BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-107I19
Chromosome14 (Build37)
Map Location 72,749,746 - 72,910,438
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC668482
Upstream geneLOC100043136, LOC668477
Downstream geneLOC675957, Fndc3a, LOC100043721, LOC100043723, LOC668487, LOC668489, Cysltr2, LOC100043149, Rcbtb2, Rb1, P2ry5, Itm2b, LOC100043152, Med4
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-107I19.bB6Ng01-107I19.g
ACCDH914987DH914988
length9391,130
definitionDH914987|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-107I19, 5' end.DH914988|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-107I19, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(72,749,746 - 72,750,685)(72,909,309 - 72,910,438)
sequence
gaattctaaaccctcatagttcctgccccctgctggttttcatccctttc
taataagtcccatggggttatccaggtagatgattattccatcttgtccc
cactccctctcaacctcccatatgccttgtgcctactatgaggtagccag
tccttaggtgctataccctccctaccatgatgcttggcctccctatatac
ccacagcagtgggttcagcaaccactgactgaaacctccaaacccatgag
ccaaaataattctttcctcttttaaagtgcttctcaattatttgccactg
tgatgataaaaaaaaaaaaaagaaaagaaaaagaaaaagaaaaaacaagc
tatattggctccatgtctttggaatataatgtggtcaggttgttcttgca
gacaaaagcaactttaaaaggatgggtttattctgaccagtgctccacca
ttgcaggaaaggcatggtgataagagcgcacagcaatgggccatgctcca
tctacagtcaggaagcagtagactgtggtcactttctcttttgttcagtc
cagatatcagccaagcccatgggatgacatcatccatattgagcacaggt
cttccagtatcatttaacccagtctaaaaactccctcagatagagccaga
ggtttgtctcctatataatcctaaatcctgccaaattgatcataaatatt
aaccccaatagccataaatatacaaaagatatatgtacaaatttgctttg
atctgtgctatgctggcaaacaaccttgaaatagaaaaataaagttgtcc
aatttggagcatttgtcaatttttgtagtatgactattcctagttacctg
aattgatgtcttttaaatattactaatatttatttatttatttattttgt
gtgtatatgtgcttttcctacatgtctatgcactgtgtg
gaattctatggaagcagtcctatgtaagtgagggcctttgaaaccctggg
gttttagtctatcccgaggactctggagttcagctctacttcaggtaagg
atgacaagcaatgacagcatttgtgtgttttggggaaggctaccaaactg
taccttccttgggtgttggtggccttgctctttggggacagaagcatcag
cttcatcaagttctatcctctgctggaaaatggcattctaaacccagtcc
ccatcttaacaagccaggtttctgcattctgttttgctcataatggatac
cggcattatgtctcgtgtgtgtatttaagataccagggcagagaagcagt
ttataaatgtggggtctgccattttgtatctgaaacttctcctgaaattt
ttagtttatgttatgaatatttctgaaagaattactgatatatatatata
tatatatacacacacacacatatatatacaatatatacacatatatgtat
atatacatacacacagatatatatatatatatacatacatacatacatat
atatacacacacgcacatataagattttgggattctggtaggaatcaatt
agcaaagtgagtcatacatacatagatgcagtttatttcatcgattttat
acatacaacacacatacatatatactacagaagatacatctctacagaaa
ccctataaggataagcaatgggaagtggtaaaatttagattggattcaaa
gcagagtttactccagtggagtgatcgtccaatcgaaagtgttgtaaatg
gtcttcaccaagagaatgaccaggttttatttatttcttgaatgctatta
ttatgattaatgccctcatattgcactttattagatatttaaagattata
aaatttctgccttagaggctgggaatatagttatggcagaaaagtcttct
gtccatccccagcacatgaatgaatgatgaatgattaataattaataata
aataaaacggaagaaaagttcttggttcaaaaaataaattttctctttga
aatatattttcaattgcatcacgctggaattgattcagttaatctatttt
ttatgattagatccagtgcctggccttctc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_72749746_72750685
seq2: B6Ng01-107I19.b_46_984

seq1  GAATTCTAAACCCTCATAGTTCCTGCCCCCTGCTGGTTTTCATCCCTTTC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTAAACCCTCATAGTTCCTGCCCCCTGCTGGTTTTCATCCCTTTC  50

seq1  TAATAAGTCCCATGGGGTTATCCAGGTAGATGATTATTCCATCTTGTCCC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATAAGTCCCATGGGGTTATCCAGGTAGATGATTATTCCATCTTGTCCC  100

