BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-128F24
Chromosome14 (Build37)
Map Location 87,582,273 - 87,723,450
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEG665324
Upstream geneLOC100043301, EG629815, LOC100043306, LOC100043778, LOC100043310, LOC100043311, Diap3
Downstream geneTdrd3, LOC100043317, LOC100043780
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-128F24.bB6Ng01-128F24.g
ACCDH930241DH930242
length1,1361,096
definitionDH930241|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-128F24, 5' end.DH930242|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-128F24, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(87,582,273 - 87,583,451)(87,722,357 - 87,723,450)
sequence
gaattctcttgaagattcaaacaattctgcaaaggacagacttagcaaaa
agagaagtctcagaggaatcgcttttgagaggcttttgtagaagaaaaag
gtgccaaaagtaaaatataattcatggcttgcgccatgaacattaaacaa
gtgcgcttccgtgggcacacgagcccatcaacattacttactgtacattt
cgctatgcttgataacttttaaagatcctggatcttcagctaaatgaagg
ttcatttgtttatttattatgaaataaactctgttttagcatgtgtcaca
gaaattctacaatccaagcagagaccaccattcgaacatcagatttaagc
actcaaattagaaactaaaataatagccaaaatagaaaaaaatgtttatg
ctttgacatacttagaacttcatgagcatagaaaccactaaaaaaaaaaa
aaaaaaaaaagctaataaaacgcagaaagctaagctaagctaagctaagc
taagatataggtatgcagcaagcagtaatgacacatggcatatgaagacc
acagaggagaaggactgagaatgtgataaaagaatctgtagaagaaaaag
aaatggccaatacatatagggtagataattcatttgataaataagataat
ataaatttgatattatttttgacatatggagcaaattagagctaaaagag
taacatctaggcttgggcacaacgcagacaaagtaagatcctcacacaca
atttatataaaggtgaaaaatgatttcttgcttcaactattaaaactgtt
taccagtatgttttctcatgtaaaatgtgtggttttttaacctagcaaat
ctgttcctggagctttcccctaagaaatgcaattacactggatcaaaatg
tatgcataacaatatccttcgttttctgagagcaaaacaaaacaatggtc
ttgacaaagctttcatcacagggaattgtacaataaactatgagaggtca
ttctccagaatgtctgtgacgttaaagtcgagtcatatacagtagagaga
gacaggaggagaggagggagacttgacgaccctttgagactcatgagtat
gctactcactggaattctaagaagttgcattgcagc
gaattcttcttggggtatgttctttggtgttgtctggagctgcctctgtc
atgtcactgccattcaggaaaggtcaggagatgtacagggacagccttgc
tgagaactgaaatagcaaatgtgacattctcacttggctgtggtctacct
accaacggttagagataatagggacacactgtatggtgggtgacaaggca
ggcaagcatgtgggacagttagtaccctgtgatgcctttttggtctggga
gtgtgcaagcctcaggtactggaattttatagctggcagcccaggttctt
cagctgcacaaattaagtacatacattccttccaaacaatgcacctagca
accccaaacccctcatccaacctccagcatcagggtttatgcatttctat
ctttgaacaatagtatgaatttcccagcccctattaacaaccaaatttag
atggttgcctttaaaatatattctcagtgtgtctggatatgaagggtcta
tctggcccaaactagttcgtggcatatgcagtaagacaatattgtgtcct
ttaataacctttgaaataatcttctatctatgtgtgcatataattaaaat
cagatgccttatgaaaagaagcatgctttggtagagtgatgactatataa
ttatgtaacaataaaaatagagaaccacccaaattgtgtcccttaggaac
cagcccttccttcctttacatccagtaaaaagagatccacggcctggagc
ccttgagtatcttcacttatgtgtcccactgccaatcatgatagtgtgtc
cactctttagtttaatctgttctccacataggttttcttgcttccttttc
aaatctattataagacctattcttaattctatgaatagaaggtcaaaaga
attctggaaacacatggcccagaccctgactaattggtaacaattaagct
actctgtgttaaagtgtaaggatagaatcaataacattgtgacttagcag
gctgcctgataatatacagtccatatacgttcaattacttcaaggatttt
gttgttataaattaagaataatactagaacaaaatgaggatggctg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_87582273_87583451
seq2: B6Ng01-128F24.b_49_1184

