BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-132K05
Chromosome14 (Build37)
Map Location 87,276,232 - 87,378,848
singlet/doubletdoublet
Overlap geneDiap3
Upstream geneLOC100043301, EG629815, LOC100043306, LOC100043778, LOC100043310, LOC100043311
Downstream geneEG665324, Tdrd3
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-132K05.bB6Ng01-132K05.g
ACCDH933391DH933392
length1,0841,157
definitionDH933391|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-132K05, 5' end.DH933392|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-132K05, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(87,377,756 - 87,378,848)(87,276,232 - 87,277,407)
sequence
gaattcatatatggtcccactagtaggggaaagaaatatctgtcagttgc
ttcttttcctctagctttgtttctcacctttcctggttgattttgggtct
tggcatctcttctttccaaatctacattgataatgggaatcattccatgt
tgagctgtataactgttccttttcctcttccctgatgaaaggttggaggt
caatatgaattccactggcataacacattgaggagcctctataatattgt
gctgttttcctccacttgacattatcctggattatgttttctgtgatttt
ttttcataaagtcaccaacagtttacatgaaacataatttaatttttgtt
actctaattttagatgtttgcatagatcaggccaaactagatgagtggga
agagaaagcatccgaacattgcaagaaagtaagtaactctgcaggcctgc
ctgtgtgtgtgagctgctgcaggcctgcctgtgtgtgtgagctgctgcag
gcctgcctgtgtgagtgcttgttatggttcctgcctcctgtctcatgtcc
ctcaggctgggtgagccagcctgagctggcctcactccatgagcactggc
tagaccagttcgttattggaaatgtgctccgcctccgtacctccttttct
tgctttatattgtcatgagaaatgccatgtgtttaaacatgtacatatga
tgtgttagctcttcttccagagtaaacctgggactttagtttcctatatt
cacactctacaccatgaatagtttctgggttctttgtttataggcaatcc
aagaaatacttcttgaatgagtgaatgaattaatgattggacagaagaaa
gggggagacaatgtatatagtataatctcaaaaaatgtttcaagcagcca
tgtgtggtcctagaggcaggcagatcttggtgttcagggataggttgatg
tgcgtagtgtgttccacgacatcaggcagcacaaaaattctggggtacta
ccagcatcagttgctcagtctagaatatctgactctgctcactttgcttt
cttggggtcgtgttttgtcctctttttactgact
gaattcatagccactgtggctcaagatcttcaaaccaagatccagataag
gatctccaagcctccagataagggtcactggtgagccttccaattccgga
ttgtaattcattccaaatattgtcaagttgacaaccaggaatagccacta
caggtgtatatagaaatctatcatcagaacaatggctaggactgagttct
agagatctgtgcatttctcttctcatagaacacaaatggctctacaggta
gtccagtatgaagcagtaagcctgggcattgtctccagactttagagtct
acatggttctcataaatttgttgaatttattcctatgtattttaaagttt
ctgacgttactacaaatagaattttaaaagcattttattgtagtaaaatt
tctattattaaaatatagaagccctcgttatttcccagtattttgcctca
tgtgttctatgagattctatattatgtctacacaaactgctatccaaaat
attttcctgtcaggcttgtctttttaatagtaataattcatgaggggaca
atttgtggacacaggaaaacttcaaatatatacatttatatatcaaaagt
tttatatgtatacaacctatatcaaaatttccatgtgtatataacccatg
tcagtccttataactgctgagtatcataatacttgaccttcagagacctt
tcaaacacaatggtagtttaaagaacatgggataaaactgtaaatgagac
aggatagatcttcaataattatacataaaagtaggagtgaaagaaaattc
tacagtaaatttagttaactgtagtctcatttcccactctagtcactgaa
aagtcttacaaggatccatgtgacctctacattcagaatactagaatacg
ttagaaaagacccaaggcagtggtggatggtcttagctgaaagcccctat
aacactgctgacaaagtgctgaatcattaaagacttgtgtgcttatacgt
gcagacagtataggctttactcctaatgatgatgtatgactagtaatagg
atgtgactgtggatggtgttttgtttgctttccaatgactgaatcagcat
tatgtatgacttcaggtatatcgatgctactagaagcacgatgcttctgt
caacaaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr14_87377756_87378848
seq2: B6Ng01-132K05.b_49_1132 (reverse)

seq1  AGTCAGTAAAAAGAGGACAAAACACGACACCAAAGAAAAGCAAAGGTGAG  50
      |||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||| |||||
seq2  AGTCAGTAAAAAGAGGACAAAACACGACCCCAA--GAAAGCAAA-GTGAG  47

seq1  CAGAGTCAGGATAATTTCTAGACTGAAGCAACTGATGCTGGTAGTACCCC  100
      |||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGTCA-GATA--TTCTAGACTG-AGCAACTGATGCTGGTAGTACCCC  93

seq1  AGAATTTTTGTGCTGCCCTGGTTGTCGTGGAACACACTACGCACATCAAC  150
      |||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATTTTTGTGCTGCC--TGATGTCGTGGAACACACTACGCACATCAAC  141

