BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-119K02
Chromosome14 (Build37)
Map Location 73,237,439 - 73,399,897
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100043721, LOC100043723, LOC668487
Upstream geneLOC668482, LOC675957, Fndc3a
Downstream geneLOC668489, Cysltr2, LOC100043149, Rcbtb2, Rb1, P2ry5, Itm2b, LOC100043152, Med4, Nudt15, Sucla2, LOC100043734, EG629578
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-119K02.bB6Ng01-119K02.g
ACCDH923792DH923793
length1,133970
definitionDH923792|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-119K02, 5' end.DH923793|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-119K02, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(73,237,439 - 73,238,586)(73,398,927 - 73,399,897)
sequence
gaattccagtaaatatttcaaaactgaaatcccttatcttcattgatgtc
aggtctttagtacttataccaaagtgaagcagttgctcaagagtgattag
gaggtcaagaatatggggggtgggggattacaagataaagaggaaaggag
agagaaccaggaagacaactggatgcccaggcagtggctagaacatagaa
acttgatgtgctcaggacaggtactctgaccacagagaactactaaatcc
atagcaaaaaaagttgagcctgtaggcttaaagttgactctggattctgg
gaaagaaacaaaatggtaggaggctggaaacataaaatggtcttggtttt
agaaaacagaaggcttgtggaggcattacagcttgttcctggaactctgt
agtcagtgtattaattgttcacttgagtatctcttcactcattaacctga
aattccaagaggtcaagtattttatctttttcttactttgtgcaatgtgg
ccaccttacattcactagatgaataaatgactgatttataacactctgca
cctatcacttaccagatatgtcttataaccatactatacatctgtaatta
tatagcaaaaattctatatggtataactttcaattatgaaaaattaattt
gcgaggcatcaaaattctatttctactatggttgccagaaaactgagaac
atatttataaacaataagtatgtaagtccctattacttacttacacgtgt
gcatcagcctttaaatatataaattatttataaaattgtactatatacat
gcttataaaaatattacacacatatacatatacctatgtataatctcaag
atttttctgccatcaagcttgcatatgaatatactgttttaaaatgtact
ttgtcaagttaattttgatctaggttttacctgagtagccatgagtttcc
ataggaactaagcatatatgaaaatgtgtgctcatatgtttttggcttat
gtgccatttatgccagttgatatgtttgtggtcattcttcggatataagt
tacagtgtcaggctatctatgcttgaggtgatgggcatttacaggaacaa
gactagcttggttccatctaggtgaggtgaatc
gaattctctggtcaaaggtgagtctctcagtaaaacacagcccaggagtt
tgcagccaacagaccgagacagtgggaagggggggctattccaggcagga
gatagatacctttctttttcttacattctggaaagtggtctgagagagac
cccagagcagaagtagatgccactcaaacagttccatcaaggtagaaggc
cctttgtgtagggtctagccagggccttgcatgtgtgtcttttagacatt
gttattggctcaggaaccccccaagaccaagttctcagcaccaaggagat
ttgtctgtcccacagggacagagggcagggaatgagagacaaagaggagg
aggagaaggggaaggagacaaatgagaggggaaggggtatttgttctggg
gaacaaaggactgcctctggttagagaggagacagacatggcccatagga
aagtggtggtttataaaggtaaagggggaaaccctgttttaggatgaggt
gtttaattgtaactgggcatattaactacatgtgtcaaaagggggctttt
cattactggatttccaataccttgagagctgaaccttggcagtcagcctc
aggaggaagaaatggctaaataagggaatggtccttgatggctagcttta
ggaatagaattcttttttttttttttttttattggcaaggcagagagaac
aagggagaagatcaaggcctatcagagccacatgctcaaggcccttcagt
attccacgggaccttgcaaccaatttttcatgtttgtttttcagtgtctt
agaggaagtttatgcctgaggctgatagtccactccgagtttttggccct
tcaaaccttctccctgttcaaggccacgggcttcttctggctagtggggc
tctagctgtatctagatgtttgggcctggcccaaggtttcagttattgat
catacacagtttgtctacaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_73237439_73238586
seq2: B6Ng01-119K02.b_41_1173

seq1  GAATTCCAGTAAATATTTCAAAACTGAAATCCCTTATCTTCATTGATGTC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAGTAAATATTTCAAAACTGAAATCCCTTATCTTCATTGATGTC  50

seq1  AGGTCTTTAGTACTTATACCAAAGTGAAGCAGTTGCTCAAGAGTGATTAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTCTTTAGTACTTATACCAAAGTGAAGCAGTTGCTCAAGAGTGATTAG  100

seq1  GAGGTCAAGAATATGGGGGGTGGGGGATTACAAGATAAAGAGGAAAGGAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGTCAAGAATATGGGGGGTGGGGGATTACAAGATAAAGAGGAAAGGAG  150

