BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-076F14
Chromosome14 (Build37)
Map Location 48,948,567 - 49,098,638
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100041831, 6720456H20Rik
Upstream geneLgals3, Dlg7, LOC666895, Fbxo34, D14Ertd436e, EG625730, LOC100042787, Ktn1, 4930447J18Rik, Map1lc3-ps2, Peli2, EG624367
Downstream gene4930572G02Rik, Otx2, LOC100041864, LOC666972, Exoc5, 4932432K03Rik, LOC218997, Nat12, 1700011H14Rik, Slc35f4
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-076F14.bB6Ng01-076F14.g
ACCDH892642DH892643
length1,185790
definitionDH892642|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-076F14, 5' end.DH892643|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-076F14, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(49,097,458 - 49,098,638)(48,948,567 - 48,949,355)
sequence
gaattctgccagtggtctcacagatgttcctgaaatttattttctttctt
ttttttaagatttatgtatgcatttatttattaggtatacaatgttttcc
ctgcatgtatgtctgcacaccggaagagggcaccagatctcaatatagaa
ggttgtgagccaccatggggttgctgggaattgatctcaggacctcttaa
cctctgagccatctctccagtccagaaatttattttcttcaataacatag
agtacaagcctcattagaaagccccaacacagtgtctatattcccataac
tattgtccatttctcctttcttttatcctttactgcggttctatttatct
ccccgccagcactaccacaatgtctggaaagaaaggtctgttggatttct
taagcacggcatgtctaatttattgagcttacattttactgagcactgat
ggattttccatttaaaattaaacagtaacacagatactattcatcaagta
tgttgaggaaatcatggggctggagagaatggctcagtgcgtaagagagg
accacatggtgcttcacgactgactgcaactccggccccaggagattcaa
catcctcttctggtctccataagcagtgcacacatgatgcgcagatatat
gtgcaggtaaaacagccatgtacatacaaagaataattaaacttttaaaa
attgaaaaaaaaaaaaaaggaaatgttgtgtcaaatgtggggacacatgt
acagcctgcacccaggcagtgtagggacacatgtacaggctggcacccag
gcagtgtggggacacatgtacagcctgcacccaggcagtgtggggacaca
tgtacaggctggcacccaggcatgtggggacacatgtacagtctgcaccc
agcagtgtaggacacatgtacaggctggcaccccagcagtgtggggacac
atgtacagcctcacccaggcagtgtgggggacacatgtacaggctggcac
ccaaggcagggtggggaaccattgtgcagcctgcagccaggaaacggagg
catggaggatataaggtgggcataagcctatgctcagagggaagcaagga
atatgcctgttgttcacagtaaacggtaatgtgtaaaagcccacctccca
gggatctatctatatacctagaatggcagggctat
gaattcaattcccagcaaccatatggtggctctcgaccatctgtaatggg
atcctatgccctcttctggtttgtagcagtcaggccaggagtggtgtttt
ctctggggtgatctgtgtgagtctggctggtcatttctatctggtgtaca
cctttgctgtgccttaagtgacacgaaactcccttgctctatacttacct
acctatagggtgtaattgaaagacccacaacgtgaggactcccccacgtt
ctgactcaggagaggcgacaccccaaaatcacccacaagaaacggtcttg
ccacaaactgcaagaggatttttattcaagagcactcttgggcccacagt
catacaccacgcaggggtagaggaccgtggcgccctgagtagctggataa
gggggtatttaaaggaagaaaccgaaactcaaggaggtgggaagggcatt
gttggaaaataccaaaaataccagttaagagtcacaaggaagtgcaaagt
taccagagtcacgaggaatacctggtaattgtgagggttatttctcaaga
cagtttctaagagcccctaacaatagcacctttgcatagcgggttccagc
aatggtcagggtgggtcagggtgactttctttgaatgaacactcctttga
acccaggaagcgggtgggtggaagaatgtcgctatctgttttatgattag
cataccttggagcactgagtttactactctttcataatcagagctggaaa
catctccttctcctccttctccttctccttctcctcctcc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_49097458_49098638
seq2: B6Ng01-076F14.b_48_1232 (reverse)

seq1  ATAGCACTGCCATTCTAGGTA-CTAGATTAGTCCCTGGGAGTGTGGCTTC  49
      ||||| |||||||||||||||  |||||   ||||||||||   ||||| 
seq2  ATAGCCCTGCCATTCTAGGTATATAGATAGATCCCTGGGAGGTGGGCTTT  50

seq1  T-CACATTTACAGTTTACTGTG-ACAACA-GCATACTCC-TGCTTCCCTC  95
      | |||| |||| |||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||
seq2  TACACA-TTACCGTTTACTGTGAACAACAGGCATATTCCTTGCTTCCCTC  99

