| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | B6Ng01-116C05.b | B6Ng01-116C05.g |
|---|
| ACC | DH921213 | DH921214 |
|---|
| length | 1,230 | 1,081 |
|---|
| definition | DH921213|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-116C05, 5' end. | DH921214|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-116C05, 3' end. |
|---|
| singlet/doublet | doublet | doublet |
|---|
| BLAST hit | unique | unique |
|---|
| Map location. | (86,503,301 - 86,504,563) | (86,344,843 - 86,345,936) |
|---|
| sequence | gaattctcagcatgcttccaaatcagaaactgattgttcccatcaatgga
gttgaaaattccatcctttttatcattgctaaagatacagatacaaacta
acagcatggaacttccagaggcacctgtcagatggagcaaacccaccatc
ttggagtaattggtgacatgatttttttgtttgttgtttgtttatatagt
tcctagctaagtaatctcttcttcatggtcattcctctatctaccctgat
gacaactttaatttgtctactgcatagattctgtctcctctgaactttaa
tttctctcacagttcttcaagtatctgcttctcctctgcactctcttcct
ttattgtatgggtcagtccaaaatcaatactatagcatgtttagcttgag
gtcagtggtgagaagaaggaactaaagatcaagaaagagaatactgcatt
gatgagagaatttggaatcccgagtttcctcctttcttttcttccaggaa
cacatggctgctgtccactctgtatggagtataggagaaacctagtacca
cagattacatggggactgacacaggatgacttaactactgaggcaaaaag
aaacaggaaaaaataagagagtaaggaagctggactgcagtgactgacaa
ctgcaggttcagagaggagaagcgcaggtggcatgaggtcaggttaagtc
ggtgcaaaccagagccctgcttctggggttacttgttcttctgattattc
aaaatgtttctgaagagtttagacattttcgctgtcaactttaccatcct
catagtgtttgtttaatattttgcctcagagactacttttctgattttat
tttataaaagccccagcaatgtcctcattggcatccaggagatagaccat
acagattatgagcatcccttttctggctcacagattagttatttcaaatt
ggctataaaccctttcaccgacaccagttatttttacacacatccaactt
cctgatattggagagaatagcagaatatgagagattgtagcaccttgtgt
ctgcagcttctgattggggaaatatacttaggtgctgtgataaaataact
atgatcatttatagcagaaagtttatttttggctcaaagattaagttgct
actgaagccatgtggatcgttgcctggtttgttagcacagaatggtttat
gaatagttacacgtggcttcattcatggga
| gaattcagcagcttatcttaagtcgacaatctacctcataggaatccgta
tctgacttgtctccatggtttgtcttcttccctttctgtgtgctttgtgg
ttctgagctcccagctcgtatgacatgaacttacaaaaaatgaaaaatat
aggattagatactcttgtttggcagtggcttattatcctgaaaattctac
aaaggcccttcatgggataaacattctcttcttagaatctgaataaaatg
ttaccaaatggatttgtaagtgataatgttcaaatattttgagcacttga
ctaatcaattataagtgctaccagtgctttatttaaaatagtgccaaggt
tgtaatttacagtgaatacatttatgtgccgagtggtatccaccagtttc
ttccagtaatcctacttgggagttatttctaatcattctgcccatgcaaa
aggactactcattgcctgatagagtactgttaccatgaagagagatttct
taagtagtaaaagctgtccagagatttgcaaatctcccattagcgctggc
tttaaacttgccttgagagctgcttctcatggatactgttgttgctaatg
tcaccagggctctgttatttctgttgctcacagaagaaacaagctctcat
ccacaaaaaggcaggaggcgagagaaagagcagaagtgggtgatggactc
gcctctttttttttttttctttttggtgaagtttactctcatctcctaca
cccttttcatctcatttattgaaatgactctgtaactcagtgaggggcaa
agaaaaggaatgaaaattcatttaagcacactcttttatttatgttaaca
ttccatcatacgctgtttaacaatttagtaaatgtttattatgcacagtg
ctacattctcgagagaataaataagtctctgtcagcacttcttttatgaa
atctattttgggtttttttctggagtttaaaaatcataataaacactttc
tcaggagatggcagaagaaatgctttgacacagttgatagtgagctgtac
ttaaaaaaaaaaatacaaacatgtgcatata
|
|---|