seq1  CACTCCCTCTCAACCTCCCATATGCCTTGTGCCTACTATGAGGTAGCCAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTCCCTCTCAACCTCCCATATGCCTTGTGCCTACTATGAGGTAGCCAG  150

seq1  TCCTTAGGTGCTATACCCTCCCTACCATGATGCTTGGCCTCCCTATATAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTAGGTGCTATACCCTCCCTACCATGATGCTTGGCCTCCCTATATAC  200

seq1  CCACAGCAGTGGGTTCAGCAACCACTGACTGAAACCTCCAAACCCATGAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACAGCAGTGGGTTCAGCAACCACTGACTGAAACCTCCAAACCCATGAG  250

seq1  CCAAAATAATTCTTTCCTCTTTTAAAGTGCTTCTCAATTATTTGCCACTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAAATAATTCTTTCCTCTTTTAAAGTGCTTCTCAATTATTTGCCACTG  300

seq1  TGATGATAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAACAAG  350
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATGAT-AAAAAAAAAAAAAAGAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAACAAG  349

seq1  CTATATTGGCTCCATGTCTTTGGAATATAATGTGGTCAGGTTGTTCTTGC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATATTGGCTCCATGTCTTTGGAATATAATGTGGTCAGGTTGTTCTTGC  399

seq1  AGACAAAAGCAACTTTAAAAGGATGGGTTTATTCTGACCAGTGCTCCACC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACAAAAGCAACTTTAAAAGGATGGGTTTATTCTGACCAGTGCTCCACC  449

seq1  ATTGCAGGAAAGGCATGGTGATAAGAGCGCACAGCAATGGGCCATGCTCC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGCAGGAAAGGCATGGTGATAAGAGCGCACAGCAATGGGCCATGCTCC  499

seq1  ATCTACAGTCAGGAAGCAGTAGACTGTGGTCACTTTCTCTTTTGTTCAGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTACAGTCAGGAAGCAGTAGACTGTGGTCACTTTCTCTTTTGTTCAGT  549

seq1  CCAGATATCAGCCAAGCCCATGGGATGACATCATCCATATTGAGCACAGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGATATCAGCCAAGCCCATGGGATGACATCATCCATATTGAGCACAGG  599

seq1  TCTTCCAGTATCATTTAACCCAGTCTAAAAACTCCCTCAGATAGAGCCAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTCCAGTATCATTTAACCCAGTCTAAAAACTCCCTCAGATAGAGCCAG  649

seq1  AGGTTTGTCTCCTATATAATCCTAAATCCTGCCAAATTGATCATAAATAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTTTGTCTCCTATATAATCCTAAATCCTGCCAAATTGATCATAAATAT  699

seq1  TAACCCCAATAGCCATAAATATACAAAAGATATATGTACAAATTTGCTTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACCCCAATAGCCATAAATATACAAAAGATATATGTACAAATTTGCTTT  749

seq1  GATCTGTGCTATGCTGGCAAACAACCTTGAAATAGAAAAATAAAGTTGTC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCTGTGCTATGCTGGCAAACAACCTTGAAATAGAAAAATAAAGTTGTC  799

seq1  CAATTTGGAGCATTTGTCAATTTTTGTAGTATGACTATTCCTAGTTACCT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATTTGGAGCATTTGTCAATTTTTGTAGTATGACTATTCCTAGTTACCT  849

seq1  GAATTGATGTCTTTTAAATATTACTAATATTTATTTATTTATTTATTTTG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTGATGTCTTTTAAATATTACTAATATTTATTTATTTATTTATTTTG  899

seq1  TGTGTATATGTGCTTTTCCTACATGTCTATGCACTGTGTG  940
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTATATGTGCTTTTCCTACATGTCTATGCACTGTGTG  939

seq1: chr14_72909309_72910438
seq2: B6Ng01-107I19.g_67_1195 (reverse)

seq1  AGAAAGCCAGGCACTAGATCTAA--CTATAAAATAGATTTAACTGAATCA  48
      |||| |||||||||| |||||||   || |||||||| ||||||||||||
seq2  AGAAGGCCAGGCACTGGATCTAATCATAAAAAATAGA-TTAACTGAATCA  49

seq1  ATTCCAGC-TGATGCATTTGAAAATATATTTCAA--GGAAATATTATTTT  95
      |||||||| ||||||| |||||||||||||||||   ||||  |||||||
seq2  ATTCCAGCGTGATGCAATTGAAAATATATTTCAAAGAGAAAATTTATTTT  99

seq1  GTGAACC-AGAACTTTTCTTCCGTTTTATTTATTTATTTATTTATTTATT  144
       |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||   ||| |
seq2  TTGAACCAAGAACTTTTCTTCCGTTTTATTTA-TTATTAATT--ATTAAT  146

