BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-085D17
Chromosome14 (Build37)
Map Location 95,745,187 - 95,827,043
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC382931
Upstream geneLOC100043783, LOC677613, LOC100043784
Downstream gene4921530L21Rik, Klhl1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-085D17.bB6Ng01-085D17.g
ACCDH898962DH898963
length1,089961
definitionDH898962|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-085D17, 5' end.DH898963|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-085D17, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(95,825,942 - 95,827,043)(95,745,187 - 95,745,991)
sequence
gaattcctagctgacacatagctcaatctctagaccaggttgtgcttgaa
ctcacatagatcagcctgtttcttcaagtattggaattaaagctatgggc
ttgtcaatatttctggactcacttataagttttaattctgtgtagactta
aataaccaaatggatggtatacagagaaactacatgtttatggcttgagg
tcagttttagaaaataccctcaattatgaattctatctcattgaataaat
atgcataagcaagaacttgaaaaataatccaatatgaatatgaaacaatt
taccttgttttagtgatagaggctcaaatatattctgttagactttgtgt
tgccagggtttcttctatgtctgttttatacagctgatttggactttttc
ttattagacatgaatttggcaaaaccagtttctggataaagatgaggaac
ttataacgtgaaaatttccccatgtggctcatggcagaatgacctgaatc
ctttcccatctcatatttcttattcctggcttatgttcttgtcatactgt
gattttgccctggtttataatcagaattatgtttcagtccccataagctc
ctggtattagttgagagagataacatgatttattgggagatcagattgct
aagtcttgcacagtcccttttcctttgtgctcatggccccaaactctctg
ggtatctagttattgatttccaccttgggaacaaatatatagaatgtagg
ttggaagtttcttttgacattaatgtgaagctaaaatcctgaaaataatg
aaacagacaaggattgcttagtgcagcagcagcagcctatgatgaagtct
tctatgaagttaaagctgagtcttctcatattaaaagccacgaaagtggt
gttctcaacaacctaagaaaagtgccatgagtggggtcatcatgtaaaca
aattctatatactatagaagttgtgtgagcattctaggctttgtatagat
tgcatcaatgtggacagtggttctaataaagtagagtctttaatgctttg
acttcggagaatgcctcacaatccaatattgctatgtgt
gaattccatgcaagagggtaagtgtattttctcaatgtctttcaaagcat
gaccaattccaggaaggtgaacaatggccacaaattgttacatggcaagt
ttatagtacacaatatctatgtttgactaaggctgtttccttcaggctaa
gacagtctctcaagggcgtatgcataagcagaggaacttgtcagggtata
atgcatgtcttaattaaaatcaaagacagatgtcagcagactcattcaag
tttaatcaaaagtaagaagtcagtcagagttaacttcagaagtgctcccc
aaacatctagatcttgactcttatgaataacactgctataaatgtagtta
tacaagtgtcctagtattatggtgcagtgtcctttgggtatatgcccagg
aattgtatagatggttcttaaggcagatcaattctcaattttctgggaaa
ctgccacattggttttgaaattgactgcacatatttgcactcccaccagc
aaagaacgattactccccttgctccgcatccttgccagtttgaactatca
cttgtgtttttcattttagccattgtgagaagtgtaagatgaagtccgag
agttgtgatttgtatttcccagatggctaagcatgctgaacatttcttta
agtgtttctttgccattacagatacctccatagggaattctctgtttgaa
attgtactctgttttttaattggatcatttgacttgctgatgtcaaattt
cttgtgttctttatatatatcggaaattagccctctatcctaatgtggga
ttgatgaagattgtttcccaatttgcagggtaccaattcgtgcttatccc
ctctcccatcaccccttcccttgctctatgaaatcccaatttttagcctg
tgctactggttattagaaagtgacctcctgtgtcatgtattaattggcca
ttcccacttat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_95825942_95827043
seq2: B6Ng01-085D17.b_46_1134 (reverse)

seq1  ACACATTAGCAATAATTAGAATTGTGAGCATTTCTCTGAAGTCAAAAGCA  50
      ||||| ||||||||  | | ||||||||   ||||| |||||| ||||||
seq2  ACACA-TAGCAATA--TTGGATTGTGAGGCATTCTCCGAAGTC-AAAGCA  46

seq1  TTAAAGACTCTACTTTATTTAGAACAACTGT-CACATTTGATGCAATTCT  99
      ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||| |||
seq2  TTAAAGACTCTACTTTA-TTAGAACCACTGTCCACA-TTGATGCAA-TCT  93