| quality values | Open.Hide.61 43 27 32 61 43 47 35 33 47 55 43 47 47 61 61 61 61 38 14 61 61 61 49 49 11 17 13 11 15 12 23 13 14 12 24 23 59 59 59 61 59 61 59 61 61 61 59 61 61
61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 61 61 55 44 61 59 45 45 28 30 30 26 35 44 55 55 59 59 61 61 61 61 61 61 61 59 61 61 61 61 61 61 61 61 59 61 61
61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 61 59 61 61 59 61 61 61 61 61 61 61 52 61 59 59 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61
59 61 61 59 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 59
61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61
61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 61 61 59 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61
61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61
61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 61 61 61 61 61 61
61 61 61 61 59 61 61 61 59 59 59 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61
61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 55 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 55 55 61 61
61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61
61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 53 61 61 52 61 61 61 53 61 61 61 61 61 61 61 53 53 47 61 50 61 61 43 43 53 53 53 61 61 61 61
61 61 47 61 43 53 61 61 61 61 61 61 61 50 43 61 53 61 52 61 61 61 61 61 52 61 61 61 53 53 57 57 57 47 50 53 57 53 53 50 53 57 47 53 53 53 47 47 52 47
53 57 57 57 41 36 42 45 57 53 53 39 57 27 53 33 53 57 38 57 57 45 53 45 53 45 19 42 25 52 47 43 50 53 53 53 28 57 30 45 45 36 57 36 53 40 46 37 52 50
52 43 37 50 39 41 33 43 39 53 45 30 57 24 46 35 41 52 53 53 50 53 50 38 53 57 57 53 28 53 28 42 33 53 43 27 52 50 34 45 42 50 53 39 33 45 32 32 42 50
36 57 57 52 35 41 19 57 46 42 37 15 35 53 24 52 23 42 57 37 42 33 40 38 32 52 57 57 42 50 19 33 39 52 29 42 13 50 42 40 57 37 32 33 25 23 48 48 40 44
37 22 40 39 40 15 41 29 53 40 30 9 57 52 43 35 36 42 40 57 57 47 25 14 29 35 37 29 9 57 23 34 29 30 37 32 33 57 57 48 40 37 30 32 16 53 45 35 37 32
51 51 33 25 37 39 51 51 31 25 22 44 45 31 27 22 31 25 22 27 47 23 30 41 29 33 28 29 8 12 25 14 27 38 27 29 25 39 16 48 20 33 23 28 14 29 29 33 27 28
27 25 20 12 32 26 25 29 29 30 43 22 35 13 51 20 51 16 13 51 51 33 26 21 33 41 20 28 28 23 29 25 22 35 16 32 29 16 28 27 15 29 38 30 19 14 32 28 29 28
28 30 26 29 24 29 43 46 43 16 39 28 15 51 29 27 17 18 19 13 10 8 10 16 16 20 14 24 15 24 29 51 51 51 28 21 19 5 7 7 31 36 12 24 22 21 20 20 8 6
29 28 28 28 24 14 16 14 25 22 19 11 5 26 15 38 36 10 12 22 12 10 14 39 23 33 15 19 27 34 17 34 13 51 11 7 7 7 17 9 7 7 9 33 14 21 27 5 5 6
12 15 22 23 10 33 18 24 12 35 14 24 25 10 15 28 35 35 33 20 44 28 8 8 14 23 26 14 22 7 6 6 26 29 29 10 10 6 7 7 8 18 34 36 5 5 6 8 13 8
19 6 13 29 5 5 22 29 5 4 4 6 6 4 5 11 11 25 32 11 6 14 21 9 6 16 11 36 18 14 12 12 9 5 4 5 4 6 10 20 5 12 5 25 10 16 19 17 19 6