seq1  AGAGAACCAGGAAGACAACTGGATGCCCAGGCAGTGGCTAGAACATAGAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAACCAGGAAGACAACTGGATGCCCAGGCAGTGGCTAGAACATAGAA  200

seq1  ACTTGATGTGCTCAGGACAGGTACTCTGACCACAGAGAACTACTAAATCC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTGATGTGCTCAGGACAGGTACTCTGACCACAGAGAACTACTAAATCC  250

seq1  ATAGCAAAAAAAGTTGAGCCTGTAGGCTTAAAGTTGACTCTGGATTCTGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGCAAAAAAAGTTGAGCCTGTAGGCTTAAAGTTGACTCTGGATTCTGG  300

seq1  GAAAGAAACAAAATGGTAGGAGGCTGGAAACATAAAATGGTCTTGGTTTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGAAACAAAATGGTAGGAGGCTGGAAACATAAAATGGTCTTGGTTTT  350

seq1  AGAAAACAGAAGGCTTGTGGAGGCATTACAGCTTGTTCCTGGAACTCTGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAACAGAAGGCTTGTGGAGGCATTACAGCTTGTTCCTGGAACTCTGT  400

seq1  AGTCAGTGTATTAATTGTTCACTTGAGTATCTCTTCACTCATTAACCTGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCAGTGTATTAATTGTTCACTTGAGTATCTCTTCACTCATTAACCTGA  450

seq1  AATTCCAAGAGGTCAAGTATTTTATCTTTTTCTTACTTTGTGCAATGTGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTCCAAGAGGTCAAGTATTTTATCTTTTTCTTACTTTGTGCAATGTGG  500

seq1  CCACCTTACATTCACTAGATGAATAAATGACTGATTTATAACACTCTGCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACCTTACATTCACTAGATGAATAAATGACTGATTTATAACACTCTGCA  550

seq1  CCTATCACTTACCAGATATGTCTTATAACCATACTATACATCTGTAATTA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTATCACTTACCAGATATGTCTTATAACCATACTATACATCTGTAATTA  600

seq1  TATAGCAAAAATTCTATATGGTATAACTTTCAATTATGAAAAATTAATTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAGCAAAAATTCTATATGGTATAACTTTCAATTATGAAAAATTAATTT  650

seq1  GCGAGGCATCAAAATTCTATTTCTACTATGGTTGCCAGAAAACTGAGAAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCGAGGCATCAAAATTCTATTTCTACTATGGTTGCCAGAAAACTGAGAAC  700

seq1  ATATTTATAAACAATAAGTATGTAAGTCCCTATTACTTACTTACACGTGT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATTTATAAACAATAAGTATGTAAGTCCCTATTACTTACTTACACGTGT  750

seq1  GCATCAGCCTTTAAATATATAAATTATTTATAAAATTGTACTATATACAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATCAGCCTTTAAATATATAAATTATTTATAAAATTGTACTATATACAT  800

seq1  GCTTATAAAAATATTACACACATATACATATACCTATGTATAATCTCAAG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTATAAAAATATTACACACATATACATATACCTATGTATAATCTCAAG  850

seq1  ATTTTTCTGCCATCAGGCTTGCATATGAATATACTGTTTTAAAATGTACT  900
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTTCTGCCATCAAGCTTGCATATGAATATACTGTTTTAAAATGTACT  900

seq1  TTGTCAAGTTAATTTTGATCTAGGTTTTACCTGAGTAGCCATGAGTTTCC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTCAAGTTAATTTTGATCTAGGTTTTACCTGAGTAGCCATGAGTTTCC  950

seq1  ATAGGAACTAAGCATATATGAAAATGTGTGCTCATATGTTTTTTGGCTTT  1000
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||
seq2  ATAGGAACTAAGCATATATGAAAATGTGTGCTCATATG-TTTTTGGC-TT  998

seq1  ATGTGCCATTTATGCCAGTTGATATTGTTTTGTGGTCATTCTTCGTATAT  1050
      |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||
seq2  ATGTGCCATTTATGCCAGTTGATAT--GTTTGTGGTCATTCTTCGGATAT  1046

seq1  AAGTCTACAGTGTTCCAGGCTATCTATGCTTGGAAGGTGAATGGGGCATT  1100
      |||| ||||||||  |||||||||||||||||  ||||||   |||||||
seq2  AAGT-TACAGTGT--CAGGCTATCTATGCTTG--AGGTGA--TGGGCATT  1089

seq1  TACAAGAAACCAAAGACAAAGCTGGGTCCACCATAGGTGAGGTGAATC  1148
      |||| |||    ||||| |   ||| |||| | |||||||||||||||
seq2  TACAGGAA---CAAGACTAGCTTGGTTCCATC-TAGGTGAGGTGAATC  1133

seq1: chr14_73398927_73399897
seq2: B6Ng01-119K02.g_67_1036 (reverse)