seq1  CATTCATTCATTCATTCATGTGCTGGGGATTGGACAGAAGACTTTTCTGC  194
      |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  CATTCA-TCATTCATTCATGTGCTGGGGA-TGGACAGAAGACTTTTCTGC  194

seq1  CATAACTATATTCCCAGCCTCTAAGGCAGAAATTTTAATATCTTTAAATA  244
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||
seq2  CATAACTATATTCCCAGCCTCTAAGGCAGAAATTTTATAATCTTTAAATA  244

seq1  TCTAATAAAGTGCAATATGAAGGCATTAATCATAATAATAGCATTCAAGA  294
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAATAAAGTGCAATATGAGGGCATTAATCATAATAATAGCATTCAAGA  294

seq1  AATAAATAAAACCTGGTCATTCTCTTGGTGAAAGACCATTTACAACACTT  344
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  AATAAATAAAACCTGGTCATTCTCTTGGTG-AAGACCATTTACAACACTT  343

seq1  TCGATTGGACGATCACTCCACTGGAGTAAACTCTGCTTTGAATCCAATCT  394
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGATTGGACGATCACTCCACTGGAGTAAACTCTGCTTTGAATCCAATCT  393

seq1  AAATTTTACCACTTCCCATTGCTTATCCTTATAGGGTTTCTGTAGAGATG  444
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTTTACCACTTCCCATTGCTTATCCTTATAGGGTTTCTGTAGAGATG  443

seq1  TATCTTCTGTAGTATATATGTATGTGTGTTGTATGTATAAAATCGATGAA  494
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCTTCTGTAGTATATATGTATGTGTGTTGTATGTATAAAATCGATGAA  493

seq1  ATAAACTGCATCTATGTATGTATGACTCACTTTGCTAATTGATTCCTACC  544
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAACTGCATCTATGTATGTATGACTCACTTTGCTAATTGATTCCTACC  543

seq1  AGAATCCCAAAATCTTATATGTGCGTGTGTGTATATATATGTATGTATGT  594
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATCCCAAAATCTTATATGTGCGTGTGTGTATATATATGTATGTATGT  593

seq1  ATGTATATATATATATATATCTGTGTGTATGTATATATACATATATGTGT  644
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTATATATATATATATATCTGTGTGTATGTATATATACATATATGTGT  643

seq1  ATATATTGTATATATATGTGTGTGTGTGTATATATATATATATATATATC  694
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATATTGTATATATATGTGTGTGTGTGTATATATATATATATATATATC  693

seq1  AGTAATTCTTTCAGAAATATTCATAACATAAACTAAAAATTTCAGGAGAA  744
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAATTCTTTCAGAAATATTCATAACATAAACTAAAAATTTCAGGAGAA  743

seq1  GTTTCAGATACAAAATGGCAGACCCCACATTTATAAACTGCTTCTCTGCC  794
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTCAGATACAAAATGGCAGACCCCACATTTATAAACTGCTTCTCTGCC  793

seq1  CTGGTATCTTAAATACACACACGAGACATAATGCCGGTATCCATTATGAG  844
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGTATCTTAAATACACACACGAGACATAATGCCGGTATCCATTATGAG  843

seq1  CAAAACAGAATGCAGAAACCTGGCTTGTTAAGATGGGGACTGGGTTTAGA  894
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAACAGAATGCAGAAACCTGGCTTGTTAAGATGGGGACTGGGTTTAGA  893

seq1  ATGCCATTTTCCAGCAGAGGATAGAACTTGATGAAGCTGATGCTTCTGTC  944
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCCATTTTCCAGCAGAGGATAGAACTTGATGAAGCTGATGCTTCTGTC  943

seq1  CCCAAAGAGCAAGGCCACCAACACCCAAGGAAGGTACAGTTTGGTAGCCT  994
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAAAGAGCAAGGCCACCAACACCCAAGGAAGGTACAGTTTGGTAGCCT  993

seq1  TCCCCAAAACACACAAATGCTGTCATTGCTTGTCATCCTTACCTGAAGTA  1044
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCCAAAACACACAAATGCTGTCATTGCTTGTCATCCTTACCTGAAGTA  1043

seq1  GAGCTGAACTCCAGAGTCCTCGGGATAGACTAAAACCCCAGGGTTTCAAA  1094
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCTGAACTCCAGAGTCCTCGGGATAGACTAAAACCCCAGGGTTTCAAA  1093

seq1  GGCCCTCACTTACATAGGACTGCTTCCATAGAATTC  1130
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCCTCACTTACATAGGACTGCTTCCATAGAATTC  1129