seq1  CTATCCCTGAACACCAAGATCTGCCTGCCTCTAGGACCACACATGGCTGC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATCCCTGAACACCAAGATCTGCCTGCCTCTAGGACCACACATGGCTGC  191

seq1  TTGAAACATTTTTTGAGATTATACTATATACATTGTCTCCCCCTTTCTTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAAACATTTTTTGAGATTATACTATATACATTGTCTCCCCCTTTCTTC  241

seq1  TGTCCAATCATTAATTCATTCACTCATTCAAGAAGTATTTCTTGGATTGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCCAATCATTAATTCATTCACTCATTCAAGAAGTATTTCTTGGATTGC  291

seq1  CTATAAACAAAGAACCCAGAAACTATTCATGGTGTAGAGTGTGAATATAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATAAACAAAGAACCCAGAAACTATTCATGGTGTAGAGTGTGAATATAG  341

seq1  GAAACTAAAGTCCCAGGTTTACTCTGGAAGAAGAGCTAACACATCATATG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAACTAAAGTCCCAGGTTTACTCTGGAAGAAGAGCTAACACATCATATG  391

seq1  TACATGTTTAAACACATGGCATTTCTCATGACAATATAAAGCAAGAAAAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACATGTTTAAACACATGGCATTTCTCATGACAATATAAAGCAAGAAAAG  441

seq1  GAGGTACGGAGGCGGAGCACATTTCCAATAACGAACTGGTCTAGCCAGTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGTACGGAGGCGGAGCACATTTCCAATAACGAACTGGTCTAGCCAGTG  491

seq1  CTCATGGAGTGAGGCCAGCTCAGGCTGGCTCACCCAGCCTGAGGGACATG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCATGGAGTGAGGCCAGCTCAGGCTGGCTCACCCAGCCTGAGGGACATG  541

seq1  AGACAGGAGGCAGGAACCATAACAAGCACTCACACAGGCAGGCCTGCAGC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACAGGAGGCAGGAACCATAACAAGCACTCACACAGGCAGGCCTGCAGC  591

seq1  AGCTCACACACACAGGCAGGCCTGCAGCAGCTCACACACACAGGCAGGCC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTCACACACACAGGCAGGCCTGCAGCAGCTCACACACACAGGCAGGCC  641

seq1  TGCAGAGTTACTTACTTTCTTGCAATGTTCGGATGCTTTCTCTTCCCACT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAGAGTTACTTACTTTCTTGCAATGTTCGGATGCTTTCTCTTCCCACT  691

seq1  CATCTAGTTTGGCCTGATCTATGCAAACATCTAAAATTAGAGTAACAAAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTAGTTTGGCCTGATCTATGCAAACATCTAAAATTAGAGTAACAAAA  741

seq1  ATTAAATTATGTTTCATGTAAACTGTTGGTGACTTTATGAAAAAAAATCA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAAATTATGTTTCATGTAAACTGTTGGTGACTTTATGAAAAAAAATCA  791

seq1  CAGAAAACATAATCCAGGATAATGTCAAGTGGAGGAAAACAGCACAATAT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAAAACATAATCCAGGATAATGTCAAGTGGAGGAAAACAGCACAATAT  841

seq1  TATAGAGGCTCCTCAATGTGTTATGCCAGTGGAATTCATATTGACCTCCA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAGAGGCTCCTCAATGTGTTATGCCAGTGGAATTCATATTGACCTCCA  891

seq1  ACCTTTCATCAGGGAAGAGGAAAAGGAACAGTTATACAGCTCAACATGGA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTTTCATCAGGGAAGAGGAAAAGGAACAGTTATACAGCTCAACATGGA  941

seq1  ATGATTCCCATTATCAATGTAGATTTGGAAAGAAGAGATGCCAAGACCCA  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGATTCCCATTATCAATGTAGATTTGGAAAGAAGAGATGCCAAGACCCA  991

seq1  AAATCAACCAGGAAAGGTGAGAAACAAAGCTAGAGGAAAAGAAGCAACTG  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATCAACCAGGAAAGGTGAGAAACAAAGCTAGAGGAAAAGAAGCAACTG  1041

seq1  ACAGATATTTCTTTCCCCTACTAGTGGGACCATATATGAATTC  1093
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGATATTTCTTTCCCCTACTAGTGGGACCATATATGAATTC  1084

seq1: chr14_87276232_87277407
seq2: B6Ng01-132K05.g_68_1224

seq1  GAATTCATAGCCACTGTGGCTCAAGATCTTCAAACCAAGATCCAGATAAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATAGCCACTGTGGCTCAAGATCTTCAAACCAAGATCCAGATAAG  50

seq1  GATCTCCAAGCCTCCAGATAAGGGTCACTGGTGAGCCTTCCAATTCCGGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCTCCAAGCCTCCAGATAAGGGTCACTGGTGAGCCTTCCAATTCCGGA  100

seq1  TTGTAATTCATTCCAAATATTGTCAAGTTGACAACCAGGAATAGCCACTA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTAATTCATTCCAAATATTGTCAAGTTGACAACCAGGAATAGCCACTA  150