seq1  GAATTCTCTTGAAGATTCAAACAATTCTGCAAAGGACAGACTTAGCAAAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCTTGAAGATTCAAACAATTCTGCAAAGGACAGACTTAGCAAAA  50

seq1  AGAGAAGTCTCAGAGGAATCGCTTTTGAGAGGCTTTTGTAGAAGAAAAAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAAGTCTCAGAGGAATCGCTTTTGAGAGGCTTTTGTAGAAGAAAAAG  100

seq1  GTGCCAAAAGTAAAATATAATTCATGGCTTGCGCCATGAACATTAAACAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCCAAAAGTAAAATATAATTCATGGCTTGCGCCATGAACATTAAACAA  150

seq1  GTGCGCTTCCGTGGGCACACGAGCCCATCAACATTACTTACTGTACATTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCGCTTCCGTGGGCACACGAGCCCATCAACATTACTTACTGTACATTT  200

seq1  CGCTATGCTTGATAACTTTTAAAGATCCTGGATCTTCAGCTAAATGAAGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGCTATGCTTGATAACTTTTAAAGATCCTGGATCTTCAGCTAAATGAAGG  250

seq1  TTCATTTGTTTATTTATTATGAAATAAACTCTGTTTTAGCATGTGTCACA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATTTGTTTATTTATTATGAAATAAACTCTGTTTTAGCATGTGTCACA  300

seq1  GAAATTCTACAATCCAAGCAGAGACCACCATTCGAACATCAGATTTAAGC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAATTCTACAATCCAAGCAGAGACCACCATTCGAACATCAGATTTAAGC  350

seq1  ACTCAAATTAGAAACTAAAATAATAGCCAAAATAGAAAAAAATGTTTATG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCAAATTAGAAACTAAAATAATAGCCAAAATAGAAAAAAATGTTTATG  400

seq1  CTTTGACATACTTAGAACTTCATGAGCATAGAAACCACTAAAAAAAAAAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTGACATACTTAGAACTTCATGAGCATAGAAACCACTAAAAAAAAAAA  450

seq1  AAAAAAAAAAGCTAATAAAACGCAGAAAGCTAAGCTAAGCTAAGCTAAGC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAAAAAAGCTAATAAAACGCAGAAAGCTAAGCTAAGCTAAGCTAAGC  500

seq1  TAAGATATAGGTATGCAGCAAGCAGTAATGACACATGGCATATGAAGACC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGATATAGGTATGCAGCAAGCAGTAATGACACATGGCATATGAAGACC  550

seq1  ACAGAGGAGAAGGACTGAGAATGTGATAAAAGAATCTGTAGAAGAAAAAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGAGGAGAAGGACTGAGAATGTGATAAAAGAATCTGTAGAAGAAAAAG  600

seq1  AAATGGCCAATACATATAGGGTAGATAATTCATTTGATAAATAAGATAAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGGCCAATACATATAGGGTAGATAATTCATTTGATAAATAAGATAAT  650

seq1  ATAAATTTGATATTATTTTTGACATATGGAGCAAATTAGAGCTAAAAGAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAATTTGATATTATTTTTGACATATGGAGCAAATTAGAGCTAAAAGAG  700

seq1  TAACATCTAGGCTTGGGCACAACGCAGACAAAGTAAGATCCTCACACACA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACATCTAGGCTTGGGCACAACGCAGACAAAGTAAGATCCTCACACACA  750

seq1  ATTTATATAAAGGTGAAAAATGATTTCTTGCTTCAACTATTAAAACTGTT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTATATAAAGGTGAAAAATGATTTCTTGCTTCAACTATTAAAACTGTT  800

