BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-105D12
Chromosome14 (Build37)
Map Location 86,811,012 - 86,912,476
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100043310, LOC100043311
Upstream geneLOC668603, LOC100043301, EG629815, LOC100043306, LOC100043778
Downstream geneDiap3, EG665324, Tdrd3
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-105D12.bB6Ng01-105D12.g
ACCDH913300DH913301
length1,0371,117
definitionDH913300|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-105D12, 5' end.DH913301|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-105D12, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(86,811,012 - 86,811,994)(86,911,352 - 86,912,476)
sequence
gaattcactaaagtcgcaggatacaaaatcgacatacagtaacaatttta
tttgtcaatagtgcacttgctggaaaagaaattaaaaaatgaatcttatt
ttaaaaggttacaataacatgaaatatttgtgaatgtgtttaaccaaatg
ttaggcctaatttggccaaaaatctaaggccctaatggaaatccctgagc
ctggctagggcctgggaacctgccttgctcacttccatactagagtgact
cagcacagcccacttttgcctagctactgctgatgtaaatagcttgattg
gccttggcaatcaccctataccctccattacccttccccaactcctaccc
tacctcctacatcatctcaccccaccaaaaagtccccaccttctccctca
accctatataagcaagaggctaatttaataaaccgagttcctgctttaat
aagacttccagcccagtatgtttccttttttgacgttatttatttatcta
tctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatc
tatctatctatttattattagatattttctttatatacatttcaaatgct
atcccaaaatttccctataccctccctccgccctgctcccctacccaccc
actcccccttcttggtcctggcattcccctgtattgggacatataaagtt
tgtaataccaaggggcctctcttcccagtgatggccgattaggccatctt
ctgctacatatacagctagagacacgagctctgggggtactgattagttc
atatcattgttccacctatagggttgcagacaccttcagctccttgggtg
ctttctctagcttcctccattgggggccctgtgttccatcttatagatga
ctgtgagcatccactttctgtatttgccaggcactggcataacctcatac
gaagacagctataccaaggtccttcagcaaaatcttttctggcattgtgc
acagtgtctgggtttggtgctgattgtgggatgatcc
gaattcaaggaaacatacataccaaaagaatcagcaaagaatggagggag
gtggatgtatgggccatgttcctcacagcctgactactatgcaccattta
cattatgtgcacatttctactgctatcgatgaaaattcatcttaaaaata
atggaatgagagcatgtatatgtatcatctgagcataggtctaatttcac
tttgggattggttcctagaaataagattagtgggtcaaaggatttggctg
tttttgaggctatttgtataagcagctctgtgatacttatttcctcggag
acataccaaatgtgaggcactcctactgaaaaatattcttgttcgtgagt
aaaacaaaaacaaaaaaattaattagtttaaaattattctaggctcaaga
ttttattatttttggtagtgcattagaaaataacacattatgataaatga
cttaagacttatgtaagttcaggaagcttttggcattctggatggatgag
gaggctatggtacaactgtctttggtcctcttaaatccatgttcctccat
cagcagctttccataccttgcttcccaaactccacccccatacattaaag
tcaagtatctgaagtgcaccagaggcaaggttgatgctacatccaccttg
accatcaagatcagtactctaggtcagtctccaagaagagatggtgatga
catcctccaggttaactagtgattggaaaggtctgagggttattgtggaa
ctgacagttcaggacaggcttatattaagtcataccttctgcctctgctt
tgaccaccaaagccctggagaagtcatcaagagacagaaagaagtaataa
acatgacactgtggatatgtcacatttgatgagattgtcacagtgcacaa
cagatatggcatcagtcctcagcagagaacacttgtacaactaactaaaa
gagattctgagcacatccacagtctgtgggctgcaatgcgaatgagcacc
aacttggtgacattatagaatacatcaacagtggtgcagtagaatggtcg
ctagtgaggaagcatagaaaaatttttaatagcagcatctgaccagataa
atagaaaagatgtgaga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_86811012_86811994
seq2: B6Ng01-105D12.b_46_1030

seq1  GAATTCACTAAAGTCGCAGGATACAAAATCGACATACAGTAACAATTTTA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACTAAAGTCGCAGGATACAAAATCGACATACAGTAACAATTTTA  50

seq1  TTTGTCAATAGTGCACTTGCTGGAAAAGAAATTAAAAAATGAATCTTATT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTCAATAGTGCACTTGCTGGAAAAGAAATTAAAAAATGAATCTTATT  100

seq1  TTAAAAGGTTACAATAACATGAAATATTTGTGAATGTGTTTAACCAAATG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAAGGTTACAATAACATGAAATATTTGTGAATGTGTTTAACCAAATG  150

