BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-095H21
Chromosome14 (Build37)
Map Location 58,022,207 - 58,127,045
singlet/doubletdoublet
Overlap geneAU040096, Ift88
Upstream geneRnf17, Cenpj, Parp4, LOC100042788, 4930548G07Rik, Pspc1, LOC100043499, 9830124H08Rik, LOC100042797, LOC219106, LOC668118, Zmym2, LOC100042817, B020004C17Rik, Gja3, Gjb2, LOC100043515, Gjb6, LOC668140, Cryl1, LOC668090
Downstream geneIl17d, N6amt2, Xpo4, Lats2, Sap18, F630043A04Rik, Mrp63, Zdhhc20, Efha1, LOC668160, Fgf9, LOC100043554
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-095H21.bB6Ng01-095H21.g
ACCDH906421DH906422
length1,0591,076
definitionDH906421|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-095H21, 5' end.DH906422|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-095H21, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(58,022,207 - 58,023,266)(58,125,965 - 58,127,045)
sequence
gaattctgcagagccaggccacctcccaagctccaacagtcagagtgcat
ggagccagctctgcatcctcctggtggcacaagctgttactgaagcccac
cattggactgtctcataaaatgacaggggctattccctataaataccaat
gtctgtaaataatgtcatcactcaaagggaacatcgaggatattcgaagg
aggcctcttgagttacggaggtggggacatcaagaattcagcctgagcag
ggcagtggtggtggatacctttaatctcagcacttgggattaaagagtta
ggtaattttgagactagtctcatctacagaatgagttccaggacacccag
ggctacatagagaaaccctgacttgaaaacaacaacaacaaaaaacatca
ctcctcacctccccaaattcaacctggttaccattttccttccctgactt
cttgtgcagcctaagtcttactaagagttgtcatatacatacggttgatg
aatgagtgctcttgaggaaatcctcaaagtgtgtgtgtctgtgtctgtgt
ctctgtctctgtctctgtctgtgtctctgactctgtgtctgtgtgtgttt
ctgtgtatgtgtctctgtgtgtctgtctgtctgtctgtctgtgtgtgtct
gtgtctgtgtttgtgtgtctgtctgtgtgtatctgtgtgtctgtgtgtat
ctgtgtgtctgtgtctatgtgtgtgtctgtatgtctgtgtgtgttttgtg
tgtgtgtctttgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgctgcatttga
gccttgatgcccacgtgactaaggtaagaaagtggacctgggaagagaag
tgcactgcctccatgaacacatgattatcaagcagtgttctgagtttcta
gaaaacattaaatactttgatgaatagtttgattttttttaactgaagtt
tctatataaattatgaatttgaattacttttgatctattatgggtcagtc
atcaacattgacaagttattctctggcaagagggtcatatagactcccag
attagatgt
gaattcatgctagaatctttgtctcaactgcatttctagccactgaaaga
tcagaaaacccatgtgtattccctgcccatgcagccccggcagtggcttt
gaacctgtgtcctaccaaggtgtcaactgtcttgtcttgagtagatgacc
acatcctactcctctccctctgtcaccgtcatactcatggataagaagag
ctacaaggcaacactgctggttaattagccagtgcaggcgtgtgcaggac
acacagtcctgggcgagggaaagagaggatgtagggaaaggtcaaaggta
tcaatttagcactttggttctttctgtcagcttctttagaaccatcacag
gtccaccacctccaccacctcacagaagctgagaaaacggaacagaaagg
tgactataatgctttactaaaaaatgatgtcacaaggagcccaaagcaag
ggatttaaaaatgtcaagaatccccaaaagtatgtaaagtgtttacggct
ggctcacaaacacaagtgtgctgtcaagatcaaggaaggacttgacaacg
tcttctcattagactgcactgccactgaggacagactgaagattcaggct
gtcagcatccctgagaccacacttctcatgctacattttttacttgagaa
ttttaaaattaaaacacagtaaaacctcattcatatgctcatctatgcca
ttcaacaacctgcacttgataatcaatgagcagaagcaggtttgtaattt
aagaactaaaatatggtaacatttataaacatatacccctatcagaacaa
tcacttgccaagttagagtgaggttttattgtgtatataaacaaacagac
aaagaacataaaacatataaggacactgctggatgactgcagtgtttctg
ggaacctgagtgctctggcacacagatgacactcaccactgcagcactcc
ctctcgtttgctgcgagaaccccgctgctgtctctgcccgatttttatgc
gctacagcagaaatagaagataagtagaggaagagtaggtgacatctttc
agaatatacagccaaagacagtaaat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_58022207_58023266
seq2: B6Ng01-095H21.b_45_1103

seq1  GAATTCTGCAGAGCCAGGCCACCTCCCAAGCTCCAACAGTCAGAGTGCAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGCAGAGCCAGGCCACCTCCCAAGCTCCAACAGTCAGAGTGCAT  50

seq1  GGAGCCAGCTCTGCATCCTCCTGGTGGCACAAGCTGTTACTGAAGCCCAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGCCAGCTCTGCATCCTCCTGGTGGCACAAGCTGTTACTGAAGCCCAC  100