seq1  TGAGCATAGGCTTATGCCCACCTTATATCCT-CATGCCTCCGTTTCCTGG  144
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  TGAGCATAGGCTTATGCCCACCTTATATCCTCCATGCCTCCGTTTCCTGG  149

seq1  CTGCAGGCTGCAC-ATGTGTCCCCACACTGCC-TGGGTGCCAGCCTGTAC  192
      ||||||||||||| |||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||
seq2  CTGCAGGCTGCACAATGGTTCCCCACCCTGCCTTGGGTGCCAGCCTGTAC  199

seq1  ATGTGT-CCCCACACTGCCTGGGTGCAGGCTGTACATGTGTCCCCACACT  241
      |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGTCCCCCACACTGCCTGGGTG-AGGCTGTACATGTGTCCCCACACT  248

seq1  GCCTGGGTGCCAGCCTGTACATGTGTCCCTACACTGCCTGGGTGCAGACT  291
      ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||
seq2  GCTGGGGTGCCAGCCTGTACATGTGT-CCTACACTG-CTGGGTGCAGACT  296

seq1  GTACATGTGTCCCCACACTGCCTGGGTGCCAGCCTGTACATGTGTCCCCA  341
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACATGTGTCCCCACA-TGCCTGGGTGCCAGCCTGTACATGTGTCCCCA  345

seq1  CACTGCCTGGGTGCAGGCTGTACATGTGTCCCCACACTGCCTGGGTGCCA  391
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGCCTGGGTGCAGGCTGTACATGTGTCCCCACACTGCCTGGGTGCCA  395

seq1  GCCTGTACATGTGTCCCTACACTGCCTGGGTGCAGGCTGTACATGTGTCC  441
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTGTACATGTGTCCCTACACTGCCTGGGTGCAGGCTGTACATGTGTCC  445

seq1  CCACATTTGACACAACATTTCCTTTTTTTTTTTTTTCAATTTTTAAAAGT  491
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACATTTGACACAACATTTCCTTTTTTTTTTTTTTCAATTTTTAAAAGT  495

seq1  TTAATTATTCTTTGTATGTACATGGCTGTTTTACCTGCACATATATCTGC  541
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATTATTCTTTGTATGTACATGGCTGTTTTACCTGCACATATATCTGC  545

seq1  GCATCATGTGTGCACTGCTTATGGAGACCAGAAGAGGATGTTGAATCTCC  591
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATCATGTGTGCACTGCTTATGGAGACCAGAAGAGGATGTTGAATCTCC  595

seq1  TGGGGCCGGAGTTGCAGTCAGTCGTGAAGCACCATGTGGTCCTCTCTTAC  641
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGGCCGGAGTTGCAGTCAGTCGTGAAGCACCATGTGGTCCTCTCTTAC  645

seq1  GCACTGAGCCATTCTCTCCAGCCCCATGATTTCCTCAACATACTTGATGA  691
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACTGAGCCATTCTCTCCAGCCCCATGATTTCCTCAACATACTTGATGA  695

seq1  ATAGTATCTGTGTTACTGTTTAATTTTAAATGGAAAATCCATCAGTGCTC  741
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGTATCTGTGTTACTGTTTAATTTTAAATGGAAAATCCATCAGTGCTC  745

seq1  AGTAAAATGTAAGCTCAATAAATTAGACATGCCGTGCTTAAGAAATCCAA  791
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAAAATGTAAGCTCAATAAATTAGACATGCCGTGCTTAAGAAATCCAA  795

seq1  CAGACCTTTCTTTCCAGACATTGTGGTAGTGCTGGCGGGGAGATAAATAG  841
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGACCTTTCTTTCCAGACATTGTGGTAGTGCTGGCGGGGAGATAAATAG  845

seq1  AACCGCAGTAAAGGATAAAAGAAAGGAGAAATGGACAATAGTTATGGGAA  891
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCGCAGTAAAGGATAAAAGAAAGGAGAAATGGACAATAGTTATGGGAA  895

seq1  TATAGACACTGTGTTGGGGCTTTCTAATGAGGCTTGTACTCTATGTTATT  941
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAGACACTGTGTTGGGGCTTTCTAATGAGGCTTGTACTCTATGTTATT  945

seq1  GAAGAAAATAAATTTCTGGACTGGAGAGATGGCTCAGAGGTTAAGAGGTC  991
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGAAAATAAATTTCTGGACTGGAGAGATGGCTCAGAGGTTAAGAGGTC  995