seq1  ATACAAAGCCTTAGAATGGCTCACACAACTTCTATAGTATATTAGAATTT  149
      |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  ATACAAAGCC-TAGAAT-GCTCACACAACTTCTATAGTATA-TAGAATTT  140

seq1  GTTTACATTGATGACCCCACTCATGGCACTTTTTCTTTAGGTTGTTTGAG  199
      ||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||
seq2  GTTTACA-TGATGACCCCACTCATGGCACTTTT--CTTAGGTTG-TTGAG  186

seq1  AACACCACTTTCGTGGCTTTTAATATGAGAAGACTCAGCTTTAACTTCAT  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACACCACTTTCGTGGCTTTTAATATGAGAAGACTCAGCTTTAACTTCAT  236

seq1  AGAAGACTTCATCATAGGCTGCTGCTGCTGCACTAAGCAATCCTTGTCTG  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGACTTCATCATAGGCTGCTGCTGCTGCACTAAGCAATCCTTGTCTG  286

seq1  TTTCATTATTTTCAGGATTTTAGCTTCACATTAATGTCAAAAGAAACTTC  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCATTATTTTCAGGATTTTAGCTTCACATTAATGTCAAAAGAAACTTC  336

seq1  CAACCTACATTCTATATATTTGTTCCCAAGGTGGAAATCAATAACTAGAT  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACCTACATTCTATATATTTGTTCCCAAGGTGGAAATCAATAACTAGAT  386

seq1  ACCCAGAGAGTTTGGGGCCATGAGCACAAAGGAAAAGGGACTGTGCAAGA  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCAGAGAGTTTGGGGCCATGAGCACAAAGGAAAAGGGACTGTGCAAGA  436

seq1  CTTAGCAATCTGATCTCCCAATAAATCATGTTATCTCTCTCAACTAATAC  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAGCAATCTGATCTCCCAATAAATCATGTTATCTCTCTCAACTAATAC  486

seq1  CAGGAGCTTATGGGGACTGAAACATAATTCTGATTATAAACCAGGGCAAA  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGAGCTTATGGGGACTGAAACATAATTCTGATTATAAACCAGGGCAAA  536

seq1  ATCACAGTATGACAAGAACATAAGCCAGGAATAAGAAATATGAGATGGGA  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCACAGTATGACAAGAACATAAGCCAGGAATAAGAAATATGAGATGGGA  586

seq1  AAGGATTCAGGTCATTCTGCCATGAGCCACATGGGGAAATTTTCACGTTA  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGATTCAGGTCATTCTGCCATGAGCCACATGGGGAAATTTTCACGTTA  636

seq1  TAAGTTCCTCATCTTTATCCAGAAACTGGTTTTGCCAAATTCATGTCTAA  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGTTCCTCATCTTTATCCAGAAACTGGTTTTGCCAAATTCATGTCTAA  686

seq1  TAAGAAAAAGTCCAAATCAGCTGTATAAAACAGACATAGAAGAAACCCTG  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGAAAAAGTCCAAATCAGCTGTATAAAACAGACATAGAAGAAACCCTG  736

seq1  GCAACACAAAGTCTAACAGAATATATTTGAGCCTCTATCACTAAAACAAG  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAACACAAAGTCTAACAGAATATATTTGAGCCTCTATCACTAAAACAAG  786

seq1  GTAAATTGTTTCATATTCATATTGGATTATTTTTCAAGTTCTTGCTTATG  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAATTGTTTCATATTCATATTGGATTATTTTTCAAGTTCTTGCTTATG  836

seq1  CATATTTATTCAATGAGATAGAATTCATAATTGAGGGTATTTTCTAAAAC  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATATTTATTCAATGAGATAGAATTCATAATTGAGGGTATTTTCTAAAAC  886

seq1  TGACCTCAAGCCATAAACATGTAGTTTCTCTGTATACCATCCATTTGGTT  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACCTCAAGCCATAAACATGTAGTTTCTCTGTATACCATCCATTTGGTT  936

seq1  ATTTAAGTCTACACAGAATTAAAACTTATAAGTGAGTCCAGAAATATTGA  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTAAGTCTACACAGAATTAAAACTTATAAGTGAGTCCAGAAATATTGA  986

