BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-087A03
Chromosome14 (Build37)
Map Location 100,403,561 - 100,583,684
singlet/doubletdoublet
Overlap geneKlf12
Upstream gene2410129H14Rik, 6720463M24Rik, Dis3, D14Ertd581e, LOC100043395, LOC100043397, Klf5, LOC100043400, LOC100043789, LOC668671, LOC668672, EG546623
Downstream geneLOC100043413, EG668683, EG668684
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-087A03.bB6Ng01-087A03.g
ACCDH900255DH900256
length1,2741,112
definitionDH900255|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-087A03, 5' end.DH900256|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-087A03, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(100,403,561 - 100,404,835)(100,582,570 - 100,583,684)
sequence
gaattcaacaggaaccaaaaacacaagccggtaccatagtaatcctattt
ctttcagtaagacacataaagatcatttagtttttggcacagatggacct
tgagctactggtatagtttagggtagccttgaactcctgatccctttgcc
tctgcaatcagccctgggattacaggtgtgagtcaccaccaaactctcct
tttctcattgaagggtacaatacaaggccgaaaatgtaagaagtttataa
taagtcgactaattttctagtttatgaattgtgacagtttctttataata
ccttttgtatgatcatatatacatgtcaaatatatggttttatgcatgtg
agtgtatttacattaatatataaaagcttaaagaaacgacaatacaaagt
cccactataagtatatcccggcatgtcctggtactgggtggacattgcac
tatggaatttccaaacatgaaaagcctgtctaagtaaactgaccggttgg
acacttgcaactaacagttcagataccaactgaacagtgataatgaggca
tattttccttgtaacttttttggaataaggtcttatctaatactgtgact
atatatataacagtatgctcttgcttctgctaagcatcactgcgttcccg
gtgcttacaatgcagaccacatcgtggaaaagtagtaaatcctgtggctc
gcttcgatttacaaatggaaaaagtgacaaccttccatttatatccgctc
cggccacatcgtacagctaaaactcgttttaagttattattgaaatggtt
gtttgcttttaaataccaaaggcttatgatggtgattagcattaaaaatg
atcacagttggccaaggaagaaaaaagagaggcctgttaatagttgtact
agttttgaggtggataatgagataataaaacacacaattggaggttatac
taccttgatgattgcagattataccaatgggcacaataatgccaccggag
agtgcggcagcactagcactcatttgctagatgatagtggattatgttcc
atgaaaagtaggacttggaggaattaagcaaaaccttgctactaccccgg
tggtgatggtccatgcctcctggaagagcaggcaaagtccttgttcccac
tttgataaattattaaatttaaaagagggaggatggccaacctctgaaaa
gacatgattcgagcgtgcggaagctcgtcccctagaggcatgagctggtt
ctcttcctctcgagacacacacgt
gaattctgctgtggcagaagatcacagctgtgatgatttaaatcacattc
attgttttcattagaaaagtgatgaacactcgtgggctgcagcttacaat
gagttttgttcttactggcactgttggccactaaaaaaataaaagggact
tgcgttgatactttttttatggacgcagaattataatccatccagttctt
tgtacatgagatcacttgcttgaaaatgatgtgtataatatttgtgagat
tcagtgttcagcctgttgttaaatacaaccagtggcttagaatgaagcag
aagataaaatgtatgtattgaagtgaaaatctaatctatggagcaatcca
aaacatggaggtataaatcacagtagtaactgggaaaccacataaaaaca
atactattagtagaggagagttatttaagaacaacattattcagaaaatg
ggaaagagggttgaaaatacacaaaggtggtcacagttggacaagcttgc
tgtatagagcagcaaacccttggatgccatctatggcccacctggtctag
tgtgattaatttttataattccaggctaatacatagtactctggacataa
ttgattcagagttatttttaaaatacaggatgtcttagatattttaagta
taaatcctactttagtaccaaggaaatgacttggtgagcaaggctctggc
ttccaagaataacagctggagttcaagtctagaggtccagaggttggaat
ggggacagatgcctgagagttgtcctttctccccacataggcaccaaggc
atgacttcccacagacagacaagtttgatgagaaaataaaataaagagat
cacaaagaagaagcctttaacaatatttgatgctgttcgtgagattccaa
tttgaattcttatttcagcttggattccatgcttgtgacattactgaaga
ccatttcctctcacatgagcatttctcgcgggaagtgatgtttagaatgc
cggtacctatgtgagtcattgagttctagtgagtctggtgaagcttcttg
ttatataccttaaatgttaaccctcagagaactgagacatggcaggactg
tcctggtgactt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_100403561_100404835
seq2: B6Ng01-087A03.b_46_1319

