BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-120G17
Chromosome14 (Build37)
Map Location 32,366,593 - 32,597,706
singlet/doubletdoublet
Overlap geneColq, Hacl1, Btd, Ankrd28
Upstream geneTkt, Prkcd, EG665466, Rft1, Sfmbt1, Tmem110, Mustn1, Itih4, Itih3, Itih1, Nek4, Spcs1, Glt8d1, Gnl3, Pbrm1, EG432834, Nt5dc2, Stab1, Nisch, Tnnc1, Sema3g, Phf7, Bap1, Dnahc1, Capn7, Sh3bp5, Mettl6, Eaf1
Downstream geneGalntl2, Dph3, Oxnad1, Msmb, Ncoa4, Timm23, Parg, LOC665601, Ogdhl, 1700024G13Rik, Chat, Slc18a3, LOC100040834, EG665618, Ercc6, 9430077A04Rik, Prrxl1, 3425401B19Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-120G17.bB6Ng01-120G17.g
ACCDH924369DH924370
length993880
definitionDH924369|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-120G17, 5' end.DH924370|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-120G17, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(32,596,702 - 32,597,706)(32,366,593 - 32,367,478)
sequence
gaattctctgagctctgagtttcagaaggatttggtacagaccttccatt
tagactccgcgtaatgtctgactgggtctcttcatcttgttttagacaat
ttaaattttaccagttttgcctatcgtttttttgtttgtttgtttgagac
agggtttctctgtgtagccctggctgtcctggaactcactctgtagacca
ggctggcctcgaactcagaaatctgcctgcctctgcctcccgagtgctgg
gattaaaggcgtgcaccaccacgcctggcacgtattttctaagtatttga
catattacacatagagaaaatatgacactatttgttcagttagtgctatg
gtattttttggtacatgtttttaaaataaataatcttgttcagggtggtt
ttatgtatatttttaggtgactacagtatattagacttttagtagaattg
tccaggtcttgccatcctttatgaaattttctactgatgtgtcagtactt
ctttttccaatcatgggtgtagatgctgagatgggtgctttaagttaaac
tttaaatttttttatagaataaattttatgtaaagaatgattgggaaaat
gtaagtatagaagttaggctcagaccataaataaataaataaataaataa
ataagttgtgacttctttagtccaagtagatgaatttacacactagagac
tttggaacaagtgaaaattactcctataaaaagaggtcctattttggaga
aaaaccctgaaaatggacaacagaatagtactataatttcatttttgttt
caagtattaggatgatatattcggtacaactctatggagatggataacat
catttatatgtacagtatttgcatacttatctaaaacattttctgaattt
aaagaaccagtagaagcagacatgtgcatgtagctagagttcatctatta
ggaggtgaagcaagcagatccattccctgcaaaagtcaggtca
gaattctgtagctggtggggatttggaagctatgagagcaccttagtgtt
ttcaaaaaggtgagccatcttgctgccaaagctgaccccacttaactccc
tgacaaggaaaacctcccttcttcacagaccgagcacggcaagggagcag
atgtgtgaatggattggcacaggtggcacaggtggcccaatgcccactcc
aggcctctgtccttgagtgacattagagctgcccctcttcaatgggatcc
tgaggtggccatgctgggccaggtatggagctggcatggaagagtctgga
gatttttcactcacccaagtccggagtactcaccgggctccggctgcctc
tgaagaacggcggtgggaagagtgggggcggtgggggcatgagtaggcag
catgctttgtggctgccccgcttcttctgatccaggccaggaagggctgt
tcagagaaaactgctgttccttagcatggagttaggatgacgatctgtga
catgcccactgtgcccaagggatgcggacacggtcacctgagattggagc
aggcccctgtgtgttgccttgaggcaacgaagacacacggagaccctctc
ttgcctctgctgaagggaatggcccagacgctgtgtgtgtcctttcctcc
ttcagagactacctctgtaggtgtggccatggttttgaaatgaccctatg
tactcatgtggttgtcagcctgctaacaagtcccacttaaatggctcagt
gtgtaggtgacagatccacagcatggagaggtgaatggaccactggactc
tatggctttgatttcacagttctatctatgtttggccttatacttggcca
gtgttaagttatgttaaatgatacaatccc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_32596702_32597706
seq2: B6Ng01-120G17.b_46_1038 (reverse)