seq1  TTGTGGACATACTGCTGTATGATCAATAAACTAGAAACCCTTGGGCCAGG  50
      |||| |||| |||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||
seq2  TTGTAGACAAACTG-TGTATGATCAAT-AACT-GAAA-CCTTGGGCCAGG  46

seq1  CCCAAACATCTAGATACAGCCTGAGGCCCCAGCTAGCCAGAAGAAG-CCG  99
      ||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||| |||
seq2  CCCAAACATCTAGATACAGCTAGA-GCCCCA-CTAGCCAGAAGAAGCCCG  94

seq1  TGGCC-TGGACAGGGAGGAGGTCTGAAGGGCC-AAAACTC-GAGTGGAC-  145
      ||||| || |||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||| 
seq2  TGGCCTTGAACAGGGAGAAGGTTTGAAGGGCCAAAAACTCGGAGTGGACT  144

seq1  ATCAGCCTCAGGCATGAACTTCCTCTAAGACACTGGAAAACAAACATGGA  195
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |
seq2  ATCAGCCTCAGGCATAAACTTCCTCTAAGACACTGAAAAACAAACATGAA  194

seq1  AAATTGGTTTGCAAGGTCCCGTGG-ATACTGAAGGGCCTTGAGCATGTGG  244
      ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTGG-TTGCAAGGTCCCGTGGAATACTGAAGGGCCTTGAGCATGTGG  243

seq1  CTCTGATAGGCCTTGATCTTCTCCCTTGTTCTCTCTGCCTTGCCAATAAA  294
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGATAGGCCTTGATCTTCTCCCTTGTTCTCTCTGCCTTGCCAATAAA  293

seq1  AAAAAAAAAAAAAAAGAATTCTATTCCTAAAGCTAGCCATCAAGGACCAT  344
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAAAAAAAAAAAGAATTCTATTCCTAAAGCTAGCCATCAAGGACCAT  343

seq1  TCCCTTATTTAGCCATTTCTTCCTCCTGAGGCTGACTGCCAAGGTTCAGC  394
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTTATTTAGCCATTTCTTCCTCCTGAGGCTGACTGCCAAGGTTCAGC  393

seq1  TCTCAAGGTATTGGAAATCCAGTAATGAAAAGCCCCCTTTTGACACATGT  444
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCAAGGTATTGGAAATCCAGTAATGAAAAGCCCCCTTTTGACACATGT  443

seq1  AGTTAATATGCCCAGTTACAATTAAACACCTCATCCTAAAACAGGGTTTC  494
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTAATATGCCCAGTTACAATTAAACACCTCATCCTAAAACAGGGTTTC  493

seq1  CCCCTTTACCTTTATAAACCACCACTTTCCTATGGGCCATGTCTGTCTCC  544
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCTTTACCTTTATAAACCACCACTTTCCTATGGGCCATGTCTGTCTCC  543

seq1  TCTCTAACCAGAGGCAGTCCTTTGTTCCCCAGAACAAATACCCCTTCCCC  594
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTAACCAGAGGCAGTCCTTTGTTCCCCAGAACAAATACCCCTTCCCC  593

seq1  TCTCATTTGTCTCCTTCCCCTTCTCCTCCTCCTCTTTGTCTCTCATTCCC  644
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCATTTGTCTCCTTCCCCTTCTCCTCCTCCTCTTTGTCTCTCATTCCC  643

seq1  TGCCCTCTGTCCCTGTGGGACAGACAAATCTCCTTGGTGCTGAGAACTTG  694
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCCTCTGTCCCTGTGGGACAGACAAATCTCCTTGGTGCTGAGAACTTG  693

seq1  GTCTTGGGGGGTTCCTGAGCCAATAACAATGTCTAAAAGACACACATGCA  744
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTTGGGGGGTTCCTGAGCCAATAACAATGTCTAAAAGACACACATGCA  743

seq1  AGGCCCTGGCTAGACCCTACACAAAGGGCCTTCTACCTTGATGGAACTGT  794
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCCCTGGCTAGACCCTACACAAAGGGCCTTCTACCTTGATGGAACTGT  793

seq1  TTGAGTGGCATCTACTTCTGCTCTGGGGTCTCTCTCAGACCACTTTCCAG  844
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAGTGGCATCTACTTCTGCTCTGGGGTCTCTCTCAGACCACTTTCCAG  843

seq1  AATGTAAGAAAAAGAAAGGTATCTATCTCCTGCCTGGAATAGCCCCCCCT  894
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGTAAGAAAAAGAAAGGTATCTATCTCCTGCCTGGAATAGCCCCCCCT  893

seq1  TCCCACTGTCTCGGTCTGTTGGCTGCAAACTCCTGGGCTGTGTTTTACTG  944
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCACTGTCTCGGTCTGTTGGCTGCAAACTCCTGGGCTGTGTTTTACTG  943

seq1  AGAGACTCACCTTTGACCAGAGAATTC  971
      |||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGACTCACCTTTGACCAGAGAATTC  970