BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-089M23
Chromosome14 (Build37)
Map Location 62,869,896 - 63,044,197
singlet/doubletdoublet
Overlap geneDleu7, Rnaseh2b, Gucy1b2
Upstream geneSgcg, Arl11, EG432864, Ebpl, Kpna3, LOC100042933, EG432865, 6330409N04Rik, LOC100042941, Trim13, Kcnrg, LOC668253
Downstream geneLOC100042960, Ppia-ps14_723.1, LOC545062, EG629059, E130113E03Rik, Ints6, LOC100042969, LOC668263, Wdfy2, LOC668268, EG432867, EG654465, EG654458, 2410125J01Rik, Defb42, LOC100042978, Ctsb, Fdft1, Neil2, Gata4, LOC100042988, LOC432868, Blk
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-089M23.bB6Ng01-089M23.g
ACCDH902290DH902291
length1,071861
definitionDH902290|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-089M23, 5' end.DH902291|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-089M23, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(63,043,131 - 63,044,197)(62,869,896 - 62,870,749)
sequence
gaattcatgcaacagggaggggtcggagaaaacagaaactaacagtccca
cacctgtctgcatacttccccgggttggaaaagacccgaatagaacgtat
ttcagttcacttaggagtgagcaggtggctcctgaattctggcatagaca
agtttgttgtcagctggaagggacaaaagagacaattcacacaggccctg
gttttctcccacccttctatccatacctttgtctagactcagaagaccta
gctagtagtcttggcaaaatatgcaagattccagaagaattatcttccca
gagatctggctatgaacagagagctgcaaggaacctgctattctgacgtg
tgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgcacctgtacatgcacatattat
tagggattgagccaagggggctcgtgtgtgttaagtgaccctctactact
gagctatatctctatcctttttattttccactttgagataggttctcact
agattgtccaggccagccttgaattgactctatagctcagacgtgccaaa
agtttatgatcctcctgccttggcctcctgagtagcttatagctacatat
aggctcgtaccataaggcttttcctgtttctgagcatctttaagtgagca
aagactttggaaagtaagaaccactctgcatccctggcagtctgtagtac
tctttcatgggaaatgctctgccgaacaagacccctcctcactgtgagat
ccaggtccatcgggagaaacagagtcctcaaaggatacagttcaggaaac
tatggctcccataggattcccagggatgctcttcagctccaccaggagtc
agaaccctgccctaagatgtgaatgttttcaggatctccatgctggccat
acaagtgaagtcttcattctcgtccaccaatgacctcagagcagcctgta
cctgttgggctgtggatgtggtgcagaggacttgggatcagtagatctcc
tacctgccttctatggactcattctgaacaaagagagataacatacagga
tcactatttccaaaaatccta
gaattctgtattagggagggttctctagagaaacaataagatacaattga
tcaaataagatagatagatagatagatagatagatagatagatagataga
tagatagatagatatgggatttgttagagtgacttataggctggggtctg
gctgttccaacaatggttgtctcctaagagaaagcccaagagtccaatgg
ttgttctgtccatgaggcgggacggcacagatggtctttaatatccacca
gaacactgaagaagtaggttctaatgccagtgaagggttgaacttgccag
caaaagtgagagcaaggatgcaaacaacaagaactttcttcttccaagtc
ctctgtacaggctaccagcagaaggtgtggcccagatttaaggttgggtc
ctcccacttcgaatgatccaatcaaatacatccttcacctagtagcttga
gtttgggttaattacagatgtagtcaagttggcaaccaagagaaaccatc
aaatatttgttccctgagatacatatcacttgcaagaagacccttttacc
cttgctttttaaaaattcccatccctgggccagccagatggctctgtggg
taaaggtgcttgtcactaagcctcatgatttgcatccaaccccttctcaa
ctccttcagctcacagggagggaaagtagcacttattgctgtcttttgac
tttccacactcaggcacatgtacatgtgcgtgtatacacacacacacaca
taccacacacacacaccactaaataaaataggtaggtaggtaaataggta
aaagatagttatttggatagatagatagatagatagatagatagatagat
agatagataga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_63043131_63044197
seq2: B6Ng01-089M23.b_47_1117 (reverse)

seq1  TAGGA-TCTTGGGAATAGATGATCCTGTTAGTGTATCTCTCTTTGTTCAG  49
      ||||| | |||| ||||| |||||||||  || |||||||||||||||||
seq2  TAGGATTTTTGGAAATAG-TGATCCTGTATGT-TATCTCTCTTTGTTCAG  48