seq1  TGACCTAGAACTTTTGCAGGGAATGGATCTGCTTGCTTCAACCTCCCTAA  50
      ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||
seq2  TGACCT--GACTTTTGCAGGGAATGGATCTGCTTGCTTC-ACCT-CCTAA  46

seq1  TAGATGGAACTCTAGCTACATGCCACCATGTCTGCTTCTACTGGTTACTT  100
      ||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||
seq2  TAGAT-GAACTCTAGCTACATGC--ACATGTCTGCTTCTACTGGTT-CTT  92

seq1  TAAAATACAGAAAATGTTTTTAAGATAAGTATGCAAATACTGTAACATAT  150
      | |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  T-AAATTCAGAAAATGTTTT--AGATAAGTATGCAAATACTGT-ACATAT  138

seq1  AAATGATGTTATCCATCTCCATAGAGTTGTACCGAATATATCATCCTAAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGATGTTATCCATCTCCATAGAGTTGTACCGAATATATCATCCTAAT  188

seq1  ACTTGAAACAAAAATGAAATTATAGTACTATTCTGTTGTCCATTTTCAGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTGAAACAAAAATGAAATTATAGTACTATTCTGTTGTCCATTTTCAGG  238

seq1  GTTTTTCTCCAAAATAGGACCTCTTTTTATAGGAGTAATTTTCACTTGTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTTTCTCCAAAATAGGACCTCTTTTTATAGGAGTAATTTTCACTTGTT  288

seq1  CCAAAGTCTCTAGTGTGTAAATTCATCTACTTGGACTAAAGAAGTCACAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAAGTCTCTAGTGTGTAAATTCATCTACTTGGACTAAAGAAGTCACAA  338

seq1  CTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATGGTCTGAGCCTAACTTCTATA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATGGTCTGAGCCTAACTTCTATA  388

seq1  CTTACATTTTCCCAATCATTCTTTACATAAAATTTATTCTATAAAAAAAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTACATTTTCCCAATCATTCTTTACATAAAATTTATTCTATAAAAAAAT  438

seq1  TTAAAGTTTAACTTAAAGCACCCATCTCAGCATCTACACCCATGATTGGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAGTTTAACTTAAAGCACCCATCTCAGCATCTACACCCATGATTGGA  488

seq1  AAAAGAAGTACTGACACATCAGTAGAAAATTTCATAAAGGATGGCAAGAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGAAGTACTGACACATCAGTAGAAAATTTCATAAAGGATGGCAAGAC  538

seq1  CTGGACAATTCTACTAAAAGTCTAATATACTGTAGTCACCTAAAAATATA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGACAATTCTACTAAAAGTCTAATATACTGTAGTCACCTAAAAATATA  588

seq1  CATAAAACCACCCTGAACAAGATTATTTATTTTAAAAACATGTACCAAAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAAAACCACCCTGAACAAGATTATTTATTTTAAAAACATGTACCAAAA  638

seq1  AATACCATAGCACTAACTGAACAAATAGTGTCATATTTTCTCTATGTGTA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATACCATAGCACTAACTGAACAAATAGTGTCATATTTTCTCTATGTGTA  688

seq1  ATATGTCAAATACTTAGAAAATACGTGCCAGGCGTGGTGGTGCACGCCTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGTCAAATACTTAGAAAATACGTGCCAGGCGTGGTGGTGCACGCCTT  738

seq1  TAATCCCAGCACTCGGGAGGCAGAGGCAGGCAGATTTCTGAGTTCGAGGC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATCCCAGCACTCGGGAGGCAGAGGCAGGCAGATTTCTGAGTTCGAGGC  788

seq1  CAGCCTGGTCTACAGAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGGGCTACACAGAGAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCCTGGTCTACAGAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGGGCTACACAGAGAA  838

seq1  ACCCTGTCTCAAACAAACAAACAAAAAAACGATAGGCAAAACTGGTAAAA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCTGTCTCAAACAAACAAACAAAAAAACGATAGGCAAAACTGGTAAAA  888

seq1  TTTAAATTGTCTAAAACAAGATGAAGAGACCCAGTCAGACATTACGCGGA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAAATTGTCTAAAACAAGATGAAGAGACCCAGTCAGACATTACGCGGA  938

seq1  GTCTAAATGGAAGGTCTGTACCAAATCCTTCTGAAACTCAGAGCTCAGAG  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTAAATGGAAGGTCTGTACCAAATCCTTCTGAAACTCAGAGCTCAGAG  988

