BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-112M22
Chromosome14 (Build37)
Map Location 10,800,836 - 10,933,266
singlet/doubletdoublet
Overlap geneFhit
Upstream geneLOC100041948, LOC100042415
Downstream geneLOC100041974
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-112M22.bB6Ng01-112M22.g
ACCDH918771DH918772
length1,034579
definitionDH918771|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-112M22, 5' end.DH918772|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-112M22, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(10,932,237 - 10,933,266)(10,800,836 - 10,801,414)
sequence
gaattcttgagtggatgacaatataatattcactgggtgcataggattat
ttcattttccatttttaagaatctaataaataaaggtttgtcattgttaa
acaccttgtttttataaagaatgcattctgtctactttcctaactaaaca
tacctagtaataattgtaatgtgatatttagttgtttttaagatgtgtct
tgtgtatgtagcgattgtgtgtgtttgtgtgtgtgtgtgcacatgcacgt
gtgcatgctttggtgtgctcatatgtgtgcatgcaagcacagaggccaga
agaagaccttgggtatcttctccctcactctcatttttattcagttgata
catggtctcacgctgaacctggcgcttttctggcccaccgactctcctgt
tttgcctctcactacattgtggttataagcatgttcacatgcatgcctcg
cttatgtagttttgtaaccatgcctggcttgtgtatgttcccagtcatgc
ctggcttagcataatcacagccatttctgacatatatacattcagaacct
tgcctggtttatgatgttctaagtcattccagctttttcttttttctttt
tcttttctttttttttaacatggacactagctatttgaacttattaattt
ctggttgagtcatctcccatatccctagttggctgctttttaagttcttc
tttgatcaggacaacattaaagttacttggaagcttaactaaagagtaat
agcaaccatgaaatttttgggcaaattttgtaaattgtgtgaatgcttta
atggtgttatagtctgagagaataatgatctcaggacagttcttttaata
gcactctctatagacaaatccacatttaagcttcctcaatgaaggaatcc
catctcccatccccattttctctagggaaatgttccaggaagaattccag
gctcgtccctgacttcagtgattaagactaactctatgtatgaggtggta
taaagggaatacatgcctccctagttcctcttat
gaattcctattgtttggtttcatggctggacaggaagcccctagatcctc
ctgttagctgcaatcttcagtctgtggtgcgggtcacaagggctctcatg
gaaggagttacagagacaaagtttggagctgagatgaaaggatggaccat
gtagagactgccatatccagggatccaccccataatcagcatccaaacgc
tgacaccattggatacactagcaagattttattgaaaggacccagatgta
gctgtctcttgtgagactatgctggggcctagcaaacacagaagtggatg
ctcacagtcagctaatggatggatcatagggctcccaatggaggagctag
agaaagtagccaaggagctaaagggatctgcaaccctataggtggaacaa
cattatgaactaaccagtaccccggagctcttgactctagctgcatatat
atcaaaagatggcctagtcggccatcactggaaagagaggcccattggac
ttgcaaactttatatgccccagtacaggggaacaccagggccaaaaaggg
ggagtgggtgggcaggggagtgggggtgg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_10932237_10933266
seq2: B6Ng01-112M22.b_50_1082 (reverse)

seq1  TAAGA-GAACTA-GGAAGCATGTATT-CCTTTATACCACCTCATTACATA  47
      ||||| |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||
seq2  TAAGAGGAACTAGGGAGGCATGTATTCCCTTTATACCACCTCA-TACATA  49

seq1  GAGTAAGTCTAAACCACTGAAGTCAAGGACGAGCCTGGAATACTTCCTGG  97
      |||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||
seq2  GAGTTAGTCTTAATCACTGAAGTCAGGGACGAGCCTGGAATTCTTCCTGG  99

seq1  AACATTTCCCCTAGAG-AAATGGGGATGGGAGATGGGATTCCTTCATTGA  146
      ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACATTT-CCCTAGAGAAAATGGGGATGGGAGATGGGATTCCTTCATTGA  148

seq1  GGAAGCTTAAATGTGGATTTGTCTATAGAGAGTGCTTATTAAAAG-ACTG  195
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||
seq2  GGAAGCTTAAATGTGGATTTGTCTATAGAGAGTGC-TATTAAAAGAACTG  197

seq1  TCCTGAGATCATTATTCTCTCAGACTATAACACCATTAAAGCATTCACAC  245
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTGAGATCATTATTCTCTCAGACTATAACACCATTAAAGCATTCACAC  247

seq1  AATTTACAAAATTTGCCC-AAAATTTCATGGTTTGCTATTACTCTTTAGT  294
      |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  AATTTACAAAATTTGCCCAAAAATTTCATGG-TTGCTATTACTCTTTAGT  296

seq1  TAAGCTTCCAAGTAACTTTAATGTTGTCCTGATC-AAGAAGAACTTAAAA  343
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  TAAGCTTCCAAGTAACTTTAATGTTGTCCTGATCAAAGAAGAACTTAAAA  346

seq1  AGCAGCCAACTAGGGATATGGGAGATGACTCAACCAGAAATTAATAAGTT  393
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGCCAACTAGGGATATGGGAGATGACTCAACCAGAAATTAATAAGTT  396

seq1  CAAATAGCTAGTGTCCATGTTAAAAAAAAAGAAAAGAAAAAGAAAAAAGA  443
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATAGCTAGTGTCCATGTTAAAAAAAAAGAAAAGAAAAAGAAAAAAGA  446