seq1  GAATTCAACAGGAACCAAAAACACAAGCCGGTACCATAGTAATCCTATTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAACAGGAACCAAAAACACAAGCCGGTACCATAGTAATCCTATTT  50

seq1  CTTTCAGTAAGACACATAAAGATCATTTAGTTTTTGGCACAGATGGACCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCAGTAAGACACATAAAGATCATTTAGTTTTTGGCACAGATGGACCT  100

seq1  TGAGCTACTGGTATAGTTTAGGGTAGCCTTGAACTCCTGATCCCTTTGCC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGCTACTGGTATAGTTTAGGGTAGCCTTGAACTCCTGATCCCTTTGCC  150

seq1  TCTGCAATCAGCCCTGGGATTACAGGTGTGAGTCACCACCAAACTCTCCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCAATCAGCCCTGGGATTACAGGTGTGAGTCACCACCAAACTCTCCT  200

seq1  TTTCTCATTGAAGGGTACAATACAAGGCCGAAAATGTAAGAAGTTTATAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTCATTGAAGGGTACAATACAAGGCCGAAAATGTAAGAAGTTTATAA  250

seq1  TAAGTCGACTAATTTTCTAGTTTATGAATTGTGACAGTTTCTTTATAATA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGTCGACTAATTTTCTAGTTTATGAATTGTGACAGTTTCTTTATAATA  300

seq1  CCTTTTGTATGATCATATATACATGTCAAATATATGGTTTTATGCATGTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTTTGTATGATCATATATACATGTCAAATATATGGTTTTATGCATGTG  350

seq1  AGTGTATTTACATTAATATATAAAAGCTTAAAGAAACGACAATACAAAGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGTATTTACATTAATATATAAAAGCTTAAAGAAACGACAATACAAAGT  400

seq1  CCCACTATAAGTATATCCCGGCATGTCCTGGTACTGGGTGGACATTGCAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCACTATAAGTATATCCCGGCATGTCCTGGTACTGGGTGGACATTGCAC  450

seq1  TATGGAATTTCCAAACATGAAAAGCCTGTCTAAGTAAACTGACCGGTTGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGGAATTTCCAAACATGAAAAGCCTGTCTAAGTAAACTGACCGGTTGG  500

seq1  ACACTTGCAACTAACAGTTCAGATACCAACTGAACAGTGATAATGAGGCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACTTGCAACTAACAGTTCAGATACCAACTGAACAGTGATAATGAGGCA  550

seq1  TATTTTCCTTGTAACTTTTTTGGAATAAGGTCTTATCTAATACTGTGACT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTTCCTTGTAACTTTTTTGGAATAAGGTCTTATCTAATACTGTGACT  600

seq1  ATATATATAACAGTATGCTCTTGCTTCTGCTAAGCATCACTGCGTTCCCG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATATATAACAGTATGCTCTTGCTTCTGCTAAGCATCACTGCGTTCCCG  650

seq1  GTGCTTACAATGCAGACCACATCGTGGAAAAGTAGTAAATCCTGTGGCTC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCTTACAATGCAGACCACATCGTGGAAAAGTAGTAAATCCTGTGGCTC  700

seq1  GCTTCGATTTACAAATGGAAAAAGTGACAACCTTCCATTTATATCCGCTC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTCGATTTACAAATGGAAAAAGTGACAACCTTCCATTTATATCCGCTC  750

seq1  CGGCCACATCGTACAGCTAAAACTCGTTTTAAGTTATTATTGAAATGGTT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGCCACATCGTACAGCTAAAACTCGTTTTAAGTTATTATTGAAATGGTT  800