seq1  CATTGGACTGTCTCATAAAATGACAGGGGCTATTCCCTATAAATACCAAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTGGACTGTCTCATAAAATGACAGGGGCTATTCCCTATAAATACCAAT  150

seq1  GTCTGTAAATAATGTCATCACTCAAAGGGAACATCGAGGATATTCGAAGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTGTAAATAATGTCATCACTCAAAGGGAACATCGAGGATATTCGAAGG  200

seq1  AGGCCTCTTGAGTTACGGAGGTGGGGACATCAAGAATTCAGCCTGAGCAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCCTCTTGAGTTACGGAGGTGGGGACATCAAGAATTCAGCCTGAGCAG  250

seq1  GGCAGTGGTGGTGGATACCTTTAATCTCAGCACTTGGGATTAAAGAGTTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAGTGGTGGTGGATACCTTTAATCTCAGCACTTGGGATTAAAGAGTTA  300

seq1  GGTAATTTTGAGACTAGTCTCATCTACAGAATGAGTTCCAGGACACCCAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAATTTTGAGACTAGTCTCATCTACAGAATGAGTTCCAGGACACCCAG  350

seq1  GGCTACATAGAGAAACCCTGACTTGAAAACAACAACAACAAAAAACATCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTACATAGAGAAACCCTGACTTGAAAACAACAACAACAAAAAACATCA  400

seq1  CTCCTCACCTCCCCAAATTCAACCTGGTTACCATTTTCCTTCCCTGACTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTCACCTCCCCAAATTCAACCTGGTTACCATTTTCCTTCCCTGACTT  450

seq1  CTTGTGCAGCCTAAGTCTTACTAAGAGTTGTCATATACATACGGTTGATG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGTGCAGCCTAAGTCTTACTAAGAGTTGTCATATACATACGGTTGATG  500

seq1  AATGAGTGCTCTTGAGGAAATCCTCAAAGTGTGTGTGTCTGTGTCTGTGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGAGTGCTCTTGAGGAAATCCTCAAAGTGTGTGTGTCTGTGTCTGTGT  550

seq1  CTCTGTCTCTGTCTCTGTCTGTGTCTCTGACTCTGTGTCTGTGTGTGTTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGTCTCTGTCTCTGTCTGTGTCTCTGACTCTGTGTCTGTGTGTGTTT  600

seq1  CTGTGTATGTGTCTCTGTGTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTGTGTGTCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGTATGTGTCTCTGTGTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTGTGTGTCT  650

seq1  GTGTCTGTGTTTGTGTGTCTGTCTGTGTGTATCTGTGTGTCTGTGTGTAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTCTGTGTTTGTGTGTCTGTCTGTGTGTATCTGTGTGTCTGTGTGTAT  700

seq1  CTGTGTGTCTGTGTCTATGTGTGTGTCTGTATGTCTGTGTGTG-TTTGTG  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  CTGTGTGTCTGTGTCTATGTGTGTGTCTGTATGTCTGTGTGTGTTTTGTG  750

seq1  TGTGTGTCTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCTCTGTGTGTGCTGCATTTGA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTGTCTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCTCTGTGTGTGCTGCATTTGA  800

seq1  GCCTTGATGCCCACGTGACTAAGGTAAGAAAGTGGACCTGGGAAGAGAAG  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTTGATGCCCACGTGACTAAGGTAAGAAAGTGGACCTGGGAAGAGAAG  850

seq1  TGCACTGCCTCCATGAACACATGATTATCAAGCAGTGTTCTGAGTTTCTA  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCACTGCCTCCATGAACACATGATTATCAAGCAGTGTTCTGAGTTTCTA  900

seq1  G-AAACA-TAAATACTTTGATG-ATAGTTGGATTTTTTTAACCTGAAGGT  946
      | ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||| ||
seq2  GAAAACATTAAATACTTTGATGAATAGTTTGATTTTTTTTAACTGAA-GT  949

seq1  TTCTATATAAATTATGAATTTGAATAACTTTTGATCTAATAATGGTCCAG  996
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||  |||
seq2  TTCTATATAAATTATGAATTTGAATTACTTTTGATCT-ATTATGGGTCAG  998

seq1  TCATCAACATTGACAAGTTACTCTCTGGCAAGAGGGGTCATATAGGACTC  1046
      |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||
seq2  TCATCAACATTGACAAGTTATTCTCTGGCAAGA-GGGTCATATA-GACTC  1046

seq1  CCAAGATTAGATGT  1060
      || |||||||||||
seq2  CC-AGATTAGATGT  1059

seq1: chr14_58125965_58127045
seq2: B6Ng01-095H21.g_69_1144 (reverse)

seq1  ATTTACTGTCTTTGGCTGTATATTCTGAAAGGATGTCACTTACTC-TCCT  49
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||
seq2  ATTTACTGTCTTTGGCTGTATATTCTGAAA-GATGTCACCTACTCTTCCT  49