seq1  CAAGCCCATAGCTTTAATTCCAATACTTGAAGAAACAGGCTGATCTATGT  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGCCCATAGCTTTAATTCCAATACTTGAAGAAACAGGCTGATCTATGT  1036

seq1  GAGTTCAAGCACAACCTGGTCTAGAGATTGAGCTATGTGTCAGCTAGGAA  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTTCAAGCACAACCTGGTCTAGAGATTGAGCTATGTGTCAGCTAGGAA  1086

seq1  TTC  1102
      |||
seq2  TTC  1089

seq1: chr14_95745187_95745991
seq2: B6Ng01-085D17.g_66_870

seq1  GAATTCCATGCAAGAGGGTAAGTGTATTTTCTCAATGTCTTTCAAAGCAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCATGCAAGAGGGTAAGTGTATTTTCTCAATGTCTTTCAAAGCAT  50

seq1  GACCAATTCCAGGAAGGTGAACAATGGCCACAAATTGTTACATGGCAAGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCAATTCCAGGAAGGTGAACAATGGCCACAAATTGTTACATGGCAAGT  100

seq1  TTATAGTACACAATATCTATGTTTGACTAAGGCTGTTTCCTTCAGGCTAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATAGTACACAATATCTATGTTTGACTAAGGCTGTTTCCTTCAGGCTAA  150

seq1  GACAGTCTCTCAAGGGCGTATGCATAAGCAGAGGAACTTGTCAGGGTATA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAGTCTCTCAAGGGCGTATGCATAAGCAGAGGAACTTGTCAGGGTATA  200

seq1  ATGCATGTCTTAATTAAAATCAAAGACAGATGTCAGCAGACTCATTCAAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCATGTCTTAATTAAAATCAAAGACAGATGTCAGCAGACTCATTCAAG  250

seq1  TTTAATCAAAAGTAAGAAGTCAGTCAGAGTTAACTTCAGAAGTGCTCCCC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAATCAAAAGTAAGAAGTCAGTCAGAGTTAACTTCAGAAGTGCTCCCC  300

seq1  AAACATCTAGATCTTGACTCTTATGAATAACACTGCTATAAATGTAGTTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACATCTAGATCTTGACTCTTATGAATAACACTGCTATAAATGTAGTTA  350

seq1  TACAAGTGTCCTAGTATTATGGTGCAGTGTCCTTTGGGTATATGCCCAGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAAGTGTCCTAGTATTATGGTGCAGTGTCCTTTGGGTATATGCCCAGG  400

seq1  AATTGTATAGATGGTTCTTAAGGCAGATCAATTCTCAATTTTCTGGGAAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTGTATAGATGGTTCTTAAGGCAGATCAATTCTCAATTTTCTGGGAAA  450

seq1  CTGCCACATTGGTTTTGAAATTGACTGCACATATTTGCACTCCCACCAGC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCCACATTGGTTTTGAAATTGACTGCACATATTTGCACTCCCACCAGC  500

seq1  AAAGAACGATTACTCCCCTTGCTCCGCATCCTTGCCAGTTTGAACTATCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGAACGATTACTCCCCTTGCTCCGCATCCTTGCCAGTTTGAACTATCA  550

seq1  CTTGTGTTTTTCATTTTAGCCATTGTGAGAAGTGTAAGATGAAGTCCGAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGTGTTTTTCATTTTAGCCATTGTGAGAAGTGTAAGATGAAGTCCGAG  600

seq1  AGTTGTGATTTGTATTTCCCAGATGGCTAAGCATGCTGAACATTTCTTTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTGTGATTTGTATTTCCCAGATGGCTAAGCATGCTGAACATTTCTTTA  650

seq1  AGTGTTTCTTTGCCATTACAGATACCTCCATAGGGAATTCTCTGTTTGAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGTTTCTTTGCCATTACAGATACCTCCATAGGGAATTCTCTGTTTGAA  700

seq1  ATTGTACTCTGTTTTTTAATTGGATCATTTGACTTGCTGATGTCAAATTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGTACTCTGTTTTTTAATTGGATCATTTGACTTGCTGATGTCAAATTT  750

seq1  CTTGTGTTCTTTATATATATCGGAAATTAGCCCTCTATCCTAATGTGGGA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGTGTTCTTTATATATATCGGAAATTAGCCCTCTATCCTAATGTGGGA  800

seq1  TTGAT  805
      |||||
seq2  TTGAT  805