seq1  AATTC  1005
      |||||
seq2  AATTC  993

seq1: chr14_32366593_32367478
seq2: B6Ng01-120G17.g_65_944

seq1  GAATTCTGTAGCTGGTGGGGATTTGGAAGCTATGAGAGCACCTTAGTGTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGTAGCTGGTGGGGATTTGGAAGCTATGAGAGCACCTTAGTGTT  50

seq1  TTCAAAAAGGTGAGCCATCTTGCTGCCAAAGCTGACCCCACTTAACTCCC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAAAAAGGTGAGCCATCTTGCTGCCAAAGCTGACCCCACTTAACTCCC  100

seq1  TGACAAGGAAAACCTCCCTTCTTCACAGACCGAGCACGGCAAGGGAGCAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACAAGGAAAACCTCCCTTCTTCACAGACCGAGCACGGCAAGGGAGCAG  150

seq1  ATGTGTGAATGGATTGGCACAGGTGGCACAGGTGGCCCAATGCCCACTCC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGTGAATGGATTGGCACAGGTGGCACAGGTGGCCCAATGCCCACTCC  200

seq1  AGGCCTCTGTCCTTGAGTGACATTAGAGCTGCCCCTCTTCAATGGGATCC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCCTCTGTCCTTGAGTGACATTAGAGCTGCCCCTCTTCAATGGGATCC  250

seq1  TGAGGTGGCCATGCTGGGCCAGGTATGGAGCTGGCATGGAAGAGTCTGGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGGTGGCCATGCTGGGCCAGGTATGGAGCTGGCATGGAAGAGTCTGGA  300

seq1  GATTTTTCACTCACCCAAGTCCGGAGTACTCACCGGGCTCCGGCTGCCTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTTTTCACTCACCCAAGTCCGGAGTACTCACCGGGCTCCGGCTGCCTC  350

seq1  TGAAGAACGGCGGTGGGAAGAGTGGGGGCGGTGGGGGCATGAGTAGGCAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGAACGGCGGTGGGAAGAGTGGGGGCGGTGGGGGCATGAGTAGGCAG  400

seq1  CATGCTTTGTGGCTGCCCCGCTTCTTCTGATCCAGGCCAGGAAGGGCTGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGCTTTGTGGCTGCCCCGCTTCTTCTGATCCAGGCCAGGAAGGGCTGT  450

seq1  TCAGAGAAAACTGCTGTTCCTTAGCATGGAGTTAGGATGACGATCTGTGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGAGAAAACTGCTGTTCCTTAGCATGGAGTTAGGATGACGATCTGTGA  500

seq1  CATGCCCACTGTGCCCAAGGGATGCGGACACGGTCACCTGAGATTGGAGC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGCCCACTGTGCCCAAGGGATGCGGACACGGTCACCTGAGATTGGAGC  550

seq1  AGGCCCCTGTGTGTTGCCTTGAGGCAACGAAGACACACGGAGACCCTCTC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCCCCTGTGTGTTGCCTTGAGGCAACGAAGACACACGGAGACCCTCTC  600

seq1  TTGCCTCTGCTGAAGGGAAATGGCCCAGACGCTGTGTGTGTCCTTTCCTC  650
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCCTCTGCTGAAGGG-AATGGCCCAGACGCTGTGTGTGTCCTTTCCTC  649

seq1  CTTCAGAGACTACCTCTGTAGGTGTGGCCATGG-TTTGAAATGACCCTAT  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  CTTCAGAGACTACCTCTGTAGGTGTGGCCATGGTTTTGAAATGACCCTAT  699

seq1  GTACTCATGTGGTTGTTCAGCCTGCTAACAAGTCCCACTTAAATGGCTCA  749
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACTCATGTGGTTG-TCAGCCTGCTAACAAGTCCCACTTAAATGGCTCA  748

seq1  GTGTGTAGGTGACCAGATCCACAGCATGGAGAGGTGAATGGACCACTGGA  799
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTAGGTGA-CAGATCCACAGCATGGAGAGGTGAATGGACCACTGGA  797

seq1  CTTCTATGGCTTTGATTTTCACAGTCTTATCTATGTTTGGCCTTAATACA  849
      | ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||| 
seq2  C-TCTATGGCTTTGA-TTTCACAGTTCTATCTATGTTTGGCCTT-ATACT  844

seq1  TGGCCAGTGTTAAGTTATGTAAAATGATACAGATCCC  886
      |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||
seq2  TGGCCAGTGTTAAGTTATGTTAAATGATACA-ATCCC  880