seq1  TTAGGCCTAATTTGGCCAAAAATCTAAGGCCCTAATGGAAATCCCTGAGC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGGCCTAATTTGGCCAAAAATCTAAGGCCCTAATGGAAATCCCTGAGC  200

seq1  CTGGCTAGGGCCTGGGAACCTGCCTTGCTCACTTCCATACTAGAGTGACT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGCTAGGGCCTGGGAACCTGCCTTGCTCACTTCCATACTAGAGTGACT  250

seq1  CAGCACAGCCCACTTTTGCCTAGCTACTGCTGATGTAAATAGCTTGATTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCACAGCCCACTTTTGCCTAGCTACTGCTGATGTAAATAGCTTGATTG  300

seq1  GCCTTGGCAATCACCCTATACCCTCCATTACCCTTCCCCAACTCCTACCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTTGGCAATCACCCTATACCCTCCATTACCCTTCCCCAACTCCTACCC  350

seq1  TACCTCCTACATCATCTCACCCCACCAAAAAGTCCCCACCTTCTCCCTCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCTCCTACATCATCTCACCCCACCAAAAAGTCCCCACCTTCTCCCTCA  400

seq1  ACCCTATATAAGCAAGAGGCTAATTTAATAAACCGAGTTCCTGCTTTAAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCTATATAAGCAAGAGGCTAATTTAATAAACCGAGTTCCTGCTTTAAT  450

seq1  AAGACTTCCAGCCCAGTATGTTTCCTTTTTTGACGTTATTTATTTATCTA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGACTTCCAGCCCAGTATGTTTCCTTTTTTGACGTTATTTATTTATCTA  500

seq1  TCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC  550

seq1  TATCTATCTATTTATTATTAGATATTTTCTTTATATACATTTCAAATGCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCTATCTATTTATTATTAGATATTTTCTTTATATACATTTCAAATGCT  600

seq1  ATCCCAAAATTTCCCTATACCCTCCCTCCGCCCTGCTCCCCTACCCACCC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCCAAAATTTCCCTATACCCTCCCTCCGCCCTGCTCCCCTACCCACCC  650

seq1  ACTCCCCCTTCTTGGTCCTGGCATTCCCCTGTATTGGGACATATAAAGTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCCCCCTTCTTGGTCCTGGCATTCCCCTGTATTGGGACATATAAAGTT  700

seq1  TGTAATACCAAGGGGCCTCTCTTCCCAGTGATGGCCGATTAGGCCATCTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAATACCAAGGGGCCTCTCTTCCCAGTGATGGCCGATTAGGCCATCTT  750

seq1  CTGCTACATATACAGCTAGAGACACGAGCTCTGGGGGTACTGATTAGTTC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTACATATACAGCTAGAGACACGAGCTCTGGGGGTACTGATTAGTTC  800

seq1  ATATCATTGTTCCACCTATAGGGTTGCAGACACCTTCAGCTCCTTGGGTG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATCATTGTTCCACCTATAGGGTTGCAGACACCTTCAGCTCCTTGGGTG  850

seq1  CTTTCTCTAGCTT-CTCCATTGGGGGCCCTGTGTTCCATCTTATAGATGA  899
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCTCTAGCTTCCTCCATTGGGGGCCCTGTGTTCCATCTTATAGATGA  900

seq1  CTGTGAGCATCCAC-TTCTGTATTTGCCAGGCACTGGCATAACCTCATAC  948
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGAGCATCCACTTTCTGTATTTGCCAGGCACTGGCATAACCTCATAC  950

seq1  G-AGACAGCTATACCAGGGTCCCTTCAGCAAAATCT  983
      | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||
seq2  GAAGACAGCTATACCAAGGT-CCTTCAGCAAAATCT  985

seq1: chr14_86911352_86912476
seq2: B6Ng01-105D12.g_69_1185 (reverse)

seq1  TCTCACATCTTTTTCTTATTTTATTTTGGTCAGATGCTGCTTATTAAAAT  50
      |||||||||||||   |||||   | |||||||||||||| |||||||| 
seq2  TCTCACATCTTTT--CTATTT--ATCTGGTCAGATGCTGC-TATTAAAA-  44

seq1  ATTTTCTTATGCTTCCTCACTAGCGGACCATTCTACTGCACCACTGTTGA  100
      |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTTCTATGCTTCCTCACTAGC-GACCATTCTACTGCACCACTGTTGA  93

seq1  TGTTATCTATAATGTCACCAGGTTGGTGCTCATTCGCATTGCAGCCCACA  150
      |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATTCTATAATGTCACCAAGTTGGTGCTCATTCGCATTGCAGCCCACA  143

