGGTAATCTTTAAT  600

seq1  TTACTTTAAACTAATAATTCAAAGTTTCCATTATATACAATCATTTTAAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACTTTAAACTAATAATTCAAAGTTTCCATTATATACAATCATTTTAAT  650

seq1  TATAATACTAAAGCAAATAGTTATTGCTTTTATAGTTTAGGGTTAAAAAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAATACTAAAGCAAATAGTTATTGCTTTTATAGTTTAGGGTTAAAAAC  700

seq1  CCTACATTATAATAAGAGTTATAACTTATTATCAATGAAATTAAGGCATT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTACATTATAATAAGAGTTATAACTTATTATCAATGAAATTAAGGCATT  750

seq1  TTTATAAAAATAAGTGATATTGTGAATTTCAATGCAATCTGTAAATTTTT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATAAAAATAAGTGATATTGTGAATTTCAATGCAATCTGTAAATTTTT  800

seq1  TTTCTTGGAATAATAGTTTGTCCACCACATCAGCTGTCTGTCATTCTATA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTTGGAATAATAGTTTGTCCACCACATCAGCTGTCTGTCATTCTATA  850

seq1  TACATTTGTCAGGAGAGATGGGTTTGTTGTCTTTTTACTAGGAGATTTGT  900
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACATTTGTCA-GAGAGATGGGTTTGTTGTCTTTTTACTAGGAGATTTGT  899

seq1  AGGAATTCTCCTAGGTCAAATTGTAAGAGATGTGTCTTTCAGCTATATAT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAATTCTCCTAGGTCAAATTGTAAGAGATGTGTCTTTCAGCTATATAT  949

seq1  AAATGACACCTCCAGTTTCTATTTAGTAGACAGGTTTATATGCCTTATTG  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGACACCTCCAGTTTCTATTTAGTAGACAGGTTTATATGCCTTATTG  999

seq1  AACTAGGAACTAACATATCTTTAAACGTATTCAAGGTATTTAATTGGGGG  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTAGGAACTAACATATCTTTAAACGTATTCAAGGTATTTAATTGGGGG  1049

seq1  TTGCTTATAGCTTTGGT-GGTGAGTACATCAAGGAAGGAAACTTAGTGGC  1099
      ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||
seq2  TTGCTTATAGCTTTGGTGGGTGAGTACATCAAG--AGGAAACTTAGTGGC  1097

seq1  AG-TCAGGCAGGCAGGCAGGCGACACTAGAACAGTGGCTAAGAGCTTACA  1148
      || ||||  ||||| ||| ||||  |||||||||  ||| ||||||||||
seq2  AGTTCAGCAAGGCATGCA-GCGAACCTAGAACAGGTGCTTAGAGCTTACA  1146

seq1  TCTGATCC  1156
      ||||||||
seq2  TCTGATCC  1154

seq1: chr14_100468061_100469091
seq2: B6Ng01-075A08.g_69_1096 (reverse)

seq1  CCTTCCCCCCCTCCCCCGAAGATCTTCAGTTTTCTACCCACGCTGACCCA  50
      ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  CCTCCCCCCCTTCCCCCGAAGATCTTCAGTTTTCTACCCACGGTGACCCA  50

seq1  CACCTCTCTGTGCTTCTCCAATTAGCACGGGGTCAGACAAAGGAGCACAT  100
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||
seq2  CACCTCTCTGTGCTTCTCCAATTAGCAC-GGGTCAGACAAAAGAGCACAT  99

seq1  CTGAGTCTCTTCTCTAATGACAAGATAAACAAAATCCATGGGATCTAATT  150
      ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGTCTC-TCTCTAATGACAAGAT-AACAAAATCCATGGGATCTAATT  147

seq1  TAATTATGTATAGTGTGTGGATCTTCTCATTAGCTGTAGTTGACTGAATA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATTATGTATAGTGTGTGGATCTTCTCATTAGCTGTAGTTGACTGAATA  197