seq1  TACCAGTATGTTTTCTCATGTAAAATGTGTGGTTTTTTAACCTAGCAAAT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCAGTATGTTTTCTCATGTAAAATGTGTGGTTTTTTAACCTAGCAAAT  850

seq1  CTGTTCCTGGAGCTTTCCCCTAAAGAAATGCAATTACACTGGATCAAAAA  900
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  CTGTTCCTGGAGCTTTCCCCT-AAGAAATGCAATTACACTGGATC-AAAA  898

seq1  TGTATGCATAACAATATCCTTCGTTTTCTGAAGAAGCAAAACAAAACAAT  950
      |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||
seq2  TGTATGCATAACAATATCCTTCGTTTTCTGA--GAGCAAAACAAAACAAT  946

seq1  GGTCTTGACAAAGCTTTCCATCACAGGGAATTGTACAAATAAACTATGGA  1000
      ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||
seq2  GGTCTTGACAAAGCTTT-CATCACAGGGAATTGTAC-AATAAACTAT-GA  993

seq1  GAGGTCATTCTCCAGAATGTTCTGTGACCGTTAAAGTCGAGGTCAATATA  1050
      ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||
seq2  GAGGTCATTCTCCAGAATG-TCTGTGA-CGTTAAAGTCGA-GTC-ATATA  1039

seq1  CCAGTTAGAAGAAGAAAGACAAAGAGAGGAAGAGGAGGGAGACTATGACA  1100
      |        || ||| ||| | || |||| |||||||||||||| |||| 
seq2  C--------AGTAGAGAGAGACAG-GAGG-AGAGGAGGGAGACT-TGAC-  1077

seq1  GACACATATGAAGACATCAAAATGAAGTTATTTGCTTTATCTCACTGGAG  1150
      ||| | | || |||| ||   ||||     | ||||    ||||||||| 
seq2  GAC-CCTTTG-AGAC-TC---ATGA----GTATGCT---ACTCACTGGA-  1113

seq1  TATCCTAAAGGAAAAGTTTGCATTGCAGC  1179
       || ||||  |||    ||||||||||||
seq2  -ATTCTAA--GAA---GTTGCATTGCAGC  1136

seq1: chr14_87722357_87723450
seq2: B6Ng01-128F24.g_68_1163 (reverse)

seq1  CAGCCATCCTCATTTTGTCTTAGTATTTATTCTTTTATTTTATAAAACAA  50
      ||||||||||||||||||  ||||| ||||||  ||| |||||  |||||
seq2  CAGCCATCCTCATTTTGTTCTAGTA-TTATTC--TTAATTTAT--AACAA  45

seq1  C-AAATCCTTGAAGTAATTGAACGTATATGACTTGTATA-TATCAGGCAG  98
      | ||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||
seq2  CAAAATCCTTGAAGTAATTGAACGTATATGGACTGTATATTATCAGGCAG  95

seq1  CCTGCTAAGTCACAATGTTATTGATTCTATCC-TACACTTTAACACAGAG  147
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  CCTGCTAAGTCACAATGTTATTGATTCTATCCTTACACTTTAACACAGAG  145

seq1  TAGCTTAATTGTTACC-ATTAGTCAGGGTCTGGGCCATGTGTTTCCAG-A  195
      |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  TAGCTTAATTGTTACCAATTAGTCAGGGTCTGGGCCATGTGTTTCCAGAA  195

seq1  TTC-TTTGACCTTCTATTCATAGAATTAAGAATAGGTCTTAT-ATAGATT  243
      ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  TTCTTTTGACCTTCTATTCATAGAATTAAGAATAGGTCTTATAATAGATT  245

seq1  TGAAAAGGAAGCAAGAAAACCTTATGTGGAGAACAGATTAAACTAAAGAG  293
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAAAGGAAGCAAGAAAACC-TATGTGGAGAACAGATTAAACTAAAGAG  294