seq1  CAGGTGTATATAGAAATCTATCATCAGAACAATGGCTAGGACTGAGTTCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGTGTATATAGAAATCTATCATCAGAACAATGGCTAGGACTGAGTTCT  200

seq1  AGAGATCTGTGCATTTCTCTTCTCATAGAACACAAATGGCTCTACAGGTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGATCTGTGCATTTCTCTTCTCATAGAACACAAATGGCTCTACAGGTA  250

seq1  GTCCAGTATGAAGCAGTAAGCCTGGGCATTGTCTCCAGACTTTAGAGTCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCAGTATGAAGCAGTAAGCCTGGGCATTGTCTCCAGACTTTAGAGTCT  300

seq1  ACATGGTTCTCATAAATTTGTTGAATTTATTCCTATGTATTTTAAAGTTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGGTTCTCATAAATTTGTTGAATTTATTCCTATGTATTTTAAAGTTT  350

seq1  CTGACGTTACTACAAATAGAATTTTAAAAGCATTTTATTGTAGTAAAATT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGACGTTACTACAAATAGAATTTTAAAAGCATTTTATTGTAGTAAAATT  400

seq1  TCTATTATTAAAATATAGAAGCCCTCGTTATTTCCCAGTATTTTGCCTCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTATTATTAAAATATAGAAGCCCTCGTTATTTCCCAGTATTTTGCCTCA  450

seq1  TGTGTTCTATGAGATTCTATATTATGTCTACACAAACTGCTATCCAAAAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTTCTATGAGATTCTATATTATGTCTACACAAACTGCTATCCAAAAT  500

seq1  ATTTTCCTGTCAGGCTTGTCTTTTTAATAGTAATAATTCATGAGGGGACA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTCCTGTCAGGCTTGTCTTTTTAATAGTAATAATTCATGAGGGGACA  550

seq1  ATTTGTGGACACAGGAAAACTTCAAATATATACATTTATATATCAAAAGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTGTGGACACAGGAAAACTTCAAATATATACATTTATATATCAAAAGT  600

seq1  TTTATATGTATACAACCTATATCAAAATTTCCATGTGTATATAACCCATG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATATGTATACAACCTATATCAAAATTTCCATGTGTATATAACCCATG  650

seq1  TCAGTCCTTATAACTGCTGAGTATCATAATACTTGACCTTCAGAGACCTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGTCCTTATAACTGCTGAGTATCATAATACTTGACCTTCAGAGACCTT  700

seq1  TCAAACACAATGGTAGTTTAAAGAACATGGGATAAAACTGTAAATGAGAC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAACACAATGGTAGTTTAAAGAACATGGGATAAAACTGTAAATGAGAC  750

seq1  AGGATAGATCTTCAATAATTATACATAAAAGTAGGAGTGAAAGAAAATTC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGATAGATCTTCAATAATTATACATAAAAGTAGGAGTGAAAGAAAATTC  800

seq1  TACAGTAAATTTAGTTAACTGTAGTCTCATTTCCCACTCTAGTCACTGAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAGTAAATTTAGTTAACTGTAGTCTCATTTCCCACTCTAGTCACTGAA  850

seq1  AAGTCTTACAAGGATCCATGTGACCTCTACATTCAGAATACTAGAATACG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTCTTACAAGGATCCATGTGACCTCTACATTCAGAATACTAGAATACG  900

seq1  TTAGAAAAGACCCAAGGCAGTGGTGGATGGTCTTAGCTGAAAAGCCCCCT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||
seq2  TTAGAAAAGACCCAAGGCAGTGGTGGATGGTCTTAGCTGAAA--GCCCCT  948

seq1  ATAAACACTGCTGACAAAGTGCTGAATCATTAAAGACTTGTGTGCTTATA  1000
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AT-AACACTGCTGACAAAGTGCTGAATCATTAAAGACTTGTGTGCTTATA  997

seq1  CGTGCAGAACAGTATAGGCTTTACTCCTAATGAATGATGTATGACTAGTA  1050
      ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  CGTGCAG-ACAGTATAGGCTTTACTCCTAATG-ATGATGTATGACTAGTA  1045

seq1  ATTAGGATGTGACTGT-GATGGTGTTTTGTTTTGCTTTTCCAAATGAACT  1099
      | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  | |||| |||
seq2  A-TAGGATGTGACTGTGGATGGTGTTTTG-TTTGCTTT--CCAATG-ACT  1090

seq1  GAATTAAGCCAATTATGTAATGAAATTTCAGTAATATATCGATGGCCTAA  1149
      ||| | |||  ||||||| |||  | |||||   ||||||||||  || |
seq2  GAA-TCAGC--ATTATGT-ATG--ACTTCAG--GTATATCGATG--CT-A  1129

seq1  CTAGAAAGCACGATGCTTCTGT--ACAAA  1176
      |||| |||||||||||||||||  |||||
seq2  CTAG-AAGCACGATGCTTCTGTCAACAAA  1157