seq1  AAAAGCTGGAATGACTTAGAACATCATAAACCAGGCAAGGTTCTGAATGT  493
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGCTGGAATGACTTAGAACATCATAAACCAGGCAAGGTTCTGAATGT  496

seq1  ATATATGTCAGAAATGGCTGTGATTATGCTAAGCCAGGCATGACTGGGAA  543
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATATGTCAGAAATGGCTGTGATTATGCTAAGCCAGGCATGACTGGGAA  546

seq1  CATACACAAGCCAGGCATGGTTACAAAACTACATAAGCGAGGCATGCATG  593
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATACACAAGCCAGGCATGGTTACAAAACTACATAAGCGAGGCATGCATG  596

seq1  TGAACATGCTTATAACCACAATGTAGTGAGAGGCAAAACAGGAGAGTCGG  643
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAACATGCTTATAACCACAATGTAGTGAGAGGCAAAACAGGAGAGTCGG  646

seq1  TGGGCCAGAAAAGCGCCAGGTTCAGCGTGAGACCATGTATCAACTGAATA  693
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGCCAGAAAAGCGCCAGGTTCAGCGTGAGACCATGTATCAACTGAATA  696

seq1  AAAATGAGAGTGAGGGAGAAGATACCCAAGGTCTTCTTCTGGCCTCTGTG  743
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATGAGAGTGAGGGAGAAGATACCCAAGGTCTTCTTCTGGCCTCTGTG  746

seq1  CTTGCATGCACACATATGAGCACACCAAAGCATGCACACGTGCATGTGCA  793
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGCATGCACACATATGAGCACACCAAAGCATGCACACGTGCATGTGCA  796

seq1  CACACACACACAAACACACACAATCGCTACATACACAAGACACATCTTAA  843
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACACACACAAACACACACAATCGCTACATACACAAGACACATCTTAA  846

seq1  AAACAACTAAATATCACATTACAATTATTACTAGGTATGTTTAGTTAGGA  893
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACAACTAAATATCACATTACAATTATTACTAGGTATGTTTAGTTAGGA  896

seq1  AAGTAGACAGAATGCATTCTTTATAAAAACAAGGTGTTTAACAATGACAA  943
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTAGACAGAATGCATTCTTTATAAAAACAAGGTGTTTAACAATGACAA  946

seq1  ACCTTTATTTATTAGATTCTTAAAAATGGAAAATGAAATAATCCTATGCA  993
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTTTATTTATTAGATTCTTAAAAATGGAAAATGAAATAATCCTATGCA  996

seq1  CCCAGTGAATATTATATTGTCATCCACTCAAGAATTC  1030
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAGTGAATATTATATTGTCATCCACTCAAGAATTC  1033

seq1: chr14_10800836_10801414
seq2: B6Ng01-112M22.g_68_646

seq1  GAATTCCTATTGTTTGGTTTCATGGCTGGACAGGAAGCCCCTAGATCCTC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTATTGTTTGGTTTCATGGCTGGACAGGAAGCCCCTAGATCCTC  50

seq1  CTGTTAGCTGCAATCTTCAGTCTGTGGTGCGGGTCACAAGGGCTCTCATG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTTAGCTGCAATCTTCAGTCTGTGGTGCGGGTCACAAGGGCTCTCATG  100

seq1  GAAGGAGTTACAGAGACAAAGTTTGGAGCTGAGATGAAAGGATGGACCAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGGAGTTACAGAGACAAAGTTTGGAGCTGAGATGAAAGGATGGACCAT  150

seq1  GTAGAGACTGCCATATCCAGGGATCCACCCCATAATCAGCATCCAAACGC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGAGACTGCCATATCCAGGGATCCACCCCATAATCAGCATCCAAACGC  200

seq1  TGACACCATTGGATACACTAGCAAGATTTTATTGAAAGGACCCAGATGTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACACCATTGGATACACTAGCAAGATTTTATTGAAAGGACCCAGATGTA  250

seq1  GCTGTCTCTTGTGAGACTATGCTGGGGCCTAGCAAACACAGAAGTGGATG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGTCTCTTGTGAGACTATGCTGGGGCCTAGCAAACACAGAAGTGGATG  300

seq1  CTCACAGTCAGCTAATGGATGGATCATAGGGCTCCCAATGGAGGAGCTAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCACAGTCAGCTAATGGATGGATCATAGGGCTCCCAATGGAGGAGCTAG  350

seq1  AGAAAGTAGCCAAGGAGCTAAAGGGATCTGCAACCCTATAGGTGGAACAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAGTAGCCAAGGAGCTAAAGGGATCTGCAACCCTATAGGTGGAACAA  400

seq1  CATTATGAACTAACCAGTACCCCGGAGCTCTTGACTCTAGCTGCATATAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTATGAACTAACCAGTACCCCGGAGCTCTTGACTCTAGCTGCATATAT  450

seq1  ATCAAAAGATGGCCTAGTCGGCCATCACTGGAAAGAGAGGCCCATTGGAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAAAAGATGGCCTAGTCGGCCATCACTGGAAAGAGAGGCCCATTGGAC  500

seq1  TTGCAAACTTTATATGCCCCAGTACAGGGGAACACCAGGGCCAAAAAGGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCAAACTTTATATGCCCCAGTACAGGGGAACACCAGGGCCAAAAAGGG  550

seq1  GGAGTGGGTGGGCAGGGGAGTGGGGGTGG  579
      |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGTGGGTGGGCAGGGGAGTGGGGGTGG  579