seq1  GACTGT-GATGTGCTCAGGATCTCTTTTAG-TAGTTGTAC-AGTGTTCTC  197
      |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||
seq2  GACTGTGGATGTGCTCAGAATCTCTTTTAGTTAGTTGTACAAGTGTTCTC  193

seq1  TGGCTGAGGACTGATGCCATATCTGTTGTGCACTGTTGACAATCTCATCA  247
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  T-GCTGAGGACTGATGCCATATCTGTTGTGCACTG-TGACAATCTCATCA  241

seq1  AATGTGACATTTCCACAGTGCTCATGTTTATTACTTCTTTCTGTCTCTTG  297
      |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGTGACATATCCACAGTG-TCATGTTTATTACTTCTTTCTGTCTCTTG  290

seq1  ATGACTTCTCCAGGGCTTTGGTGGTCAAAGCAGAGGCAGAAGGTATGACT  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  ATGACTTCTCCAGGGCTTTGGTGGTCAAAGCAGAGGCAGAAGGTATGAC-  339

seq1  TTAATATAAGCCTGTCCTGAACTGTCAGTTCCACAATAACCCTCAGACCT  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATATAAGCCTGTCCTGAACTGTCAGTTCCACAATAACCCTCAGACCT  389

seq1  TTCCAATCACTAGTTAACCTGGAGGATGTCATCACCATCTCTTCTTGGAG  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCAATCACTAGTTAACCTGGAGGATGTCATCACCATCTCTTCTTGGAG  439

seq1  ACTGACCTAGAGTACTGATCTTGGTGGTCAAGGTGGATGTAGCATCAACC  497
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGACCTAGAGTACTGATCTTGATGGTCAAGGTGGATGTAGCATCAACC  489

seq1  TTGCCTCTGGTGCACTTCAGATACTTGACTTTAATGTATGGGGGTGGAGT  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCCTCTGGTGCACTTCAGATACTTGACTTTAATGTATGGGGGTGGAGT  539

seq1  TTGGGAAGCAAGGTATGGAAAGCTGCTGATGGAGGAACATGGATTTAAGA  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGGAAGCAAGGTATGGAAAGCTGCTGATGGAGGAACATGGATTTAAGA  589

seq1  GGACCAAAGACAGTTGTACCATAGCCTCCTCATCCATCCAGAATGCCAAA  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACCAAAGACAGTTGTACCATAGCCTCCTCATCCATCCAGAATGCCAAA  639

seq1  AGCTTCCTGAACTTACATAAGTCTTAAGTCATTTATCATAATGTGTTATT  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTTCCTGAACTTACATAAGTCTTAAGTCATTTATCATAATGTGTTATT  689

seq1  TTCTAATGCACTACCAAAAATAATAAAATCTTGAGCCTAGAATAATTTTA  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTAATGCACTACCAAAAATAATAAAATCTTGAGCCTAGAATAATTTTA  739

seq1  AACTAATTAATTTTTTTGTTTTTGTTTTACTCACGAACAAGAATATTTTT  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTAATTAATTTTTTTGTTTTTGTTTTACTCACGAACAAGAATATTTTT  789

seq1  CAGTAGGAGTGCCTCACATTTGGTATGTCTCCGAGGAAATAAGTATCACA  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTAGGAGTGCCTCACATTTGGTATGTCTCCGAGGAAATAAGTATCACA  839

seq1  GAGCTGCTTATACAAATAGCCTCAAAAACAGCCAAATCCTTTGACCCACT  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCTGCTTATACAAATAGCCTCAAAAACAGCCAAATCCTTTGACCCACT  889

seq1  AATCTTATTTCTAGGAACCAATCCCAAAGTGAAATTAGACCTATGCTCAG  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCTTATTTCTAGGAACCAATCCCAAAGTGAAATTAGACCTATGCTCAG  939

seq1  ATGATACATATACATGCTCTCATTCCATTATTTTTAAGATGAATTTTCAT  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGATACATATACATGCTCTCATTCCATTATTTTTAAGATGAATTTTCAT  989

seq1  CGATAGCAGTAGAAATGTGCACATAATGTAAATGGTGCATAGTAGTCAGG  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGATAGCAGTAGAAATGTGCACATAATGTAAATGGTGCATAGTAGTCAGG  1039

seq1  CTGTGAGGAACATGGCCCATACATCCACCTCCCTCCATTCTTTGCTGATT  1097
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGAGGAACATGGCCCATACATCCACCTCCCTCCATTCTTTGCTGATT  1089

seq1  CTTTTGGTATGTATGTTTCCTTGAATTC  1125
      ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTGGTATGTATGTTTCCTTGAATTC  1117