6 5 4 5 3 5 5 23 23 9 8 6 7 23 14 9 5 3 4 8 19 16 8 3 4 4 2 2 2 4 6 7 20 5 4 5 6 7 3 3 3 4 3 7 3 7 13 12 9 5
3 4 8 4 3 2 3 3 13 7 11 4 9 10 7 14 6 16 23 5 9 13 17 7 13 5 13 13 3 13 | Open.Hide.61 61 55 49 61 11 11 11 27 11 12 13 26 18 13 59 43 59 59 59 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 34
43 36 26 28 28 26 41 44 61 61 61 61 61 61 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 59 61
61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61
61 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 59 59 61 61 59 61 59 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 61 61 61
59 61 61 61 61 61 61 59 59 59 61 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61
61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61
61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 61 61 59 61 59
59 61 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61
61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 55
61 50 61 61 61 61 61 61 61 61 55 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 55 61 55 55 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 53 61 61 61 61 61 52 61 61 61 61
61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 50 43 43 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 53 61 61 61 53 61 61 61 61 61 61 53
61 61 61 53 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 52 57 53 57 57 57 57 57 57 53 53 53 50 53 57 57 53 52 53 57 53 57 47 57 57 42 57 57 53 52 53 57 53 57
47 53 38 57 57 52 57 57 57 53 57 57 57 57 57 57 53 52 57 57 53 57 46 32 53 47 47 53 52 45 53 53 40 53 57 30 57 47 47 52 47 37 52 57 57 53 53 50 35 47
47 41 38 47 30 44 57 57 53 36 57 35 45 46 57 41 14 41 37 46 57 43 57 38 52 57 41 28 57 28 47 47 28 57 47 26 52 53 57 53 39 53 42 25 57 53 37 28 40 52
30 53 57 42 42 42 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 53 36 34 57 57 57 28 57 52 22 28 30 52 31 29 57 24 29 37 37 44 34 34 16 37 37 30 37 41 23 34 36 23
27 57 48 25 57 57 31 33 24 36 33 33 37 25 29 57 30 33 30 32 40 35 57 33 27 40 32 28 32 34 37 48 27 30 27 34 34 33 27 21 29 32 29 25 46 46 33 21 25 47
30 23 44 47 45 19 24 29 37 28 25 29 27 51 48 33 25 39 34 25 33 51 31 24 31 21 39 13 29 18 35 16 28 34 51 46 18 26 27 51 29 27 29 43 29 16 29 25 29 18
43 20 28 36 25 27 29 19 30 28 28 24 29 28 38 29 51 25 18 20 29 19 17 29 51 32 33 27 24 29 39 29 29 41 23 51 23 28 28 28 27 23 16 17 16 23 17 10 5 19
21 21 21 31 15 29 30 29 25 34 9 23 17 29 20 35 20 16 5 44 28 11 7 33 19 15 17 22 26 20 25 23 34 23 16 23 14 21 34 26 33 19 51 51 25 6 5 10 27 38
20 16 51 15 17 12 51 38 24 24 35 28 21 44 44 44 42 35 13 17 15 29 18 28 11 11 38 23 21 35 35 39 13 31 7 5 6 7 26 12 31 44 18 8 9 26 12 38 8 18
6 4 5 17 12 17 7 5 6 12 7 23 30 14 15 18 4 3 30 19 15 29 11 18 30 23 22 18 8 5 10 5 7 20 12 20 12 5 16 7 6 6 5 4 16 26 16 7 21 12
11 14 19 26 26 27 27 26 31 30 35 30 9 4 6 10 7 27 22 10 7 19 23 10 14 11 4 8 5 6 26 |
|---|