seq1  GTTTGCTTTTAAATACCAAAGGCTTATGATGGTGATTAGCATTAAAAATG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTGCTTTTAAATACCAAAGGCTTATGATGGTGATTAGCATTAAAAATG  850

seq1  ATCACAGTTGGCCAAGGAAGAAAAAAGAGAGGCCTGTTAATAGTTGTACT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCACAGTTGGCCAAGGAAGAAAAAAGAGAGGCCTGTTAATAGTTGTACT  900

seq1  AGTTTTGAGGTGGATAATGAGATAATAAAACACACAATTGGAGGTTATAC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTTTGAGGTGGATAATGAGATAATAAAACACACAATTGGAGGTTATAC  950

seq1  TACCTTGATGATTGCAGATTATACCAATGGGCACAATAATGCCACCGGAG  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCTTGATGATTGCAGATTATACCAATGGGCACAATAATGCCACCGGAG  1000

seq1  AGTGCGGCAGCAACTAGCACTCATTTGCTAGATGATAAGTGGATTATGTT  1050
      ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  AGTGCGGCAGC-ACTAGCACTCATTTGCTAGATGAT-AGTGGATTATGTT  1048

seq1  CCATGAAAAGTAGGACTT-GAGGAATACAGCAAAACC-TGCTACTACACA  1098
      |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||| | 
seq2  CCATGAAAAGTAGGACTTGGAGGAATTAAGCAAAACCTTGCTACTACCCC  1098

seq1  G--TGTGAT-GCCCATGC--TCTGG-AGAGCAGGCAAAGTCCTTGTTCAC  1142
      |   ||||| | ||||||   |||| |||||||||||||||||||||| |
seq2  GGTGGTGATGGTCCATGCCTCCTGGAAGAGCAGGCAAAGTCCTTGTTCCC  1148

seq1  ACTTTGATAAATTTAACTAATTAAAAAAAAAGAGAGAGAGAATGGCAAAC  1192
      |||||||||||||      ||||||   ||| |||| ||| ||||| |||
seq2  ACTTTGATAAATT------ATTAAATTTAAA-AGAGGGAGGATGGCCAAC  1191

seq1  ATCTAGAAAGGACAATGAAATCAGAGC-TGCGAGATGTCTGTTCCTCTTA  1241
       ||| |||| ||| |||  ||  |||| |||| || | ||  ||| ||  
seq2  CTCT-GAAAAGAC-ATG--ATTCGAGCGTGCG-GAAG-CTCGTCCCCT--  1233

seq1  TGAGGC--TAGCTGG---TCTTCCTCTCCGAG---CACACGT  1275
       |||||   ||||||   ||||||||| ||||   |||||||
seq2  AGAGGCATGAGCTGGTTCTCTTCCTCT-CGAGACACACACGT  1274

seq1: chr14_100582570_100583684
seq2: B6Ng01-087A03.g_69_1180 (reverse)

seq1  AAGTCACCAAGACAGTCCTGCCATGTCTCAGTCTCT-TGAGGG-TAACAT  48
      ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||
seq2  AAGTCACCAGGACAGTCCTGCCATGTCTCAGT-TCTCTGAGGGTTAACAT  49

seq1  TTAAGGTAATATTAACAAG-AGCTTCACCAGACTCACTAAGAACTCAATG  97
      ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  TTAAGGT-ATA-TAACAAGAAGCTTCACCAGACTCACT-AGAACTCAATG  96

seq1  ACTCACATAGGTACCGGCATTCTAAACATCACTTCCCGCGAGAAATGCTC  147
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCACATAGGTACCGGCATTCTAAACATCACTTCCCGCGAGAAATGCTC  146

seq1  ATGTGAGAGGAAATGGTCTTCAGTAATGTCACAAGCATGGAATCCAAGCT  197
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGAGAGGAAATGGTCTTCAGTAATGTCACAAGCATGGAATCCAAGCT  196

seq1  GAAATAAGAATTCAAATTGGAATCTCACGAACAGCATCAAATATTGTTAA  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAATAAGAATTCAAATTGGAATCTCACGAACAGCATCAAATATTGTTAA  246