seq1  TGGACACACTATCATGATTGGCAGTGGGACACATAAGTGAAGATACTCAA  343
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGACACACTATCATGATTGGCAGTGGGACACATAAGTGAAGATACTCAA  344

seq1  GGGCTCCAGGCCGTGGATCTCTTTTTACTGGATGTAAAGGAAGGAAGGGC  393
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCTCCAGGCCGTGGATCTCTTTTTACTGGATGTAAAGGAAGGAAGGGC  394

seq1  TGGTTCCTAAGGGACACAATTTGGGTGGTTCTCTATTTTTATTGTTACAT  443
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTTCCTAAGGGACACAATTTGGGTGGTTCTCTATTTTTATTGTTACAT  444

seq1  AATTATATAGTCATCACTCTACC-AAGCATGCTTCTTTTCATAAGGCATC  492
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTATATAGTCATCACTCTACCAAAGCATGCTTCTTTTCATAAGGCATC  494

seq1  TGATTTTAATTATATGCACACATAGATAGAAGATTATTTCAAAGGTTATT  542
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATTTTAATTATATGCACACATAGATAGAAGATTATTTCAAAGGTTATT  544

seq1  AAAGGACACAATATTGTCTTACTGCATATGCCACGAACTAGTTTGGGCCA  592
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGGACACAATATTGTCTTACTGCATATGCCACGAACTAGTTTGGGCCA  594

seq1  GATAGACCCTTCATATCCAGACACACTGAGAATATATTTTAAAGGCAACC  642
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAGACCCTTCATATCCAGACACACTGAGAATATATTTTAAAGGCAACC  644

seq1  ATCTAAATTTGGTTGTTAATAGGGGCTGGGAAATTCATACTATTGTTCAA  692
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTAAATTTGGTTGTTAATAGGGGCTGGGAAATTCATACTATTGTTCAA  694

seq1  AGATAGAAATGCATAAACCCTGATGCTGGAGGTTGGATGAGGGGTTTGGG  742
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATAGAAATGCATAAACCCTGATGCTGGAGGTTGGATGAGGGGTTTGGG  744

seq1  GTTGCTAGGTGCATTGTTTGGAAGGAATGTATGTACTTAATTTGTGCAGC  792
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGCTAGGTGCATTGTTTGGAAGGAATGTATGTACTTAATTTGTGCAGC  794

seq1  TGAAGAACCTGGGCTGCCAGCTATAAAATTCCAGTACCTGAGGCTTGCAC  842
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGAACCTGGGCTGCCAGCTATAAAATTCCAGTACCTGAGGCTTGCAC  844

seq1  ACTCCCAGACCAAAAAGGCATCACAGGGTACTAACTGTCCCACATGCTTG  892
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCCCAGACCAAAAAGGCATCACAGGGTACTAACTGTCCCACATGCTTG  894

seq1  CCTGCCTTGTCACCCACCATACAGTGTGTCCCTATTATCTCTAACCGTTG  942
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGCCTTGTCACCCACCATACAGTGTGTCCCTATTATCTCTAACCGTTG  944

seq1  GTAGGTAGACCACAGCCAAGTGAGAATGTCACATTTGCTATTTCAGTTCT  992
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGGTAGACCACAGCCAAGTGAGAATGTCACATTTGCTATTTCAGTTCT  994

seq1  CAGCAAGGCTGTCCCTGTACATCTCCTGACCTTTCCTGAATGGCAGTGAC  1042
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCAAGGCTGTCCCTGTACATCTCCTGACCTTTCCTGAATGGCAGTGAC  1044

seq1  ATGACAGAGGCAGCTCCAGACAACACCAAAGAACATACCCCAAGAAGAAT  1092
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGACAGAGGCAGCTCCAGACAACACCAAAGAACATACCCCAAGAAGAAT  1094

seq1  TC  1094
      ||
seq2  TC  1096