seq1  -ATGAGT-CATGGAAGGCA-GTTGGAGACTCTGACTGAATCCCAAGTCCT  96
       |||||| ||| ||||||| || ||||| ||| |||| ||||||||||||
seq2  AATGAGTCCATAGAAGGCAGGTAGGAGA-TCT-ACTG-ATCCCAAGTCCT  95

seq1  CTGCACCACATCCCACAGCCCAACAAGGTACAGGCTGCTCTCGAGGTCAT  146
      ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||
seq2  CTGCACCACAT-CCACAGCCCAAC-AGGTACAGGCTGCTCT-GAGGTCAT  142

seq1  T-GTGGACGGAGAATGAAGACTTCACTGGTATGGCCAGCATGGAGATCCC  195
      | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||
seq2  TGGTGGAC-GAGAATGAAGACTTCACTTGTATGGCCAGCATGGAGAT-CC  190

seq1  TGAAAACATTCACATCCTTAGGGCAGGGTTCTGACTCCTGGTGGAGCTGA  245
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAAACATTCACAT-CTTAGGGCAGGGTTCTGACTCCTGGTGGAGCTGA  239

seq1  AGAGCATCCCTGGGAATCCTATTGGAGCCATAG-TTCCTG-ACTGTATCC  293
      |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||
seq2  AGAGCATCCCTGGGAATCCTATGGGAGCCATAGTTTCCTGAACTGTATCC  289

seq1  TTTGAGGACTCTGTTTCTCCCGATGGACCTGGATCTCACAGTGAGGA-GG  342
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  TTTGAGGACTCTGTTTCTCCCGATGGACCTGGATCTCACAGTGAGGAGGG  339

seq1  GTCTTGTTCGGCAGAGCATTT-CCATG-AAGAGTACTACAGACTGCCAGG  390
      ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTTGTTCGGCAGAGCATTTCCCATGAAAGAGTACTACAGACTGCCAGG  389

seq1  GATGCAGAGTGGTTCTTACTT--CCAAGTCTTTGCTCACTT-AAGATGCT  437
      |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||
seq2  GATGCAGAGTGGTTCTTACTTTCCAAAGTCTTTGCTCACTTAAAGATGCT  439

seq1  CAG-AACAGG-AAAGCCTTATGGTACGAGCCTATATGTAGCTATAAGCTA  485
      ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAAACAGGAAAAGCCTTATGGTACGAGCCTATATGTAGCTATAAGCTA  489

seq1  CTCAGGAGGCCAAGGCAGGAGGATCATAAACTTTTGGCACGTCTGAGCTA  535
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGGAGGCCAAGGCAGGAGGATCATAAACTTTTGGCACGTCTGAGCTA  539

seq1  TAGAGTCAATTCAAGGCTGGCCTGGACAATCTAGTGAGAACCTATCTCAA  585
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAGTCAATTCAAGGCTGGCCTGGACAATCTAGTGAGAACCTATCTCAA  589

seq1  AGTGGAAAATAAAAAGGATAGAGATATAGCTCAGTAGTAGAGGGTCACTT  635
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGGAAAATAAAAAGGATAGAGATATAGCTCAGTAGTAGAGGGTCACTT  639

seq1  AACACACACGAGCCCCCTTGGCTCAATCCCTAATAATATGTGCATGTACA  685
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACACACACGAGCCCCCTTGGCTCAATCCCTAATAATATGTGCATGTACA  689

seq1  GGTGCACACACACACACACACACACACACACACACGTCAGAATAGCAGGT  735
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGCACACACACACACACACACACACACACACACGTCAGAATAGCAGGT  739

seq1  TCCTTGCAGCTCTCTGTTCATAGCCAGATCTCTGGGAAGATAATTCTTCT  785
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTGCAGCTCTCTGTTCATAGCCAGATCTCTGGGAAGATAATTCTTCT  789

seq1  GGAATCTTGCATATTTTGCCAAGACTACTAGCTAGGTCTTCTGAGTCTAG  835
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAATCTTGCATATTTTGCCAAGACTACTAGCTAGGTCTTCTGAGTCTAG  839

seq1  ACAAAGGTATGGATAGAAGGGTGGGAGAAAACCAGGGCCTGTGTGAATTG  885
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAAGGTATGGATAGAAGGGTGGGAGAAAACCAGGGCCTGTGTGAATTG  889

seq1  TCTCTTTTGTCCCTTCCAGCTGACAACAAACTTGTCTATGCCAGAATTCA  935
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTTTTGTCCCTTCCAGCTGACAACAAACTTGTCTATGCCAGAATTCA  939