seq1  CTACTTATCTTCTTATTTCTTGCTGTAGCGCAT-AAAATCGGGCAGAGAC  98
      |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  CTACTTATCTTC-TATTTC-TGCTGTAGCGCATAAAAATCGGGCAGAGAC  97

seq1  AGCAGCGGGGGTTCTCGCAGCAAACGAGAGGGGAGTGCTGGCAGTGGTGA  148
      |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||
seq2  AGCAGC-GGGGTTCTCGCAGCAAACGAGA-GGGAGTGCT-GCAGTGGTGA  144

seq1  GTGTCATCTGTGTGCCAGAGCACTCAGGTTCCCAGAAACACTGCAGTCAT  198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTCATCTGTGTGCCAGAGCACTCAGGTTCCCAGAAACACTGCAGTCAT  194

seq1  CCAGCAGTGTCCTTTATATGTTTTATGTTCTTTGTCTGTTTGTTTATATA  248
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGCAGTGTCC-TTATATGTTTTATGTTCTTTGTCTGTTTGTTTATATA  243

seq1  CACAATAAAACCTCACTCTAACTTGGCAAGTGATTGTTCTGATAGGGGTA  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAATAAAACCTCACTCTAACTTGGCAAGTGATTGTTCTGATAGGGGTA  293

seq1  TATGTTTATAAATGTTACCATATTTTAGTTCTTAAATTACAAACCTGCTT  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTTTATAAATGTTACCATATTTTAGTTCTTAAATTACAAACCTGCTT  343

seq1  CTGCTCATTGATTATCAAGTGCAGGTTGTTGAATGGCATAGATGAGCATA  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTCATTGATTATCAAGTGCAGGTTGTTGAATGGCATAGATGAGCATA  393

seq1  TGAATGAGGTTTTACTGTGTTTTAATTTTAAAATTCTCAAGTAAAAAATG  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAATGAGGTTTTACTGTGTTTTAATTTTAAAATTCTCAAGTAAAAAATG  443

seq1  TAGCATGAGAAGTGTGGTCTCAGGGATGCTGACAGCCTGAATCTTCAGTC  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCATGAGAAGTGTGGTCTCAGGGATGCTGACAGCCTGAATCTTCAGTC  493

seq1  TGTCCTCAGTGGCAGTGCAGTCTAATGAGAAGACGTTGTCAAGTCCTTCC  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCCTCAGTGGCAGTGCAGTCTAATGAGAAGACGTTGTCAAGTCCTTCC  543

seq1  TTGATCTTGACAGCACACTTGTGTTTGTGAGCCAGCCGTAAACACTTTAC  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGATCTTGACAGCACACTTGTGTTTGTGAGCCAGCCGTAAACACTTTAC  593

seq1  ATACTTTTGGGGATTCTTGACATTTTTAAATCCCTTGCTTTGGGCTCCTT  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACTTTTGGGGATTCTTGACATTTTTAAATCCCTTGCTTTGGGCTCCTT  643

seq1  GTGACATCATTTTTTAGTAAAGCATTATAGTCACCTTTCTGTTCCGTTTT  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGACATCATTTTTTAGTAAAGCATTATAGTCACCTTTCTGTTCCGTTTT  693

seq1  CTCAGCTTCTGTGAGGTGGTGGAGGTGGTGGACCTGTGATGGTTCTAAAG  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGCTTCTGTGAGGTGGTGGAGGTGGTGGACCTGTGATGGTTCTAAAG  743

seq1  AAGCTGACAGAAAGAACCAAAGTGCTAAATTGATACCTTTGACCTTTCCC  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTGACAGAAAGAACCAAAGTGCTAAATTGATACCTTTGACCTTTCCC  793

seq1  TACATCCTCTCTTTCCCTCGCCCAGGACTGTGTGTCCTGCACACGCCTGC  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACATCCTCTCTTTCCCTCGCCCAGGACTGTGTGTCCTGCACACGCCTGC  843

seq1  ACTGGCTAATTAACCAGCAGTGTTGCCTTGTAGCTCTTCTTATCCATGAG  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGGCTAATTAACCAGCAGTGTTGCCTTGTAGCTCTTCTTATCCATGAG  893

seq1  TATGACGGTGACAGAGGGAGAGGAGTAGGATGTGGTCATCTACTCAAGAC  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGACGGTGACAGAGGGAGAGGAGTAGGATGTGGTCATCTACTCAAGAC  943

seq1  AAGACAGTTGACACCTTGGTAGGACACAGGTTCAAAGCCACTGCCGGGGC  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGACAGTTGACACCTTGGTAGGACACAGGTTCAAAGCCACTGCCGGGGC  993

seq1  TGCATGGGCAGGGAATACACATGGGTTTTCTGATCTTTCAGTGGCTAGAA  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCATGGGCAGGGAATACACATGGGTTTTCTGATCTTTCAGTGGCTAGAA  1043

seq1  ATGCAGTTGAGACAAAGATTCTAGCATGAATTC  1081
      |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCAGTTGAGACAAAGATTCTAGCATGAATTC  1076