seq1  AGGCTTCTTTCTTTGTGATCTCTTTATTTTATTTTCTCATCAAACTTGTC  297
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCTTC-TTCTTTGTGATCTCTTTATTTTATTTTCTCATCAAACTTGTC  295

seq1  TGTCTGTGGGGAAGTCATGCCTTGGTGCCTATGTGGGGAGAAAGGACAAC  347
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTGT-GGGAAGTCATGCCTTGGTGCCTATGTGGGGAGAAAGGACAAC  344

seq1  TCTCAGGCATCTGTCCCCATTCCAACCTCTGGACCTCTAGACTTGAACTC  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCAGGCATCTGTCCCCATTCCAACCTCTGGACCTCTAGACTTGAACTC  394

seq1  CAGCTGTTATTCTTGGAAGCCAGAGCCTTGCTCACCAAGTCATTTCCTTG  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTGTTATTCTTGGAAGCCAGAGCCTTGCTCACCAAGTCATTTCCTTG  444

seq1  GTACTAAAGTAGGATTTATACTTAAAATATCTAAGACATCCTGTATTTTA  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACTAAAGTAGGATTTATACTTAAAATATCTAAGACATCCTGTATTTTA  494

seq1  AAAATAACTCTGAATCAATTATGTCCAGAGTACTATGTATTAGCCTGGAA  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATAACTCTGAATCAATTATGTCCAGAGTACTATGTATTAGCCTGGAA  544

seq1  TTATAAAAATTAATCACACTAGACCAGGTGGGCCATAGATGGCATCCAAG  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATAAAAATTAATCACACTAGACCAGGTGGGCCATAGATGGCATCCAAG  594

seq1  GGTTTGCTGCTCTATACAGCAAGCTTGTCCAACTGTGACCACCTTTGTGT  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTTGCTGCTCTATACAGCAAGCTTGTCCAACTGTGACCACCTTTGTGT  644

seq1  ATTTTCAACCCTCTTTCCCATTTTCTGAATAATGTTGTTCTTAAATAACT  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTCAACCCTCTTTCCCATTTTCTGAATAATGTTGTTCTTAAATAACT  694

seq1  CTCCTCTACTAATAGTATTGTTTTTATGTGGTTTCCCAGTTACTACTGTG  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTCTACTAATAGTATTGTTTTTATGTGGTTTCCCAGTTACTACTGTG  744

seq1  ATTTATACCTCCATGTTTTGGATTGCTCCATAGATTAGATTTTCACTTCA  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTATACCTCCATGTTTTGGATTGCTCCATAGATTAGATTTTCACTTCA  794

seq1  ATACATACATTTTATCTTCTGCTTCATTCTAAGCCACTGGTTGTATTTAA  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACATACATTTTATCTTCTGCTTCATTCTAAGCCACTGGTTGTATTTAA  844

seq1  CAACAGGCTGAACACTGAATCTCACAAATATTATACACATCATTTTCAAG  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACAGGCTGAACACTGAATCTCACAAATATTATACACATCATTTTCAAG  894

seq1  CAAGTGATCTCATGTACAAAGAACTGGATGGATTATAATTCTGCGTCCAT  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGTGATCTCATGTACAAAGAACTGGATGGATTATAATTCTGCGTCCAT  944

seq1  AAAAAAAGTATCAACGCAAGTCCCTTTTATTTTTTTAGTGGCCAACAGTG  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAAAGTATCAACGCAAGTCCCTTTTATTTTTTTAGTGGCCAACAGTG  994

seq1  CCAGTAAGAACAAAACTCATTGTAAGCTGCAGCCCACGAGTGTTCATCAC  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGTAAGAACAAAACTCATTGTAAGCTGCAGCCCACGAGTGTTCATCAC  1044

seq1  TTTTCTAATGAAAACAATGAATGTGATTTAAATCATCACAGCTGTGATCT  1097
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCTAATGAAAACAATGAATGTGATTTAAATCATCACAGCTGTGATCT  1094

seq1  TCTGCCACAGCAGAATTC  1115
      ||||||||||||||||||
seq2  TCTGCCACAGCAGAATTC  1112