seq1  GGAGCCACCTGCTCACTCCTAAGTGAACTGAAATACGTTCTATTCGGGTC  985
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGCCACCTGCTCACTCCTAAGTGAACTGAAATACGTTCTATTCGGGTC  989

seq1  TTTTCCAACCCGGGGAAGTATGCAGACAGGTGTGGGACTGTTAGTTTCTG  1035
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCCAACCCGGGGAAGTATGCAGACAGGTGTGGGACTGTTAGTTTCTG  1039

seq1  TTTTCTCCGACCCCTCCCTGTTGCATGAATTC  1067
      ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCTCCGACCCCTCCCTGTTGCATGAATTC  1071

seq1: chr14_62869896_62870749
seq2: B6Ng01-089M23.g_72_930

seq1  ATTCTGTATTAGGGAGGGTTCTCTAGAGAAACAATAAGATACAATTGATC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCTGTATTAGGGAGGGTTCTCTAGAGAAACAATAAGATACAATTGATC  50

seq1  AAATAAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATAAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATA  100

seq1  GATAGATAGATATGGGATTTGTTAGAGTGACTTATAGGCTGGGGTCTGGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAGATAGATATGGGATTTGTTAGAGTGACTTATAGGCTGGGGTCTGGC  150

seq1  TGTTCCAACAATGGTTGTCTCCTAAGAGAAAGCCCAAGAGTCCAATGGTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTCCAACAATGGTTGTCTCCTAAGAGAAAGCCCAAGAGTCCAATGGTT  200

seq1  GTTCTGTCCATGAGGCGGGACGGCACAGATGGTCTTTAATATCCACCAGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCTGTCCATGAGGCGGGACGGCACAGATGGTCTTTAATATCCACCAGA  250

seq1  ACACTGAAGAAGTAGGTTCTAATGCCAGTGAAGGGTTGAACTTGCCAGCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACTGAAGAAGTAGGTTCTAATGCCAGTGAAGGGTTGAACTTGCCAGCA  300

seq1  AAAGTGAGAGCAAGGATGCAAACAACAAGAACTTTCTTCTTCCAAGTCCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTGAGAGCAAGGATGCAAACAACAAGAACTTTCTTCTTCCAAGTCCT  350

seq1  CTGTACAGGCTACCAGCAGAAGGTGTGGCCCAGATTTAAGGTTGGGTCCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTACAGGCTACCAGCAGAAGGTGTGGCCCAGATTTAAGGTTGGGTCCT  400

seq1  CCCACTTCGAATGATCCAATCAAATACATCCTTCACCTAGTAGCTTGAGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCACTTCGAATGATCCAATCAAATACATCCTTCACCTAGTAGCTTGAGT  450

seq1  TTGGGTTAATTACAGATGTAGTCAAGTTGGCAACCAAGAGAAACCATCAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGGTTAATTACAGATGTAGTCAAGTTGGCAACCAAGAGAAACCATCAA  500

seq1  ATATTTGTTCCCTGAGATACATATCACTTGCAAGAAGACCCTTTTACCCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATTTGTTCCCTGAGATACATATCACTTGCAAGAAGACCCTTTTACCCT  550

seq1  TGCTTTTT-AAAATTCCCATCCCTGGGCCAGCCAGATGGCTCTGTGGGTA  599
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTTTTAAAAATTCCCATCCCTGGGCCAGCCAGATGGCTCTGTGGGTA  600

seq1  AAGGTGCTTGTCACTAAGCCTCATGATTTGCATCCAACCCC-TCTCAACT  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  AAGGTGCTTGTCACTAAGCCTCATGATTTGCATCCAACCCCTTCTCAACT  650

seq1  CCTTCAGCTCACA-GGAGGGAAAGTAAGCACTTATTGCTGTCTTTTGAC-  696
      ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| 
seq2  CCTTCAGCTCACAGGGAGGGAAAGT-AGCACTTATTGCTGTCTTTTGACT  699

seq1  TTCCACACTCAGGCACATGTACATGTGCGTGTATACACACACACACACAT  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCACACTCAGGCACATGTACATGTGCGTGTATACACACACACACACAT  749

seq1  A-CACACACACACACCACTAAAT-AAATAGGTAGGTAGGTAAGTAGGTAA  794
      | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||
seq2  ACCACACACACACACCACTAAATAAAATAGGTAGGTAGGTAAATAGGTAA  799

seq1  AAGATAGTTATTTGGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATA  844
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGATAGTTATTTGGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATA  849

seq1  GATAGATAGA  854
      ||||||||||
seq2  GATAGATAGA  859