seq1  ACTGCATGTCATCTGATCCCTTTATTCTTTTCCCCCAGCTTCATGGTTTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGCATGTCATCTGATCCCTTTATTCTTTTCCCCCAGCTTCATGGTTTT  247

seq1  AGAAGACATTCAATCAGTGGTATCGAGCGAGCATTTACTATGTGCCAGCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGACATTCAATCAGTGGTATCGAGCGAGCATTTACTATGTGCCAGCT  297

seq1  ATTGTCTTGTATAGATTTTTTTCAGATAAAGAAAAACACAATAATATGCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGTCTTGTATAGATTTTTTTCAGATAAAGAAAAACACAATAATATGCT  347

seq1  ATGTACTTCCATGCTAAAATATAGGTGCTAAGTACTGCATTAAAAAAAAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTACTTCCATGCTAAAATATAGGTGCTAAGTACTGCATTAAAAAAAAA  397

seq1  ATTAATGAAGCTGGTAAGATCTGGAGTACCAAAACAGGCATGGAAGCCAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAATGAAGCTGGTAAGATCTGGAGTACCAAAACAGGCATGGAAGCCAG  447

seq1  GCTGGCAAGTGGAAAAGGCCAAAAAGCGACTTCATGCGTTCTTTATTTCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGGCAAGTGGAAAAGGCCAAAAAGCGACTTCATGCGTTCTTTATTTCT  497

seq1  TACCGTTTCATACATTTATGTAAGGGGTTTTAGTTGATTATAAAACTTGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCGTTTCATACATTTATGTAAGGGGTTTTAGTTGATTATAAAACTTGT  547

seq1  TCTCCTTCCCTATTTCCTCCCTCTCTTGCTGCAAGGCTCCTCAGCAAGAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCCTTCCCTATTTCCTCCCTCTCTTGCTGCAAGGCTCCTCAGCAAGAC  597

seq1  CCTCTCCTACTTGCATGTCTTTGTGTATGGCCCTCAATCAAGAATCTCTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTCCTACTTGCATGTCTTTGTGTATGGCCCTCAATCAAGAATCTCTT  647

seq1  GTTTCAGTGAGAAGTTATTTTGTGCAGAGAGGGCACCATATCAGGGGCTA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTCAGTGAGAAGTTATTTTGTGCAGAGAGGGCACCATATCAGGGGCTA  697

seq1  CCCCACTGAGAAAATGACACCCTTTCTGCCAACAACTGTTACCTCCCACA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCACTGAGAAAATGACACCCTTTCTGCCAACAACTGTTACCTCCCACA  747

seq1  GTCCTCCAGGCAGGGAAAGACCCCAGGGACAGCTTCCCCTAGCCATGCAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCTCCAGGCAGGGAAAGACCCCAGGGACAGCTTCCCCTAGCCATGCAT  797

seq1  GCTGGTGTTGAAAGCATGATGACCATACCATATAAGGAAAAAAGCCCCCT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGGTGTTGAAAGCATGATGACCATACCATATAAGGAAAAAAGCCCCCT  847

seq1  CTTCCTCCTTTCCCCATCCTCTGGCTCTAACAGTCTGTCTGTGCCCTTCC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCTCCTTTCCCCATCCTCTGGCTCTAACAGTCTGTCTGTGCCCTTCC  897

seq1  ACAGTGCTCCTTGAGCCCCACAGGGGGGTGATAGTGACCCATTCAGGGTC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGTGCTCCTTGAGCCCCACAGGGGGGTGATAGTGACCCATTCAGGGTC  947

seq1  ACCTCTGTATAGCATATACCACAAGGCTAGCTTCCTCCTCACAAGTGGAA  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTCTGTATAGCATATACCACAAGGCTAGCTTCCTCCTCACAAGTGGAA  997

seq1  GAACAGGGAGGGTGTTGCCAGTACAGAATTC  1031
      |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACAGGGAGGGTGTTGCCAGTACAGAATTC  1028