seq1  CTGAGATCAATTCCCAGCAACCCCATGGTGGCTCACAACCTTCTATATTG  1041
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGATCAATTCCCAGCAACCCCATGGTGGCTCACAACCTTCTATATTG  1045

seq1  AGATCTGGTGCCCTCTTCCGGTGTGCAGACATACATGCAGGGAAAACATT  1091
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATCTGGTGCCCTCTTCCGGTGTGCAGACATACATGCAGGGAAAACATT  1095

seq1  GTATACCTAATAAATAAATGCATACATAAATCTTAAAAAAAAGAAAGAAA  1141
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATACCTAATAAATAAATGCATACATAAATCTTAAAAAAAAGAAAGAAA  1145

seq1  ATAAATTTCAGGAACATCTGTGAGACCACTGGCAGAATTC  1181
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAATTTCAGGAACATCTGTGAGACCACTGGCAGAATTC  1185

seq1: chr14_48948567_48949355
seq2: B6Ng01-076F14.g_70_859

seq1  GAATTCAATTCCCAGCAACCATATGGTGGCTCTCGACCATCTGTAATGGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAATTCCCAGCAACCATATGGTGGCTCTCGACCATCTGTAATGGG  50

seq1  ATCCTATGCCCTCTTCTGGTTTGTAGCAGTCAGGCCAGGAGTGGTGTTTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCTATGCCCTCTTCTGGTTTGTAGCAGTCAGGCCAGGAGTGGTGTTTT  100

seq1  CTCTGGGGTGATCTGTGTGAGTCTGGCTGGTCATTTCTATCTGGTGTACA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGGGGTGATCTGTGTGAGTCTGGCTGGTCATTTCTATCTGGTGTACA  150

seq1  CCTTTGCTGTGCCTTAAGTGACACGAAACTCCCTTGCTCTATACTTACCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTTGCTGTGCCTTAAGTGACACGAAACTCCCTTGCTCTATACTTACCT  200

seq1  ACCTATAGGGTGTAATTGAAAGACCCACAACGTGAGGACTCCCCCACGTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTATAGGGTGTAATTGAAAGACCCACAACGTGAGGACTCCCCCACGTT  250

seq1  CTGACTCAGGAGAGGCGACACCCCAAAATCACCCACAAGAAACGGTCTTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGACTCAGGAGAGGCGACACCCCAAAATCACCCACAAGAAACGGTCTTG  300

seq1  CCACAAACTGCAAGAGGATTTTTATTCAAGAGCACTCTTGGGCCCACAGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACAAACTGCAAGAGGATTTTTATTCAAGAGCACTCTTGGGCCCACAGT  350

seq1  CATACACCACGCAGGGGTAGAGGACCGTGGCGCCCTGAGTAGCTGGATAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATACACCACGCAGGGGTAGAGGACCGTGGCGCCCTGAGTAGCTGGATAA  400

seq1  GGGGGTATTTAAAGGAAGAAACCGAAACTCAAGGAGGTGGGAAGGGCATT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGGTATTTAAAGGAAGAAACCGAAACTCAAGGAGGTGGGAAGGGCATT  450

seq1  GTTGGAAAATACCAAAAATACCAGTTAAGAGTCACAAGGAAGTGCAAAGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGGAAAATACCAAAAATACCAGTTAAGAGTCACAAGGAAGTGCAAAGT  500

seq1  TACCAGAGTCACGAGGAATACCTGGTAATTGTGAGGGTTATTTCTCAAGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCAGAGTCACGAGGAATACCTGGTAATTGTGAGGGTTATTTCTCAAGA  550

seq1  CAGTTTCTAAGAGCCCCTAACAATAGCACCTTTGCATAGCGGGTTCCAGC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTTTCTAAGAGCCCCTAACAATAGCACCTTTGCATAGCGGGTTCCAGC  600

seq1  AATGGTCAGGGTGGGTCAGGGTGACTTTCTTTGAATGAACACTCC-TTGA  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  AATGGTCAGGGTGGGTCAGGGTGACTTTCTTTGAATGAACACTCCTTTGA  650

seq1  ACCCAGGAAGCGGGTGGGTGGAAGAATGTCGCTATCTGTTTTATGATTAG  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCAGGAAGCGGGTGGGTGGAAGAATGTCGCTATCTGTTTTATGATTAG  700

seq1  CATACCTTGGAGCACTGAGTTTACTACTCTTTCATAATCAGAGCTGGAAA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATACCTTGGAGCACTGAGTTTACTACTCTTTCATAATCAGAGCTGGAAA  750

seq1  CATCTCCTTCTCCTCCTTCTCCTTCTCCTTCTCCTCCTCC  789
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTCCTTCTCCTCCTTCTCCTTCTCCTTCTCCTCCTCC  790